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ショウジョウバエ細胞分化の時空間秩序と安定性をin silico構成系から理解す

研究課題

研究課題/領域番号 09J10671
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 生体生命情報学
研究機関東京大学

研究代表者

中島 昭彦  東京大学, 大学院・総合文化研究科, 特別研究員(PD)

研究期間 (年度) 2009 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
1,400千円 (直接経費: 1,400千円)
2010年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2009年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
キーワード遺伝子ネットワーク / ニューロブラスト / 神経幹細胞 / ロバストネス / 細胞選別 / セルラーポッツモデル / 緩和過程 / 協同性
研究概要

1.発生過程では、幹細胞から様々な細胞種が作り出されることで複雑な組織を形成できるため、その細胞分化の機構を理解することは発生生物学の最重要課題の一つである。ショウジョウバエの神経幹細胞では一定の順序に従った転写因子の発現がみられ、時間的な発現の多様性により細胞の多様性が生み出される、非常に興味深い分化のメカニズムを示すモデル系である。転写因子の制御関係からこの特徴的な遺伝子発現が生み出されていることを示唆する知見が数多く得られてきたが、その遺伝子制御ネットワークの全体像はこれまで描けていなかった。本研究では、これまで得られた実験的知見と整合的振る舞いを示す遺伝子ネットワークの探索から、一定の発現順序を生み出すためのコアネットワークの同定に成功した。合わせて、発現順序の安定性の解析から安定な経時的発現を作り出すためのネットワークモジュールを明らかにし、ショウジョウバエ転写ネットワークが神経の多様化に最適な構造であるということが理解できた。これら結果はショウジョウバエ神経発生の理解に加えて、頑強な遺伝子発現パターンを生み出すネットワークの一般的特性の理解に役立つ。2.次に、作り出された多様な細胞から空間的組織構造が作り出される機構を明らかにするために、モデル系として細胞選別現象に注目し、数理モデルを用いて細胞選別が細胞のどのような力学的な特徴を必要としているか理論的に解析した。その結果、細胞接着に由来する表面張力で駆動される運動と、接着した細胞集団の集団拡散運動の2つの力学的過程が選別に重要とわかった。特に注目すべき性質として、細胞集団が大きくなるにつれ、他の細胞の間を通り抜けるまでにかかる時間が飛躍的に延びてしまうこと、したがって実際の組織形成では、細胞選別の素早い進展のために細胞集団の極性や動きを揃えた協調的運動が物理的に要請されていることを明らかにすることができた。

報告書

(2件)
  • 2010 実績報告書
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2011 2010 2009 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (9件)

  • [雑誌論文] Kinetics of the cellular Potts model revisited2011

    • 著者名/発表者名
      Akihiko Nakajima, Shuji Ishihara
    • 雑誌名

      New Journal of Physics

      巻: 13

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Robustness under functional constraint : The genetic network for temporal expression in Drosophila neurogenesis2010

    • 著者名/発表者名
      Akihiko Nakajima, Takako Isshiki, Kunihiko Kaneko, Shuji Ishihara
    • 雑誌名

      PLoS Computational Biology

      巻: 6

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Robustness under functional constraint : The genetic network for temporal expression in Drosophila neurogenesis

    • 著者名/発表者名
      Akihiko Nakajima, Takako Isshiki, Kunihiko Kaneko, Shuji Ishihara
    • 雑誌名

      PLoS Computational Biology (掲載確定)

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文]

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 細胞の血縁識別による自己組織化的集合シグナルの不安定化2010

    • 著者名/発表者名
      中島昭彦
    • 学会等名
      日本定量生物の会第3回年会
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      2010-11-27
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Domain-growth kinetics of cell sorting2010

    • 著者名/発表者名
      Akihiko Nakajima
    • 学会等名
      International Conference on Systems Biology 2010
    • 発表場所
      Edinburgh International Conference Centre, Edinburgh, UK
    • 年月日
      2010-10-11
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 細胞選別の動力学2010

    • 著者名/発表者名
      中島昭彦
    • 学会等名
      日本機械学会 第23回計算力学講演会
    • 発表場所
      北見工業大学
    • 年月日
      2010-09-23
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] cAMP waves and oscillations during kin-discrimination in Dictyostelium discoideum2010

    • 著者名/発表者名
      Akihiko Nakajima
    • 学会等名
      第48回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      東北大学
    • 年月日
      2010-09-21
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 細胞選別の緩和過程2010

    • 著者名/発表者名
      中島昭彦
    • 学会等名
      日本物理学会年会
    • 発表場所
      岡山大学、岡山
    • 年月日
      2010-03-23
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] REGULATORY MODULE FOR ROBUST TEMPORAL GENE EXPRESSION IN DROSOPHILA NEUROGENESIS2010

    • 著者名/発表者名
      中島昭彦
    • 学会等名
      CSHL meeting, Computational Cell Biology(2010)
    • 発表場所
      Hinxton, UK
    • 年月日
      2010-02-13
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 細胞選別のドメイン成長過程の解析2009

    • 著者名/発表者名
      中島昭彦
    • 学会等名
      日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アスティ徳島,徳島
    • 年月日
      2009-10-30
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Functional constraint and robustness in the genetic network for the temporal expression in Drosophila neurogenesis2009

    • 著者名/発表者名
      中島昭彦
    • 学会等名
      International Symposium on Complex Systems Biology
    • 発表場所
      東京大学本郷キャンパス、東京
    • 年月日
      2009-10-01
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 細胞選別緩和過程の解析2009

    • 著者名/発表者名
      中島昭彦
    • 学会等名
      日本数理生物学会
    • 発表場所
      東京大学駒場キャンパス、東京
    • 年月日
      2009-09-10
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書

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公開日: 2009-04-01   更新日: 2024-03-26  

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