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生体分子認識機構の解明と利用

研究課題

研究課題/領域番号 10145106
研究種目

特定領域研究(A)

配分区分補助金
研究機関京都大学

研究代表者

今中 忠行  京都大学, 大学院・工学研究科, 教授 (30029219)

研究分担者 高木 昌宏  北陸先端科学技術大学院大学, 材料科学研究科, 教授 (00183434)
早出 広司  東京農工大学, 工学部, 助教授 (10187883)
大竹 久夫  広島大学, 工学部, 教授 (10127483)
研究期間 (年度) 1998 – 2001
研究課題ステータス 完了 (2001年度)
配分額 *注記
112,600千円 (直接経費: 112,600千円)
2000年度: 36,500千円 (直接経費: 36,500千円)
1999年度: 39,000千円 (直接経費: 39,000千円)
1998年度: 37,100千円 (直接経費: 37,100千円)
キーワード生体分子 / 認識 / 酵素 / DNAポリメラーゼ / 超好熱菌 / 走化性 / βプロペラタンパク質 / ファイトケラチン / 分子認識 / Rubisco / DNA ligase / β-glycosidase / 基質特異性 / 始原菌 / バイオターゲティング / 環境応答分子 / 重金属捕捉ペプチド / phytochelatin / 抗体工学
研究概要

ターゲティング素子の分子認識について研究した。今中は、様々な生体分子、具体的には酵素の分子認識機構の研究を行い、特殊な(基質・コファクター特異的)分子認識機構をもつ酵素を多数発見した。また超高熱始原菌Thermococcus kodakaraensis KOD 1由来の酵素に着目し、構造解析と共に詳細な機能解析を行った。大竹は、Pseudomonas aeruginosaにおける走化性の分子機構を対象に遺伝的な解析を行った。P.aeruginosaにとって、自然界に存在する20種のL型アミノ酸、有機酸、芳香族化合物、酸素、無機リン酸(Pi)は誘引物質であったが、チオシアン酸・イソチアン酸エステルや揮発性塩素化芳香族化合物に対する走化性は示さなかった。またこれに関連して、メチル基受容化学走化性タンパク質(MCP)依存経路の詳細な解析を行った。早出は、βプロペラタンパク(BPP)の分子構造の解析を行った。マルチキメラPQQGDHの構築により、結合の安定性・特異性が大幅に向上した。さらに、w-モチーフ構造が構造安定性に及ぼす影響を解析することにより、BPPをモデルとした新しい分子設計技術の可能性を示した。高木は、抗酸化物質やフィトケラチンによるカドミウム解毒作用がもたらすアポトーシスについて解析した。抗酸化物質は、酸化ストレスを引き起こすカドミウムイオンを解毒することが出来るが、フィトケラチンによるカドミウム解毒作用はそれよりも強く、その効果はBcl-2と相乗的であった。Arabidopsis dialiana由来のフィトケラチン合成遺伝子をjurkat細胞に導入することにより、植物に特異的なフィトケラチンを生産する哺乳動物細胞を作成し、そのjurkat細胞がカドミウム耐性を示すことを確認した。

報告書

(4件)
  • 2001 研究成果報告書概要
  • 2000 実績報告書
  • 1999 実績報告書
  • 1998 実績報告書
  • 研究成果

    (29件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (29件)

  • [文献書誌] Y.Hashimoto 他: "Extracellular synthesis, specific recognition, and intracellular degradation of cyclomaltodextrins by the hyperthermophilic archaeon Thermococcus sp. strain B 1001"J. Bacteriol. 183・17. 5050-5057 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Shiraki 他: "Comparative analyses of the conformational stability between a hyperthermophilic protein and its mesophilic counterpart"Eur. J. Biochem. 268・15. 4144-4150 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Y.Kannan 他: "Active subtilisin-like protease from form a hyperthermophilic archaeon in a from with a putative prosequence"Appl Environ. Micro biol. 67・6. 2445-2452 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tajima, T 他: "Chemotaxis of the nematode Caenorhaditis elegans toward cycloheximide and quinine hydrochloride"J. Biosci. Bioeng. 91. 322-324 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Mitsutani, A 他: "Analysis of algicidal proteins of a diatom-lytic marine bacterium Pseudoalteromonas sp. strain A25 by two-dimentional electrophoresis"Phycologia. 40. 286-291 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] J.Okuda 他: "The Role of Conserved His775/781 in Membrane-Binding PQQ Glucose Dehydrogenase of Escherichia coli and Acinetobacter calcoaceticus"J. Biochem. Mol. Biol. Biophys. 4. 415-422 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Y. Hashimoto et.al: "Extracellular synthesis, specific recognition, and intracellular degradation of cyclomaltodextrins by the hyperthermophilic archaeon Thermococcus sp. strain B 1001"J. Bacteriol. 183 ・ 17. 5050-5057 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K. Shiraki et.al: "Comparative analyzes of the conformational stability between a hyperthermophilic protein and its mesophilic counterpart"Eur.J. Biochem. 268 ・ 15. 4144-4150 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Y. Kannan et.al: "Active subtilisin-like protease from a hyperthermophilic archaeon in a form with a putative prosequence"Appl Environ. Microbiol. 67 ・ 6. 2445-2452 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tajima, T et.al: "Chemotaxis of the nematode Caenorhaditis elegans toward cycloheximide and quinine hydrochloride"J. Biosci. Bioeng. 91. 322-324 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Mitsutani, A et.al: "Analysis of algicidal proteins of a diatom-lytic marine bacterium Pseudoalteromonas sp. strain A25 by two-dimentional electrophoresis"Phycologja. 40. 286-291 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] J. Okuda et.al.: "The Role of Conserved His775/781 in Membrane-Binding PQQ Glucose Dehydrogenase of Escherichia coli and Acinetobacter calcoaceticus"J. Biochem. Mol. Biol. Biophys. 4. 415-422 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tadayuki Imanaka: "Presence of a structurally novel type Rubisco in the hyperthermophilic archaeon, Pyrococcus kodakaraensis KOD1."Journal of Biological Chemistry. 274(8). 5078-5082 (1999)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Tadayuki Imanaka: "Rubisco from the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus kodakaraensis KOD1 is composed solely of large subunits and forms a pentagonal structure."Journal of Molecular Biology. 293(1). 57-66 (1999)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Tadayuki Imanaka: "Rubisco from the hyperthermophilic archaeon, Thermococcus kodakaraensis."Methods in Enzymol.. 331. 353-365 (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Tadayuki Imanaka: "A DNA ligase from a hyperthermophilic archaeon with unique cofactor specificity."Journal of Bacteriology. 182(22). 6424-6433 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Tadayuki Imanaka: "Gene analysis and enzymatic properties of thermostable β-glycosidase from Pyrococcus kodakaraensis KOD1."J.Bioscience and Bioengineering. 88(2). 130-135 (1999)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] S. Ezaki et al.: "Presence of a structurally novel type ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase in the hyperthermophilic archaeon, Pyrococcus kodakaraensis KOD1"J. Biol. Chem.. 274. 5078-5082 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] N. Rashid et al.: "Isolation and characterization of phychrotrophs from subterranean environments"J. Biosci. Bioeng.. 87. 746-751 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] S. Ezaki et al.: "Gene analysis and enzymatic properties of thermostable β-glycosidase from Pyrococcus kodakaraensis KOD1"J. Biosci. Bioeng.. 88. 130-135 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] S. Satofuka et al.: "Rapid method for detection and detoxification of heavy metal ions in water environments using phytochelatin"J. Biosci. Bioeng.. 88. 287-291 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] N. Maeda et al.: "Ribulose bisphosphate carboxylase/oxygenase from the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus kodakaraensis KOD1 is composed solely of large subunits and forms a pentagonal structure"J. Mol. Biol.. 293. 57-66 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] T. Tanaka et al.: "A unique chitinase with dual active sites and triple substrate binding sites from hyperthermophilic archaeon Pyrococcus kodakaraensis KOD1"Appl. Environ. Microbiol.. 65. 5338-5344 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] R.N.Rahman et al.: "Sequence analysis of glutamate dehydrogenase (GDH) from the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus sp.KOD1 and comparison of the enzymatic characteristics of native and recombinant GDHs." Mol.Gen.Genet.257. 338-347 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] M.Haruki et al.: "Gene cloning and characterization of recombinant RNase HII from a hyperthermophilic archaeon." J.Bacteriol.180. 6207-6214 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Y.Koga et al.: "Thermostable glycerol kinase from a hyperthermophilic archaeon: gene cloning and characterization of the recombinant enzyme." Protein.Eng.11. 1219-1227 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] M.Nishioka et al.: "Characterization of two intein homing endonucleases encoded in the DNA polymerase gene of Pyrococcus kodakaraensis strain KOD1." Nucleic.Acids.Res.26. 4409-4412 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] M.A.Siddiqui et al.: "In vitro heat effect on heterooligomeric subunit assembly of thermostable indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase." FEBS.Lett.4. 372-376 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] R.N.Rahman et al.: "Ion pairs involved in maintaining a thermostable structure of glutamate dehydrogenase from a hyperthermophilic archaeon." Biochem.Biophys.Res.Commun.30. 920-926 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書

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公開日: 1998-04-01   更新日: 2016-04-21  

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