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分子進化学的解析に基づく抗マラリア薬剤の標的分子探索

研究課題

研究課題/領域番号 10166227
研究種目

特定領域研究(A)

配分区分補助金
研究機関統計数理研究所

研究代表者

橋本 哲男  統計数理研究所, 調査実験解析研究系, 助教授 (50208451)

研究分担者 長谷川 政美  統計数理研究所, 予測制御研究系, 教授 (60011657)
研究期間 (年度) 1998
研究課題ステータス 完了 (1998年度)
配分額 *注記
900千円 (直接経費: 900千円)
1998年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
キーワードマラリア原虫 / Plasmodium / Alveolata / Stramenopiles / 色素体 / apicoplast / 真核生物 / 葉緑体関連遺伝子
研究概要

マラリア原虫Plasmodiumと宿主との間に存在する分子生物学的差異を明確化し、治療薬の開発や標的分子の解明のための基礎資料を提供することを目的として、分子進化学解析を中心とした研究を進めている。
本年度は、Plasmodium falciparumのペプチド鎖伸長因子(EF-2),ヴァリン-及びイソロイシンtRNA合成酵素(ValRS,IleRS)、及び最近の小亜粒子リボソームRNA(SSU-rRNA)の解析からStramenopiles(褐藻や珪藻を含む分類群)への所属が示唆されている原虫Blastocystis hominisのEF-2,70kDa熱ショック蛋白質(hsp70),液胞型ATP邸e(v-ATPase)に関する遺伝子解析を実施しこれらのオリジナルデータを得た。
EF-2,valRS,ileRS,hsp70,v-ATPaseについては、得られたオリジナルデータをデータベースから収集した他の真核生物、古細菌、真正細菌の全相同アミノ酸配列データとともにアライメントした。さらに、PlasomodiumやAlveolata(Plasmodiumを含む分類群)の他の生物種のデータが存在する他の分子種についても全データの収集・アライメントを行なった。これらをもとに、最尤法により真核生物全体の系統樹を推定した。さらに、個々の解析結果を総合評価することにより、真核生物内部の系統的位置関係を統計的視点から詳細に検討した。その結果、AlveolataがStramenopilesの姉妹群になるという可能性の高いことが明らかとなった。
一方、上記分子種以外にもPlasmodium類及びToxoplasma gondii類で配列が明らかとなっているものについては、データベースサーチを定期的に行なってデータ収集とアライメントの作業を継続してきた。とくに、P.falciparum及びT.gondiiの色素体様オルガネラ(apicoplast)にコードされている分子種については、それら全てのアライメントを終了した。分子系統樹解析の結果、apicoplastは明らかに植物や藻類の色素体と同一の起源をもつと考えられた。また、核コードのものを含めapicoplast関連分子種に関する分子進化学的データ解析を将来網羅的に実施するための準備として、葉緑体関連遺伝子群の分子系統樹解析を行なった。

報告書

(1件)
  • 1998 実績報告書
  • 研究成果

    (1件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (1件)

  • [文献書誌] Hashimoto,T.et al.: "Secondary absence of mitochondria in Giardia lamblia and Trichomonas vaginalis revealed by valyl-tRNA synthetase phylogeny" Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 95. 6860-6865 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書

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公開日: 1998-04-01   更新日: 2016-04-21  

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