• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

ゲノム全域スクリーニングによる脊椎後縦靭帯骨化症の原因遺伝子同定

研究課題

研究課題/領域番号 10470301
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 整形外科学
研究機関東京大学 (2000)
群馬大学 (1998-1999)

研究代表者

井ノ上 逸朗  東京大学, 医科学研究所, 客員助教授 (00192500)

研究分担者 武田 純  群馬大学, 生体調節研究所, 教授 (40270855)
酒匂 崇  鹿児島大学, 医学部・整形外科, 教授 (10041295)
研究期間 (年度) 1998 – 2000
研究課題ステータス 完了 (2000年度)
配分額 *注記
12,800千円 (直接経費: 12,800千円)
2000年度: 3,000千円 (直接経費: 3,000千円)
1999年度: 3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
1998年度: 6,400千円 (直接経費: 6,400千円)
キーワード後縦靭帯骨化症 / 多因子疾患 / 連鎖解析 / 疾患遺伝子 / マイクロサテライト / 後縦靭帯骨化症、 / ゲノム解析、 / 罹患同胞対連鎖解析, / 感受性遺伝子 / ゲノム全域 / 罹患同胞対連鎖解析
研究概要

後縦靭帯骨化症(OPLL)はその名のとおり後縦靭帯の異所性骨化を認める疾患で、さまざまな脊髄神経圧迫症状を呈する。OPLLは頻度の高い疾患であり、30歳以上の3-4%が発症する。OPLLは高齢発症であるにもかかわらず、その成因には遺伝要因が強く関与している。OPLL羅患同胞対においてHLAハプロタイプを共有することが知られていた。そこでHLA領域にOPLL責任遺伝子が存在すると予想され、HLA領域の羅患同胞対連鎖解析をおこなった。比較的強い連鎖を認め、領域に存在するコラーゲン11A2遺伝子を候補と予想した。コラーゲン11A2遺伝子のSNP解析により、イントロン6に存在するSNP(intron 6(-4A))がOPLLに関連していることを示すことができた。かつこの多型はスプライシングに影響を与える機能的多型であることを示すこともできた。しかしながら、OPLLは多因子疾患であり、他の遺伝子の関与が当然予想される。我々はOPLLに関連する遺伝子すべてを明らかにする目的で、羅患同胞対連鎖解析法によるゲノム全域スクリーニングをおこなった。ゲノム全域での400遺伝マーカーの解析により、5ヶ所の領域で連鎖を認めることができた。その中で、D21S263(P=0.00008,LOD=3.4)をピークとした21番染色体10センチモルガンで強い連鎖を認めた。羅患同胞対連鎖解析法では疾患遺伝子座のピンポイントに限界があり、これ以上の絞り込みは不可能と考えられた。そこで、ケースコントロールスタディによる疾患遺伝子同定を目指した。この領域の全ゲノム配列は最近榊、清水グループから発表されている。多型マーカーの中でマイクロサテライトはゲノム配列から直接検索できる利点がある。領域のマイクロサテライトを検索し、ケースコントロールスタディによる遺伝子座の絞り込みを試みた。2塩基リピートが10回以下のマイクロサテライトは多型性がまったくないことが多かったので、リピートが10回以上のマイクロサテライトを選別している。D21S263からテロメア側の10Mbにわたり計100個のマイクロサテライトを用い、患者200例、対照(非OPLL)200例でアレル頻度を比較した。結果、いくつかのマーカーで有意な差を認めた。特に、AML遺伝子領域の連続したマイクロサテライトで有意な関連を得、もっとも強い有意差(P=0.003)をAML遺伝子上流に存在するマイクロサテライトで得ることができた。

報告書

(4件)
  • 2000 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1999 実績報告書
  • 1998 実績報告書
  • 研究成果

    (27件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (27件)

  • [文献書誌] Maeda, S: "Functional impact of human collagen α2(X1)gene polymorphism in pathogenesis of ossification of the posterior longitudinal ligament of the spine."J.Bone.Miner.Res.. (in press). (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yabe, I: "Predisposing chromosome of spinocerebellar ataxia type 6(SCA6)in Japanese."J.Med.Genet.. (in press). (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nishigori, H: "Mutations in the small heterodimer partner gene are associated with mild obesity in Japan."Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 98. 575-580 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Maeda, S: "Gender-specific haplotype association of collagen α2(X1)gene in ossification of the posterior longitudinal ligament of the spine."J.Hum.Genet.. 46. 1-4 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Numasawa, T: "Human retinoic receptor β : complete genemic sequence and mutation search for ossification of posterior longitudinal ligament of the spine."J.Bone Miner.Res.. 14. 500-508 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Koga, H: "Genetic mapping of ossification of the posterior longitudinal ligament of the spine."Am.J.Hum.Genet.. 62. 1460-1467 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Maeda, S., Ishidou, Y., Koga, H., Taketomi, E., Ikari, K., Komiya, S., Takeda, J., Sakou, T., Inoue, I.: "Functional impact of human collagen α 2(XI)gene polymorphism in pathogenesis of ossification of the posterior longitudinal ligament of the spine."J.Bone.Miner.Res.. (In press). (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yabe, I., Sasaki, H., Yamashita, I., Tashiro, K., Tatei, A., Suzuki, Y., Kida, H., Takiyama, Y., Nashizawa, M., Hokezu, Y., Nagamatsu, K., Oda, T., Ohnishi, A., Inoue, I., Hata, A.: "Predisposing chromosome of spinocerebellar ataxia type 6 6(SCA6)in Japanese."J.Med.Genet.. (In press). (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nishigori, H., Tomura, H., Kanamori, M., Yamada, S., Kikuchi, N., Sho, K., Tonooka, N., Onigata, K., Inoue, I., Kojima, I., Yamagata, K.Yang, Q., Matsuzawa, Y., Kohama, T., Miki, T., Seino, S., Kim, M., Choi, H., Moore, D., Takeda, J.: "Mutations in the small heterodimer partner gene are associated with mild obesity in Japan."Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 98. 575-580 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Maeda, S., Koga, H., Matsunaga, S., Numasawa, T., Takeda, J., Harata, S., Sakou, T., Inoue, I.: "Gender-specific haplotype association of collagen α2(XI)gene in ossification of the posterior longitudinal ligament of the spine."J.Hum.Genet.. 46. 1-4 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Aihara, Y., Mashima, H., Onda, H., Hisano, S., Kasuya, H., Hori, T., Yamada, S., Tomura, H., Yamada, Y., Inoue, I., Kojima, I., Takeda, J.: "Molecular cloning of a novel brain-type Na^+-dependent inorganic phosphate cotransporter."J.Neurochem.. 74. 2622-2625 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yamada, S., Zhu, O., Aihara, Y., Onda, H., Zhang, Z., Yu, L., Jin, L., Si, YJ., Nishigoli, H, Tomura, H., Inoue, I., Morikawa, A., Yamagata, K., Hanafusa, T., Matsuzawa, Y., Takeda, J.: "Cloning of cDNA and the gene encoding human hepatocyte nuclear factor(HNF)-3 beta and mutation screening in Japanese subjects with maturity-onset diabetes of the young."Diabetologia. 43. 121-124 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nakajima, T., Tong, C., Rohrwasser, A., Bloem, LJ., Pratt, JH., Inoue, I., Lalouel, J-M.: "Functional analysis of a mutation occurring between the two in-frame AUG codons of human angiotensinogen."J.Biol.Chem.. 274. 35749-35755 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Onda, H., Kasuya, H., Takakura, K., Hori, T., Imaizumi, T., Takeuchi, T., Inoue, I., Takeda, J.: "Identification of genes differentially expression canine vasospastic cerebral arteries after subarachnoid hemorrhage."J.Cereb.Blood Flow Metab.. 19. 1279-1288 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tomura, H., Nishigori, H., Sho, K., Yamagata, K., Inoue, I., Takeda, J.: "Loss-of-function and dominant-negative mechanisms associated with hepatocyte nuclear factor-1β mutations in familial type 2 diabetes mellitus."J.Biol.Chem.. 274. 12975-12978 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Maeda,S: "Functional impact of human collagen α2 (Xl) gene polymorphism in pathogenesis of ossification of the posterior Iongitudinal ligament of the spine."J.Bone.Miner.Res.. (In press). (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Yabe,I: "Predisposing chromosome of spinocerebellar ataxia type 6(SCA6) in Japanese."J.Med.Genet.. (In press). (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Nishigori,H: "Mutations in the small heterodimer partner gene are associated with mild obesity in Japan."Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 98,. 575-580 (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Maeda,S: "Gender-specific haplotype association of collagen α2 (Xl) gene in ossification of the posterior longitudinal ligament of the spine."J.Hum.Genet.. 46,. 1-4 (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Numasawa,T: "Human retinoic receptor β: complete genomic sequence and mutation search for ossification of posterior longitudinal ligament of the spine."J.Bone Miner.Res.. 14,. 500-508 (1999)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Koga,H: "Genetic mapping of ossification of the posterior longitudinal ligament of the spine."Am.J.Hum.Genet.. 62,. 1460-1467 (1998)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Takuya Numasawa: "Human retinoic X receptor B: complete genomic sequence and mutation search for ossification of posterior longituidinal ligament of the spine"J Bone Miner Res. 14. 500-508 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Hiroaki Koga: "Genetic mapping of ossification of the posterior longitudinal ligament of the spine"Am J Hum Genet. 62. 1460-1467 (1998)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] 井ノ上逸朗: "連鎖解析法"Diabetes Frontier. 9. 67-73 (1998)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] 前田真吾: "後縦靭帯骨化症候補遺伝子COL11A2の多型によるmRNA発現の差"脊椎外科. (in press). (2000)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] 井ノ上逸朗: "ポストシークエンスのゲノム科学"中山書店(in press). (2000)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Takuya Numasawa: "Human retinoic X receptor β:complete genomic sequence and mutation search for ossification of posterior longitudinal ligament of the spine" J Bone Miner Res. (in press). (1999)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書

URL: 

公開日: 1998-04-01   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi