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バクテリオファージ尾部基盤の構築原理の解明

研究課題

研究課題/領域番号 10480178
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物物理学
研究機関東京工業大学

研究代表者

有坂 文雄  東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (80133768)

研究期間 (年度) 1998 – 2000
研究課題ステータス 完了 (2000年度)
配分額 *注記
7,700千円 (直接経費: 7,700千円)
2000年度: 1,600千円 (直接経費: 1,600千円)
1999年度: 1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
1998年度: 4,200千円 (直接経費: 4,200千円)
キーワード分子シャペロン / 繊維状蛋白質 / 会合平衡 / 超遠心沈降平衡法 / 熱変性 / グアニジン塩酸変性 / テイルリゾチーム / 感染 / バクテリオファージ / プロセッシング / 分子集合 / X線結晶解析 / four helix-bumdie / 偽復帰突然変異体
研究概要

本研究の対象蛋白質の1つであるテイルリゾチームは昨年明らかになったように、Ser351とAla352の間でプロセッシングが起こる。C末端側ドメインは3量体形成に必須であり、切断後も複合体として留まる。このC末端側ドメインはテイルおよび成熟ファージ中にも存在していることがウェスタンブロッティングにより証明されていたが、テイルから直接同ドメインを単離して確認することは出来ていなかった。しかし、最近になってテイルから同タンパク質のバンドを取り出してエドマン分解により直接同C末端ドメインが存在することを証明することができた。当研究室で学位取得後米国パーデュー大学に留学した金丸は、最近gp5-gp27が複合体の結晶化に成功し、同結晶が約2.5A分解能の回折点を与えることを見いだした。ごく最近、gp27のセレノメチオニン置換体を含む複合体を用いて位相を決定することが出来た。この複合体はgp5とgp27を各3分子含むヘテロ6量体であり、3月中には構造が決定できそうで、既にgp5のC末端に細長いβヘリックスが見えてきている。他方、小尾繊維の繊維形成に必須のgp57Aは熱変性および変性剤による変性が高度に可逆的である珍しい例である。この蛋白質の会合の性質を詳細に調べるためにUVモニターとレイリー干渉計を用いて広範囲の濃度領域で重量平均浮揚分子量を測定した。この実験は、またいくつかの温度およびいくつかの濃度のグアニジン塩酸存在下でも行った。その結果、単量体は二次構造を持たないこと、基本会合体は2量体であって六量体と平衡関係にあることが明らかとなった。高濃度領域では6量体はさらに会合する傾向にある。単量体-2量体間の平衡定数は30℃付近に極大値を持つが、2量体-6量体間の平衡定数は温度に対して単調に減少した。

報告書

(4件)
  • 2000 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1999 実績報告書
  • 1998 実績報告書
  • 研究成果

    (28件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (28件)

  • [文献書誌] Li ZHAO: "Stoichiometry and Inter-subunit Interaction of the Wedge Initiation Complex, Gp10-gp11 of Bacteriophage T4"Biochim.Biophys.Acta. 1479. 286-292 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shigeki TAKEDA: "Comparative Imaging of the T4 Phage Baseplate with Atomic Force and Electron Antigen Recognizes Specific O-Antigens of Bacterial Lipopolysaccharides Microscopy"Res.Comm.Biochem.& Mol.Biol.. 3. 181-192 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Mainul HOQUE: "Chimeric virus-like particle of adeno-associated virus"Biochim.Biophys.Res.Comm.. 266. 376-371 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Takeshi KAWABATA: "Structural/functional assignment of unknown bacteriophage T4 proteins by iterative database searches"Gene. 259. 223-233 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Satoshi INOUE: "Silk Fibroin Bombyx mori is Secreted Assembling a High Molecular-Mass iterative database searches"J.Biol.Chem.. 275. 40517-40528 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 有坂文雄: "超遠心分析の基礎と新たな展開(4)"蛋白質核酸酵素. 44・1. 82-94 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shigeki TAKEDA: "Comparative Imaging of the T4 Phage Baseplate with Atomic Force and Electron Microscopy Antigen Recognizes Specific O-Antigens of Bacterial Lipopolysaccharides"Res. Comm. Biochem. & Mol. Biol.. 3. 181-192 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Mainul HOQUE: "Chimeric virus-like particle of adeno-associated virus"Biochim. Biophys. Res. Comm.. 266. 371-376 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Li ZHAO: "Stoichiometry and Inter-subunit Interaction of the Wedge Initiation Complex, Gp10-gp11 of Bacteriophage T4"Biochim. Biophys. Acta. 1479. 286-292 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Takeshi KAWABATA: "Structural/functional assignment of unknown bacteriophage T4 proteins by iterative database searches"Gene. 259. 223-233 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Satoshi INOUE: "Silk Fibroin Bombyx mori is Secreted Assembling a High Molecular-Mass Elementary Unit Consisting of H-chain, L-chain and P25, with 6 : 6 : 1 Molar Ratios."J.Biol. Chem.. 275. 40517-40528 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shigeki TAKEDA: "Comparative Imaging of the T4 Phage Baseplate with Atomic Force and Electron Microscopy Antigen Recognizes Specific O-Antigens of Bacterial Lipopolysaccharides"Res.Comm.Biochem.& Mol.Biol.. 3. 181-192 (1999)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Mainul HOQUE: "Chimeric virus-like particle of adeno-associated virus"Biochim.Biophys.Res.Comm.. 266. 371-376 (1999)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Li ZHAO: "Stoichiometry and Inter-subunit Interaction of the Wedge Initiation Complex, Gp10-gp11 of Bacteriophage T4"Biochim.Biophys.Acta. 1479. 286-292 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Takeshi KAWABATA: "Structural/functional assignment of unknown bacteriophage T4 proteins by iterative database searches"Gene. 259. 223-233 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Satoshi INOUE: "Silk Fibroin Bombyx mori is Secreted Assembling a High Molecular-Mass iterative database searches"J.Biol.Chem.. 275. 40517-40528 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Masato USHIYAMA: "A 12-Porphyrin Construction of a System: Synthesis of Peptide Porphyrin with Multiple Histidines and the Aggregation Behavior in the Presence of Hemin"Bull.Chem.Soc.Japn. 72. 1351-1364 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Kei-ichiro INAMORI: "A Newly Identified Horseshoe Crab Lectin with Specificity for Blood Group A Antigen Rcognizes Specific O-Antigens of Bacterial Lipopolysaccharides"J.Biol.Chem.. 274. 3272-3278 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Shuji KANAMARU: "C-terminal Fragment of the Precursor Tail Lysozyme of Bacteriophage T4 Stays as a Structutral Component of the Baseplate after Cleavage"J.Bacteriology. 181. 2739-2744 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Mainul HOQUE: "Nuclear Transport of the major capsid protein is essential for Adeno-Associated Virus Capsid Formation"J.Virol.. 73-9. 7912-7915 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Shigeki TAKEDA: "Comparative Imaging of the T4 Phage Baseplate with Atomic Force and Electron Microscopy"Res.Comm.Biochem.& Mol.Biol.. (in press).

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Li ZHAO: "Stoichiometry and Inter-subunit Interaction of the Wedge Initiation Complex,Gp10-gp11 of Bacteriophage T4"Biochim.Biophys.Acta. (in press).

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Shigeki TAKEDA: "Mapping of Functional Sites on the Primary Structure of the Tail Lysozyme of Bacteriophage T4 by Mutation Analysis" Biochem.Biophys.Acta. 1384. 243-252 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Shigeki TAKEDA: "Discovery of the tail tube gene of bacteriophage Mu and sequence analysis of the sheath and tube genes" Biochim.Biophys.Acta. 1399. 88-92 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] 有坂文雄: "超遠心分析の基礎と新たな展開(1)" 蛋白質核酸酵素. 43(13). 2024-2032 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] 有坂文雄: "超遠心分析の基礎と新たな展開(2)" 蛋白質核酸酵素. 43(14). 2145-2152 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] 有坂文雄: "超遠心分析の基礎と新たな展開(3)" 蛋白質核酸酵素. 43(15). 2238-2244 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] 有坂文雄: "生体物質相互作用のリアルタイム解析実験法" シュプリンガーフェークラーク東京社, 268 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書

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公開日: 1998-04-01   更新日: 2016-04-21  

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