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天然有機分子の立体配置決定のための実践的方法論

研究課題

研究課題/領域番号 10554043
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分展開研究
研究分野 分離・精製・検出法
研究機関大阪大学 (1999-2000)
東京大学 (1998)

研究代表者

村田 道雄  大阪大学, 大学院・理学研究科, 教授 (40183652)

研究分担者 内海 博明  日本電子株式会社, 研究員
橘 和夫  東京大学, 大学院・理学系研究科, 教授 (70142081)
松森 信明  大阪大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50314357)
研究期間 (年度) 1998 – 2000
研究課題ステータス 完了 (2000年度)
配分額 *注記
12,900千円 (直接経費: 12,900千円)
2000年度: 2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
1999年度: 4,400千円 (直接経費: 4,400千円)
1998年度: 6,000千円 (直接経費: 6,000千円)
キーワードNMR / スピン結合定数 / J値 / 立体配置 / 立体配座 / 天然物 / マイトトキシン / アンフィジノール / 鎖状構造
研究概要

天然有機分子の構造決定は、この20年NMRの長足な進歩によって飛躍的に迅速化、高精度化した。それに伴って、結晶性の低い化合物であっても、分子量が大きく複雑な化合物であっても構造が決定できるようになってきた。
天然有機化合物の構造解析法は、X線回折法もしくは、NMRを中心とした方法に大別されると言ってよい。最新のNMR技術が苦手とする構造解析の分野があり、そのかなりの部分は相対立体配置(不斉炭素のR^*,S^*の帰属)の帰属である。特に、鎖状構造では困難なことが多く、また、このような天然物は普通結晶化しないので、鎖状化合物の立体配置が未解明のまま残されていることが多い。そこで、本基盤研究(B)展開研究では、鎖状構造に適応可能な非経験的NMR解析法を考案し、実践と通じて方法論を確立した。すなわち、スピン結合定数のうち、炭素と水素の2および3結合離れたJ値を用いれば、かなりの部分の1,2-および1,3-置換体の立体配置と立体配座が判明することが分かった。この方法(JBCA法)を用いれば、優位な回転配座が2つ存在する場合でも、立体配置を知ることができる。すなわち、2つの配座の平均から得られるJ値は、アンチ型とゴーシュ型の両者の平均的な値をとる場合あがる。これをJ値から判断でき、さらの他の位置の-水素のJ値を利用することができれば、配座の混合物を2つの配座に分離して考えることができる。本方法の導入によって、配座交換のかる系についても立体配置解析ができることになった。具体的には、JBCA法によって、マイトトキシンやアンフィジノールといった鎖状化合物の立体配置も明らかにすることができた。

報告書

(4件)
  • 2000 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1999 実績報告書
  • 1998 実績報告書
  • 研究成果

    (20件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (20件)

  • [文献書誌] Tanaka,I.: "A new ceramide with a novel branched-chain fatty acid isolated from the epiphytic dinoflagellate Coolia monotis."J.Nat.Prod.. 61. 685-688 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Murata,M.: "Labeling pattern of okadaic acid from ^<18>O_2 and [^<18>O_2]acetate elucidated by collision-induced dissociation tandem mass spectrometry."J.Am.Chem.Soc.. 120. 147-151 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Murata,M.: "Absolute configuration of amphidinol 3, the first complete structure determination from amphidinol homologues :"J.Am.Chem.Soc.. 121. 870-871 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Matsumori,N.: "Stereochemical determination of acyclic structures based on carbon-proton spin-coupling constants"J.Org.Chem.. 64. 866-876 (1999)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Izumikawa,M.: "^<18>O-labelling pattern of okadaic Acid from H_2^<18>O in dinoflagellate Prorocentrum lima elucidated by tandem mass spectrometry."Eur.J.Biochem... 267. 5179-5182 (2000)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ikeda,H.: "Absolute configuration of alfatoxin A, a specific inhibitor of aflatoxin production by Aspergillus parasiticus"J.Org.Chem.. 65. 438-444 (2000)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Akasaka,K.: "Absolute configuration of a ceramide with a novel branched-chain fatty acid isolated from the epiphytic dinoflagellate, Coolia monotis."Biosci.Biotech.Biochem.. 64. 1842-1846 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tanaka, I., Matsuoka, S., Murata, M.and Tachibana, K.: "A new ceramide with a novel branched-chain fatty acid isolated from the epiphytic dinoflagellate Coolia monotis."J.Nat.Prod.. 61. 685-688 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Murata, M., Izumikawa, M., Tachibana, K., Fujita, T.and Naoki, H.: "Labeling pattern of okadaic acid from ^<18>O_2 and [^<18>O_2] acetate elucidated by collision-induced dissociation tandem mass spectrometry."J.Am.Chem.Soc.. 120. 147-151 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Murata, M., Matsuoka, S., Matsumori, N., Paul, G.K., Tachibana, K.: "Absolute configuration of amphidinol 3, the first complete structure determination from amphidinol homologues : Application of a new configuration analysis based on the carbon-hydrogen spin-coupling constants."J.Am.Chem.Soc.. 121. 870-871 (1999)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Matsumori, N., Kaneno, D., Murata, M., Nakamura, H.and Tachibana, K.: "Stereochemical determination of acyclic structures based on carbon-proton spin-coupling constants -A method of configuration analysis for natural products."J.Org.Chem.. 64. 866-876 (1999)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Izumikawa, M., Murata, M., Tachibana, K., Fujita, T., Naoki, N.: "^<18>O-labelling pattern of okadaic Acid from H_2^<18>O in dinoflagellate Prorocentrum lima elucidated by tandem mass spectrometry."Eur.J.Biochem.. 267. 5179-5182 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ikeda, H., Matsumotiri, N., Ono, M., Suzuki, A., Isogai, A, Nagasawa, H., Sakuda, S.: "Absolute configuration of alfatoxin A, a specific inhibitor of aflatoxin production by Aspergillus parasiticus"J.Org.Chem.. 65. 438-444 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Akasaka, K., Shichijyukari, S., Matsuoka, S., Murata, M., H.Meguro, H.Ohrui.: "Absolute configuration of a ceramide with a novel branched-chain fatty acid isolated from the epiphytic dinoflagellate, Coolia monotis."Biosci.Biotech.Biochem.. 64. 1842-1846 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 赤坂和昭: "Absolute Configuration of a ceramide with a Novel Branched-chain Fatty Acid Isolated from the Epiphytic Dinoflagellate, Coolia monotis"Biosci. Biorech Biochem. 64. 1842 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] 泉川美穂: "^<18>O-labelling Pattern of Okadaic Acid from H_2 ^<18>O in Dinoflagellate Prorocentrum lima Elucidated by Tandem Mass Spectrometry."Eur.J.Biochem.. 267. 5179-5182 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Matsumori, N. et al.: "Stereochemical determination of acyclic structures based or carbon proton spin-coupling constants-A method of configuration analysis for natural product"J. Org. Chem.. 64. 866-876 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Iijima, K. et al.: "Identification of N^ω-carboxymethylarginine as novel acid-labile advanced glycation and product in collagen"Biochemical. J.. (in press). (2000)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Michio Murata: "Absolute configuration of amphidinol 3,the first complete senucture elucidation from amphidinal nomolognes" Journal of American Chemical Society. 121. 870-871 (1999)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Nobuaki Matsumori: "Sterechemical determination of acyclic structures based on carbon-proton spin-compling constants-A method of condiguration analysis for natural products" The Journal of Organic Chemistry. (印刷中). (1999)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書

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公開日: 1998-04-01   更新日: 2016-04-21  

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