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生命の情報通信機能の解明と生命型情報通信ネットワークの構造デザイン

研究課題

研究課題/領域番号 10555128
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分展開研究
研究分野 情報通信工学
研究機関九州工業大学

研究代表者

岡本 正宏  九州工業大学, 情報工学部, 助教授 (40211122)

研究分担者 山川 烈  九州工業大学, 情報工学部, 教授 (00005547)
江口 至洋  三井情報開発(株), 総合研究所, 所長
尾家 祐二  九州工業大学, 情報工学部, 教授 (50167293)
溝口 佳寛  九州工業大学, 情報工学部, 助教授 (80209783)
久原 哲  九州大学, 大学院・農学研究院, 教授 (00153320)
研究期間 (年度) 1998 – 2000
研究課題ステータス 完了 (2000年度)
配分額 *注記
12,700千円 (直接経費: 12,700千円)
2000年度: 1,700千円 (直接経費: 1,700千円)
1999年度: 3,900千円 (直接経費: 3,900千円)
1998年度: 7,100千円 (直接経費: 7,100千円)
キーワードネットワークトポロジー / 機能素子開発 / フォルトトレラント / 代謝ネットワーク / 輻輳制御 / シミュレータ
研究概要

生物化学の特に代謝系などに代表される非線形反応ネットワーク解析を前提とした統合的な生体内反応系解析システムBEST-KITをCおよびJava言語を用いて開発した。このシステムはクライアント・サーバ型に設計されており、ユーザがブラウザを使ってインターネット経由でホームページにアクセスすると、自動的にJavaアップレットプログラムがダウンロードされ、ユーザのブラウザ上で翻訳・実行される。今年度は、構築したスキームのローカルディスクへの保存と、アップロードの機能を追加し、最終的なマニュアル整備を行った。
URLは、http://www.brs.kyushu-u.ac.jp/〜bestkit.htmlである。
さらに、既存の通信ネットワークのルーティング制御に生体内の情報処理モデルを組み入れるための検討を行った。その結果、酵素反応系のフィードバック制御速度式とホップ数の両方を考慮した適応型ルーティングシステムを考案し、6ノードからなるネットワークシステムを使って、ホップ数のみを考慮したものとの比較を行った。その結果、本研究で設計したアルゴリズムを用いることで、トラフィックの各ノードでの平均化というQOS(Quality of Science)が完成した。具体的には、各ノードの予約パケット、送信パケット、およびノード間の通信速度の情報をある時間間隔で書き換え、それらを基に混雑状況を計算し、隣接ノードに制御パケットを流す。それにホップ数評価を重みつきで評価し、分岐したネットワークでどちらにパケットを流すかが決定される。

報告書

(4件)
  • 2000 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1999 実績報告書
  • 1998 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (9件)

  • [文献書誌] K.Sakuraba et al.: "BEST-KIT : Development of Biochemical Engineering System Analyzing Tool-Kit"Proceedings of 1^<st>. Intl.Conf.on System Biology (ICSB2000). 124-129 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kenji Sakuraba, Jun-ichi Ueno, Masakazu Mori, Kouji Tanaka, Jun Yoshimura, Masahiro Okamoto: "BEST-KIT : Development of Biochemical Engineering System Analyzing Tool-KIT."Proc.of the 1^<th>.Intl.Conf.on System Biology (ICSB2000). 124-129 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yoshitaka Isobe, Tetsuji Nishizono, Jun Yoshimura, Kenji Sakurabe, Masahiro Okamoto: "Development of Web-based Simulation System for Real-time Optimal Control in Bio-process System."Proc.of the 28^<th>.SICE Symp. on Intelligent Systems. (in Japanese). 63-68 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Sakuraba et al.: "BEST-KIT : Development of Biochemical Engineering System Analyzing Tool-Kit"Proceedings of 1^<st>.Intl.Conf.on System Biology (ICSB2000). 124-129 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] D.Tominaga et.al.: "Nonlinear numerical optimization technique based on genetic algorithm for inverse problems"Proc.of the German Conference on Bioinformatics (GCB'99). 1. 127-140 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] M.Okamoto et al.: "Biochemical Neuron: Hardware implementation of functional devices by mimicking The natural intelligence such as metabolic control systems"Computers and Electric.Engng.. 25. 421-438 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] D.Tominaga & M.Okamoto: "Design of canonical model describing complex nonlinear dynamics" Proc.Of7th.Intl.Conf.on computer applications in biotechnol. 1. 85-90 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] 岡本正宏: "ナチュラルインテリジェンスに学ぶ知的通信技術:生体内代謝経路を用いた情報通信の恒常性探索と機能素子の探索" SCAT Technical J.21. 2-11 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] M.Okamoto et al.: "Biochemical Neuron:Hardware implementation of functional devices by mimicking The natural intelligence such as metabolic control systems" Intl.J.Computers and Electric Engng.in press. (1999)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書

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公開日: 1998-04-01   更新日: 2016-04-21  

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