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遺伝子DNAの塩基配列を利用した双口吸虫の虫卵による種の鑑別

研究課題

研究課題/領域番号 10660278
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 基礎獣医学・基礎畜産学
研究機関岩手大学

研究代表者

板垣 匡  岩手大学, 農学部, 助教授 (80203074)

研究期間 (年度) 1998 – 1999
研究課題ステータス 完了 (1999年度)
配分額 *注記
2,800千円 (直接経費: 2,800千円)
1999年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
1998年度: 2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
キーワード双口吸虫 / リボソームDNA / ITS-2 / 虫卵 / 種の鑑別 / PCR-RFLP / ITS2 / Calicophoron calicophorum / Orthocoelium streptocoelium / Homalogaster paloniae / Calicophoron microbothlium / DNA
研究概要

本研究の目的は、1.形態学的には種の識別が困難な双口吸虫卵を遺伝子DNAの塩基配列から識別が可能であるか否かを明らかにすること、2.識別法として、より簡便なPCR-linked RFLP法を確立することである。本年度は2.についての実験を行ない、次の結果を得た。3種類の双口吸虫、すなわち Calicophron calicophorum,Orthocoelium streptocoelium,Homalogaster paloniaeを用いてリボソームDNAのITS-2の塩基配列を決定し、配列の違いを調べた。ITS-2の塩基対数はC.calicophorumおよびO.streptocoeliumで284bp、H.paloniaeで285bpと種間による差異は低かった。また配列の違いについても、C.calicophorumとO.streptocoeliumの間で4.2%、H.paloniaeとO.streptocoeliumで4.6%、H.paloniaeとC.calicophorum5.3%といずれの値も低い値であった。これらの塩基配列に基づいて制限酵素地図を作成したところ、3種類の制限酵素、すなわち、AccII,MflIおよび HhaIの認識部位が3種の双口吸虫で異なっていた。実際に各種双口吸虫の単一虫卵から抽出したゲノムDNAを用いてPCR-RFLPを行ったところ、特に制限酵素AccIIの切断パターンから3種の虫卵は容易に識別することが可能であった。以上のことから、ITS-2領域のDNA塩基配列をマーカーとして利用したPCR-RFLPによって虫卵からの双口吸虫種の鑑別が可能であることが明らかとなった。

報告書

(3件)
  • 1999 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1998 実績報告書
  • 研究成果

    (2件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (2件)

  • [文献書誌] Itagaki, T., N. Tsumagari , K.Tsutsumi: "Discrimination of three amphistome species by PCR-RFLP based on rDNA ITS-2 marker Discrimination of three amphistome species by PCR-RFLP based on rDNA ITS-2 marker"submitteed to Parasitology Research.

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Itagaki, T., Tsumagari, Y. and Tsutsumi, K: "Species differentiation of paramphistomoidea based on PCR-linked RFLP of ITS-2 of ribosomal DNA"Parasitology International. 47 (suppl). (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要

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公開日: 1998-04-01   更新日: 2016-04-21  

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