| 研究課題/領域番号 |
10670192
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
実験病理学
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| 研究機関 | 東京大学 |
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研究代表者 |
佐藤 均 東京大学, 医科学研究所, 助手 (70183829)
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| 研究期間 (年度) |
1998 – 1999
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| 研究課題ステータス |
完了 (1999年度)
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| 配分額 *注記 |
3,000千円 (直接経費: 3,000千円)
1999年度: 1,400千円 (直接経費: 1,400千円)
1998年度: 1,600千円 (直接経費: 1,600千円)
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| キーワード | 1p36転座 / 悪性リンパ腫 / FISH / コスミド / YAC |
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| 研究概要 |
悪性リンパ腫の発症に関わる未知の遺伝子を含むと考えられる1p36領域内に21個のコスミド、5個のP1ファージマーカーをマルチカラーFISH法を用いて整列化し細胞遺伝学レベルの物理的地図を構築した。その配列順序は1pter-D1S1002(cYS142)-D1S1053(cYS1467)-D1Z2-D1S1085(cYS1138)-D1S1013(cYS1299)-D1S1032(cYS1384)-D1S1010(cYS1296)/D1S1047(cYS1429)-D1S96-D1S989(cYS1287)/D1S1131(cYS1234)-NPPA-D1S975(cYS1173)-D1S968(cYS1121)-D1S1062(cYS73)-D1S1092(cYS1148)-D1S1130(cYS1232-D1S1028(cYS1363)-D1S967(cYS1120)-PAX7-D1S1111(cYS1180)-D1S1073(cYS191)-D1S1037(cYS1406)-D1S1112(cYS1181)-D1S1040(cYS144)-D1S112-cen.であった(Satoh et al.,paper in preparation)。このマップをもとに、SCIDマウス内腫瘍細胞株HMS株の1p36転座切断点を同定した。その切断点はD1S96とD1S989(cYS1287)の間に存在し、ALL由来のB細胞株BALL-1とcytogenetic breakpointが一致した(Satoh et al.,paper in preparation)。そこでHMS株の1p36転座切断点を含むゲノム断片を得るために5'側flanking markerであるD1S96P1ファージマーカーをアンカーとするYACクローンを選別する一方で、3'側flanking markerであるD1S989(cYS1287)コスミドマーカー内のユニーク配列をもとにYAC libraryのスクリーニングを行うために、0.3kb BamHI断片のシーケンスを行った。ホモロジー検索の結果、このsequenceの5'側30bpはEST AA650088の3'側30bpと100%塩基配列が一致した。EST配列内にprimerをセットしmicrocell hybridのゲノムDNAを鋳型にしてPCRを施行した結果、このESTが含まれるcDNAは第1染色体上にマップされた。現在は隣接するfragmentの同定を行うとともに、1p36内(約30Mbと推定される)の9.2MbをカバーするCEPHメガYAC8クローンを入手し、これらのクローンが転座点あるいはESTを含むかどうか検討している。
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