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ヒト腫瘍免疫レパトアのプロテオミクスプロフィーリング

研究課題

研究課題/領域番号 10F00121
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分外国
研究分野 人体病理学
研究機関札幌医科大学

研究代表者

佐藤 昇志  札幌医科大学, 医学部, 教授

研究分担者 コーチン ビタリー  札幌医科大学, 医学部, 外国人特別研究員
VITALY Kochin  札幌医科大学, 医学部, 外国人特別研究員
研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
2,900千円 (直接経費: 2,900千円)
2012年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2011年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2010年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
キーワードMHCクラスI / 抗原提示 / 腫瘍抗原ペプチド / 抗原掲示 / ERAAP
研究概要

CD8+T細胞は標的細胞に提示されるペプチド/MHCクラスI複合体を特異的に認識し、これを傷害する。提示される抗原ペプチドは内在性に発現した蛋白に由来する分解産物であるが、これらのペプチドがどのようなメカニズムでつくられ、またどのようなペプチド群(レパートリー)を形成しているのかは未だに不明な点が多い。本プロジェクトではマススペクトロメトリーを利用し実際に提示されてくるMHCクラスIペプチド群の網羅的解析を行う。
当該年度では、
1)HLA-A24特異抗体産生ハイブリドーマよりモノクローナル抗体を精製濃縮し、ペプチド/HLAクラスI複合体を回収するための親和カラムを作成した。
2)約1.5×10^9個のHLA-A24発現するヒト大腸癌細胞株(SW480,Colo320,HCT-15/b2m)より細胞抽出液を準備し、親和カラムでペプチド/HLAクラスI複合体を回収した後、弱酸で結合ペプチドを遊離回収した。
3)分子量3kDaフィルターを通した遊離ペプチドをRP-HPLCによりフラクション化し、それぞれのサンプルをマススペクトロメトリー(ABI/4800plusMALDI_TOF/TOF)により網羅的にシークエンス解析した。
4)SW480,Colo320,HCT-15/b2mからは重複のない186個、コントロールとして用いたHLA-A24発現しないヒト大腸癌細胞株HCT-116からは5個のペプチド配列を検出した(2013年3月現在)。実験の再現性は約80%程度であり、また既知のHLA-A24結合モチーフを利用した親和性解析では前者のペプチド群が有意に高く、後者はいずれもHLA-A24結合モチーフを欠損していた。この結果は、本システムにより高い精度でがん細胞のHLA-A24に提示されるナチュラルペプチドレパートリーを網羅的解析可能であることを示している。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

交付申請書に記載した研究実施計画通りにプロジェクトが進行している。

今後の研究の推進方策

ヒト腫瘍細胞に提示されるペプチド・MHCクラスIレパートリーを網羅的に解析するためのシステムを日本人に最も多い遺伝子多型であるHLA-A24において樹立し、本プロジェクトにおける目標を達成した。今後はこのシステムを応用し、CD8+T細胞応答を惹起する免疫原性を有したナチュラル抗原ペプチドのスクリーニングを行う予定である。

報告書

(3件)
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2012 2011

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] Efficiency of G2/M-related tumor-associated antigen-targeting cancer immunotherapy depends on antigen expression in the cancer stem-like population2012

    • 著者名/発表者名
      Takashi Mori, Satoshi Nishizawa, Yoshihiko Hirohashi, Toshihiko Torigoe, Yasuaki Tamura, Akari Takahashi, Vitaly Kochin, Reona Fujii, Kondo Toru, Mark I. Greene, Isao Hara, Noriyuki Sato
    • 雑誌名

      Experimental and Molecular Pathology

      巻: 92 号: 1 ページ: 27-32

    • DOI

      10.1016/j.yexmp.2011.09.016

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cytotoxic T lymphocytes.Sniping cancer stem cells2012

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiko Hirohashi, Toshihiko Torigoe, Satoko Inoda, Rena Morita, Vitaly Kochin, Noriyuki Sato
    • 雑誌名

      Oncoimmunology

      巻: 1 号: 1 ページ: 123-125

    • DOI

      10.4161/onci.1.1.18075

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] The role of phosphopeptides presented on MHC class I2011

    • 著者名/発表者名
      Vitaly Kochin
    • 学会等名
      日本病理学会
    • 発表場所
      松本市
    • 年月日
      2011-08-05
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] The role of phosphopeptides presented on MHC class I2011

    • 著者名/発表者名
      Vitaly Kochin
    • 学会等名
      日本癌学会
    • 発表場所
      名古屋市
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書

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公開日: 2010-12-03   更新日: 2024-03-26  

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