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生細胞内のRNAポリメラーゼII動態の計測

研究課題

研究課題/領域番号 10F00712
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分外国
研究分野 分子生物学
研究機関大阪大学

研究代表者

木村 宏  大阪大学, 生命機能研究科, 准教授

研究分担者 STASEVICH Timothy  大阪大学, 生命機能研究科, 外国人特別研究員
STASEVICH Timothy J.  大阪大学, 生命機能研究科, 外国人特別研究員
研究期間 (年度) 2010 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
2011年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2010年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
キーワード転写制御 / RNAポリメラーゼ / 細胞核 / 翻訳後修飾 / エピジェネティクス / 遺伝子発現 / 生細胞イメージング / FRAP
研究概要

真核生物のRNAポリメラーゼIIは、遺伝子の転写を担う重要な酵素であり、十数個のサブユニットから構成される。生きた細胞の中で、RNAポリメラーゼがどのように転写開始、伸長、終結を行うのかを明らかにすることは、遺伝子発現制御を理解するうえで非常に重要である。これまでにもGFP融合蛋白質を用いてRNAポリメラーゼIIの生細胞における分子動態が解析されてきたが、個々の報告で異なるモデルと結果が得られておりその全容の解明には至っていない。本研究は、RNAポリメラーゼIIの状態に応じて付加される翻訳後修飾の違いを利用して、そのプロモータ上へのリクルート、転写開始、転写伸長の各ステップに至るキネティクスを明らかにするとともに、ヒストン修飾などクロマチン構造の変化と転写制御の関係を生きた細胞で明らかにすることを目的として行った。昨年度の研究で、Fabを用いた内在性RNAポリメラーゼII検出系を構築し、転写誘導に伴うRNAポリメラーゼIIの動態を計測した。本年度は、その計測結果の定量化を行った。また、ヒストンH3K27のアセチル化の変動も合わせて解析を行った。さらに、定量的ウェスタンブロッティングにより、細胞あたりのRNAポリメラーゼIIの総量と特定のリン酸化状態にある分子数を見積もった。そして、RNAポリメラーゼIIの集積、転写開始、転写伸長のキネティックモデルの構築とシミュレーションを行い、RNAポリメラーゼIIの数と生細胞計測により得られた集積曲線に最もよく適合する数値を導き出した。その結果、遺伝子のプロモータにリクルートされたRNAポリメラーゼIIが、転写開始に至るまでに、複数回の解離と結合を繰り返すこと、また、転写開始から伸長に至る過程は比較的効率が高いこと、また、ヒストンの脱アセチル化が新規転写を抑制する可能性があることなどが示唆された。

報告書

(2件)
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2012 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (5件) 備考 (3件)

  • [雑誌論文] Tracking epigenetic histone modifications in single cells using Fab-based live endogenous modification labeling2011

    • 著者名/発表者名
      Hayashi-Takanaka Y
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res

      巻: 39 号: 15 ページ: 6475-6488

    • DOI

      10.1093/nar/gkr343

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Assembly of the transcription machinery : ordered and stable, random and dynamic, or both?2011

    • 著者名/発表者名
      Timothy J.Stasevich
    • 雑誌名

      Chromosoma

      巻: 120 号: 6 ページ: 533-545

    • DOI

      10.1007/s00412-011-0340-y

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Visualizing live-cell epigenetic modifications of endogenous RNA polymerase II and histones at an activated gene array2012

    • 著者名/発表者名
      Timothy J Stasevich
    • 学会等名
      Visualizing the transcription cycle of endogenous RNA polymerase II in single living cells
    • 発表場所
      San Diego Convention Center (San Diego、アメリカ)
    • 年月日
      2012-02-27
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Visualizing the Transcription Cycle of RNA Polymerase II in Single Living Cells2011

    • 著者名/発表者名
      Timothy J Stasevich
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)(招待講演)
    • 年月日
      2011-12-16
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 蛋白質翻訳後修飾の生細胞イメージング2011

    • 著者名/発表者名
      木村宏
    • 学会等名
      第11回蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク(大阪府吹田市)(招待講演)
    • 年月日
      2011-06-08
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Timing the recruitment, initiation, and elongation of endogenous RNA polymerase II in single living cells2011

    • 著者名/発表者名
      Timothy J Stasevich
    • 学会等名
      International Symposium Physicochemical Field for Genetic Activities
    • 発表場所
      淡路
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Direct quantification of pol II recruitment, initiation, and elongation times in live cells2010

    • 著者名/発表者名
      Timothy J Stasevich
    • 学会等名
      BMB 2010
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.dma.jim.osaka-u.ac.jp/kg-portal/aspi/RX0011D.asp?UNO=17710&page=

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/labs/hiraoka/index.html

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.dma.jim.osaka-u.ac.jp/kg-portal/aspi/RX0011D.asp?UN0=17710&page=

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書

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公開日: 2010-12-03   更新日: 2024-03-26  

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