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選択的オートファジーの積荷認識機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 10J01988
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 構造生物化学
研究機関北海道大学

研究代表者

渡邊 康紀  北海道大学, 大学院・生命科学院, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
2012年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2011年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2010年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
キーワードオートファジー / 選択的オートファジー / 結晶構造解析 / Atg19 / Atg34 / Ams1 / Ape1 / 構造生物学 / 出芽酵母 / 液胞酵素
研究概要

出芽酵母において液胞酵素であるAms1はオートファジーを介して選択的に液胞へ輸送されることが知られており,Ams1の選択的な液胞への輸送にはレセプタータンパク質であるAtg19,Atg34が重要な役割を担っている.本研究では積荷であるAms1と,Atg19,Atg34との複合体の立体構造を明らかにし,選択的オートファジーにおける積荷認識機構を解明することを目的としている.選択的オートファジーは神経変性疾患等の原因となるタンパク質凝集体の分解に関わっており,本研究は将来的に行われる応用研究に対して,重要な基礎研究になるであろう.今年度(H24年度)は昨年度に引き続きAms1の遊離型およびAtg19のAms1結合ドメイン(ABD)との結合型の結晶構造解析を行った.Ams1遊離型の位相は昨年度までに多波長異常分散法により決定しており,構造決定には最終的に2.3A分解能の回折データを用いた.Ams1は対称的な四量体構造を形成しており,その四量体形成には主にN末端ドメインが寄与していた,また,Ams1のAtg19ABD結合型の良質な結晶を得ることに成功し,最終的に3.3A分解能の回折データを用いて,遊離型Ams1の立体構造をモデル分子として分子置換法により構造を決定した.さらにAtg34ABD結合型の結晶化にも成功し,こちらは3.0A分解能で構造決定した.Atg19,Atg34どちらの場合でもABDはAms1四量体に対し四分子結合していた.また,ABDは自身のフォールドの側面を介したユニークな結合様式でAms1と結合していたin vivo,in vitroの変異実験により,オートファジーによるAmslの選択的な液胞への輸送にはこのようなユニークな結合様式が重要であることを明らかにした.

報告書

(3件)
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2012 2011 2010

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (6件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Structure-based analyses reveal distinct binding sites for Atg2 and phosphoinositides in Atg18.2012

    • 著者名/発表者名
      Yasunori Watanabe, Takafumi Kobayashi, Hayashi Yamamoto, Hisashi Hoshida, Rinji Akada, Fuyuhiko Inagaki, Yoshinori Ohsumi, Nobuo N. Noda
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 287 号: 38 ページ: 31681-31690

    • DOI

      10.1074/jbc.m112.397570

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Selective transport of alpha-mannosidase by autophagic pathways : structural basis for cargo recognition by Atg19 and Atg34.2010

    • 著者名/発表者名
      Yasunori Watanabe, Nobuo N.Noda, Hiroyuki Kumeta, Kuninori Suzuki, Yoshinori Ohsumi, Fuyuhiko Inagaki
    • 雑誌名

      The journal of biological chemistry

      巻: 285 ページ: 30026-30033

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 構造に基づいた解析により明らかとなったAtg18のAtg2及びイノシトールリン脂質との異なる結合領域2012

    • 著者名/発表者名
      渡邊 康紀
    • 学会等名
      第85回日本生化学会大会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県)
    • 年月日
      2012-12-14
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Structure of Amsl-Atg34 complex reveals the mechanism of Amsl recognition during selective autophagy2012

    • 著者名/発表者名
      Yasunori Watanabe
    • 学会等名
      6th International Symposium on Autophagy
    • 発表場所
      万国津梁館(沖縄県)
    • 年月日
      2012-10-30
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Structural analysis of LGG-1, an Atg8 homolog in Caenorhabditis elegans2011

    • 著者名/発表者名
      Yasunori Watanabe
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • 年月日
      2011-12-14
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 酵母Cvt経路の構造的基盤2010

    • 著者名/発表者名
      渡邊康紀
    • 学会等名
      平成22年度「タンパク質分解」班会議
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2010-11-16
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] オートファジーに必須なタンパク質群の構造的基盤(構造解析)2010

    • 著者名/発表者名
      渡邊康紀
    • 学会等名
      平成22年度ターゲットタンパク成果発表会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-10-20
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 選択的オートファジー受容体の立体構造から明らかとなった積荷認識の特異性2010

    • 著者名/発表者名
      渡邊康紀
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2010-06-17
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [図書] Mechanism of Cargo Recognition During Selective Autophagy2012

    • 著者名/発表者名
      Yasunori Watanabe, Nobuo N.Noda
    • 総ページ数
      16
    • 出版者
      InTech(in press)
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書

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公開日: 2010-12-03   更新日: 2024-03-26  

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