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転移活性をもつ内在性レトロトランスポゾンのエピジェネティックな制御機構

研究課題

研究課題/領域番号 10J03057
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 植物生理・分子
研究機関国民遺伝学研究所 (2012)
総合研究大学院大学 (2010-2011)

研究代表者

塚原 小百合  国民遺伝学研究所, 総合遺伝研究系, 特別研究員(PD)

研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
2012年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2011年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2010年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
キーワードレトロトランスポゾン / セントロメア / シロイヌナズナ / エピジェネティクス / エピジェネティック
研究概要

シロイヌナズナ近縁種のレトロトランスポゾンTal1は、セントロメア領域特異的に転移する。本年度は、Tal1のセントロメア領域へのターゲッティングに必要な因子を同定することを目的とし、実験を行った。具体的には、Tal1の発現を誘導できるような形質転換体に対して、EMS処理により変異を誘導した後、Tal1の発現を誘導して転移させ、Tal1がセントロメアをターゲッティングできなくなる変異体の選抜を行うことを目的とした。本年度の成果としては、スクリーニングに必要なコンストラクト、および形質転換体の作成までを行った。
<コンストラクトの作成>
(1)エストロゲン誘導Tal1コード領域
EMS処理後にTal1の転移を引き起こすことができるよう、発現誘導可能なTal1コンストラクトを作成した、エストロゲン誘導のベクターにTal1のコード領域(逆転写酵素、インテグレース等転移に必要なタンパクをコードする)をつなぐ。LTR部分は含まないため、この配列自体は転移しない。
(2)Tal1 LTR領域
Tal1の内部配列(タンパクをコードする領域)を除去し、LTRとその内側数百bpのみを含む。転移に必要なタンパクをコードしないため、この配列だけでは転移できないが、タンパク存在下で転移可能。
<形質転換>
上記の2種類のコンストラクトについて、それぞれ別々に形質転換を行い、A. thalianaに導入した。このうち1種類については形質転換体を得ることができた。

報告書

(3件)
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2012 2011 2010

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (6件)

  • [雑誌論文] Centromere-targeted de novo integrations of an LTR retrotransposon in Arabidopsis lyrata2012

    • 著者名/発表者名
      Tsukahara, et al
    • 雑誌名

      Genes & Development

      巻: 26 号: 7 ページ: 705-713

    • DOI

      10.1101/gad.183871.111

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Centromere-targeted de novo integrations of an LTR retrotransposon of Arabidopsis lyrata2012

    • 著者名/発表者名
      Sayuri Tsukahara
    • 学会等名
      77th Cold Spring Harbor Symposium : The Biology of Plants
    • 発表場所
      Cold spring harbor (USA)
    • 年月日
      2012-04-02
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Centromere-Specific Integrations of copia-type Retrotrnaposon in Arabidopsis lyrata2012

    • 著者名/発表者名
      Sayuri Tsukahara
    • 学会等名
      The 8th Okazaki Biology Conference
    • 発表場所
      Okazaki Conference Center (Okazaki)
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] A.lyrataにおけるLTRレトロトランスポゾンのセントロメア特異的分布の形成機構2011

    • 著者名/発表者名
      塚原小百合
    • 学会等名
      日本遺伝学会第83回大会
    • 発表場所
      京都大学
    • 年月日
      2011-09-20
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Centromere-specific Integration of copia-type LTR retrotransposon in A.lyrata2011

    • 著者名/発表者名
      Sayuri Tsukahara
    • 学会等名
      International Botanical Congress 2011
    • 発表場所
      Melbourne Congress and Exhibition Centre (Melbourne)
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] A.lyrataにおけるCOPIA93レトロトランスポゾンのセントロメア特異的分布の形成機構2010

    • 著者名/発表者名
      塚原小百合
    • 学会等名
      日本遺伝学会 第82回大会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 年月日
      2010-09-21
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Mobile endogenous retrotransposons in Arabidopsis thaliana2010

    • 著者名/発表者名
      塚原小百合
    • 学会等名
      International Conference for Arabidopsis Research
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2010-06-08
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書

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公開日: 2010-12-03   更新日: 2024-03-26  

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