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農業水域に生息する魚類個体群の保全遺伝生態学的研究

研究課題

研究課題/領域番号 10J06719
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 農業土木学・農村計画学
研究機関独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構

研究代表者

西田 一也  独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構, 農村工学研究所・資源循環工学研究領域, 特別研究員(PD)

研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
2,800千円 (直接経費: 2,800千円)
2012年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2011年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2010年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
キーワード農業水域 / 淡水魚 / 遺伝的集団構造 / 遺伝的多様性 / 在来・非在来 / 個体群 / 遺伝的構造 / 流域スケール / 近縁外来種
研究概要

当該年度は,全国スケールにおけるアブラハヤ・タカハヤのミトコンドリアDNA(mtDNA)Dloopの解析を行った.解析には33地点281個体の957bpを供した.ハプロタイプ(配列の種類)を基に系統樹を作成して,各地域で得られたハプロタイプ間の類縁関係を把握した.
系統樹はまずタカハヤとアブラハヤに分かれ,両種間の平均塩基置換率は5.8%であった.タカハヤのハプロタイプは地理的にまとまったクレードを形成し,それらのクレード間の平均塩基置換率は1.1~2.4%であった.アブラハヤのハプロタイプにも地理的にまとまったクレードを形成するものが存在したが,なかには地理的にまとまらないハプロタイプもみられた.地理的にまとまったクレード間の平均塩基置換率は1.1~2.6%であった.仮に一般的な動物のミトコンドリアの進化速度とされる100万年当たり2%の塩基置換(Brown et al., 1979)を適用すると,アブラハヤとタカハヤはおよそ290万年前(鮮新世)に分化し,タカハヤとアブラハヤそれぞれのクレードはおよそ55~130万年前(更新世中期~前期)に分化したと推定された.
関東地方で得られたタカハヤのハプロタイプは琵琶湖・淀川水系と同じクレードに属したことから,関東地方のタカハヤは同水系からの移植に由来する。と考えられた.また,アブラハヤについても,地理的に離れた東北地方と琵琶湖・淀川水系のハプロタイプが同じクレードに属したことから,同水系からの移植があった可能性も示唆された.
なお,アブラハヤとタカハヤの共存水域で得たサンプリング個体の中には,ごく少数ではあるが,両種の交雑により生じたと考えられる個体が存在したことから,アブラハヤとタカハヤおよび交雑個体を簡便に判別する方法として,RAPD分析による両種および交雑個体の判別方法を開発した.

報告書

(3件)
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2012 2011

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (5件)

  • [雑誌論文] 流域の連続性と分断がホトケドジョウLefua echigoniaの遺伝的構造・多様性に与える影響分析-ミトコンドリアDNA D-loopの解析-2012

    • 著者名/発表者名
      西田一也, 小出水規行, 竹村武士, 渡部恵司, 森淳
    • 雑誌名

      農村工学研究所技報

      巻: 212 ページ: 177-188

    • NAID

      40019326128

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] DNA解析による関東地方のタモロコの在来・非在来の予備的検討2012

    • 著者名/発表者名
      西田一也, 小出水規行, 渡部恵司, 竹村武士, 森淳
    • 学会等名
      農業農村工学会大会講演会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 年月日
      2012-09-19
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 農村の生き物モニタリング調査研究の動向と具体的事例および今後の課題2012

    • 著者名/発表者名
      西田一也
    • 学会等名
      農業農村工学会大会講演会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 年月日
      2012-09-19
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 多摩川流域におけるホトケドジョウの遺伝的多様性2011

    • 著者名/発表者名
      西田一也, 小出水規行, 竹村武士, 渡部恵司, 森淳
    • 学会等名
      第12回自然環境復元学会
    • 発表場所
      東京都府中市,東京農工大学
    • 年月日
      2011-11-27
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Comparative DNA and morphological analyses with respect to the distribution ranges of an introduced and native Rhynchocypris species in the Tama River Basin, Japan2011

    • 著者名/発表者名
      Kazuya Nishida, Noriyuki Koizumi, Toshiyuki Sato, Yutaro Senga, Takeshi Takemura, Keiji Watabe, Atushi Mori
    • 学会等名
      PAWEES2011 International Conference
    • 発表場所
      National Taiwan University, Taipei Taiwan
    • 年月日
      2011-10-28
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 多摩川流域におけるドジョウの遺伝的構造2011

    • 著者名/発表者名
      西田一也, 小出水規行, 皆川明子, 渡部恵司, 竹村武士, 森淳
    • 学会等名
      平成23年度農業農工学会大会講演会
    • 発表場所
      福岡県博多市,九州大学
    • 年月日
      2011-09-07
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書

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公開日: 2010-12-03   更新日: 2024-03-26  

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