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大環状ポリオキサゾール二量体化合物を用いたDNA四重鎖の可逆的認識とその検出

研究課題

研究課題/領域番号 10J07978
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 生体関連化学
研究機関東京農工大学

研究代表者

飯田 圭介  東京農工大学, 大学院・工学府, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
1,400千円 (直接経費: 1,400千円)
2011年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2010年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
キーワードグアニン四重鎖 / G-quadruplex / タンパク / テロメア / ポリオキサゾール / テロメスタチン
研究概要

グアニンが豊富なDNA配列は、一価のカチオン(Na+,K+など)存在下でG-quadruplex(G4)と呼ばれる特殊な高次構造を形成する。G4は、グアニン同士がG-quartetと呼ばれる平面構造を形成し、さらにそれらがπ-π相互作用により積み重なることで安定化されている。代表的なG4形成配列にはヒトのテロメアに含まれるTTAGGGの繰り返し配列がある。テロメア配列におけるG4の形成はテロメア伸長酵素であるテロメラーゼの阻害、およびテロメア維持機構を担うテロメア結合タンパクの解離により、癌細胞をアポトーシスへと導くことが知られている。G4の生体内における形成の有無およびG4の生物学的機能を調査するためのツールとして、in vitroにおいてG4に強力かつ選択的に結合するG4リガンドが求められている。
我々は昨年度までにG4認識部位を二点持つG4リガンドとして大環状ヘキサオキサゾール二量体を報告している。今年度は、生体内において形成されるG4を強力に安定化することを目的として長鎖テロメアDNAとの相互作用解析を行った。具体的には、G4を一つ形成する24残基、二つ形成する48残基、三つ形成する72残基、四つ形成する96残基のDNAについてそのG4結合能を評価することとした。合成した各種化合物とテロメアDNAとの相互作用をCDスペクトル解析、電気泳動実験によりそれぞれ解析を行った結果、この新規6OTD二量体は、長鎖テロメアG4と相互作用し、分子内で連続的にハイブリッド型のG4構造を形成していることが明らかとなった。さらにCD融解実験を行った結果、長鎖テロメアG4をに対して極めて強力に結合することを明らかとした。6OTD二量体を用いたテロメアG4に結合するタンパクの同定へと展開し、G4結合タンパク質の精製・同定法を確立する。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

生体内において形成されるG4を強力に安定化することを目的として長鎖テロメアDNAとの相互作用解析を行うことができたため。具体的には、G4を一つ形成する24残基、二つ形成する48残基、三つ形成する72残基、四つ形成する96残基のDNAについてそのG4結合能を評価した

今後の研究の推進方策

6OTD二量体が長鎖テロメアG4をに対して極めて強力に結合することが明らかになったので、今後6OTD二量体を用いたテロメアG4に結合するタンパクの同定へと展開し、G4結合タンパク質の精製・同定法を確立する。

報告書

(2件)
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2012 2011 2010

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (6件)

  • [雑誌論文] Design and Synthesis of G-Quadruplex Ligands Bearing Macrocyclic Hexaoxazoles with Four-Way Side Chains2012

    • 著者名/発表者名
      K.Iida, S.Majima, T.Ohtake, M.Tera, K.Shin-ya, K.Nagasawa
    • 雑誌名

      Heterocycles

      巻: Vol.84 号: 1 ページ: 401-411

    • DOI

      10.3987/com-11-s(p)88

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A Caged Ligand for a Telomeric G-Quadruplex2012

    • 著者名/発表者名
      T.Nakamura, K.Iida, M.Tera, K.Shin-ya, H.Seimiya, K.Nagasawa
    • 雑誌名

      ChemBioChem

      巻: Vol.13 号: 6 ページ: 774-777

    • DOI

      10.1002/cbic.201200013

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Design and Synthesis of Telomestatin Derivatives Containing Methyl Oxazole and Their G-Quadruplex Stabilizing Activities2010

    • 著者名/発表者名
      S.Majima, M.Tera, K.Iida, Shin-ya, K.Nagasawa
    • 雑誌名

      Heterocycles

      巻: Vol.82 ページ: 1345-1357

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] グアニン四重鎖構造を安定化する大環状ポリオキサゾール化合物類の合成と機能評価2010

    • 著者名/発表者名
      寺正行、飯田圭介、新家一男、長澤和夫
    • 雑誌名

      有機合成化学協会誌

      巻: Vol.69 ページ: 129-139

    • NAID

      10027916398

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Synthesis of macrocyclic hexaoxazole (60TD) dimers, containing guanidine and amine functionalized side chains, and an evaluation of their telomeric G4 stabilizing properties2010

    • 著者名/発表者名
      K.Iida, M.Tera, T.Hirokawa, K.Shin-ya, K.Nagasawa
    • 雑誌名

      Journal of Nucleic Acids

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Visualization of G-quadruplexes by using a BODIPY-labeled Macrocyclic Heptaoxazole2010

    • 著者名/発表者名
      M.Tera, K.Iida, K.Ikebukuro, H.Seimiya, K.Shin-ya, K.Nagasawa
    • 雑誌名

      Organic & Biomolecular Chemistry

      巻: Vol.8 ページ: 2749-2755

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 大環状ヘキサオキサゾール二量体化合物と長鎖テロメアG-quadruplexとの相互作用解析2012

    • 著者名/発表者名
      飯田圭介、寺正行、広川貴次、新家一男、長澤和夫
    • 学会等名
      日本化学会第92春季年会
    • 発表場所
      慶應義塾大学日吉キャンパス・矢上キャンパス
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 長鎖テロメアG-quadruplexを安定化する大環状ヘキサオキサゾール誘導体の合成とその活性評価2012

    • 著者名/発表者名
      飯田圭介、寺正行、広川貴次、新家一男、長澤和夫
    • 学会等名
      日本薬学会第132年会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Synthesis and Evaluation of Macrocyclic Hexaoxazole Dimers as G-quadruplex Ligands2011

    • 著者名/発表者名
      K.Iida, M.Tera, K.Shin-ya, K.Nagasawa
    • 学会等名
      8th AFMC International Medicinal Chemistry Symposium "Frontier of Medicinal Science" (AIMECS11)
    • 発表場所
      KEIO PLAZA HOTEL TOKYO
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Synthesis of macrocyclic hexaoxazole dimers as a G-quadruplex binder2011

    • 著者名/発表者名
      K.Iida, M.Tera, K.Shin-ya, K.Nagasawa
    • 学会等名
      Third International Meeting on G-Quadruplex and G-assenmbly
    • 発表場所
      Sorrento, Italy at the Grand Hotel Vesuvio
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Structure-activity relationship studies of macrocyclic hexaoxazole (60TD) dimers and an evaluation of their telomeric G4 stabilizing properties2010

    • 著者名/発表者名
      K.Iida, M.Tera, K.Shin-ya, T.Hirokawa, K.Nagasawa
    • 学会等名
      International chemical congress of pacific basin societies
    • 発表場所
      Tokyo, Japan
    • 年月日
      2010-12-16
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] テロメスタチン誘導体を用いたグアニン四重鎖構造の安定化と可視化に関わる研究2010

    • 著者名/発表者名
      寺正行、飯田圭介、土井隆行、清宮啓之、新家一男、長澤和夫
    • 学会等名
      第52回天然有機化合物討論会
    • 発表場所
      グランシップ(静岡コンベンションアーツセンター)
    • 年月日
      2010-09-30
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書

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公開日: 2010-12-03   更新日: 2024-03-26  

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