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経口標識化DNAを用いた組換え反応の速度論的解析

研究課題

研究課題/領域番号 11146210
研究種目

特定領域研究(A)

配分区分補助金
研究機関大阪大学

研究代表者

増井 良治  大阪大学, 大学院・理学研究科, 助手 (40252580)

研究期間 (年度) 1999
研究課題ステータス 完了 (1999年度)
配分額 *注記
1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
1999年度: 1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
キーワードRecA / 相同的組換え / 共鳴エネルギー転移 / 蛍光DNA
研究概要

遺伝情報の編成やDNA修復において重要である相同的組換え反応は,細菌ではRecA蛋白質が担っている。組換え反応の全容解明には,各々の素反応の詳細な解析,特に速度論的な解析が必要である。しかし,RecAの場合,反応過程を経時的に研究した報告はほとんどない。本研究では,複数の蛍光プローブを導入したDNAを用いて,蛍光の共鳴エネルギー転移を利用したDNA鎖の相互の配置の動的変化すなわち組換えの速度を推定し,組換え反応過程の経時的な変化を追跡することを試みた。まず,標識可能なアミノ基やチオール基を持つデオキシヌクレオチドを用いて二種類の蛍光標識化DNA(50-mer)を人工的に合成した。一方は分子中央にテトラメチルローダミン(R)を,もう1つは5端にフルオレセイン(F),3'にテキサスレッド(T)を導入した。大腸菌RecA蛋白質は,すでに構築してある大量発現系を用いて調製した。次に,R一本鎖DNAとRecAの相互過程を蛍光スペクトルを用いて測定したところ,少なくとも2つの結合相が観察された。このR-一本鎖DNA-RecA複合体にF/T-二本鎖DNAを加え,Rの励起光で励起したところ有意な蛍光スペクトル変化が見られた。反応前後の差スペクトルは,ほぼTのものに相当した。さらに,Tの蛍光波長で時間変化を測定したところ,大きく2つの相が見られた。このように,今回構築した測定系でRecA-一本鎖DNA複合体と二本鎖DNAとのペアリング反応を,蛍光エネルギー転移を利用して実際に測定できることが示された。

報告書

(1件)
  • 1999 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (6件)

  • [文献書誌] 増井良治: "好熱菌の全ゲノム配列決定とその意義"蛋白質 核酸 酵素. 44(2). 165-170 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Shibata Akihiko: "Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of a DNA excision repair enzyme, UvrB, from Thermus thermophilus HB8"Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr.. 55(3). 704-705 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Noriko Nakagawa: "Crystal structure of Thermus thermophilus HB8 UvrB protein, a key enzyme of nucleotide excision repair"The Journal of Biochemistry. 126(6). 986-990 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Yuri Kil: "Efficient strand transfer by the RadA recombinase from the hyperthermophilic archaeon Desulfurococcus amylolyticus"Journal of Bacteriology. 182(1). 130-134 (2000)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Maria Spies: "The RadA protein from a hyperthermophilic archaeon Pyrobaculum islandicum is a DNA-dependent ATPase that shows two disparate catalytic modes, with a transition temperature at 75℃"European Journal of Biochemistry. 267(4) (in press). (2000)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Atsushi Yamagata: "Interaction of UvrA and UvrB proteins with a fluorescent single-stranded DNA"Journal of Biological Chemistry. 275 (in press). (2000)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書

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公開日: 1999-04-01   更新日: 2016-04-21  

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