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大腸菌呼吸鎖電子伝達酵素複合体の構造生物学による全体像の解明

研究課題

研究課題/領域番号 11169209
研究種目

特定領域研究(A)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関東京大学

研究代表者

茂木 立志  東京大学, 大学院・理学系研究科, 助手 (90219965)

研究期間 (年度) 1999 – 2000
研究課題ステータス 完了 (2000年度)
配分額 *注記
3,300千円 (直接経費: 3,300千円)
2000年度: 1,500千円 (直接経費: 1,500千円)
1999年度: 1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
キーワード好気的呼吸鎖 / 超分子複合体 / 構造生物学 / 分子共生 / ユビキノン / 金属中心 / 大腸菌 / 末端酸化酵素 / 呼吸鎖 / 酵素複合体 / FTIR / 膜結合型マシーナリー / コハク酸水素酵素
研究概要

1)酸化還元中心を結合するサブユニットの構造ドメインに着目し、好気的呼吸鎖電子伝達系の4つの超分子複合体、すなわち、NADH脱水素酵素(複合体I)、コハク酸脱水素酵素(複合体II)、チトクロムbc_1複合体(複合体III)、末端酸化酵素(複合体IV)が分子共生と呼ぶべきダイナミックな再編成過程を経て進化してきたことを明らかにした。
2)大腸菌チトクロムbo型ユビキノール酸化酵素を末端酸化酵素のモデル系として、サブユニットIの高スピンヘムーCu_B複核中心で、高スピンヘムに結合した酸素分子の0=0結合が解裂してオキシ中間体からフェリル中間体ができる過程で、Tyr288残基が酸塩基触媒として働いて自らはプロトンと電子を供給して中性ラジカルになったパーフェリル中間体を経由することを明らかにした。
更に、1-^<13>C-Tyrや4-^<13>C-Tyrで標識した酵素標品を用い、酸素還元反応場での蛋白微細構造変化を解析し、完全酸化型から完全還元型への変換過程で、チロシン残基側鎖のプロトン化は観察されず、Kチャネル末端にあるTyr288残基の主鎖構造がGlu286側鎖の水素結合変化と平行して変化することを明らかにし、サブユニットIのヘリックスVIの構造変化が酵素の還元に伴うチャネルの機能制御に重要な役割を果していることを示唆する結果を得た。
3)X線構造解析では同定できないチトクロムbo型ユビキノール酸化酵素の2つのキノン酸化還元部位の構造を解明するために2種類のアジドユビキノンを合成し、光親和性標識実験系を構築した。
4)パルスラジオリシス法で、Cu_B中心がヘム間の電子移動に重要な役割を果すことを示した。
5)グリセロール密度平衡遠心やヒドロキシアパタイトHPLCステップを従来の精製法に加え、結晶化条件の改善に不可欠な無傷の複合体純度を向上させることが可能になった。

報告書

(2件)
  • 2000 実績報告書
  • 1999 実績報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (18件)

  • [文献書誌] Uchida,T.: "Resonance Raman studies of oxo intermediates in the reaction of pulsed cytochrome bo with hydrogen peroxide."Biochemsitry. 39. 6669-6678 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Kobayashi,K.: "Transient formation of ubisemiquinone radical and subsequent electron transfer processes in the Escherichia coli cytochrome bo revealed by pulse radiolysis."Biochemsitry. 39. 15620-15625 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Tsubaki,M.: "Probing molecular structure of dioxygen reduction site of bacterial quinol oxidases through ligand binding to the redox metal centers."J.Inorg.Biochem.. 82. 19-25 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] 平田肇: "シリーズ・ニューバイオフィジックスII第3巻ポンプとトランスポーター"共立出版. 240 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] 吉田賢右: "シリーズ・バイオサイエンスの新世紀第7巻生体膜のエネルギー装置"共立出版. 211 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] H. Miyoshi: "Characterization of the ubiquinol oxidation sites in cytochromes bo and bd from Escherichia coli using aurachin C analogues"J. Biochem.. 125. 138-142 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] E. Muneyuki: "Time-resolved measurements of photovoltage generation by bacteriorhodopsin and halorhodopsin adsorbed on a thin polymer film"J. Biochem.. 125. 270-276 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Y. Yamazaki: "Fourier-transform infrared studies on conformational changes of bd-type ubiquinol oxidase from Escherichia coli upon photoreduction of the redox metal centers"J. Biochem.. 125. 1131-1136 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] M. Tsubaki: "Fluoride-binding to the Escherichia coil bd-type ubiquinol oxidase studied by visible absorption and EPR spectroscopies"J. Biochem.. 126. 98-103 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Y. Yamazaki: "Effects of amino substitutions on redox-induced conformational changes of the Escherichia coli o-type ubiquinol revealed by Fourier-transform infrared spectroscopy"J. Biochem.. 126. 194-199 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] M. Tsubaki: "Azide- and cyanide-bindings to the Escherichia coli bd-type ubiquinol oxidase studied by visible absorption, EPR and FTIR spectroscopies"J. Biochem.. 126. 510-519 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] K. Sakamoto: "Defining structural domain of subunit II of the heme-copper terminal oxidase using chimeric enzymes from the Escherichia coli bo-type ubiquinol oxidase and the thermophilic Bacillus caa_3-type cytochrome c oxidase"FEBS Lett.. 126. 934-939 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] M. Tsubaki: "Fourier-transform infrared studies on azide binding to the binuclear center of the Escherichia coli bo-type ubiquinol oxidase"FEBS Lett.. 449. 191-195 (4999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] T. Mogi: "Role of a bound ubiquinone on reactions of the Escherichia coli cytochrome bo with ubiquinol and dioxygen"FEBS Lett.. 457. 61-64 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] K. Kobayashi: "Pulse radiolysis studies on electron transfer processes in cytochrome bd-type ubiquinol oxidase from Escherichia coli"Biochemistry. 38. 5913-5917 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] P. Hellwig: "The vibrational modes of ubiquinone in cytochrome bo_3 identified by FTIR difference spectroscopy and specific ^<13>C labeling"Biochemistry. 38. 14683-14689 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] 茂木立志: "バクテリオロドプシンの結晶構造とプロトン輸送機構"蛋白質核酸酵素. 41. 51-56 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] 茂木立志: "オキシダーゼ:酸素呼吸を支える分子装置の分子進化と作動機構"ニューバイオフィジックス、第3巻イオンポンプとトランスポーター(平田肇、茂木立志編)、共立出版. 3(印刷中). (2000)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書

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公開日: 1999-04-01   更新日: 2018-03-28  

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