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集合系マシーナリーのモデル細胞としての高度好熱菌T.thermophilus

研究課題

研究課題/領域番号 11169224
研究種目

特定領域研究(A)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関大阪大学

研究代表者

倉光 成紀  大阪大学, 大学院・理学研究科, 教授 (60153368)

研究分担者 増井 良治  大阪大学, 大学院・理学研究科, 助手 (40252580)
研究期間 (年度) 1999 – 2000
研究課題ステータス 完了 (2000年度)
配分額 *注記
8,200千円 (直接経費: 8,200千円)
2000年度: 3,200千円 (直接経費: 3,200千円)
1999年度: 5,000千円 (直接経費: 5,000千円)
キーワードMutM / MutY / UvrA / UvrB / UvrC / UvrD / MutS / MutL / 高度好熱菌 / Thermus thermophilus HB8 / 構造生物学 / 構造ゲノム科学 / ゲノム解析 / X線結晶解析 / DNA修復系 / アミノ酸代謝系
研究概要

高度好熱菌Thermus thermophilus HB8のゲノム解析をほぼ完了した(理化学研究所との共同研究)。その結果によれば,T.thermophilus HB8のゲノムサイズは2Mbpで,約2000個の遺伝子からなり,DNA修復に関与する酵素は約50種類存在することが明らかになった。これまでに,塩基除去修復系のMutM,MutY,EndoV,ヌクレオチド除去修復系のUvrA,UvrB,UvrC,UvrD,組換え修復系のRecA蛋白質,その他,DNA polymerase I,DNA ligase等についての,遺伝子のクローニング・蛋白質の量産化・精製・結晶化を行った。さらに,UvrB,MutM,photolyase,DNA polymerase Iについては,立体構造解析を行った。
その中で,UvrA,UvrB,UvrCの他,ミスマッチ修復系のMutS,MutLは,集合系マシーナリーを形成していた。
また,酸化傷害修復系のMutMとMutYは,酸化された塩基を修復するための基質特異性が相補し合っていることが示唆された。MutMについては立体構造解析を完了したので,その結果を基にして,酸化傷害DNA基質との反応機構を推定することができた。それを基にして,触媒基と考えられる2つのグルタミン酸やリジン残基を置換した変異型酵素を作製し,傷害DNAを含む基質との反応を解析した結果,より詳細な反応機構が明らかにすることができた。

報告書

(2件)
  • 2000 実績報告書
  • 1999 実績報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (13件)

  • [文献書誌] Nakai,T.: "Structure of Thermus thermophilus HB8 Aspartate Aminotransferase and Its Complex with Maleate"Biochemistry. 38(8). 2413-2424 (1999)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Hoseki,J.: "Directed Evolution of Thermostable Kanamycin-Resistant Gene Products in an Extremely Thermophilic Bacterium, Thermus thermophilus"J.Biochem.. 126(5). 951-956 (1999)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Nakagawa,N.: "Crystal Structure of Thermus thermophilus HB8 UvrB Protein, A Key Enzyme of Nucleotide Excision Repair"J.Biochem.. 126(6). 986-990 (1999)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] 倉光成紀: "好熱菌全ゲノムの配列決定とその意義"蛋白質核酸酵素. 44(2). 165-170 (1999)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Sugahara,M.: "Crystal Structure of a Repair Enzyme of Oxidatively-Damaged-DNA, MutM (Fpg), from an Extreme Thermophile, Thermus thermophilus HB8"EMBO J.. 19(15). 3857-3869 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Yokoyama,S.: "Structural Genomics Projects in Japan"Nature Struct.Biol.. 7. 943-945 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Shibata, A.: "Crystallization and Preliminary X-Ray Diffraction Studies of a DNA Excision Repair Enzyme, UvrB, from Thermus thermophilus"Acta Cryst.. D55. 1-3 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Nakai, T.: "Structure of Thermus thermophilus HB8 Aspartate Aminotransferase and Its Complex with Maleate"Biochemistry. 38・8. 2413-2424 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Hoseki, J.: "Directed Evolution of Thermostable Kanamycin-Resistant Gene Products in an Extremely Thermophilic Bacterium, Thermus thermophilus"J. Biochem.. 126・5. 951-956 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Nakagawa, N.: "Crystal Structure of Thermus thermophilus HB8 UvrB Protein, A Key Enzyme of Nucleotide Excision Repair"J. Biochem.. 126・6. 986-990 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Sugahara, M.: "Crystallization and Preliminary X-ray Crystallography of T. thermophilus MutM Involved in Repairs of Oxidative DNA Damage"J. Biochem.. 127・1. 9-11 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] 増井良治,倉光成紀: "好熱菌全ゲノムの配列決定とその意義"蛋白質核酸酵素. 44・2. 165-170 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] 倉光成紀: "実験室の小さな生きものたち"羊土社. 4 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書

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公開日: 1999-04-01   更新日: 2018-03-28  

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