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分子間相互作用の可視化と細胞内分子定量イメージング

研究課題

研究課題/領域番号 11242206
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関国立遺伝学研究所

研究代表者

徳永 万喜洋  国立遺伝学研究所, 構造遺伝学研究センター, 教授 (00192659)

研究分担者 椎名 伸之  国立遺伝学研究所, 構造遺伝学研究センター, 助手 (30332175)
安永 卓生  九州工業大学, 情報工学部, 助教授 (60251394)
後藤 由季子 (後藤 由起子)  東京大学, 分子細胞生物学研究所, 助教授 (70252525)
仁木 宏典  放射線アイソトープセンター, 助教授 (70208122)
木村 宏  京都大学, 先端領域融合医学研究機構, 教授 (30241392)
研究期間 (年度) 1999 – 2003
研究課題ステータス 完了 (2003年度)
配分額 *注記
180,000千円 (直接経費: 180,000千円)
2003年度: 32,300千円 (直接経費: 32,300千円)
2002年度: 29,800千円 (直接経費: 29,800千円)
2001年度: 37,400千円 (直接経費: 37,400千円)
2000年度: 39,100千円 (直接経費: 39,100千円)
1999年度: 41,400千円 (直接経費: 41,400千円)
キーワード1分子イメージング / 1分子ナノテクノロジー / 薄層斜光照明法 / 蛍光顕微鏡 / 細胞質核間分子輸送 / 定量的画像解析 / 分子機構定量解析 / 対物レンズ型全反射照明法 / 低角斜光照明法 / 細胞質核間輸送 / 対物レンズ型全反射照明 / 共焦点顕微鏡 / 核輸送
研究概要

細胞内部の蛍光1分子イメージングを、薄層斜光照明法を用いて行い、細胞内部での分子数と分子間相互作用を定量的に解析した。細胞質・核間輸送を担うImportin beta分子と核膜孔複合体との相互作用に関し、1分子と核膜孔1個との蛍光強度比から、結合分子数を定量した。濃度を変え、核膜孔との結合分子数・結合定数を求めた。その結果、2種類の結合部位があることが見つかり、弱い結合部位は、最大結合分子数110(+60,-40)個、解離定数70(+50,-30)nM、強い結合部位は、最大結合分子数7(+6,-4)個、解離定数0.3(+0.2,-0.1)nMであった。核膜孔複合体の構造には8回対称性があるので、強い結合部位の個数は、8個(もしくは16個)と推定される。1分子像の経時変化から、Importin betaと核膜孔複合体の結合時間(滞在時間)を求め、弱い結合が約1秒、強い結合が6秒以上、輸送中が約3秒であった。
核内移行の輸送活性を蛍光像から直接計測したところ、細胞レベルの核内輸送速度と、以上の1分子計測で求めた値とがよく一致し、1分子解析による新しい手法が有用であることを示した。
強い結合部位は核膜孔通過と密接な関係にあり、弱い結合部位はたくさんの分子を結合させて輸送される分子を集める役割を果たしていると考えられる。相互作用の強弱および変化により選択的な通過を実現しており、たくさんの分子を集めることにより通過速度を速めているという、新しいモデルを提案した。

報告書

(5件)
  • 2003 実績報告書
  • 2002 実績報告書
  • 2001 実績報告書
  • 2000 実績報告書
  • 1999 実績報告書
  • 研究成果

    (52件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (52件)

  • [文献書誌] Hirakawa Y: "Observation and analysis of single DNA nano-kinetics by pin-fiber video scope"Analyst. 128. 676-680 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 徳永万喜洋: "生きた細胞内でうごめく「分子の振舞い」をダイナミックな映像で可視化"ダイヤモンド・ループ ダイヤモンド社. 4. 38 (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Yamaichi, Y.: "migS, a cis-acting site that affects bipolar positioning of oriC on the Escherichia coli chromosome"EMBO J.. 23(1). 221-233 (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Tsuruta, F: "JNK promotes Bax translocation to mitochondria through phosphorylation of 14-3-3 proteins"EMBO J. (in press). (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Hirabayashi, Y: "The Wnt-beta-catenin pathway directs neuronal differentiation of cortical neural precursor cells"Development. (in press). (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Higuchi, M: "The phosphatidylinositol-3 kinase (PI3K) -Akt pathway suppresses neurite branch formation in NGF-treated PC12 Cells"Genes to Cells. 8. 657-669 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Miyagi, S: "The sox-2 regulatory regions display their activities in two distinct multipotent stem cells"Mol.Cell.Biol. (in press).

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Suzawa, M: "Cytokines suppress adipogenesis and PPAR-gamma function through the TAK1/TAB1/NIK cascade"Nat.Cell Biol.. 5. 224-230 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Fujishiro, M: "Three Mitogen-Activated Protein kinases inhibit Insulin signaling by different mechanisms in 3T3-L1 adipocytes"Mol.Endocrinology. 17. 487-497 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Sakoda, H: "Differing roles of Akt and SGK in glucose metabolism, DNA synthesis and oncogenic activity"J.Biol.Chem. 278. 25802-25807 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Katome, T: "Use of RNA-interference-mediated gene silencing and adenoviral overexpression to elucidate the roles of AKT/PKB-isoforms in insulin actions"J.Biol.Chem. 278. 28312-28323 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Kimura H: "Measuring histone and polymerase dynamics in living cells."Methods Enzymol.. 375. 381-393 (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Muraki, M: "Manipulation of alternative splicing by a newly developed inhibitor of Clks"J.Biol.Chem. (in press). (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Inoue, K: "TNF alpha-induced ATF3 expression is bidirectionally regulated by the JNK and ERK pathways in vascular endothelial cells"Genes Cells. 9. 59-70 (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Tatsumi, Y: "The ORC1 cycle in human cells : I. Cell cycle-regulated oscillation of human ORC1"J.Biol.Chem. 278. 41528-41534 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Duringer, C: "HAMLET interacts with histones and chromatin in tumor cell nuclei"J.Biol.Chem. 278. 42131-42135 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Hori, T: "Dynamic behavior of Nuf2-Hec1 complex that localizes to centrosome and centromere and is essential for mitotic progression in vertebrate cells"J.Cell Sci.. 116. 3347-3362 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Suzuki, H: "Involvement of MKK6 in TCRαβ^<int>CD69^<lo> : a target population for apoptotic cell death in thymocytes"FASEB J.. 17. 1538-1540 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Ishimi, Y: "Enhanced expression of Mcm proteins in cancer cells derived from uterine cervix"Eur.J.Biochem. 279. 1089-1101 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Kudo, Y: "Quantifying the syncytialisation of human placental trophoblast BeWo cells grown in vitro"Biochim.Biophys.Acta. 1640. 25-31 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 木村 宏: "時間軸にわたる染色体機能の変化"医学のあゆみ. 208. 890-894 (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 木村 宏: "四角いスタンプ"細胞工学. 22. 1041 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 木村 宏: "細胞核構造と機能のストカスティックな制御"生物物理. 43. 234-239 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 木村 宏: "クロマチンのダイナミクス"生体の科学. 54. 166-170 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 徳永万喜洋: "生物物理ハンドブック(石渡信一・桂勲・桐野豊・美宅成樹編)"朝倉書店(印刷中).

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 増山典久: "実験医学 増刊"羊土社. 258-264 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 樋口麻衣子: "実験医学"羊土社. 2499-2504 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 木村 宏: "細胞核のダイナミクス(米田悦啓・竹安邦夫編)"シュプリンガーフェアラーク東京(印刷中).

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Hirakawa, Y.: "Analysis of the Nano-Kinetic Movement of a Single DNA by a Pin-Fiber Video Scope"Analytical Sciences. 18. 1293-1294 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Fkuzawa A.: "Single Molecule Measurement of Elasticity of Serine-Glutamate-and Lysine-Rich Repeats of Invertebrate Connectin Reveals That Its Elasticity Is Caused Entropically by Random Coil Structure"J.Mus.Res.Cell Mot.. (in press).

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 徳永 万喜洋: "「見えなかったものを観る-無理と言われたテーマに挑戦-」"ロマン探究""Science & Technorogy Journal. 11・10. 52-53 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Ogawara, Y: "Akt enhances Mdm2-mediated ubiquitination and degradation of p53"J.Biol.Chem.. 277. 21843-21850 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Tsuruta, F.: "The PI3K-Akt pathway suppresses Bax translocation to mitochondria"J.Biol.Chem.. 277. 14040-14047 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Shinohara, M: "SWAP-70 is a guanine nucleotide exchange factor that mediates signaling of membrane ruffling"Nature. 416. 759-763 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Yoshida, T.: "Archaeal Group II Chaperonin Mediates Protein Folding in the cis-Cavity Without a Detachable GroES-like Co-chaperonin"J.Mol.Biol. 315(1). 73-85 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 徳永 万喜洋: "実験医学別冊"バイオイメージングでここまで理解(わか)る""表面のみを高画質に観察できる全反射蛍光顕微鏡法. 104-113 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 徳永 万喜洋: "生物物理ハンドブック"アクチン・ミオシン分子モーター系(印刷中).

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 安永 卓生: "機器分析"透過型電子顕微鏡法. 247-260 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 安永 卓生: "これからの大学等研究施設 生命科学編"電子顕微鏡とその施設. 8-3-8-6 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 安永 卓生: "「第6回シミュレーション・サイエンス・シンポジウム」及び核融合科学研究所共同研究「大型シミュレーション研究」合同研究会集録集"分子動力学を用いた、電子顕微鏡三次元像からの原子モデル構築へ向けて(印刷中).

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Yanagida T.: "Single-motor mechanics and models of the myosin motor."Philos.Trans.R.Soc.Lond.B. 355. 441-447 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Graves,J.D.: "Both phosphorylation and caspase-mediated cleavage contribute to regulation of the Ste-20-like Protein Kinase Mst1 during CD95/Fas-induced apoptosis."J.Biol.Chem.. (in press). (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Fujishiro,M.: "MKK6/3 and p38 MAPK Pathway Activation is not Necessary for Insulin-Induced Glucose Uptake, but Regulates Glucose Transporter Expression."J.Biol.Chem.. (in press). (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Ura,S.,Masuyama,N.: "MST1-JNK promotes apoptosis via caspase-dependent and -independent pathways."Genes to Cells.. (in press). (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] 喜多村和郎: "ミオシン頭部1分子はATP分解1回で複数ステップ動く:1分子補足・操作によるルースカップリングの直接証拠"生物物理. 40(2). 89-93 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] 徳永万喜洋: ""新生物物理の最前線"日本生物物理学会 編"講談社ブルーバックス. (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] K.Kitamura: "A single myosin head moves along an actin filament with regular steps of 5.3 nenometers"Nature. 379. 129-134 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] 廣島通夫: "分子間相互作用のイメージング -分子間力顕微鏡と1分子技術-"電子顕微鏡. 34(2). 151-153 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] 徳永万喜洋: "ミオシン1分子は1個のATP分解の間に複数ステップで働く"蛋白質・核酸・酵素. 44(11). 1584-1589 (1999)

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      1999 実績報告書
  • [文献書誌] 徳永万喜洋: "1分子技術で観るミオシンの分子メカニズム"細胞工学. 18(11). 1641-1647 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] 喜多村和郎: "ミオシン頭部1分子はATP分解1回で複数ステップで働く"生理物理. (印刷中). (2000)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] 船津高志: "生命科学を拓く新しい光技術"共立出版. 186 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書

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公開日: 1999-04-01   更新日: 2018-03-28  

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