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プロリンを重要成分として含む一次構造制御型ポリペプチドの三次元構造の解析

研究課題

研究課題/領域番号 11450373
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 高分子構造物性(含繊維)
研究機関大阪府立大学

研究代表者

林 壽郎  大阪府立大学, 先端科学研究所, 教授 (90026089)

研究分担者 平野 義明  大阪工業大学, 工学部, 助教授 (80247874)
岡 勝仁  大阪府立大学, 先端科学研究所, 助教授 (70203966)
研究期間 (年度) 1999 – 2001
研究課題ステータス 完了 (2001年度)
配分額 *注記
12,800千円 (直接経費: 12,800千円)
2001年度: 2,700千円 (直接経費: 2,700千円)
2000年度: 2,700千円 (直接経費: 2,700千円)
1999年度: 7,400千円 (直接経費: 7,400千円)
キーワード周期性ポリペプチド / プロリン / コンホメーション / 分子力学 / ペプチド合成 / 円二色性 / ヘリックス / 生体材料 / 分子力学計算 / 二次構造 / β-ヘリックス / 周期性タンパク質 / 合成ポリペプチド / 三次元構造解析 / ヘリックス構造 / 核磁気共鳴スペクトル / 円偏光二色性 / 赤外吸収スペクトル / 反復アミノ酸配列
研究概要

1)アミノ酸配列とコンホメーションの対応関係に関する知見の集積のため、天然由来の周期性タンパク質におけるプロリン含有の反復アミノ酸配列をモデル化した周期性ポリペプチド、Poly(Leu-Pro-Pro)、Poly(Xaa-Pro-Pro)、Poly(Xaa-Pro)、poly(Xaa-Xaa-Pro)、poly(Xaa-Xaa-Xaa-Pro)(Xaa=Ala、Leu、Val、Phe、Glu、Asp、Lys、Arg等)を固相法により合成し、溶液中でのコンホメーションについて円二色性スペクトル測定により検討した。既知のポリプロリン-II構造とは異なるヘリックス構造が存在していることを示す円二色性スペクトルが得られた。さらに、反復アミノ酸配列と溶媒、pH、温度に依存して、安定構造が変化することを明らかにし、分子力学計算により予測している新規のヘリックス構造の可能性を強く支持する結果得た。2)天然由来の長周期型周期性タンパク質のアミノ酸配列反復部分、および、モデル化した周期性ポリペプチドについて、分子力学計算に基づく構造最適化によるコンホメーション解析を試み、アミノ酸配列と安定な基本骨格構造の対応関係についての有用な知見を得た。3)プロリンを主成分とするアミノ酸ランダム共重合体を縮合法により合成した。微少副成分のアミノ酸の疎水性に依存して大きく相転移挙動は変化するが、円二色性スペクトルに反映するような大きな二次構造の変化は生じていないことが明らかになった。

報告書

(4件)
  • 2001 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2000 実績報告書
  • 1999 実績報告書
  • 研究成果

    (33件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (33件)

  • [文献書誌] T.Nakamura et al.: "Conformational Analysis of Model Polypeptide Having Repetitive Ala-Pro-Pro-Pro Sequence"Peptide Science. 2000. 321-324 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Y.Hirano et al.: "Conformational Analysis of Model Polypeptides Having Repetitive Xaa-Pro Sequence"Peptide Science. 2000. 337-340 (2001)

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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] I.Ohiso et al.: "Theoredical Conformational Analysis of the Tandem Repeat Sequence in RNA Polymerase II"Bull.Chem.Soc.Jpn.. 74. 1847-1855 (2001)

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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.Wakahara et al.: "Conformational Analysis of Model Polypeptides Having Repetitive Xaa-Pro-Pro Sequences"Peptide Science. 2001. 289-292 (2002)

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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Y.Onoda et al.: "Conformational Analysis of Model Polypeptides Having Repetitive Glu-Pro-Pro-Pro Sequences"Peptide Science. 2001. 293-296 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] N.Nakamura et al.: "Conformational Analysis of Model Polypeptides Having Repetitive Xaa-Pro-Pro-Pro Sequences"Peptide Science. 2002. 341-344 (2003)

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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Nakamura, M.Wakahara, M.Oka, T.Hayashi, M.Hattori, Y.Hirano: "Conformational Analysis of Model Polypeptides Having Repetitive Ala-Pro-Pro-Pro Sequence"Peptide Science. 2000. 321-324 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Y.Hirano, M.Shimoda, M.Hattori, M.Oka, T.Hayashi: "Conformational Analysis of Model Polypeptides Having Repetitive Xaa-Pro Sequence"Peptide Science. 2000. 337-340 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] L.Ohiso, M.Oka, N.Nishi: "Theoretical Conformational Analysis of the Tandem Repeat Sequence in RNA Polymerase II"Bull. Chem. Soc. Jpn.. 74. 1847-1855 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Y.Onoda, M.Oka, T.Hayashi, Y.Hirano: "Conformational Analysis of Model Polypeptides Having Repetitive Glu-Pro-Pro-Pro Sequences"Peptide Science. 2001. 293-296 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.Wakahara, T.Nakamura, M.Oka, T.Hayashi, M.Hattori, Y.Hirano: "Conformational Analysis of Model Polypeptides Having Repetitive Xaa-Pro-Pro Sequences"Peptide Science. 2001. 289-292 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Y.Hirano, M.Shimoda, S.Tokuyama, M.Morita, M.Hattori, M.Oka, T.Hayashi: "Conformational Analysis of Model Repetitive Polypeptides Poly(Xaa-Pro)"Peptide Science. 2001. 273-276 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] N.Nakamura, Y.Onoda, S.Kakinoki, M. Oka, T.Hayashi, M.Hattori, Y.Hirano: "Conformational Analysis of Model Polypeptides Having Repetitive Xaa-Pto-Pro-Pro Sequences"Peptide Science. 2002. 341-344 (2003)

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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H.Akiyama, S.Kakinoki, M.Oka, T.Hayashi, M.Hattori, M.Arimonto, Y.Hirano: "Conformational Analysis of Model Polypeptides Having Repetitive Ala-Ala-Pro Sequences"Peptide Science. 2002. 345-348 (2003)

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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Iuchi, M.Kayahara, Y.Hori, M.Oka, T.Hayashi, Y.Hirano: "Molecular Design of β-Hairpin Peptides Having Arg-Gly-Asp-Ser Sequence"Peptide Science. 2002. 361-364 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Nakamura et al.: "Conformational Analysis of Model Polypeptides Having Repetitive Ala-Pro-Pro-Pro Sequence"Peptide Science. 2000. 321-324 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] I.Ohiso et al.: "Theoretical Conformational Analysis of the Tandem Repeat Sequence in RNA Polymerase II"Bull.Cheu.Soc.Jpn. 74. 1847-1855 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Y.Onoda et al.: "Conformational Analysis of Model Polypeptides Having Repetitive Glu-Pro-Pro-Pro Sequences"Peptide Science. 2001. 293-296 (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] M.Wakahara et al.: "Conformational Analysis of Model Polypeptides Having Repetitive Xaa-Pro-Pro Sequences"Peptide Science. 2001. 289-292 (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Y.Hirano et al.: "Conformational Analysis of Model Repetitive Polypeptides Poly(Xaa-Pro)"Peptide Science. 2001. 273-276 (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] M.Oka et al.: "Conformational Analysis of Periodic Polypeptides Composed of Proline and Alanine Residues"Biomedical Material.Res.Asia. 5. 548-549 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] M.Hattori,M.Oka,T.Hayashi,Y.Hirano: "Synthesis and conformational analysis of model peptides having repetitive Xaa-Pro-Pro sequences"Peptide Science. 1999. 343-346 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] M.Hattori,Y.Hirano,M.Oka,T.Hayashi: "Synthesis and conformational analysis of model polypeptides having repetitive Gly-Pro-Xaa sequences"Biomedical Material Res.Asia. 4. 150-151 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] M.Oka,T.Hayashi: "Theoretical analysis of β-type super secondary structures constructed by β-strands"Peptides Science. 1999. 331-334 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] M.Oka,T.Hayashi: "Theoretical analysis of α α β-type super secondary structures constructed by α-helices and β-strands"Peptides Science. 1999. 335-338 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] M.Oka,M.Hattori,T.Hayashi,Y.Hirano: "Theoretical conformational analysis of the turn portion of tachyplesin I based on the Ala-residue approximation"Peptides Science. 1999. 339-342 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Y.Hirano,T.Iuchi,Y.Yamaguti,M.Oka,T.Hayashi: "Synthesis and evaluation of cell-attachment activity of RGDS mimetic peptides"Biomedical Material Res.Asia. 4. 108-109 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] T.Kiyota: "Structure and Activity Relationship of D-Amino Acid-Invorporated Antimicrobial Model Polypeptides"Peptide Scince. 1998. 241-244 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] M.Oka: "Theoretical Analysis of α-Hairpin Structures Stabilized by Electrostatic Int eractions between Two Charged Residues"Peptide Scince. 1998. 361-364 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] M.Oka: "Theoretical Analysis of α-Hairpin Structures Stabilized by a Disulfide-Linkage between Two Helices"Peptide Scince. 1998. 365-368 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] M.Oka: "Theoretical Analysis of β-Hairpin Structures Stabilized by a Disulfide-Linkage between Two Strands"Peptide Scince. 1998. 369-372 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Y.Hirano: "Synthesis and Conformational Analysis on Model Polypeptides for Repaptitive Portion of Amelogen in from Bovine Tooth Enamel"Peptide Scince. 1998. 373-376 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] M.Hattori: "Synthesis and Conformational Analysis on Model Peptides Having Repetitive Xaa-Pro-Pro Sequences"Peptide Scince. 1999(印刷中). (2000)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書

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公開日: 1999-04-01   更新日: 2016-04-21  

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