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水田各部位の生物相に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 11460031
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 植物栄養学・土壌学
研究機関名古屋大学

研究代表者

木村 眞人 (木村 真人)  名古屋大学, 大学院・生命農学研究科, 教授 (20092190)

研究分担者 村瀬 潤  名古屋大学, 大学院・生命農学研究科, 助手 (30285241)
浅川 晋  名古屋大学, 大学院・生命農学研究科, 助教授 (50335014)
渡辺 彰  名古屋大学, 大学院・生命農学研究科, 助教授 (50231098)
豊田 剛己  名古屋大学, 大学院・生命農学研究科, 助手 (30262893)
研究期間 (年度) 1999 – 2001
研究課題ステータス 完了 (2001年度)
配分額 *注記
15,000千円 (直接経費: 15,000千円)
2001年度: 3,600千円 (直接経費: 3,600千円)
2000年度: 3,200千円 (直接経費: 3,200千円)
1999年度: 8,200千円 (直接経費: 8,200千円)
キーワード水田生態系 / 微生物群集 / 田面水 / 浸透水 / クローニング / 水稲根圏 / 水生生物 / PCR-DGGE / リン脂質脂肪酸 / 稲ワラ / 水稲根圈微生物 / 植物遺体 / PCR-RFLP / 水田土壌 / 季節変動 / SEM
研究概要

田面水、浸透水、暗渠水それどれの部位から試水を採取し、その脂肪酸組成を比較したところ、採取時期に関わらず極めて類似した脂肪酸組成が得られ、主要な微生物群集がグラム陰性細菌群であることが判明した。田面水に関しては、長期肥料連用試験水田圃場を供試し、季節変動を特徴付ける微生物群集、常時存在する微生物群集、各処理区に特徴的な微生物群集の解明を目的としてPCR-DGGE法を適用し、クローニングの後、その塩基配列から、それぞれの微生物群集を推定した。
化学肥料、稲ワラ、稲ワラ堆肥をそれぞれ加えた湛水ポットを準備し、培養した4種のミジンコを別個に添加し、6週間にわたって経時的に回収後、それぞれのミジンコに共生している微生物群集をPCR-RFLP法で調査した結果、共生する細菌群集は施肥の違いに関わらず、ミジンコごとに異なっていることが判明した。
水稲根に生育する微生物をPCR-DGGE法から構造解析した結果、PCR-RFLP法で得られた前年の結果とよく一致し、水稲根の採取時期によって規則的に変動するとともに、高位節根から低位節根に向かっての微生物群集構造の変動も観察された。そこで、常時水稲根で観察されたDGGEバンド、季節変動に伴って変動するDGGEバンド、高位節根および低位節根に特徴的なDGGEバンドをそれぞれ切り出し、クローニングの後、塩基配列からbiotypeの系統関係を明らかにした。加えて、水田圃場に埋設した稲ワラを定期的に回収し、その脂肪酸組成を解析した結果、圃場においても稲ワラらの分解に関与する微生物群集が主にグラム陽性細菌群であることが判明した。
以上の本年度の研究成果および過去2年間の研究成果をもとに、水稲生育各時期における水田土壌各部位の生物相の特徴として、それぞれの部位に特徴ある微生物群集が生育し、全体として水田生態系の微生物群集を多様にしていると、総括された。

報告書

(4件)
  • 2001 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2000 実績報告書
  • 1999 実績報告書
  • 研究成果

    (29件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (29件)

  • [文献書誌] Guang-Hua Wang: "Effect of fungicide Thiram on microbial communities of rice seed surface estimated by culture-dependent and culture-independent (PCR-RFLP) methods"Soil Science and Plant Nutrition. 47・2. 303-314 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Masatsugu Yamazaki: "Spatial distribution of aquatic organisms in a paddy field during off-crop season under drained conditions"Edaphologia. 68. 23-31 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Makoto Kimura: "Phospholipid fatty acid composition of microbiota in the percolating water from a rice Paddy microcosm"Soil Science and Plant Nutrition. 47・3. 533-545 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Makoto Kimura: "Microbiota responsible for the decomposition of rice straw in a submerged paddy soil estimated from phospholipid fatty acid composition"Soil Science and Plant Nutrition. 47・3. 569-578 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Masatsugu Yamazaki: "Aquatic organisms in the floodwater of a Japanese paddy field under a long-term fertilizer trial"Soil Science and Plant Nutrition. 47・3. 587-599 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ainin Niswati: "Microbiota associated with microcrustacean in the floodwater of a Japanese paddy field estimated by RFLP analysis"Soil Science and Plant Nutrition. 48・1. (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Cho Cho Tun and Makoto Kimura: "Microscopic observation of the decomposition process of leaf blade of rice straw and colonizing microorganisms in a Japanese paddy field soil during the cultivation period of paddy rice"Soil Science and Plant Nutrition. Vol. 46, No. 1. 127-137 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Akiko Okabe, Koki Toyota and Makoto Kimura: "Seasonal variations of phospholipid fatty acid Composition in the floodwater of a Japanese paddy under a long-term fertilizer trial"Soil Science and Plant Nutrition. Vol. 46, No. 1. 177-188 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yoshiteru Muraoka, Eitaro Hamakawa. Koki Toyota and Makoto Kimura: "Observation of microbial colonization on the surface of rice roots along with their development and degradation"Soil Science and Plant Nutrition. Vol. 46, No. 2. 491-502 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Akiko Okabe, Hiroe Oike, Koki Toyota and Makoto Kimura: "Comparison of phospholipid fatty acid composition in floodwater and plow layer soil during the rice cultivation period in a Japanese paddy field"Soil Science and Plant Nutrition. Vol. 46, No. 4. 893-904 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Guang-Hua Wane. Yasunori Nakajima, Ichiro Shaku and Makoto Kimura: "Effect of fungicide Thiram on microbial communities of rice seed surface estimated by culture-dependent and culture-independent (PCR-RFLP) methods"Vol. 47, No. 3. 303-314 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Masatsugu Yamazaki. Yukihiro Hamada. Nobuchika Kamimoto, Takashi Momii and Makoto Kimura: "Spatial distribution of aquatic organisms in a paddy field during off-crop season under drained conditions"Edaphologia. Vol. 68. 23-31 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Makoto Kimura, Hiroyoshi Kishi. Akiko Okabe and Nagamitsu Maie: "Phospholipid fatty acid composition of microbiota in the percolating water from a rice paddy microcosm"Soil Science and Plant Nutrition. Vol. 47, No.3. 533-545 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Makoto Kimura, Mariko Miyaki, Ko-Ichiro Fujinaka and Nagamitsu Male/: "Microbiota responsible for the decomnosition of rice straw in a submerged paddy soil estimated from phospholipid fatty acid composition"Soil Science and Plant Nutrition. Vol. 47, No.3. 569-578 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Masatsugu Yamazaki, Yukihiro Hamada, Takeo Ibuka, Takashi Momii and Makoto Kimura: "Aquatic organisms in the floodwater of a Japanese paddy field under a long-term fertilizer trial"Soil Science and Plant Nutrition. Vol. 47, No.3. 587-599 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ainin Niswati, Makoto Ikenaga and Makoto Kimura: "Microbiota associated with microcrustacean in the floodwater of a Japanese paddy field estimated by RFLP analysis"Soil Science and Plant Nutrition. Vol. 48, No.2(in press). (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Guang-Hua Wang: "Effect of fungicide Thiram on microbial communities of rice seed surface estimated by culture-dependent and culture-independent(PCR-RFLP)methods"Soil Science and Plant Nutrition. 47・2. 303-314 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Masatsugu Yamazaki: "Spatial distribution of aquatic organisms in a paddy field during off-crop season under drained conditions"Edaphologia. 68. 23-31 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Makoto Kimura: "Phospholipid fatty acid composition of microbiota in the percolating water from a rice paddy microcosm"Soil Science and Plant Nutrition. 47・3. 533-545 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Makoto Kimura: "Microbiota responsible for the decomposition of rice straw in a submerged paddy soil estimated from phospholipid fatty acid composition"Soil Science and Plant Nutrition. 47・3. 569-578 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Masatsugu Yamazaki: "Aquatic organisms in the floodwater of a Japanese paddy field under a long-term fertilizer trial"Soil Science and Plant Nutrition. 47・3. 587-599 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Ainin Niswati: "Microbiota associated with microcrustacean in the floodwater of a Japanese paddy field estimated by RFLP analysis"Soil Science and Plant Nutrition. 48・1. (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Makaoto Kimura and Cho Cho Tun: "Microscopic observation of the decomposition process of leaf sheath of rice straw and colonizing microorganisms during the cultivation period of paddy rice"Soil Science and plant Nutrition. 45・2. 429-437 (1999)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Cho Cho Tun and Makoto Kimura: "Microscopic observation of the decomposition process of leaf blade of rice straw and colonizing microorganisms in a Japanese paddy field soil during the cultivation period of paddy rice."Soil Science and plant Nutrition. 46・1. 127-137 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Akiko Okabe,Koki Toyota and Makoto Kimura: "Seasonal variations of phospholipid fatty acid compostition in the floodwater of a Japanese paddy field under a long-term fertilizer trial"Soil Science and plant Nutrition. 46・1. 177-188 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Akiko Okabe,Hiroe Oike,Koki Toyota and Makoto Kimura: "Comparison of phospholipid fatty acid composition in floodwater and plow layer soil during the rice cultivation period in a Japanese paddy field"Soil Science and plant Nutrition. 46・4. 893-904 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Makoto Kimura and Cho Cho Tun: "Microscopic observation of the decomposition process of leaf sheath of rice straw and colonizing microorganisms during the cultivation period of paddy rice"Soil Science and Plant Nutrition. 45巻2号. 427-437 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Akiko Okabe, Koki Toyota and Makoto Kimura: "Seasonal variations of phospholipid fatty acid composition in the floodwater of a Japanese paddy field under a long-term fertilizer trial"Soil Science and Plant Nutrition. 46巻1号(印刷中). (2000)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Cho Cho Tun and Makoto Kimura: "Microscopic observation of the decomposition process of leaf blade of rice straw and colonizing microorganisms in a Japanese paddy field soil during the cultivation period of paddy rice"Soil Science and Plant Nutrition. 46巻1号(印刷中). (2000)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書

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公開日: 1999-04-01   更新日: 2016-04-21  

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