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魚類比較ゲノムマッピングによる水産遺伝育種の基盤研究

研究課題

研究課題/領域番号 11460088
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 水産学一般
研究機関東京水産大学

研究代表者

岡本 信明  東京水産大学, 水産学部, 教授 (40114912)

研究分担者 小林 敬典  水産庁養殖研究所, 主任研究員
関 伸吾  高知大学, 農学部, 助教授 (20216518)
研究期間 (年度) 1999 – 2001
研究課題ステータス 完了 (2001年度)
配分額 *注記
14,300千円 (直接経費: 14,300千円)
2001年度: 3,000千円 (直接経費: 3,000千円)
2000年度: 3,600千円 (直接経費: 3,600千円)
1999年度: 7,700千円 (直接経費: 7,700千円)
キーワードゲノム / マイクロサテライトマーカー / 伝染性膵臓壊死症 / ニジマス / 遺伝子地図 / リンケージマップ / QTL解析 / 耐病性 / ヒラメ / リンケージマツプ
研究概要

本年度は、平成11年度に作製した約200個のマイクロサテライトマーカー(CAリピートマーカー)を用いた29遺伝子連鎖群からなるニジマス遺伝子地図を利用して、ニジマスの伝染性膵臓壊死症抵抗性に関するQTL解析を行った。
ニジマスの伝染性膵臓壊死症(IPN)は、Binavirusに属するIPNウイルスによって引き起こされる疾病で、ニジマス系群にはその抵抗性に差があることが報告されている。本年度は、伝染性膵臓壊死症(IPN)に対する耐病性/感受性のQTL解析のために準備された、ニジマスIPN耐病性系統(YN-RT201)、IPN感受性系統(YK-RT101)の2系統からの戻し交配家系を用いて、PNウイルスで浸漬感染(10^<5.0>TCID_<50>/ml,1時間)を行ない、IPN耐病性(表現型;生、死)と50遺伝子座、27遺伝子連鎖群からなるマイクロサテライトマーカーを用いたDNA多型の遺伝状況との関連性の有無を解析した。
その結果、ニジマスIPN感受性/耐病性に関連する2つの連鎖群に属する4遺伝子座(OmyRGT41TUF, Ssa4DU;リンケージグループA、OmyOGT4TUF, OmyRGT6/iiTUF;リンケージグループC)を見いだした。耐病性のような水産有用形質の多くが量的形質に支配されていると考えられる中にあって、本成果は量的形質であってもその原因遺伝子座の特定に遺伝子連鎖地図とそれを用いたQTL解析が有効であることを示したもので、今後の水産における分子育種に道を開いたものと考える。

報告書

(4件)
  • 2001 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2000 実績報告書
  • 1999 実績報告書
  • 研究成果

    (30件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (30件)

  • [文献書誌] Kitagawa T: "Two genetically divergent groups in the Japanese spined loach, Cobitis takatsuensis, and their phylogenetic relationships among Japanes Cobitis infferred from mitochondrial DNA analysis"Zoological Science. 18. 249-259 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Saitoh K: "Sequence and structure of Japanese Flounder (Paralichthys olivaceus) mitoc hondrial genome"The Bulletin of Tohoku National Fisheries Reserch lnstitute. 64. 1-36 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Akiyuki Ozaki: "Quantitative trait loci (QTLs) associated with resistance/susceptibility of infectious pancreatic necrosis (IPN) in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)"Molecular Genetics and Genomics. 265. 23-31 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.R.M.Coimbra: "Twenty microsatellite markers from the Japanese flounder. Paralichthys olivaceus"Fiseries Science. 67. 358-360 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kayo Nakamura: "Genetic mapping of the dominant albino locus in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)"Molecular Genetics and Genomics. 265. 687-693 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.R.M.Coimbra: "A genetic linkage map of the Japanese flounder, Paralichthys olivaceus, and obserbations on sex recombination"Aquaculture. (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A. Ozaki, T. Sakamoto, S.-K. Khoo, K. Nakamura, M.R.M. Coimbra, S. Kitada and N. Okamoto: "Quantitative trait loci (QTLs) associated with resistance/susceptibility of infectious pancreatic necrosis (IPN) in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)"Molecular Genetics and Genomics. 265. 23-31 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.R.M. Coimbra, O. Hasegawa, K. Kobayashi, S. Koretsugu, E. Ohara and N. Okamoto: "Twenty microsatellite markers from the Japanese flounder, Paralichthys olivaceus"Fiseries Science. 67. 358-360 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K. Saitoh, T. Kobayashi, K. Hayashizaki, T. Asahida, Y. Yokoyama, H. Toyohara and Y. Yamashita: "Sequence and structure of Japanese Flounder (Paralichthys olivaceus) mitochondrial genome"The bulletin of Tohoku National Fisheries Research Institute. 64. 1-38 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T. Sakamoto, R.G. Danzmann, K. Gharbi, P. Hpward, A. Ozaki, S.-K. Khoo, R.A. Woram, N. Okamoto, M.M. Ferguson, L.-E. Holem, R. Guyomard and B. Hoyheim: "A microsatellite linkage map of rainbow trout (Oncorthynchus mykiss) characterized by large sex-specific differnces in recombination rates"Genetics. 155. 13331-1345 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] J.J. Agresti, S. Seki, A. Cnaani, S. Poompuang, E.M. Hallerman, N. Umiel, G. Hulata, G.A.E. Gall and B. May: "Breeding new strains of tilapia : development of an artificial center of origin andn linkage map based on AFLP and microsatellite loci."Aquaculture. 185. 43-56 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] s. Seki, J.J. Agresti, G.A.E. Gall, N. Taniguchi and B. May: "AFLP analysis of genetic diversity in three populations of ayu Plecoglossus altivelis"Fisheries Sci.. 65. 888-892 (1999)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] I. Oohara, K. Sawano, T. Okazaki and T. Kobayashi: "Reexamination of the molecular phylogeny of the Masu salmon in the genus Oncorhynchus"Proc. 5th Indo-Pac. Fish Conf., Noume'a, 1997. 417-426 (1999)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T. Sakamoto, N. Okamoto, M. Ishii, M. Maita and Y. Ikeda: "RFLP and VNTR markers isolated from the genomic DNA of rainbow trout and cytogenetic mapping by fluorescence in situ hybridization"Fisheries Science. 62. 719-722 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T. Sakamoto, N. Okamoto and Y. Ikeda: "Application of PCR primer pairs from rainbow trout to detect polymorphisms of CA repeat DNA loci i five confamilial speacies"Fisheries Science. 62. 552-555 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kitagawa T: "Two genetically divergent groups in the Japanese spined loach, Cobitis takatsuensis, and their phylogenetic relationships among Japanes Cobitis infferred from mitochondrial DNA analysis"Zoological Science. 18. 249-259 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Saitoh K: "Sequence and structure of Japanese Flounder (Paralichthys olivaceus) mitoc hondrial genome"The Bulletin of Tohoku National Fisheries Research Institute. 64. 1-36 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Akiyuki Ozaki: "Quantitative trait loci (QTLs) associated with resistance/susceptibility of infectious pancreatic necrosis (IPN) in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)"Molecular Genetics and Genomics. 265. 23-31 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] M.R.M.Coimbra: "Twenty microsatellite markers from the Japanese flounder. Paralichthys olivaceus"Fiseries Science. 67. 358-360 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Kayo Nakamura: "Genetic mapping of the dominant albino locus in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)"Molecular Genetics and Genomics. 265. 687-693 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] M.R.M.Coimbra: "A genetic linkage map of the Japanese flounder, Paralichthys olivaceus, and obserbations on sex recombination"Aquaculture. (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] M.R.M.Coimbra: "Four microsatellite markers in the Japanese flounder, Paralichthys olivaceus."Animal Genetics. 31. 72-73 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] M.R.M.Coimbra: "Poli-RC35-TUF, a highly polymorphic microsatellite marker in the Japanese flounder, Paralichthys olivaceus."Journal of Animal Science. 78. 1690 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Akiyuki Ozaki: "Quantitativetrait loci (QTLs) associated with resistance/susceptibility of unfectious pancreatic necrosis (IPN) in rainbow trout."Molecular and General Genetics. (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] M.R.M.Coimbra: "Twenty microsatellite markers from the Japanese flounder,Paralichthys olivaceus."Fiseries Science. 67. (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] 坂本崇: "ニジマスマイクロサテライトマーカーを用いた連鎖地図の作成とそれを用いたQTL解析"蛋白質・核酸・酵素. 45. 206-213 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Takashi Sakamoto: "A microsatellite linkage map of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) characterized by large sex-specific differences in recombination rates."Genetics. (2000)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Akiyuki Ozaki: "Two highly polymorphic dinucleotide microsatellites in trainbow trout (Oncorhynchus mykiss); OmvRGT7TUF and OmvRGT8TUF."Animal Genetics. 30. 393 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Sok-Kean Khoo: "Four highly polymorphic dinucleotide microsatellites in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)."Animal Genetics. 31. 73 (2000)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Sok-Kean Khoo: "Rapid Communication: Two highly polymorphic dinucleotide microsatellites in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss): OmyRGT18TUF and OmyRGT23TUF."J. Animal Science. 78. 490 (2000)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書

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公開日: 1999-04-01   更新日: 2016-04-21  

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