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複雑系としての蛋白質合成系

研究課題

研究課題/領域番号 11480198
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 分子生物学
研究機関東京大学

研究代表者

上田 卓也  東京大学, 大学院・新領域創成科学研究科, 教授 (80184927)

研究分担者 鈴木 勉  東京大学, 大学院・新領域創成科学研究科, 講師 (20292782)
大矢 禎一  東京大学, 大学院・新領域創成科学研究科, 教授 (20183767)
研究期間 (年度) 1999 – 2000
研究課題ステータス 完了 (2001年度)
配分額 *注記
14,300千円 (直接経費: 14,300千円)
2000年度: 4,200千円 (直接経費: 4,200千円)
1999年度: 10,100千円 (直接経費: 10,100千円)
キーワードtRNA / アミノアシル化 / メチル基 / 転写反応 / 多義語コドン / コドン認識 / 翻訳 / Candida / メチル化
研究概要

我々はCandida酵母においてCUGコドンがセリンとロイシンの2種のアミノ酸を同時に指定していることを、tRNAの解析と遺伝学的な手法により明らかにした。この多義的な遺伝暗号変換機構のCandida酵母における生物学的意義を解明するために、多義語コドンを司るtRNASerCAGのロイシン受容能を定量的に変化させ、細胞内あるいは生育への影響を解析しようとしている。これまでの解析によりtRNA^<Ser>CAGのロイシン受容能はアンチコドン3'側隣接塩基である37位の1-メチルグアノシン(mlG)のメチル基によって支配されていることが明らかになっている。今回はさらに受容能を向上させるために、73位の識別部位をGからAに改変することを試みた。細胞内に変異tRNAを発現させる前に、in vitroでロイシン受容能を評価するために、T7RNApoIymeraseを用いた未修飾tRNAを作製したがロイシンの取り込みは全く検出されなかった。さらに、今回新たに大腸菌m^lG methylaseを組換えタンパク質として調製し、未修飾tRNAの37位をメチル化したところ、nativeなものとほぼ同等のロイシン受容能が確認された。この結果は分子内のたった一つのメチル基がアミノアシルtRNA合成酵素の決定因子になりうることを直接的に示した初めての例である。さらに、73位の識別部位をAに置換すると、ロイシン受容能は飛躍的に向上しnativeなtRNA^<Ser>CAGをはるかに凌ぐ活性が確認された。Kcat/Kmの値としては、識別塩基がAへの変異は400倍の上昇を、37位をGからm^lGにしたtRNAでは、10倍の上昇が観察された。これらの結果を基に、細胞内でこれらの変異型tRNAを導入し、細胞機能の変化を観察する予定である。

報告書

(3件)
  • 2001 研究成果報告書概要
  • 2000 実績報告書
  • 1999 実績報告書
  • 研究成果

    (35件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (35件)

  • [文献書誌] Yasukawa, T: "A pathogenic point mutation reduces stability of mitochondrial mutant tRNA^<lle>"Nucleic Acids Research. 28. 3779-3784 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tomari, Y: "The role of tightly bound ATP In Escherichia coli tRNA nucleotidyltransferase"Genes to Cells. 5. 689-698 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yokogawa, T: "Characterization and tRNA Recognition of Mammalian Mitochondrial Seryl-tRNA Synthetase"J. Bio. Chem.. 275. 19913-19920 (2000)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yasukawa, T: "Defect in modification at the anticodon wobble nucleotide of mitochondrial tRNA^<Lys> with the MERRF encephalomyopathy pathogenic mutation"FEBS Letters. 467. 175-178 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yasukawa, T: "Modification Defect at Anticodon Wobble Nucleotide of Mitochondrial tRNAs^<Leu>(UUR) with Pathogenic Mutations of Mitochondrial Myopathy, Encephalopahty, Lactic Acidosis, and Stroke-like Episodes"J. Biol. Chem.. 275. 4251-4257 (2000)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yokobori, S.: "Complete DNA Sequence of the Mitochondrial Genome of the Ascidia Halocynthia roretzi(Chordata, Urochordata)"Genetics. 153. 1851-1862 (1999)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tomita, K: "Codon reading patterns in Drosophila melanogaster mitochondria based on their tRNA sequences : a unique wobble rule In animal mitochondria"Nucleic Acids Research. 27,. 4291-4297 (1999)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Suzuki, T: "High Sensitive Analysis of Modified Nucleosides by LC/MS Using ESI/Iontrap Mass Spectrometry"J. Mass Spectrom. Soc. Jpn.. 47(3). 168-176 (1999)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Sasuga, J.: "Gene Contents and Organization of a Mitochondrial DNA Segment of the Squid Loligo bleekeri"J. Mol. Evol. 48. 692-702 (1999)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kondow, A.: "An extra tRNAGly(U^*CU)found in ascidian mitochondria responsible for decoding non-universal codons AGA/AGG as glycine"Nucleic Acids Research. 27. 2554-2559 (1999)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ogawa, T.: "A cytotoxic ribonuclease targeting specific transfer rna anticodons"Science. 283. 2097-2100 (1999)

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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tomita, T: "The presence of pseudouridine in the anticodon alters the genetic code : a possible mechanism for assignment of the AAA lysine codon as asparagine in echinoderm mitochondria"Nucleic Acids Research. 27. 1683-1689 (1999)

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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yasukawa, T.: "A pathogenic point mutation reduces stability of mitochondrial mutant tRNA^<llcγ>"Nucleic Acids Research. 28. 3779-3784 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tomari, Y.: "The role of tightly bound ATP In Escherichia coli tRNA nucleotidyltransferase"Genes to Cells. 5. 689-698 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yokogawa, T.: "Characterization and tRNA Recognition of Mammalian Mitochondrial Seryl-tRNA Synthetase"J. Biol. Chem.. 275. 19913-19920 (2000)

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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yasukawa, T.: "Defect in modification at the anticodon wobble nucleotide of mitochondrial tRNA^<Lys> with the MERRF excephalomyopathy pathogenic mutation"FEBS Letters. 467. 175-178 (2000)

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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yasukawa, T.: "Modification Defect at Anticodon Wobble Nucleotide of Mitochondrial tRNAs^<Leu> (UUR) with Pathogenic Mutations of Mitochondrial Myopathy, Encephalopathy, Lactic Acidosis, and Stroke-like Episodes"J. Biol. Chem.. 275. 4251-4257 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yokobori, S.: "Complete DNA Sequence of the Mitochondrial Genome of the Ascididan Halocynthia reretzi (Chordata, Urochordata)"Genetics. 153. 1851-1862 (1999)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tomita, K.: "Codon reading patterns in Drosophila melanogaster mitochondra based on their tRNA sequences : a wobble rule In animal mitochondria"Nucleic Acids Research. 27. 4291-4297 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Suzuki, T.: "High Sensitive Analysis of Modified Nucleosides by LC/MS Using ESI/Iontrap Mass Spectrometry"J. Mass Spectrom, Soc. Jpn.. 47(3). 168-176 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Sasuga, J.: "Gene Contents and Organization of a Mitochondrial DNA Segment of the Squid Loligo bleekeri"J. Mol. Evol.. 48. 692-702 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kondow, A.: "An extra tRNAGly (U*CU) found in ascidian mitochondria responsible for decoding non-universal codons AGA/AGG as glycine"Nucleic Acids Researh. 27. 2554-2559 (1999)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ogawa, T.: "A cytotoxic ribonnuclease targeting specific transfer maanticodons"Science. 283. 2097-2100 (1999)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tomita, T.: "The presence of pseudouridine in the anticodon alters the genetic code : a possible mechanism for assignment of the AAA lysine codon as asparagine in echinoderm mitochondria"Nucleic Acids Research. 27. 1683-1689 (1999)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yasukawa,T: ""A pathogenic point mutation reduces stability of mitochondrial mutant tRNA^<lle>""Nucleic Acids Research. 28. 3779-3784 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Tomari,Y: ""The role of tightly bound ATP In Escherichia coli tRNA nucleotidyltransferase""Genes to Cells. 5. 689-698 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Yokogawa,T: ""Characterization and tRNA Recognition of Mammalian Mitochondrial Seryl-tRNA Synthetase""J.Biol.Chem.. 275. 19913-19920 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Yasukawa,T: ""Defect in modification at the anticodon wobble nucleotide of mitochondrial tRNA^<Lys> with the MERRF encephalomyopathy pathogenic mutation""FEBS Letters. 467. 175-178 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Yasukawa,T: ""Modification Defect at Anticodon Wobble Nucleotide of Mitochondrial tRNAs^<Leu>(UUR) with Pathogenic Mutations of Mitochondrial Myopathy, Encephalopahty,Lactic Acidosis,and Stroke-like Episodes""J.Biol.Chem. 275. 4251-4257 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Tomita,T,,Ueda,T.and Watanabe,K.: "The presence of pseudouridine in the anticodon alters the genetic codeb : a possible mechanism for assignment of the AAA lysine codon as asparagine in echinoderm mitochondria"Nucleic Acids Research. 1683-1689

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Ogawa,T.,Tomita,K.,Ueda,T.,Watanabe,K.,Uozumi,T.and Masaki,H.: "A cytotoxic ribonuclease targeting specific transfer RNA anticodons"Science. 283,. 2097-2100

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Kondow,A.,Suzuki,T.,Yokobori,S.,Ueda,T.and Watanabe,K.: "An extra tRNA^<Gly>(U^*CU) found in ascidian mitochondria responsible for decoding non-universal codons AGA/AGG as glycine"Nucleic Acids Research. 27.. 2554-2559

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Sasuga,J.,Yokobori,S.,Kaifu,M.,Ueda,T.,Nishikawa,K.and Watanabe,K.,: "Gene contents and organization of a mitochondrial DNA segment of the squid Loligo bleekeri"J.Mol.Evol.. 48,. 692-702

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Tomita,K.,Ueda,T.,Ishiwa,S.,P.F.Crain,J.A.McCloskey and Watanabe,K.: "Codon reading patterns in Drosophila melanogaster mitochondria based on their tRNA sequences : a unique wobble rule in animal mitochondria"Nucleic Acids Research. 27,. 4291-4297

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Yokobori,S.,Ueda,T.,G.F-Fuchs,S.Paabo,Ueshima,R.,Kondow,A.,Nishikawa,K.,Watanabe,K.: "Complete DNA sequence of mitochondrial genome of the ascidian Halocynthia roretzi(Chordata,Urochordata)"Genetics. 153,. 1851-1862

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書

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公開日: 1999-04-01   更新日: 2016-04-21  

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