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放射光を用いた天然コラーゲンの精密X線回折像に基づく奥山モデルの検証

研究課題

研究課題/領域番号 11650922
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 高分子構造物性(含繊維)
研究機関東京農工大学

研究代表者

奥山 健二  東京農工大学, 工学部, 教授 (30038020)

研究分担者 野口 恵一  東京農工大学, 機器分析センター, 講師 (00251588)
神鳥 成弘  東京農工大学, 工学部, 助教授 (00262246)
研究期間 (年度) 1999 – 2001
研究課題ステータス 完了 (2001年度)
配分額 *注記
3,500千円 (直接経費: 3,500千円)
2001年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2000年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
1999年度: 1,700千円 (直接経費: 1,700千円)
キーワードコラーゲン / トリプルヘリックス / コイルドコイル / 繊維回折 / X線回折 / 放射光 / 結晶構造解析 / 構造モデル / コラーゲン構造
研究概要

本研究の目的は、代表者等がモデルペプチドの構造を基に1977年以来提案しているコラーゲンの構造モデルの妥当性を、天然コラーゲンからの放射光を用いたX線回折像を精密構造解析することにより検証することである。研究成果をまとめると、次のようになる。
(1)ネズミの尻尾の腱から良好なX線回折像を得るのは困難であるが、カンガルーやワラビーの腱からは常に配向試料が得られ、本研究の試料として非常に有利であることを見つけた。
(2)天然コラーゲンからの回折像のようにBragg反射がほとんどなく、ブロードで各回折点を定義できない様な場合には通常のバックグラウンド除去法は適用できない。このような場合には、Fourier-Bessel級数により二次元的に回折像中のバックグラウンドを除去する方法が良いことがわかった。
(3)放射光を利用しての回折像の測定が最終年度になって初めて認められたため、現在まだ奥山モデルの回折データを用いての精密化は出来ていないが、得られた回折像の定性的な比較からはRich & Crickモデルでも、奥山モデルでも回折像中の強度分布は説明できる。今後は、回折像中の各層線上の強度分布を定量的に求め、モデル構造から得たmolecular transformと定量的な一致の度合いを目安にtriple-helix構造を精密化する。

報告書

(4件)
  • 2001 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2000 実績報告書
  • 1999 実績報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (19件)

  • [文献書誌] K.Okuyama: "7/2-Helical model for collagen -Evidence from model peptides"Proc. Indian Acad. Sci. (Chem. Sci.). 111. 19-34 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Okuyama: "Structure analysis of a collagen-model peptide with a (Pro-Hyp-Gly) Sequence repeat"J. Biochem.. 125. 310-318 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 奥山 健二: "モデルペプチドを用いたコラーゲンの構造研究"日本結晶学会誌. 42. 346-353 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Okuyama: "Crystal structure analysis of a collagen-model peptide, (Pr-Pro-Gly)9 at 1.0Å resolution"Polymer J.. 33. 812-818 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 奥山 健二: "コラーゲンの三重らせん構造"理学電気ジャーナル. 32. 12-23 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Okuyama: "Structural study of collagen based on single crystal analyses of model peptides, in "Peptide Science 2000", ed. by T. Shioiri"The Japanese Peptide Society. 263-264 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K. Okuyama: "7/2-Helical model for collagen-Evidence from model peptides"Proc. Indian Acad. Sci.. 111. 19-34 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] V. Nagarajan: "Structure analysis of a collagen-model peptide with a (Pro-Hyp-Gly) sequence repeat"J. Biochem.. 125. 310-318 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K. Okuyama: "Triple-helical structure of collagen based on single crystal analyses of model peptides"J. Cryst. Soc, Jpn.. 42. 346-353 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] C. Hongo: "CrystaI structure analysis of a collagen-model peptide, (Pro-Pro-Gly) 9 at 1.0A resolution"Polymer J.. 33. 812-818 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K. Okuyama: "Triple-helical structure of collagen"The Rigaku-Denki Journal. 32. 12-23 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K. Okuyama: "Structural study of collagen based on single crystal analyses of model peptides"in "Peptide Science 2000", ed. By T. Shioiri. 263-264 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 奥山健二: "コラーゲンの三重らせん構造"理学電気ジャーナル. 32. 12-23 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] K. Okuyama: "Crystal Structure Analysis of a Collagen-Model Peptide, (Pro-Pro-Gly)_9"Polymer J.. 33. 812-818 (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] K. Okuyama: "Structural Study of Collagen Based on Single Crystal Analyses of Model Peptides In "Peptide Science 2000", ed. by T. Shioiri"The Japanese Peptide Society. 263-264 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] 奥山健二: "モデルペプチドを用いたコラーゲンの構造研究"日本結晶学会誌. 42. 346-353 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] V.Nagarajan: "Structure analysis of a collagen-model peptide with a (Pro-Hyp-Gly) sequence repeat"J. Biochem.. 125. 310-318 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] K.Okuyama: "1/2-Helical model for collagen -Evidence from model peptide"Proc. Indian Acad. Sci. (Chem. Sci.). 111(1). 19-34 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] 奥山健二(分担): "結晶解析ハンドブック 分担部分 繊維状高分子の構造解析"共立出版. 673 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書

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公開日: 1999-04-01   更新日: 2016-04-21  

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