| 研究課題/領域番号 |
11660003
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
育種学
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| 研究機関 | 京都大学 |
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研究代表者 |
谷坂 隆俊 京都大学, 農学研究科, 教授 (80026591)
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| 研究分担者 |
堀端 章 近畿大学, 生物理工学部, 助手 (70258060)
中崎 鉄也 京都大学, 農学研究科, 助手 (60217693)
奥本 裕 京都大学, 農学研究科, 助教授 (90152438)
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| 研究期間 (年度) |
1999 – 2000
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| 研究課題ステータス |
完了 (2000年度)
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| 配分額 *注記 |
3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
2000年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
1999年度: 2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
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| キーワード | イネ / 易変性突然変異 / YAC / トランスポゾン / 細粒遺伝子 / 易変性遺伝子 |
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| 研究概要 |
水稲品種銀坊主へのガンマ線照射によって誘発された易変性細粒突然変異遺伝子slgは高頻度で野生型に復帰することから、slgの中には活性が高いトランスポゾンが挿入されていると推察される。このトランスポゾンの構造を明らかにするため、slgのポジショナル・クローニングを試みた。slgは2YACクローン、Y1774およびY3356の重複部分に座乗することから、Y1774をプローブとして日本晴に由来する209個のcDNAクローンを選抜し、この中からPCRによって増幅可能であった54クローンの部分塩基配列を決定した。塩基配列を基に同一のクローンを除き、40個の独立クローンを得た。これらクローンをプローブとしてサザン解析を行い、両YACに座乗するクローンを決定した。また、同じプローブを用いたサザン解析により、原品種、細粒突然変異系統および復帰型個体間で多型の有無を調査した。多数のクローンが両YACにハイブリダイズしたが、クローンNo.27以外はイネゲノム全体に非特異的にハイブリダイズするため2個のYACに特異的なクローンであると断定できなかった。クローンNo.120を用いたサザン解析では、slg保有系統と原品種との間で多型が観察され、No.120はslg座近傍の遺伝子座の産物である可能性があると考えられた。また、slgの易変性が遺伝子のメチル化に起因する可能性を検証するため、slg保有系統と原品種との間でMspIサイトにおけるメチル・シトシンのシトシン全体に対する相対比を調査した。その結果、slg保有系統ではメチル・シトシンの相対比が原品種に比べて半減していた。この現象とslgの易変性との関係は未解明だが、slgはイネ・ゲノムのメチル化程度を変更する可能性が高いと考えられた。
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