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インプリント遺伝子およびトランスジーンの核内コミュニケーションの解析

研究課題

研究課題/領域番号 11660086
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用微生物学・応用生物化学
研究機関三重大学

研究代表者

奥村 克純  三重大学, 生物資源学部, 助教授 (30177183)

研究期間 (年度) 1999 – 2000
研究課題ステータス 完了 (2000年度)
配分額 *注記
3,600千円 (直接経費: 3,600千円)
2000年度: 1,400千円 (直接経費: 1,400千円)
1999年度: 2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
キーワードインプリント遺伝子 / FISH / DNAメチル化 / ヒストンアセチル化 / 核マトリクス / ヘテロクロマチン / SNRPN / 一次転写産物 / ヒストン脱アセチル化 / genome imprinting / intranuclear structure / Igf2r / Chromosome territory / gene silencing / heterochromatin
研究概要

動物特有の種々の生物学的な現象とゲノムや染色体構造、遺伝子の機能的発現とその核内配置、遺伝子間コミュニケーション等との関係を明らかにすることを目指し、まずヒトSNRPNと、近傍領域の15番染色体セントロメアの細胞周期に依存したコミュニケーション、核内配置、クロモソームテリトリーとの関係をヒトHL60細胞で検討した。HL60細胞ではこの遺伝子の複製タイミングや遺伝子発現のインプリンティングは維持されているものの、細胞周期依存的ホモログ間コミュニケーションが起こらず、これには複製や発現のコントロール以外の要因が関与することを示した。また同一染色体上のSNRPNとセントロメアはS期後期に核内の同じ分室にパッケージされること、これは複製後に起こり同一複製focusで複製されるのではないこと、SNRPNは発現にかかわらずテリトリー周辺部に、セントロメアはテリトリー内部に配置していることを明らかにした。次に遺伝子発現とサイレンシング、遺伝子の核内配置の関係の一局面を明らかにするため、核内一次転写産物の検出をSNRPNを例として可視化したところ、時間依存的に片アレルから両アレルに発現パターンが変化し、SNRPNの発現はDNAメチル化やヒストン脱アセチル化によって制御されることを明らかにした。一方、マウスIgf2のアレル特異的不活性化機構に核内ヘテロクロマチンが関与するか検討した。一方のアレルがヘテロクロマチンと結合する核が30%程度見られ、発現が抑制される父方アレルが結合する割合が多く、この機構の関与が示唆され、この結合割合はS期の進行とともに減少し、複製との関連性も示唆された。またマウス胚性線維芽細胞を用いてIgf2,H19等の発現状態も可視化し、インプリント遺伝子が、アレル特異的発現制御を受けること、遺伝子の発現状態と核マトリクスへの結合性は密接に関連することを見出した。

報告書

(3件)
  • 2000 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1999 実績報告書
  • 研究成果

    (42件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (42件)

  • [文献書誌] Naoyuki Fujita: "Methylation-mediated Transcriptional Silencing in Euchromatin by Methyl-CpG Binding Protein MBD1 Isoforms"Molecular and Cellular Biology. 19巻. 6415-6426 (1999)

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  • [文献書誌] Teijiro Aso: "Structural Organization and Chromosome Location of the Mouse Elongin A Gene (Tceb3)"Cytogenetics Cell Genetics. 86巻. 259-262 (1999)

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  • [文献書誌] Shaoping Xie: "Cloning, Expression, and Chromosome Locations of the Human DNMT3 Gene Family"Gene. 236巻. 87-95 (1999)

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  • [文献書誌] Masaki Okano: "Assignment of cytosine-5 DNA methyltransferases Dnmt3a and Dnmt3b to mouse chromosome bands 12A2-A3 and 2H1 by in situ hybridization"Cytogenetics Cell Genetics. 86巻. 333-334 (1999)

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  • [文献書誌] Tatsuya Hayashi: "Organization and Chromosomal Localization of the Human Endothelial Protein C Receptor Gene"Gene. 238巻. 367-373 (1999)

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  • [文献書誌] Masahiro Nogami: "Intranuclear Arrangement of Human Chromosome 12 Correlates to Large-scale Replication Domains"Chromosoma. 108巻. 514-522 (2000)

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  • [文献書誌] Masahiro Nogami: "Relative Locations of the Centromere and Imprinted SNRPN Gene within Chromosome 15 Territories During the Cell Cycle in HL60 Cells"Journal of Cell Science. 113巻. 2157-2165 (2000)

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  • [文献書誌] Hong-Seog Park: "Newly identified repeat sequences, derived from human chromosome 21q-ter are also localized in the subtelomeric region of particular chromosomes and 2q13, and are conserved in the chimpanzee genome"FEBS Letters. 475巻. 167-169 (2000)

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  • [文献書誌] Masaki Ishida: "DNA Fluorescence In Situ Hybridization in Paramecium : Telomere Localization in Macronucleus"Zoological Science. 17巻. 1289-1295 (2000)

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  • [文献書誌] Keizo Yuasa: "Genomic Organization of the Human Phosphodiesterase PDE11A Gene : Evolutionary Relatedness with Other PDEs Containing GAF Domains"European Journal of Biochemistry. 268巻. 168-178 (2001)

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  • [文献書誌] Tomohiro Ishii: "Projection of Three Subsets of Olfactory Neurons Expressing the Odorant Receptor Transgene and the Two Cognate Endogenous Alleles"Genes to Cells. 6巻. 71-78 (2001)

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  • [文献書誌] Hideo Michibata: "Novel splice variants, genomic organization, their specific expression and chromosomal localization of the human Ca2+/calmodulin-dependent phosphodiesterase (PDE1A) gene"Biochimica Biophysica Acta. (印刷中). (2001)

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  • [文献書誌] Atsushi Kohda: "Visualization of Biallelic Expression of the Imprinted SNRPN Gene Induced by Inhibitors of DNA Methylation and Histone Deacetylation"Bioscience Biotechnology and Biochemistry. (印刷中). (2001)

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  • [文献書誌] Atsushi Kohda: "Preparation of Extended Metaphase Chromosomes from Human Cultrued Cells Using a Topoisomerase II Inhibitor, ICRF-193"Bioscience Biotechnology and Biochemistry. (印刷中). (2001)

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  • [文献書誌] Naoyuki Fujita, et al.: "Methylation-mediated Transcriptional Silencing in Euchromatin by Methyl-CpG Binding Protein MBDI Isoforms :"Mol.Cell.Biol.. 19(cover). 6415-6426 (1999)

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  • [文献書誌] Teijiro Aso, et al.: "Structural Organization and Chromosome Location of the Mouse Elongin A Gene (Tceb3) :"Cytogenet. Cell Genet.. 86. 259-262 (1999)

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  • [文献書誌] Shaoping Xie, et al.: "Cloning, Expression, and Chromosome Locations of the Human DNMT3 Gene Family :"Gene. 236. 87-95 (1999)

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  • [文献書誌] Masaki Okano, et al.: "Assignment of Cytosine-5 DNA Methyltransferases Dnmt3a and Dnmt3b to Mouse Chromosome Bands 12A2-A3 and 2H1 by in situ Hybridization"Cytogenet.Cell Genet.. 86. 333-334 (1999)

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  • [文献書誌] Tatsuya Hayashi, et al.: "Organization and Chromosomal Localization of the Human Endothelial Protein C Receptor Gene :"Gene. 238. 367-373 (1999)

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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Masahiro Nogami, et al.: "Intranuclear Arrangement of Human Chromosome 12 Correlates to Large- scale Replication Domains :"Chromosoma. 108(cover). 514-522 (2000)

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  • [文献書誌] Masahiro Nogami, et al.: "Relative Locations of the Centromere and Imprinted SNRPN Gene within Chromosome 15 Territories During the Cell Cycle in HL60 Cells"J.Cell Sci.. 113. 2157-2165 (2000)

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  • [文献書誌] Hong-Seog Park, et al.: "Newly identified repeat sequences, derived from human chromosome 21q-ter, are also localized in the subtelomeric region of particular chromosomes and 2q13, and are conserved in the chimpanzee genome."FEBS Lett.. 475. 167-169 (2000)

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  • [文献書誌] Masaki Ishida, et al.: "DNA Fluorescence In Situ Hybridization in Paramecium : Telomere Localization in Macronucleus :"Zoological Sci.. 17. 1289-1295 (2000)

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  • [文献書誌] Keizo Yuasa, et al.: "Genomic Organization of the Human Phosphodiesterase PDE11A Gene : Evolutionary Relatedness with Other PDEs Containing"GAF Domains : Eur.J.Biochem.. 268. 168-178 (2001)

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  • [文献書誌] Tomohiro Ishii, et al.: "Monoallelic Expresion of the Odourant Receptor Gene and Axonal Projection of Olfactory Sensory Neurones :"Genes to Cells. 6. 71-78 (2001)

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  • [文献書誌] Hideo Michibata, et al.: "Novel splice variants, genomic organization, their specific expression and chromosomal localization of the human Ca2+/calmodulin-dependent phosphodiesterase (PDE1A) gene :"Biochim.Biophys.Acta.. (in press.).

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  • [文献書誌] Atsushi Kohda, et al.: "Visualization of Biallelic Expression of the Imprinted SNRPN Gene Induced by Inhibitors of DNA Methylation and Histone Deacetylation :"Biosci.Biotechnol.Biochem.. (in press.).

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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Atsushi Kohda, et al.: "Preparation of Extended Metaphase Chromosomes from Human Cultured Cells Using a Topoisomerase II Inhibitor, ICRF-193 :"Biosci.Biotechnol.Biochem.. (in press.).

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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Masahiro Nogami: "Relative Locations of the Centromere and Imprinted SNRPN Gene within Chromosome 15 Territories During the Cell Cycle in HL60 Cells"Journal of Cell Science. 113巻12号. 2157-2165 (2000)

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      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Hong-Seog Park: "Newly identified repeat sequences, derived from human chromosome 21q-ter, are also localized in the subtelomeric region of particular chromosomes and 2q13. and are conserved in the chimpanzee genome"FEBS Letters. 475巻3号. 167-169 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Masaki Ishida: "DNA Fluorescence In Situ Hybridization in Paramecium : Telomere Localization in Macronucleus"Zoological Science. 17巻. 1289-1295 (2000)

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      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Keizo Yuasa: "Genomic Organization of the Human Phosphodiesterase PDE11A Gene : Evolutionary Relatedness with Other PDEs Containing GAF Domains"European Journal of Biochemistry. 268巻1号. 168-178 (2001)

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      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Tomohiro Ishii: "Projection of Three Subsets of Olfactory Neurons Expressing the Odorant Receptor Transgene and the Two Cognate Endogenous Alleles"Genes to Cells. 6巻1号(印刷中). (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Hideo Michibata: "Novel splice variants, genomic organization, their specific expression and chromosomal localization of the human Ca2+/calmodulin-dependent phosphodiesterase (PDE1A) gene"Biochimica Biophysica Acta. (印刷中). (2001)

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      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Atsushi Kohda: "Visualization of Biallelic Expression of the Imprinted SNRPN Gene Induced by Inhibitors of DNA Methylation and Histone Deacetylation"Bioscience Biotechnology and Biochemistry. 65巻5号(印刷中). (2001)

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      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Atsushi Kohda: "Preparation of Extended Metaphase Chromosomes from Human Cultured Cells Using a Topoisomerase II Inhibitor, ICRF-193"Bioscience Biotechnology and Biochemistry. 65巻5号(印刷中). (2001)

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  • [文献書誌] Naoyuki Fujita: "Methylation-mediated Transcriptional Silencing in Euchromatin by Methyl-CpG Binding Protein MBD1 Isoforms"Molecular and Cellular Biology. 19巻9号. 6415-6426 (1999)

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      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Teijiro Aso: "Structural Organization and Chromosome Location of the Mouse Elongin A Gene (Tceb3)"Cytogenetics Cell Genetics. 86巻3-4号. 259-262 (1999)

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      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Shaoping Xie: "Cloning,Expression,and Chromosome Locations of the Human DNMT3 Gene Family"Gene. 236巻1号. 87-95 (1999)

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      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Masaki Okano: "Assignment of cytosine-5 DNA methyltransferases Dnmt3a and Dnmt3b to mouse chromosome bands 12A2-A3 and 2H1 by in situ hybridization"Cytogenetics Cell Genetics. 86巻3-4号. 333-334 (1999)

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      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Tatsuya Hayashi: "Organization and Chromosomal Localization of the Human Endothelial Protein C Receptor Gene"Gene. 238巻2号. 367-373 (1999)

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      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Masahiro Nogami: "Intranuclear Arrangement of Human Chromosome 12 Correlates to Large-scale Replication Domains"Chromosoma. (印刷中).

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      1999 実績報告書

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公開日: 1999-04-01   更新日: 2016-04-21  

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