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巨大DNA断片の移入による発がん関連遺伝子の単離

研究課題

研究課題/領域番号 11671147
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 外科学一般
研究機関東北大学

研究代表者

古川 徹  東北大学, 大学院・医学系研究科, 助手 (30282122)

研究分担者 砂村 眞琴  東北大学, 医学部・附属病院, 講師 (10201584)
福重 真一  東北大学, 大学院・医学系研究科, 講師 (90192723)
堀井 明  東北大学, 大学院・医学系研究科, 教授 (40249983)
渋谷 和彦  東北大学, 医学部・附属病院, 助手 (70260429)
研究期間 (年度) 1999 – 2000
研究課題ステータス 完了 (2000年度)
配分額 *注記
3,600千円 (直接経費: 3,600千円)
2000年度: 1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
1999年度: 1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
キーワード膵臓がん / ゲノム / 6q / 12q / 18q / BAC / 染色体 / STS
研究概要

膵がんでは染色体1p,6q,9p,12q,17p,18qにヘテロ接合性の喪失(LOH)が高頻度に認められる。これらLOHの領域には機能喪失性の異常を来して膵がんの発生、進展に関与しているがん抑制遺伝子が存在する可能性が高い。本研究はこれら欠失領域を含む巨大DNA断片を用意し、それを欠失を示すがん細胞に導入し、腫瘍抑制効果を確認した上で発現遺伝子の探索から欠失領域に存在するがん抑制遺伝子を見い出すことを目的とした。欠失領域を含む巨大DNA断片を見い出すために酵母人工染色体(YAC)、細菌人工染色体(BAC)のマッピングを行った。6q,12q,上の欠失領域を完全にカバーするYAC,BACコンティグを完成させた。6q21上の最小欠失領域は500-kbのYACに含まれ、BAC3個によりカバーされるが、さらに周辺の領域を含む、BAC10個よりなる物理的距離1-Mb相当のBACコンティグを完成させた。本領域にはexpressed sequence tag(EST)が42個含まれることを明らかにした。このコンティグはWeb上http://www-alis.tokyo.jst.go.jp/HGS/plmap.pl?PIID=14で公開している。12q21上の欠失領域は1.5-MbのYAC2個、平均140-kbのBAC21個でカバーされる。同部位において新規のsequence tagged sites(STS)を40個同定し、ESTを10個マッピングした。欠失領域をカバーするクローンから新規遺伝子を幾つか単離し解析した。また、移入する膵がん細胞の遺伝的性質を知るために既知の腫瘍関連遺伝子について異常の有無を解析した。18qの欠失が比較的早期の膵腫瘍病変で認められることを明らかにした。18q複数のクローンをとってその表現型の解析、移入染色体のマッピング、候補がん抑制遺伝子の解析を行った。18番染色体を移入することにより18番染色体上及びそれに関連すると考えられる遺伝子群の発現回復が認められ、in vitroでの増殖抑制効果、in vivoでの造腫瘍性抑制効果が認められた。

報告書

(3件)
  • 2000 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1999 実績報告書
  • 研究成果

    (30件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (30件)

  • [文献書誌] Makino, N.et al.: "Isolation and characterization of the human gene homologous to the Drosophila headcase(hdc) gene in chromosome bands 6q23-q24, a region of common deletion in human pancreatic cancer. "DNA Sequence. (In press).

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  • [文献書誌] Inoue, H.et al.: "Exclusion of SMAD4 mutation as an early genetic change in human pancreatic ductal adenocarcinoma."Genes, Chromosomes and Cancer. (In press).

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  • [文献書誌] Youssef, E.et al.: "Human BAC contig covering the deleted region in pancreatic cancer at 12q21."DNA Sequence. (In press).

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  • [文献書誌] Sun, C.et al.: "Characterization of the mutations of the K-ras, p53, p16, and SMAD4 genes in 15 human pancreatic cancer cell lines."Oncology Report. 8. 89-92 (2001)

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  • [文献書誌] Sakurada, K.et al.: "RIZ, the retinoblastoma protein interacting zinc finger gene, is mutated in genetically unstable cancers of the pancreas, stomach, and colorectum."Genes, Chromosomes and Cancer. 30. 207-211 (2001)

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  • [文献書誌] Kondo, E.et al.: "Not hMSH2 but hMLH1 is frequently silenced by hypermethylation in endometrial cancer but rarely silenced in pancreatic cancer with microsatellite instability."International Journal of Oncology. 17. 535-541 (2000)

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  • [文献書誌] Yatsuoka, T.et al.: "Association of poor prognosis with loss of 12q, 17p, and 18q, and concordant loss of 6q/17p and 12q/18q in human pancreatic ductal adenocarcinoma."American Journal of Gastroenterology. 95. 2080-2085 (2000)

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  • [文献書誌] Furukawa, T.et al.: "Cloning and characterization of the human UDP-N-acetylglucosamine : a-1, 3-D-mannoside b-1, 4-N-acetylglucosaminyltransferase IV-homologue(hGnT-IV-H) gene."Journal of Human Genetics. 44. 397-401 (1999)

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  • [文献書誌] Yatsuoka, T.et al.: "Genomic analysis of the thymine-DNA glycosylase(TDG) gene on 12q22-q24. 1 in human pancreatic ductal adenocarcinoma"International Journal of Pancreatology. 25. 97-102 (1999)

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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Abe, T.et al.: "Identification of three commonly deleted regions on chromosome arm 6q in human pancreatic cancer."Genes, Chromosomes and Cancer. 25. 60-64 (1999)

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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Abe, T., Makino, N., Furukawa, T., Ouyang, H., Kimura, M., Yatsuoka, T., Yokoyama, T., Inoue, H., Fukushige, S., Hoshi, M., Hayashi, Y., Sunamura, M., Kobari, M., Matsuno, S.and Horii, A.: "Identification of three commonly deleted regions on chromosome arm 6q in human pancreatic cancer."Genes, Chromosomes and Cancer. 25. 60-64 (1999)

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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yatsuoka, T., Furukawa, T., Abe, T., Yokoyama, T., Sunamura, M., Kobari, M., Matsuno, S.and Horii, A.: "Genomic analysis of the thymine-DNA glycosylase (TDG) gene on 12q22-q24.1 in human pancreatic ductal adenocarcinoma."International Journal of Pancreatology. 25. 97-102 (1999)

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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Furukawa, T., Youssef, E.M., Yatsuoka, T., Yokoyama, T., Makino, N., Inoue, H., Fukushige, S., Hoshi, M., Hayashi, Y., Sunamura, M.and Horii, A.: "Cloning and characterization of the human UDP-N-acetylglucosamine : alpha-1,3-D-mannoside beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase IV- homologue (hGnT-IV-H) gene."Journal of Human Genetics. 44. 397-401 (1999)

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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yatsuoka, T., Sunamura, M., Furukawa, T., Fukushige, S., Yokoyama, T., Inoue, H., Shibuya, K, Takeda, K, Matsuno, S., and Horii, A.: "Association of poor prognosis with loss of 12q, 17p, and 18q, and concordant loss of 6q/17p and 12q/18q in human pancreatic ductal adenocarcinoma."American Journal of Gastroenterology. 95. 2080-2085 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kondo, E., Furukawa, T., Yoshinaga, K., Kijima, H., Semba, S., Yatsuoka, T., Yokoyama, T., Fukushige, S., and Horii, A.: "Not hMSH2 but hMLH1 is frequently silenced by hypermethylation in endometrial cancer but rarely silenced in pancreatic cancer with microsatellite instability."International Journal of Oncology. 17. 535-541 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Sun, C., Yamato, T., Furukawa, T., Ohnishi, Y., Kijima, H., and Horii, A.: "Characterization of the mutations of the K-ras, p53, p16, and SMAD4 genes in 15 human pancreatic cancer cell lines."Oncology Report. 8. 89-92 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Youssef, E.M., Kaneko, K., Yatsuoka, T., Hayashi, Y., Hoshi, M., Horii, A., Furukawa, T.: "Human BAC contig covering the deleted region in pancreatic cancer at 12q21."DNA Sequence. (in press).

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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Inoue, H., Furukawa, T., Sunamura, M., Takeda, K., Matsuno, S., Horii, A.: "Exclusion of SMAD4 mutation as an early genetic change in human pancreatic ductal adenocarcinoma. Gen.Chromosom."Genes, Chromosomes and Cancer. (in press).

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Makino, N., Yamato, T., Inoue, H., Furukawa, T., Abe, T., Yokoyama, T., Yatsuoka, T., Fukushige, S., Orikasa, S., Takahashi, T., Horii, A.: "Isolation and characterization of the human gene homologous to the Drosophila headcase (hdc) gene in chromosome bands 6q23-q24, a region of common deletion in human pancreatic cancer."DNA Sequence. (in press).

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Makino,N. et al. : "Isolation and characterization of the human gene homologous to the Drosophila headcase (hdc) gene in chromosome bands 6q23-q24, a region of common deletion in human pancreatic cancer."DNA Sequence. (In press).

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Inoue,H. et al.: "Exclusion of SMAD4 mutation as an early genetic change in human pancreatic ductal adenocarcinoma."Genes,Chromosomes and Cancer. (In press).

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Youssef,E. et al.: "Human BAC contig covering the deleted region in pancreatic cancer at 12q21."DNA Sequence. (In press).

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Sun,C. et al.: "Characterization of the mutations of the K-ras, p53, p16, and SMAD4 genes in 15 human pancreatic cancer cell lines."Oncology Report. 8. 89-92 (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Sakurada,K. et al.: "RIZ, the retinoblastoma protein interacting zinc finger gene, is mutated in genetically unstable cancers of the pancreas, stomach, and colorectum."Genes, Chromosomes and Cancer. 30. 207-211 (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Kondo,E. et al.: "Not hMSH2 but hMLH1 is frequently silenced by hypermethylation in endometrial cancer but rarely silenced in pancreatic cancer with microsatellite instability"International Journal of Oncology. 17. 535-541 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Yatsuoka,T. et al.: "Association of poor prognosis with loss of 12q,17p,and 18q,and concordant loss of 6q/17p and12q/18q in human pancreatic ductal adenocarcinoma."American Journal of Gastroenterology. 95. 2080-2085 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Yatsuoka,T.et al.: "Association of poor prognosis with loss of 12q, 17p, and 18q, and concordant loss of 6q/17p and 12q/18q in human pancreatic ductal adenocarcinoma"American Journal of Gastroenterology. (in press).

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Furukawa,T.et al.: "Cloning and characterization of the human UDP-N-acetylglucosamine : a-1,3-D-mannoside b-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase IV-homologue (hGnT-IV-H) gene"Journal of Human Genetics. 44. 397-401 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Yatsuoka,T.et al.: "Genomic analysis of the thymine-DNA glycosylase (TDG) gene on 12q22-q24.1 in human pancreatic ductal adenocarcinoma"International Journal of Pancreatology. 25. 97-102 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Abe,T.et al.: "Identification of three commonly deleted regions on chromosome arm 6q in human pancreatic cancer"Genes, Chromosomes and Cancer. 25. 60-64 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書

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公開日: 1999-04-01   更新日: 2016-04-21  

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