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RNAを選択的に分子認識する核酸誘導体の開発

研究課題

研究課題/領域番号 11680589
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物有機科学
研究機関京都工芸繊維大学

研究代表者

岩瀬 礼子  京都工芸繊維大学, 繊維学部, 助手 (90283697)

研究分担者 村上 章  京都工芸繊維大学, 繊維学部, 教授 (60210001)
研究期間 (年度) 1999 – 2000
研究課題ステータス 完了 (2000年度)
配分額 *注記
3,600千円 (直接経費: 3,600千円)
2000年度: 2,000千円 (直接経費: 2,000千円)
1999年度: 1,600千円 (直接経費: 1,600千円)
キーワードRNA誘導体 / RNA結合性 / アンチセンス / 2',4'-アミノメチル結合 / アミド結合型RNA / オリゴヌクレオチド / A型構造 / 核酸分解酵素耐性 / RNAアナログ / RNA結合能 / アミノメチル結合 / C3'-endo / アミド結合 / 2'-4'結合
研究概要

RNA結合性と核酸分解酵素耐性を持つ新規修飾核酸の創出を目的として、アミド結合型RNA、及び、2',4'-アミノメチル結合型オリゴヌクレオチドの開発を行った。
1.アミド結合型RNAの固相合成法の開発とその性質
RNAのリン酸ジエステル結合をアミド結合に置換した修飾RNA(U^*U(1),U^*U^*U^*U^*U^*U(2)、CCCUUUU^*U^*U^*U(3)(^*:アミド結合))をホスホニウム系縮合剤PyBOPを用いて固相合成する方法を開発した。U^*Uは核酸分解耐性があり、かつ、3'-カルボキシメチル基を持つリボヌクレオシド誘導体の糖構造が、C3'-endo型に固定化されていることがわかった。また、3とRNA相補鎖は、非修飾体の場合と同様な安定性の二重鎖を形成し、その構造はA型であることがわかった。従って、アミド結合型RNAは、RNA結合性のある核酸分解酵素耐性型RNAであることが示唆された。今後、遺伝子制御やRNA構造検索プローブとしての利用への展開が期待できる。
2.2',4'-アミノメチル結合型核酸の開発
核酸のリン酸ジエステル結合を短鎖の2',4'-アミノメチル結合に置換した修飾オリゴヌクレオチドUaTUaTT(4)及びdCCCTUaTTTTT(5)(a:2',4'-アミノメチル結合)を合成した。4の3'-エキソヌクレアーゼに対する抵抗性の検討から、2',4'-アミノメチル結合が3'末端にあるオリゴヌクレオチドは、強い分解耐性を示すことがわかった。また、4は1本鎖でA型構造を形成し、RNA相補鎖とA型二重鎖構造を形成しやすい骨格を持つ可能性が示唆された。5は、RNA相補鎖とA型二重鎖構造を形成するが、2',4'-アミノメチル結合を1カ所導入したことによる二重鎖の不安定化が生じた。今後、2',4'-アミノメチル結合の導入数と二重鎖構造の安定性の関係を検討する必要がある。

報告書

(3件)
  • 2000 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1999 実績報告書
  • 研究成果

    (24件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (24件)

  • [文献書誌] K.Yamana: "2'-Pyrene modified oligonucleotide provides a highly sensitive fluorescent probe of RNA"Nucleic Acids Res.. 27,11. 2387-2392 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] R.Iwase: "Study on RNA structure by pyrene-labeled 2'-O-methyloligoribonucleotides"Nucleic Acids Symposium Series. 42. 115-116 (1999)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] R.Iwase: "Photodynamic antisense regulation using psoralen-conjugated oligo (nucleotide phosphorothioate)s (I) Growth regulation of cervical carcinoma cells."Nucleic Acids Symposium Series. 42. 223-224 (1999)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A.Mahara: "Characterization of RNA structure by bis-pyrene-labeled 2'-O-methyloligonucleoides."Nucleic Acids Symposium Series. 44. 199-200 (2000)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Kimura: "Effect of serine residue on the effectiveness of cationic polypeptide-based gene delivery."Nucleic Acids Symposium Series. 44. 299-300 (2000)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Yamaoka: "Enhanced expression of foreign gene transferred to Mammalian cells in vitro using chemically modified poly(L-lysine)s as gene carriers"Chem.Lett.. 118-119 (2000)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Yamana: "2'-Pyrene Modified Oligonucleotide Provides a Highly Sensitive Fluorescent Probe of RNA."Nucl. eic Acids Res.. 27. 2387-2392 (1999)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] R.Iwase: "Study on RNA structure by pyrene-labeled 2'-O- methyloligoribonucleotides."Nucleic Acids Symposium Series. 42. 115-116 (1999)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] R.Iwase: "Photodynamic antisense regulation using psoralenconjugated oligo (nucleotide phosphorothioate) s (I) Growth regulation of cervical carcinoma cells."Nucleic Acids Symposium Series. 42. 223-224 (1999)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A.Mahara: "Characterization of RNA structure by bis-pyrene-labeled 2'-O- methyloligonucleoides."Nucleic Acids Symposium Series. 44. 199-200 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Kimura: "Effect of serine residue on the effectiveness of cationic polypeptide-based gene delivery."Nucleic Acids Symposium Series. 44. 299-300 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Yamaoka: "Enhanced expression of foreign gene transferred to Mammalian cells in vitro using chemically modified poly (L-lysine) s as gene carriers."Chem. Lett. 118-119 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Yamana: "2'-Pyrene modified oligonucleotide provides a highly sensitive fluorescent probe of RNA."Nucleic A cids Res.. 27,11. 2387-2392 (1999)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] R.Iwase: "Study on RNA structure by pyrene-labeled 2'-O-methyloligoribonucleotides"Nucleic A cids Symposium Series. 42. 115-116 (1999)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] R.Iwase: "Photodynamic antisense regulation using psoralen-conjugated oligo (nucleotide phosphorothioate)s (I) Growth regulation of cervical carcinoma cells."Nucleic A cids Symposium Series. 42. 223-224 (1999)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] A.Mahara: "Characterization of RNA structure by bis-pyrene-labeled 2'-O-methyloligonucleoides."Nucleic A cids Symposium Series. 44. 199-200 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] T.Kimura: "Effect of serine residue on the effectiveness of cationic polypeptide-based gene delivery."Nucleic A cids Symposium Series. 44. 299-300 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] T.Yamnaoka: "Enhanced expression of foreign gene transferred to Mammalian cells in vitro using chemically modified poly (L-lysine) s as gene carriers"Chem.Lett.. 118-119 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Iwase, R.: "Study on RNA Structure by pyrene-labeled 2'-O-methyloligoribonucleotides"Nucl. Acids Res. Symp. Series. 42. 115-116 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Iwase,R.: "Photodynamic Antisense Regulation Growth using Psoralen-conjugated Oligo(nucleoside phosphorothioate)s(l) Growth Regulation of Cervical Carcinoma Cells"Nucl. Acids Res. Symp. Series. 42. 223-224 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Murakami,A.: "Photodynamic Antisense Pegulation (PDAR) of Human Cervical Carcinoma Cell Growth using Psoralen-conjugated Oligo(nucleoside phosphorothioate)"Eur. J. Pharm. Sci.. (in press).

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Murakami,A.: "Photodynamic Antisense Pegulation (PDAR) of Human Cervical Carcinoma Cell"FBPS' 99 Proceedings: Biomedical Polymers and Polymer Therapeutics. (in press).

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Yamaoka,T.: "Enhanced expression of foreign gene transferred to Mammalian cells in vitro using chemically modified poly(L-lysine)s as gene carriers:"Chem Lett.. 2000. 118-119 (2000)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Yamana,K.: "Hybridization switch for fluorescence of 2'-pyrene modified ribonucleoside incorporated into oligonucleotides;"Nucl. Acids Res.. 27・11. 2387-2392 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書

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公開日: 1999-04-01   更新日: 2016-04-21  

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