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高時間分解能電気測定・分光測定によるハロロドプシンのポンプ機能の解明

研究課題

研究課題/領域番号 11680653
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物物理学
研究機関東京工業大学

研究代表者

宗行 英朗  東京工業大学, 資源化学研究所, 助手 (80219865)

研究期間 (年度) 1999 – 2001
研究課題ステータス 完了 (2001年度)
配分額 *注記
3,700千円 (直接経費: 3,700千円)
2001年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2000年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
1999年度: 1,500千円 (直接経費: 1,500千円)
キーワードハロロドプシン / イオンポンプ / 光サイクル / 光起電性 / 分光測定 / フォトサイクル / 電荷移動
研究概要

平成11年度は,実験装置・結果の解析系の改良をまず行った.従来の高時間分解能電気測定装置の入力インピーダンスをさらに高くして,測定可能な時間領域をのばすとともに,解析系のプログラムを移動平均を取りながら,間引き処理をするように改良した.
平成12-13年度は,H.salinarum由来のハロロドプシンを用いて,輸送イオンであるCl^-の濃度を広範囲に変化させて,どの反応ステップが輸送に関わっているかを詳細に検討した.その結果,H.salinarum由来のハロロドプシンは3MCl^-存在下でmsecとsub-msecのオーダーの時定数を持つ電荷移動を示した.Cl^-濃度を更に上げていくとmsecの時間領域で起こる電荷移動が顕著に遅くなることが観察され,信号強度も減少した.この結果は,遅い電荷移動の成分が,蛋白内部から表面へのCl^-移動に関与することを示す.そこで時定数の増加は,この表面にある結合部位が空の状態である確率に関係し,強度の減少は,エネルギー化状態が緩和することによるものと仮定して解析した結果,エネルギー化状態の寿命が,約90msecと見積もられた(現在投稿中).
また,日立基礎研の大友純博士の協力を得て,Shark株のハロロドプシンの野生型及びR108Q変異体を供与していただき,その起電性について検討した.その結果,従来Cl^-輸送に必須と言われていたR108をQに変異させたものでもCl^-濃度を非常に上げてやると起電性を示すこと,そのCl^-濃度依存性は見かけ上急峻な協同性を示すことなどが明らかになった.
一方イオンポンプの動作機構に関して確率的な要素を大幅に取り入れたモデルを構築した.現在,このモデルを拡張して自由エネルギーの概念を自然に取り込んで熱力学・統計力学との関連が明らかになるように改良中である.

報告書

(4件)
  • 2001 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2000 実績報告書
  • 1999 実績報告書
  • 研究成果

    (52件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (52件)

  • [文献書誌] Mitome, N, Ono, S., Suzuki, T., Shimabukuro, K., Muneyuki, E, Yoshida, M.: "Presence of phosphate at a catalytic site suppresses the formation of the MgADP inhibited form of F_1-ATPase"Eur. J. Biochem.. 269. 53-60 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hirono-Hara, Y., Noji, H., Nishiura, M., Muneyuki, E., Hara, K-Y., Yasuda, R., Kinosita, K., Jr., Yoshida, M.: "Pause and rotation of F_1-ATPase during catalysis"Proc. Natl Acad. Sci. USA. 98. 13649-13654 (2001)

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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shibata, A., Ikema, H., Ueno, S., Muneyuki, E., Higuti, T.: "Alkane derivative-bacteriorhodopsin interaction : proton transport and protein structure"Colloids Surf B Biointerfaces. 22. 31-38 (2001)

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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Eiro Muneyuki, Takaaki A. Fukami: "Properties of the stochastic energization-relaxation channel model for vectorial ion transport"Biophys. J.. 78. 1166-1175 (2000)

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  • [文献書誌] Daichi Okuno, Makoto Asaumi, Eiro Muneyuki: "Chloride concentration dependency of the electrogenic activity of halorhodopsin"Biochemistry. 38. 5422-5429 (1999)

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  • [文献書誌] Tsunoda, S.P., Muneyuki, E., Amano, T., Yoshida, M., Noji, H.: "Cross-linking of Two Subunits in the Closed Conformation in F_1-ATPase"J. Biol. Chem.. 274. 5701-5706 (1999)

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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] E.Muneyuki, C.Shibazaki, H.Ohtani, D.Okuno, M.Asaumi, T.Mogi: "Time-Resolved Measurements of Photovoltage Generation by Bacteriorhodopsin and Halorhodopsin Adsorbed on a Thin Polymer Film"J. Biochem.. 125. 270-276 (1999)

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  • [文献書誌] Yoshida, M., Muneyuki, E.Hisabori, T.: "ATP SYNTHASE -A MARVELLOUS ROTARY ENGINE OF THE CELL"Nature Review Molecular Cell Biology. 2. 669-677 (2001)

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  • [文献書誌] Masaike, T., Noji, H., Muneyuki, E., Yassuda, R., Kinosita Jr.K., Yoshida, M.: "Rotation of F_1-ATPase and the hinge residues of the β subunit"J. Exper.Biol.. 203. 1-8 (2000)

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  • [文献書誌] Muneyuki, E., Noji, H., Amano, T., Masaike, T., Yoshida, M.: "FoF_1-ATP synthase ; general structural features of "ATP-engine" and a problem on free energy transduction"Biochim.Biophys.Acta. 1458. 467-481 (2000)

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  • [文献書誌] Bald, D., Muneyuki, E., Amano, T., Kruip, J., Hisabori, T., Yoshida, M.: "The noncatalytic site-deficient α_3β_3γ subcomplex and FoF_1-ATP synthase can continuously catalyze ATP hydrolysis when Pi is present"Eur. J. Biochem.. 262. 563-568 (1999)

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  • [文献書誌] Amano, T., Matsui, T., Muneyuki, E., Noji, H., Yoshida, M., Hisabori, T.: "α_3β_3γ Complex of F_1-ATPase from thermophilic Bacillus PS3 can maintain steady-state ATP hydrolysis activity depending on the number of non-catalytic sites"Biochem. J.. 343. 135-138 (1999)

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  • [文献書誌] 宗行 英朗, 吉田 賢右: "熱揺らぎの中で働くナノ分子モーター"未来材料. 1・5. 2-5 (2001)

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  • [文献書誌] 宗行英朗, 吉田賢右: "新ミトコンドリア学 第一章1・3エネルギー転換系と分子モーター"内海耕慥・井上正康 監修 共立出版. 14-21 (2001)

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  • [文献書誌] 久堀 徹, 宗行英朗, 野地博行, 吉田賢右: "シリーズ・ニューバイオフィジックスII-3ポンプとトランスポーター 第一章 ATP合成酵素"ss. 19-40 (2000)

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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Noriyo Mitome, Sakurako Ono, Toshiharu Suzuki, Katsuya Shimabukuro, Eiro Muneyuki, Masasuke Yoshida: "Presence of phosphate at a catalytic site suppresses the formation of the MgADP inhibited form of F_1-ATPase"Eur. J. Biochem.. 269. 53-60 (2002)

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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yoko Hirono-Hara, Hiroyuki Noji, Masaya Nishiura, Eiro Muneyuki, Kiyotaka Y. Hara, Ryohei Yasuda, Kazuhiko Kinosita, Jr., and Masasuke Yoshida: "Pause and rotation of F_1-ATPase during catalysis"Proc. Natl Acad. Sci. USA. 98. 13649-13654 (2001)

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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shibata, A., Ikema, H., Ueno, S., Muneyuki, E., Higuti, T.: "Alkane derivative-bacteriorhodopsin interaction : proton transport and protein structure"Colloids Surf B Biointerfaces. 22. 31-38 (2001)

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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Eiro Muneyuki and Takaaki A. Fukami: "Properties of the stochastic energization-relaxation channel model for vectorial ion transport"Biophys. J.. 78. 1166-1175 (2000)

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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Toyoki Amano, Tadashi Matsui, Eiro Muneyuki, Hiroyuki Noji, Masasuke Yoshida and Toru Hisabori: "α_3β_3γ Complex of F_1-ATPase from thermophilic Basillus PS3 can maintain steady-state ATP hydrolysis activity depending on the number of non-catalytic sites"Biochem. J.. 343. 135-138 (1999)

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  • [文献書誌] Dirk Bald, Eiro Muneyuki, Toyoki Amano, Jochen Kruip, Toru Hisabori, and Masasuke Yoshida: "The noncatalytic site-deficient α_3β_3γ subcomplex and FoF_1-ATP synthase can continuously catalyze ATP hydrolysis when Pi is present"Eur. J. Biochem.. 262. 563-568 (1999)

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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Daichi Okuno, Makoto Asaumi, and Eiro Muneyuki: "Chloride concentration dependency of the electrogenic activity of halorhodopsin"biochemistry. 38. 5422-5429 (1999)

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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Satoshi P. Tsunoda, Eiro Muneyuki, Toyoki Amano, Masasuke Yoshida, and Hiroyuki Noji: "Cross-linking of Two Subunits in the Closed Conformation in F_1-ATPase"J. Biol. Chem.. 274. 5701-5706 (1999)

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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] E. Muneyuki, C. Shibazaki, H. Ohtani, D. Okuno, M. Asami, and T. Mogi: "Time-Resolved Measurements of Photovoltage Generation by Bacteriorhodopsin and Halorhodopsin Absorbed on a Thin Polymer Film"J. Biochem.. 125. 270-276 (1999)

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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Masasuke Yoshida, Eiro Muneyuki and Toru Hisabori: "ATP SYNTHASE - A MARVELLOUS ROTARY ENGINE OF THE CELL"Nature Review Molecular Cell Biology. 2. 669-677 (2001)

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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tomoko Masaike, Hiroyuki Noji, Eiro Muneyuki, Ryohei Yassuda, Kazuhiko Kinosita Jr. and Masasuke Yoshida: "Rotation of F_1-ATPase and the hinge residues of the β subunit"J. Exper. Biol.. 203. 1-8 (2000)

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      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Eiro Muneyuki, Hiroyuki Noji, Toyoki Amano, Tomoko Masaike and Masasuke Yoshida: "FoF_1-ATP synthase ; general structural features of "ATP-engine" and a problem on a free energy transduction"Biochim. Biophys. Acta. 1458. 467-481 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Mitome, N, Ono, S., Suzuki, T, Shimabukuro, K, Muneyuki.E., Yoshida, M.: "Presence of phosphate at a catalytic site suppresses the formation of the MgADP inhibited form of F_1-ATPase"Eur.J.Biochem. 269. 53-60 (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Hirono-Hara, Y., Noji.H, Nishiura, M., Muneyuki, E., Hara, K-Y, Yasuda, R, Kinosita, K, Jr., Yoshida, M: "Pause and rotation of F_1-ATPase during catalysis"Proc. Natl Acad. Sci. USA. 98. 13649-13654 (2001)

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      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Shibata, A., ikema, H., Ueno, S., Muneyuki, E., Higuti, T.: "Alkane derivative-bacteriorhodopsin interaction : proton transport and protein structure"Colloids Surf B Biointerfaces. 22. 31-38 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Eiro Muneyuki, Takaaki A., Fukami: "Properties of the stochastic energization-relaxation channel model for vectorial ion transport"Biophys.J.. 78. 1166-1175 (2000)

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      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Daichi Okuno, Makoto Asaumi, Eiro Muneyuki: "Chloride concentration dependency of the electrogenic activity of halorhodopsin"Biochemistry. 38. 5422-5429 (1999)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Tsunoda, S.P., Muneyuki, E., Amano, T., Yoshida, M., Noji, H.: "Cross-linking of Two Subunits in the Closed Conformation in F_1-ATPase"J.Biol.Chem.. 274. 5701-5706 (1999)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] E.Muneyuki, C.Shibazaki, H.Ohtani, D.Okuno. M.Asaumi, T.Mogi: "Time-Resolved Measurements of Photovoltage Generation by Bacteriorhodopsin"J.Biochem. 125. 270-276 (1999)

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      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Yoshida, M. Muneyuki, E., Hisabori, T.: "ATP SYNTHASE-A MARVELLOUS ROTARY ENGINE OF THE CELL"Nature Review Molecular Cell Biology. 2. 669-677 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Masaike, T., Noji, H., Muneyuki, E., Yassuda, R., Kinosita, Jr. K., Yoshida, M.: "Rotation of F^1-ATPase and the hinge residues of the β subunit"J. Exper. Biol. 203. 1-8 (2000)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Muneyuki, E., Noji, H., Amano, T., Masaike. T, Yoshida, M.: "FoF^1-ATP synthase ; general structural features of "ATP-engine" and a problem on free energy transduction"Biochem. Biophys. Acta. 1458. 467-481 (2000)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] 宗行 英朗, 吉田 賢右: "熱揺らぎの中で働くナノ分子モーター"未来材料. 1・5. 2-5 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] 宗行英朗, 吉田賢右: "新ミトコンドリア学第一章 1・3エネルギー転換系と分子モーター"内海耕造・井上正康監修共立出版. 14-21 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] 久堀 徹, 宗行英朗, 野地博行, 吉田賢右: "シリーズ・ニューバイオフィジックスII-3ポンプとトランスポーター 第一章 ATP合成酵素"平田肇, 茂木立志編共立出版. 19-40 (2000)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Eiro Muneyuki and Takaaki A.Fukami: "Properties of the stochastic energization-relaxation channel model for vectorialion transport"Biophys. J. 78. 1166-1175 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Masaike,T.,Noji,H.,Muneyuki,E.,Yassuda,R.,Kinosita K.Jr.,Yoshida M.: "Rotation of F_1-ATPase and the hinge residues of the β subunit"J.Exp.Biol.. 203. 1-8 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Muneyuki,E.,Noji,H.,Amano,T.,Masaike T.,Yoshida,M.: "FoF_1-ATP synthase ; general structural features of "ATP-engine" and a problem on free energy transduction"Biochim.Biophys.Acta. 1458. 467-481 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] 久堀徹,宗行英朗,野地博行,吉田賢右: "シリーズ・ニューバイオフィジックスII-3 ポンプとトランスポーター(平田肇,茂木立 志編)第一章 ATP合成酵素"共立出版. 22/240 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Eiro Muneyuki and Takaaki A.Fukumi: "Properties of the stochastic energization-relaxation channel model for vectorial ion transport"Biophys J,in press. 78(3). (2000)

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      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Tomoko Masaike,Hiroyuki Noji,Eiro Muneyuki,Ryohei Yassuda,Kazuhiko Kinosita Jr.and Masasuke Yoshida: "Rotation of F_1-ATPase and the hinge residues of theβsubunit"J.Exper.Biol... 203. 1-8 (2000)

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      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Eiro Muneyuki,Hiroyuki Noji,Toyoki Amano,Tomoko Masaike and Masasuke Yoshida: "FoF_1-ATP synthase ; general structural features of "ATP-engine" and a problem on free energy transduction"Biothim.Biophys.Acta in press. (2000)

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      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Toyoki Amano,Tadashi Matsui,Eiro Muneyuki,Hiroyuki Noji: "α_3β_3γ Complex of F_1-ATPase from thermophilic Bacillus PS3 can maintain steady-state ATP hydrolysis activity depending on the number of non-catalytic sites"Biochem.J.. 343. 135-138 (1999)

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      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Dirk Bald,Eiro Muneyuki,Toyoki Amano,Jochen Kruip,Toru: "The noncatalytic site-deficient α_3β_3γ subcomplex and FoF_1-ATP synthase can continuously catalyze ATP hydrolysis when Pi is present"Eur.J.Biochem.. 262. 563-568 (1999)

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      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Daichi Okuno,Makoto Asaumi and Eiro Muneyuki: "Chloride concentration dependency of the electrogenic activity of halorhodopsin"Biochemistry. 38. 5422-5429 (1999)

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      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Satoshi P.Tsunoda,Eiro Muneyuki,Toyoki Amano,Masasuke Yoshida and Hiroyuki Noji: "Cross-linking of Two Subunits in the Closed Conformation in F_1-ATPase"J. Biol.Chem.. 274. 5701-5706 (1999)

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      1999 実績報告書
  • [文献書誌] E.Muneyuki,C.Shibazaki,H.Ohtani,D.Okuno,M.Asaumi and T.Mogi: "Time-Resolved Measurements of Photovoltage Generation by Bacteriorhodopsin and Halorhodopsin Adsorbed on a Thin Polymer Film"J.Biochem.. 125. 270-276 (1999)

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      1999 実績報告書

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公開日: 1999-04-01   更新日: 2016-04-21  

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