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超好熱菌・古細菌を用いた組換え機構の分子進化的研究

研究課題

研究課題/領域番号 11694207
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 分子生物学
研究機関大阪大学

研究代表者

倉光 成紀  大阪大学, 大学院・理学研究科, 教授 (60153368)

研究分担者 増井 良治  大阪大学, 理学研究科, 助手 (40252580)
加藤 龍一  大阪大学, 理学研究科, 助手 (50240833)
研究期間 (年度) 1999 – 2000
研究課題ステータス 完了 (2000年度)
配分額 *注記
8,700千円 (直接経費: 8,700千円)
2000年度: 4,100千円 (直接経費: 4,100千円)
1999年度: 4,600千円 (直接経費: 4,600千円)
キーワード相同的組換え / DNA修復 / 高度好熱菌 / 超好熱菌 / 古細菌 / RecA / RadA / DNA / 遺伝子組換え / Thermus thermophilus HB8 / Desulfurcoccus amyloliticus
研究概要

DNAには様々な傷害が生じている。その傷害を直ちに修復してDNAの遺伝情報を維持するために,細胞内には様々なDNA修復系が存在する。原核生物の場合,DNA修復には約50種類の酵素が関与するが,これまでに,組換え修復系のRecA,RuvA,RuvB,RuvC,ssb,等の他,塩基除去修復系のMutM,MutY,EndoIII,EndoV,ヌクレオチド除去修復系のUvrA,UvrB,UvrC,UvrD等,ミスマッチ修復系のMutS,MutL等についても,好熱菌由来の遺伝子についてクローニング・蛋白質の量産化・精製を行い,組換え修復との関係の包括的理解を試みつつある。
その中でもとくに,RecA蛋白質は組換え修復の中心的役割を果たしているが,そのRecAホモログを超好熱性古細菌や高度好熱菌からクローニングし,それら組換え修復に関与する酵素群の構造機能相関について解析した。その結果,それらホモログはいずれも,ATP加水分解,一本鎖DNA結合,さらに相同的DNA鎖交換活性を示し,機能発現機構は似かよっていた。しかし,超好熱菌酵素には構造的な特徴がみられ,ATPase活性の温度依存性のアーレニウスプロット,一本鎖DNA結合能やDNA鎖交換反応などが,75℃を境に顕著な増大を見せた。そこで,溶液中における蛋白質の立体構造を円二色性スペクトルや蛍光スペクトルで調べたところ,やはり75℃を境に立体構造変化が生じていることが確かめられた。それらの結果から,超好熱菌酵素は75℃以上でDNA結合部位を含む領域のコンフォメーション変化を起こすことによって,至適生育温度の100℃で高い触媒効率を発揮していることが示唆された。

報告書

(3件)
  • 2000 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1999 実績報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (21件)

  • [文献書誌] Kil,Y.V.: "Efficient Strand Transfer by the RadA Recombinase from the Hyperthermophilic Archaeon Desulfurococcus amyloliticus"J Bacteriol.. 182(1). 130-134 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Spies,M.: "The RadA Protein from a Hyperthermophilic Archaeon P. islandicum is a DNA-Dependent ATPase with a transition Temperature at 75℃"Eur.J.Biochem.. 267. 1125-1137 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Isaev-Ivanov,: "Fluorescence and Excitation Escherichia coli RecA Protein Spectra Analyzed Separately for Tyrosine and Tryptophan Residues"Arch.Biochem.Biophys.. 376(1). 124-140 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Sugahara,M.: "Crystal Structure of a Repair Enzyme of Oxidatively-Damaged-DNA, MutM (Fpg), from an Extreme Thermophile, Thermus thermophilus HB8"EMBO J.. 19(15). 3857-3869 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kil, Y.V.: "Efficient Strand Transfer by the RadA Recombinase from the Hyperthermophilic Archaeon Desulfurococcus amyloliticus"J.Bacteriol.. 182 (1). 130-134 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Spies, M.: "The RadA Protein from a Hyperthermophilic Archaeon P.islandicum is a DNA-Dependent ATPase with a transition Temperature at 75℃"Eur.J.Biochem.. 267. 1125-1137 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Isaev-Ivanov: "Fluorescence and Excitation Escherichia coli RecA Protein Spectra Analyzed Separately for Tyrosine and Tryptophan Residues"Arch.Biochem.Biophys.. 376 (1). 124-140 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Sugahara, M.: "Crystal Structure of a Repair Enzyme of Oxidatively-Damaged-DNA, MutM (Fpg), from an Extreme Thermophile, Thermus thermophilus HB8"EMBO J.. 19 (15). 3857-3869 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nakagawa,N.: "Crystal Structure of Thermus thermophilus HB8 UvrB Protein,A Key Enzyme of Nucleotide Excision Repair"J.Biochem.. 126(6). 986-990 (1999)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Kil,Y.V.: "Efficient Strand Transfer by the RadA Recombinase from the Hyperthermophilic Archaeon Desulfurococcus amyloliticus."J.Bacteriol.. 182(1). 130-134 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Spies,M.: "The RadA Protein from a Hyperthermophilic Archaeon Pyrobaculum islandicum is a DNA-Dependent ATPase that Exhibits Two Disparate Catalytic Modes,with a transition Temperature at 75℃"Eur.J.Biochem.. 267. 1125-1137 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Isaev-Ivanov,V.V.: "Fluorescence and Excitation Escherichia coli RecA Protein Spectra Analyzed Separately for Tyrosine and Tryptophan Residues"Arch.Biochem.Biophys.. 376(1). 124-140 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Sugahara,M.: "Crystal Structure of a Repair Enzyme of Oxidatively-Damaged-DNA,MutM (Fpg) , from an Extreme Thermophile, Thermus thermophilus HB8"EMBO J.. 19(15). 3857-3869 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Yokoyama,S.: "Structural Genomics Projects in Japan"Nature Struct.Biol.. 7. 943-945 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Kil,Y.V: "Efficient Strand Transfer by the RadA Recombinase from the Hyperthermophilic Archaeon Desulfurococcus amyloliticus"J.Bacteriol.. 182・1. 130-134 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Kato,R.: "Effect of ssDNA and Temperature on Activity of Thermus thermophilus RecA Protein"Eur.J.Biochem.. 259. 592-601 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Hoseki,J.: "Directed Evolution of Thermostable Kanamycin-Resistant Gene Products in an Extremely Thermophilic Bacterium, Thermus thermophilus"J.Biochem.. 126・5. 951-956 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Spies,M: "The RadA Protein from a Hyperthermophilic Archaeon P. islandicum is a DNA-Dependent ATPase with a transition Temperature at 75℃"Eur.J.Biochem.. (印刷中). (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Isaev-Ivanv,V.V.: "Fluorescence and Excitation Escherichia coli RecA Protein Spectra Analyzed Separately for Tyrosine and Tryptophan Residues"Arch.Biochem.Biophys.. (印刷中). (2000)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] 増井 良治,倉光 成紀: "好熱菌全ゲノムの配列決定とその意義"蛋白質核酸酵素. 44・2. 165-170 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] 倉光 成紀: "実験室の小さな生きものたち"羊土社. 4 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書

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公開日: 1999-04-01   更新日: 2016-04-21  

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