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相同性をしめすヒト染色体領域の構造解析によるゲノムの成立と進化の解明

研究課題

研究課題/領域番号 11694317
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 広領域
研究機関東海大学

研究代表者

猪子 英俊  東海大学, 医学部, 教授 (10101932)

研究分担者 安藤 麻子  東海大学, 医学部, 講師 (40101935)
研究期間 (年度) 1999 – 2000
研究課題ステータス 完了 (2000年度)
配分額 *注記
7,100千円 (直接経費: 7,100千円)
2000年度: 3,300千円 (直接経費: 3,300千円)
1999年度: 3,800千円 (直接経費: 3,800千円)
キーワードHLA / ゲノム倍化 / 進化 / 相同領域 / CD1 / 糖転移酵素 / 4倍化 / 免疫応答 / 第1染色体1q21-25領域 / CD1遺伝子 / HLA領域 / 相同遺伝子 / 遺伝子重複 / ゲノム構造
研究概要

ヒトの第6染色体6p21.3領域に位置するHLA領域と相同性を有する遺伝子が多数みいだされるヒト第1染色体1q21-25領域のゲノム構造をHLA領域と比較、解析することにより、MHCの進化の起源と進化の過程を解明することを目的として、まず、HLA領域と相同性を有する領域の一つである第1染色体1q21-22領域のシークエンシング解析をおこなった。その結果、セントロメア側から、CD1D-CD1A-CD1C-CD1B-CD1E-SPTA1-MNDA-IFI16-AIM2-BL1A-FY-FCER1Aの順に12個の発現遺伝子が見い出された。また、これらの発現遺伝子に加えて、20個の嗅覚受容体遺伝子をはじめとする29個の遺伝子候補あるいは偽遺伝子が新たに見いだされた。さらに、CD1遺伝子領域におけるドットマトリックス解析をおこなった結果、CD1遺伝子間には、HLAクラスI領域に顕著に見い出された遺伝子重複の痕跡は認められなかった。したがって、CD1遺伝子群の形成は太古に起きたものと推測された。
ついで、染色体重複直前のゲノム構造を保持する頭索動物ナメクジウオにおけるMHC相同領域のシークエンシング解析をおこなった。その結果、これらの総塩基数は350,270bpで、このうちに32個の遺伝子の存在が予測された。これらの遺伝子のうち、14個(RING3,h-Rev107-like,RXR,NEU-like,p44 protein,Notch,Selectinなど)の遺伝子については、上記のMHC領域あるいはMHC相同領域上に存在した。このように、ナメクジウオはMHC領域の構造を保持していることから、相同性をしめすヒト染色体領域の構造解析をおこなう上で有効なモデル動物であることが示唆された。

報告書

(3件)
  • 2000 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1999 実績報告書
  • 研究成果

    (44件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (44件)

  • [文献書誌] Shiina T, et al.: "Molecular dynamics of MHC genesis unraveled by sequencing analysis of the 1,796,938 bp HLA class I region."Proc Natl Acad Sci USA. 96. 13282-13287 (1999)

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  • [文献書誌] The MHC sequencing consortium (Aguado B, et al.): "Complete structure and gene map of a human major histocompatibility complex(MHC)."Nature. 401. 921-923 (1999)

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  • [文献書誌] Shiina T, et al.: "Genome sequencing analysis of the 1.8Mb entire human MHC class I region."Immunological Reviews. 167. 193-199 (1999)

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  • [文献書誌] Dai KZ, et al.: "The SH2D2A gene encoding the T-cell-specific adapter protein(TSAd) is localized centromeric to the CD1 gene cluster on human chromosome 1."Immunogenetics. 51. 179-185 (2000)

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  • [文献書誌] Keicho N, et al.: "Fine localization of a major disease-susceptibility locus for diffuse panbronchiolitis."Am J Hum Genet. 66. 501-507 (2000)

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  • [文献書誌] Matsuzaka Y, et al.: "New polymorphic microsatellite markers in the human MHC class II region."Tissue Antigens. 56. 492-500 (2000)

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  • [文献書誌] Shiina et al.: "The beta 1,3-galactosyltransferase-4 (B3GALT4) gene is located in the centromeric segment of the human MHC class II region."Immunogenetics. 51. 75-78 (2000)

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  • [文献書誌] Dai KZ, et al.: "The SH2D2A gene encoding the T-cell-specific adapter protein (TSAd) is localized centromeric to the CD1 gene cluster on human chromosome 1."Immunogenetics. 51. 179-185 (2000)

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  • [文献書誌] Keicho N, et al.: "Fine localization of a major disease-susceptibility locus for diffuse panbronchiolitis."Am J Hum Genet. 66. 501-507 (2000)

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  • [文献書誌] Watanabe Y, et al.: "Replication timing of the human X-inactivation center(XIC) region : correlation with chromosome bands."Gene. 252. 163-172 (2000)

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  • [文献書誌] Ota M, et al.: "On the MICA deleted-MICB null, HLA-B4801 haplotype."Tissue Anitgens. 56. 268-271 (2000)

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  • [文献書誌] Yabuki K, et al.: "Dev Ophthalmol"Kargar. 15 (1999)

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  • [文献書誌] Kanaya S, et al.: "Major Histocompatibility Complex; Evolution, Structure, and Function"Springer. 15 (2000)

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  • [文献書誌] Komatsu-Wakui M, et al.: "Major Histocompatibility Complex; Evolution, Structure, and Function"Springer. 7 (2000)

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  • [文献書誌] Shiina T, et al.: "Molecular dynamics of MHC genesis unraveled by sequencing analysis of the 1,796,938 bp HLA class I region."Proc Natl Acad Sci USA. 96. 13282-13287 (1999)

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  • [文献書誌] The MHC sequencing consortium (Aguado B, et al): "Complete structure and gene map of a human major histocompatibility complex (MHC)."Nature. 401. 921-923 (1999)

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  • [文献書誌] Shiina T, et al: "Genome sequencing analysis of the 1.8 Mb entire human MHC class I region."Immunological Reviews. 167. 193-199 (1999)

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  • [文献書誌] Dai KZ, et al: "The SH2D2A gene encoding the T-cell-specific adapter protein (TSAd) is localized centromeric to the CD1 gene cluster on human chromosome 1."Immunogenetics. 51. 179-185 (2000)

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  • [文献書誌] Keicho N, et al: "Fine localization of a major disease-susceptibility locus for diffuse panbronchiolitis."Am J Hum Genet. 66. 501-507 (2000)

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  • [文献書誌] Matsuzaka Y, et al: "New polymorphic microsatellite markers in the human MHC class II region."Tissue Antigens. 56. 492-500 (2000)

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  • [文献書誌] Yabuki K, et al.: "Uveitis Update Immunogenetics"Dev.Ophthalmol.(ed.BenEzra) Basel, Kargar. 77-91 (1999)

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  • [文献書誌] Kanaya S, et al.: "Disribution of polypurine/polypyrimidine tract sequences in the human MHC region and their possible functions."Major Histocompatibility Complex (ed.Kasahar M), Springer, Tokyo. 131-145 (2000)

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  • [文献書誌] Shiina T et al.: "The beta 1, 3-galactosyltransferase-4 (B3GALT4) gene is located in the centromeric segment of the human MHC class II region."Immunogenetics. 51. 75-78 (2000)

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  • [文献書誌] Dai KZ, et al.: "The SH2D2A gene encoding the T-cell-specific adapter protein (TSAd) is localized centromeric to the CD1 gene cluster on human chromosome 1."Immunogenetics. 51. 179-185 (2000)

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  • [文献書誌] Keicho N, et al.: "Fine localization of a major disease-susceptibility locus for diffuse panbronchiolitis."Am J Hum Genet. 66. 501-507 (2000)

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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Watanabe Y, et al.: "Replication timing of the human X-inactivation center (XIC) region : correlation with chromosome bands."Gene. 252. 163-172 (2000)

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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ota M, et al.: "On the MICA deleted-MICB null, HLA-B4801 haplotype."Tissue Anitgens. 56. 268-271 (2000)

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  • [文献書誌] Komatsu-Wakui M, et al.: "MIC-A polymorphism and a MIC-A-MIC-B null haplotype with Å'100kb deletion."Major Histocompatibility Complex (ed.Kasahar M), Springer, . Tokyo. 480-486 (2000)

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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shiina et al.: "The beta 1,3-galactosyltransferase-4 (B3GALT4) gene is located in the centromeric segment of the human MHC class II region."Immunogenetics. 51. 75-78 (2000)

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      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Dai KZ, et al.: "The SH2D2A gene encoding the T-cell-specific adapter protein (TSAd) is localized centromeric to the CD1 gene cluster on human chromosome 1."Immunogenetics. 51. 179-185 (2000)

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      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Keichi N, et al.: "Fine localization of a major disease-susceptibility locus for diffuse panbronchiolitis."Am J Hum Genet. 66. 501-507 (2000)

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      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Watanabe Y, et al.: "Replication timing of the human X-inactivation center (XIC) region : correlation with chromosome bands."Gene. 252. 163-172 (2000)

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      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Ota M, et al.: "On the MICA deleted-MICB null, HLA-B4801 haplotype."Tissue Anitgens. 56. 268-271 (2000)

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      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Matsuzaka Y, et al.: "New polymorphic microsatellite markers in the human MHC class II region."Tissue Antigens. 56. 492-500 (2000)

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      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Kanaya S, et al.: "Major Histocompatibility Complex ; Evolution, Structure, and Function"Springer. 15 (2000)

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      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Komatsu-Wakui M, et al.: "Major Histocompatibility Complex ; Evolution, Structure, and Function"Springer. 7 (2000)

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      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Shiina T, et al.: "Molecular dynamics of MHC genesis unraveled by sequencing analysis of the 1,796,938 bp HLA class I region"Proc Natl Acad Sci USA. 96. 13282-13287 (1999)

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      1999 実績報告書
  • [文献書誌] The MHC sequencing consortium(Aguado B,et al.): "Complete structure and gene map of a human major histocompatibility complex(MHC)"Nature. 401. 921-923 (1999)

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      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Oka A, et al.: "Association analysis using refined microsatellite markers localizes a susceptible locus for psonasis vulgaris within a 111 kb segment telomeric of the HLA-C gene"Hum Mol Genetics. 8. 2165-2170 (1999)

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      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Ota M,et al.: "The critical reqion for Behcet's disease in the human major histocompatlbility complex is reduced to a 46 kb segment centromeric of HLA-B, by association analysis using refined microsattellite mapping"Am J Hum Genet. 64. 1406-1410 (1999)

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      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Yamazaki M, et al.: "Genome organization around the centromeric end of theHLA class I region ; large-scale seqeuncing analysis"J Mol Evol. 48. 317-327 (1999)

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      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Shiina T, et al.: "Genome sequencing analysis of the 1.8 Mb entire human MHC class I region"Immunological Reviews. 167. 193-199 (1999)

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      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Yabuki K, et al.: "Dev Ophthalmol"Kargar. 15 (1999)

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      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Kanaya S, et al.: "Major Histocompatibility Complex; Evolution, Structure,and Function"Springer. 15 (2000)

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      1999 実績報告書

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公開日: 1999-04-01   更新日: 2016-04-21  

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