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粘菌行動の反応拡散移流モデルに学ぶシステムの自己組織化

研究課題

研究課題/領域番号 11750222
研究種目

奨励研究(A)

配分区分補助金
研究分野 知能機械学・機械システム
研究機関理化学研究所

研究代表者

中垣 俊之  理化学研究所, 局所時空間機能研究チーム, フロンティア研究員 (70300887)

研究期間 (年度) 1999 – 2000
研究課題ステータス 完了 (2000年度)
配分額 *注記
2,400千円 (直接経費: 2,400千円)
2000年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
1999年度: 1,400千円 (直接経費: 1,400千円)
キーワードphysarum / oscillation / maze / morph-senesis / reaction-diffusion / Slime mould / Physarum / amoeboid movement / rhythm / pattern formation / entrainment
研究概要

我々は、アメーバ様細胞である粘菌変形体が、迷路の経路探索問題の最短解を見出すことができることを発見した。迷路いっぱいに広がる粘菌に、餌を二ヶ所に与えると、行き止まりの経路に伸びている粘菌が衰退し、餌場所を繋ぐ経路にのみ管を残した。この管の配置は、出口を結ぶ全ての経路を示している。これは、見方を変えれば迷路の解をすべてあげつらっていることになる。さらに、時間が経つと、餌場所を繋ぐ管のうち長いものから衰退し、最後には最も短い管だけが残った。この経路は迷路の最短経路である。衰退した部分は、餌場所へ運ばれ餌を包み込んだ。これにより、粘菌は迷路のような複雑な状況でも、二つの餌場所から効率よく養分を吸収できるだろう。粘菌は、経路の長さという評価基準で、迷路の全ての解を序列付けることができた。粘菌の計算能力の高さが伺われる。このような粘菌の迷路探索機構は、反応拡散方程式のパターン形成としてモデル化できることを示した。粘菌の変形運動は、局所的に発生する自励的化学リズムの織り成す時空パターンに基づくことが分った。
粘菌を用いた実験を行うことにより解を求めるという粘菌コンピューターの可能性が生まれた。計算量の爆発を伴う組合せ最適化問題への適用が期待される。粘菌は、原形質と呼ばれる物質の塊であるから、粘菌の計算能力が明らかになれば、物質による情報機能の再構成などの機能性材料の設計原理に新たな方向となる。また、生物情報処理機構の研究に全く新しい切り口を与えた。単細胞生物のこのような高い情報機能は、脳にみる高次情報機能の一つの進化的起源として極めて興味深い。

報告書

(2件)
  • 2000 実績報告書
  • 1999 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (9件)

  • [文献書誌] T.NAKAGAKI,H.YAMADA,A.TOTH: "Maze-solving by an amoeboid organism"NATURE. 407. 470-470 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] T.NAKAGAKI,H.YAMADA,T.ueda: "Interaction between cell shape and contraction pattern"Biophysical Chemistry. 84. 195-204 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] T.NAKAGAKI,H.YAMADA: "[Quantum Information II](Edited by T.Hida,K.Saito)-Rhythmic Contraction and its Fluctuation"World Scientific Publisher Co.(singapore). 227(107〜124) (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Nakagaki T.,Yamada H.and Ito M.: "Reaction-diffusion-advection model for pattern formation of rhythmic contraction in a giant amoeboid cell of the Physarum plasmodium"Journal of Theoretical Biology. 197. 496-506 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Yamada H.,Nakagaki T.and Ito M.: "Pattern formation of a reaction-diffusion system with self-consistent flow in the amoeboid organism Physarum plasmodium"Physical Review E. 59. 1009-1014 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Nakagaki T.,Yamada H.and Ueda T.: "Modulation of cellular rhythm and photoavoidance by oscillatory irradiation in the Physarum plasmodium"Biophysical Chemistry. 82. 23-28 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Nakagaki T.,Yamada H.and Ueda T.: "Interaction between cell shape and contraction pattern in the Physarum plasmodium"Biophysical Chemistry. (in press). (2000)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] 中垣俊之、山田裕康: "粘菌変形体の収縮リズムパターンと行動"数理生物ニュースレター. 29. 63-78 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Nakagaki T.and Yamada H.: "「Quantum Information II」(Rhythmic contraction and its fluctuations in an amoeboid organism of the Physarum plasmodium)"World Scientific Publisher Co.(in press).

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書

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公開日: 1999-04-01   更新日: 2016-04-21  

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