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マイクロRNA制御異常を介した筋萎縮性側索硬化症発症病態の解明

研究課題

研究課題/領域番号 11F01413
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分外国
研究分野 病態医化学
研究機関大阪大学

研究代表者

河原 行郎  大阪大学, 医学系研究科, 准教授

研究分担者 LI Quan  大阪大学, 医学系研究科, 外国人特別研究員
LI Quan  大阪大学, 医学系研究科, 外国人特別研究員
研究期間 (年度) 2011 – 2013
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
2013年度: 200千円 (直接経費: 200千円)
2012年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2011年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
キーワード脳神経疾患 / RNA / 筋萎縮性側索硬化症 / 痴呆 / 遺伝子
研究概要

筋萎縮性側索硬化症(ALS)の発症メカニズム解明のため、病態と深く関連するRNA結合蛋白質TDP-43によるマイクロRNA制御機能に着目して研究を開始した。前年度までに、直接的にTDP-43に結合するマイクロRNA前駆体を同定するべく、培養細胞(HEK293T)を用いたPAR-CLIP法の樹立と、その後の情報解析手法を構築した。今年度は、実際にTDP-43ともう一つのALS関連RNA結合蛋白質であるFUSに対してPAR-CLIP法を施行し、標的RNAを網羅的に解析した。その結果、TDP-43およびFUSに結合する標的RNA、結合モチーフなどを決定することに成功した。TDP-43はイントロンに最も多く結合していたが、FUSは3'UTRやcoding regionsにより多く結合していた。全体としてHEK293T細胞では、TDP-43の結合しているマイクロRNA前駆体は、ごく少数であった。TDP-43は、(UG)nの比較的長い繰り返し配列に強く結合したが、FUSはGGU配列に弱い結合傾向を認めるのみであった。TDP-43及びFUSが制御する遺伝子のうち、25~50%程度の遺伝子は両者による制御下にあると考えられた。最後1に、家族性ALSで同定されている遺伝子点変異によるアミノ酸置換が、RNA結合能に影響するかどうかを評価した。その結果、D169G, G348Sのいずれの点変異を挿入した場合でも、モチーフは変動せず、さらに制御される遺伝子の95%以上が一致した。この結果から、点変異は結合RNAのプロファイルには影響しないと考えられた。以上、ALSに関連するTDP-43およびFUSの標的を網羅的に決定し、その性状を詳しく明らかにした。用いた培養細胞においては、TDP-43が直接結合するマイクロRNA前駆体はごく少数であったが、今後モデル動物を用いて更に解析を進める必要がある。

今後の研究の推進方策

(抄録なし)

報告書

(3件)
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2014 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (7件) (うち招待講演 2件) 備考 (3件)

  • [雑誌論文] A subset of circulating microRNAs are predictive for cardiac death after discharge for acute myocardial infarction.2012

    • 著者名/発表者名
      Sen Matsumoto
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications.

      巻: 727 号: 2 ページ: 280-284

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2012.09.039

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Tissue- and plasma-specific microRNA signatures for atherosclerotic abdominal aortic aneurysm.2012

    • 著者名/発表者名
      Keiwa Kin
    • 雑誌名

      Journal of the American Heart Association

      巻: e00745 号: 5

    • DOI

      10.1161/jaha.112.000745

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Quantification of A-to-I editing of microRNAs using a conventional method.2012

    • 著者名/発表者名
      Yukio Kawahara
    • 雑誌名

      Nature Protocols

      巻: 7 号: 7 ページ: 1426-1437

    • DOI

      10.1038/nprot.2012.073

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] マイクロRNA2011

    • 著者名/発表者名
      河原行郎
    • 雑誌名

      分子精神医学

      巻: 11(3) ページ: 172-177

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Identification of common targets of TDP-43 and FUS by PAR-CLIP2014

    • 著者名/発表者名
      Li Q, Yamamoto M, Yokoshi M, Suzuki Y. Kawahara Y.
    • 学会等名
      New Frontier of Molecular Neuropathology 2014
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Toward a comprehensive analysis of Ataxin-2 functions for the understanding of a common mechanism underlying neurodegeneration2014

    • 著者名/発表者名
      Kawahara Y.
    • 学会等名
      第91回日本生理学会年会
    • 発表場所
      鹿児島
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] A common RNA targets of TDP-43 and FUS : 岔l investigation into the disease mechanism of ALS2013

    • 著者名/発表者名
      YAMAMOTO Munetaka
    • 学会等名
      International Symposium on Genome Science
    • 発表場所
      東京大学' (東京)
    • 年月日
      2013-01-09
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] PAR-CLIP法を用いたTDP-43とFUSに共通するターゲットの同定2013

    • 著者名/発表者名
      山本 宗隆、李 全、鈴木 穣 河原 行郎
    • 学会等名
      第15回RNAミーティング
    • 発表場所
      愛媛
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Comprehensive analysis of the roles of TDP-43 and FUS in RNA processing2013

    • 著者名/発表者名
      Li Q, Yamamoto M, Seno S, Matsuda H, Suzuk Y, Kawahara Y.
    • 学会等名
      第36回日本神経科学大会
    • 発表場所
      京都
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Toward a comprehensive functional analysis of Ataxin-2 for the understanding of a common mechanism underlying neurodegeneration2013

    • 著者名/発表者名
      Kawahara Y.
    • 学会等名
      第36回日本神経科学大会
    • 発表場所
      京都
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] A message from TDP-43/FUS complexes : narrow down the ALS-associatedRNA targets2012

    • 著者名/発表者名
      LI Quan
    • 学会等名
      NGS現場の会 第二回研究会
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク(大阪)
    • 年月日
      2012-05-25
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.med.osaka-u.ac.jp/pub/rna/publications.html

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.med.osaka-u.ac.jp/pub/rna/publications.html

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://apprentice.jpn.org/hp/research-kawahara.html

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書

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公開日: 2011-12-22   更新日: 2024-03-26  

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