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湖沼浮遊細菌群集の多様性が細菌-原生生物間の有機物伝達に果たす役割

研究課題

研究課題/領域番号 11J00658
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 生態・環境
研究機関京都大学

研究代表者

高巣 裕之  京都大学, 理学研究科, 特別研究員(DC2)

研究期間 (年度) 2011 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
1,300千円 (直接経費: 1,300千円)
2012年度: 600千円 (直接経費: 600千円)
2011年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
キーワード琵琶湖 / 細菌群集 / 呼吸鎖キノン / 微生物食物網 / 炭素循環
研究概要

細菌の増殖速度および原生生物による捕食速度とウイルス溶菌速度を同時に見積もることのできる改良希釈培養法と呼吸鎖キノン分析を組み合わせることで、亜集団の増殖および死滅速度を見積もることに成功した。実験の結果、細菌群集の増殖速度は、原生動物による捕食およびウイルスによる溶菌によって死滅する速度と、ほぼ釣り合うことが示された。自然細菌群集の死滅要因としては、様々な環境要因が考えられるが、琵琶湖の細菌群集は物理化学的な環境要因の変化によって死滅する前に、捕食と溶菌によって速やかに死滅していることが推察された。また、補食および溶菌による死滅様式は、亜集団によって異なるというよりは、密度依存的な補食と増殖速度依存的な溶菌で説明できることが示唆された。さらに、現場で優占する亜集団(ユビキノン-8および10含有細菌亜集団)は、速い速度で活発に増殖し、その後速やかに死滅することから、微生物ループにおける細菌群集を介する炭素流の大部分(約6割)を駆動していることが明らかとなった。一般に、淡水湖沼や河川ではBetaproteobacteriaに属する細菌が優占することが知られているが、この細菌群の多くはUQ-8を保持していることが報告されている。このことから、UQ-8保持亜集団は、淡水環境の微生物ループの炭素循環過程において重要な役割を担っていることが考えられる。本研究は、呼吸鎖キノンによって細菌群集を亜集団に分割することで、優占細菌亜集団と微生物ループにおける炭素循環との関係を明らかにした。

報告書

(2件)
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2013 2012 2011

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (7件)

  • [雑誌論文] Estimation of carbon biomass and community structure of planktonic bacteria in Lake Biwa using respiratory quinone analysis2013

    • 著者名/発表者名
      Takasu, H., Kunihiro, T., Nakano, S.
    • 雑誌名

      Limnology

      巻: (印刷中)(掲載確定) 号: 3 ページ: 247-256

    • DOI

      10.1007/s10201-013-0402-3

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Anatoxin-a-producing Raphidiopsis mediterranea Skuja var. grandis Hill is one ecotype of non-heterocystous Cuspidothrix issatschenkoi (Usacev) Rajaniemi et al. in Japanese lakes.2013

    • 著者名/発表者名
      Hodoki, Y., Ohbayashi, K., Kobayashi, Y., Takasu, H., Okuda, N., Nakano, S.
    • 雑誌名

      Harmful Algae

      巻: 21-22 ページ: 44-53

    • DOI

      10.1016/j.hal.2012.11.007

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Vertical community structure of bacteria and phytoplankton in Lake Biwa using respiratory quinone and pigment analysis2012

    • 著者名/発表者名
      Takasu, H., Kunihiro, T., Nakano, S.
    • 雑誌名

      Interdisciplinary Studies on Environmental Chemistry

      巻: 6 ページ: 377-385

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Increase in Alphaproteobaoteria in association with a polychaete, Capitella sp.I, in the organically enriched sediment2011

    • 著者名/発表者名
      Kunihiro, T., Takasu, H., Miyazaki, T., Uramoto, Y., Kinoshita, K., Yodnarasri, S., Hama, D., Wada, M., Kogure, K., Ohwada, K., Tsutsumi, H.
    • 雑誌名

      ISME journal

      巻: 5 号: 11 ページ: 1818-1831

    • DOI

      10.1038/ismej.2011.57

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Fluoroquinolone (FQ) Contamination Does Not Correlate with Occurrence of FQ-Resistant Bacteria in Aquatic Environments of Vietnam and Thailand2011

    • 著者名/発表者名
      Takasu, H., Suzuki, S., Reungsang, A., Viet, P.H.
    • 雑誌名

      Microbes and environments

      巻: 26 号: 2 ページ: 135-143

    • DOI

      10.1264/jsme2.ME10204

    • NAID

      130000676792

    • ISSN
      1342-6311, 1347-4405
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Tetracycline resistance genes persist at aquaculture farms in the absence of selection pressure2011

    • 著者名/発表者名
      Tamminen, M., Karkman, A., Lohmus, A., Muziasari, W.I., Takasu, H., Wada, S., Suzuki, S., Virta, M.
    • 雑誌名

      Environmental Science and Technology

      巻: 45 号: 2 ページ: 386-391

    • DOI

      10.1021/es102725n

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 呼吸鎖キノンを生物指標とした湖沼浮遊細菌の炭素バイオマス量および群集構造の評価2012

    • 著者名/発表者名
      高巣裕之、國弘忠生、中野伸一
    • 学会等名
      日本陸水学会第77回大会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2012-09-16
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 琵琶湖の浮遊細菌群集の炭素現存量とその行方2012

    • 著者名/発表者名
      高巣裕之、國弘忠生、中野伸一
    • 学会等名
      2012年度日本地球化学会年会
    • 発表場所
      九州大学
    • 年月日
      2012-09-11
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Carbon content and community structure of planktonic bacteria in large mesotrophic Lake Biwa using respiratory quinone analysis2012

    • 著者名/発表者名
      Takasu, H., Kunihiro, T., Nakano, S.
    • 学会等名
      2012 ASLO aquatic sciences meeting (ASM)
    • 発表場所
      ピアザ淡海(滋賀県大津市)
    • 年月日
      2012-07-08
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 琵琶湖の表水層と深水層における細菌バイオマスの季節動態2011

    • 著者名/発表者名
      高巣裕之、國弘忠生、中野伸一
    • 学会等名
      微生物生態学会
    • 発表場所
      京都大学
    • 年月日
      2011-10-08
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 琵琶湖の表層水と深層水における細菌群集の動態-呼吸鎖キノンを生物指標とした評価-2011

    • 著者名/発表者名
      高巣裕之、國弘忠生、中野伸一
    • 学会等名
      日本陸水学会第76回大会
    • 発表場所
      島根大学
    • 年月日
      2011-09-23
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Relative biomass of major phylogenetic bacterial groups and biological valiables in mesotrophic Lake Biwa, Japan2011

    • 著者名/発表者名
      Takasu, H., Kunihiro, T., Nakano, S.
    • 学会等名
      The 12th Symposium on Aquatic Microbial Ecology (SAME)
    • 発表場所
      ロストック(ドイツ)
    • 年月日
      2011-08-30
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Biomass of major phylogenetic bacterial groups in water column of large mesotrophic Lake Biwa, Japan2011

    • 著者名/発表者名
      Takasu, H., Kunihiro, T., Nakano, S.
    • 学会等名
      International Symposium on Advanced Studies by Young Scientists on Environmental Pollution and Ecotoxicology
    • 発表場所
      愛媛大学
    • 年月日
      2011-08-05
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書

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公開日: 2011-12-12   更新日: 2024-03-26  

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