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細胞内mRNP動態解析によるmiRNA翻訳制御メカニズムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 11J02706
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 分子生物学
研究機関東京大学

研究代表者

泉 奈津子  東京大学, 分子細胞生物学研究所, 特別研究員(PD)

研究期間 (年度) 2011 – 2013
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
2013年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2012年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2011年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
キーワードmiRNA / mRNP
研究概要

本研究は特定のmRNP (mRNA-タンパク質複合体)を細胞内から精製する手法を確立し、これを用いてmiRM結合によるmRNPの構成変化を解析することにより、miRNA作用機序を解明することを目的としてきた。mRNP精製技術を確立するため、これまでRNP精製タグやレポーターRNAの構造、精製条件など、種々の検討を重ねてきたが、細胞内からのレポーターmRNP回収効率が著しく低いという問題が解決できず、現状ではmRNP構成成分を解析することは困難であると判断した。このため、本年度は並行して進めてきたpiRNA経路の解析に注力した。piRNAは主に生殖系列細胞に発現する24-31塩基長のsmall RNAで、Argonauteファミリーに属するPIWIタンパク質と複合体を形成し、トランスポゾンの発現抑制に機能している。piRNA生成のメカニズムの詳細は未だ不明な点が多いが、長い1本鎖のpiRNA前駆体が、PIWIタンパク質に取り込まれた後、その3'末端が適切な長さまで削られ、2'-0-メチル化修飾を受けることで成熟piRNAがつくられると考えられている。昨年度から、piRNAを介したトランスポゾンの発現抑制への関与が示唆されていたHsp90シャペロンのpiRNA生成における役割を明らかにするために、Hsp90の活性阻害によるpiRNA経路への影響をin vivo、in vitroの両面から解析してきた。その結果、Hsp90がPIWIタンパク質を安定化し、piRNA前駆体のPIWIタンパク質への正しい取り込みを促進していることを明らかにした。また、本年度はPIWIタンパク質に取り込まれたpiRNA前駆体の3'末端のトリミングを担う未知のヌクレアーゼTrimmerの同定を目指した解析を進めた。Trimmerは細胞不溶性画分に存在し、その活性を可溶化することが困難なため、これまで生化学的に同定することができなかった。この問題を解決するため、様々な活性抽出条件の検討および最適化を行った結果、一部のトリミング活性を可溶化できる条件を見出すことに成功した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

(抄録なし)

今後の研究の推進方策

(抄録なし)

報告書

(3件)
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2014 2013 2012 2011

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 7件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Diversity of the piRNA pathway for nonself silencing : worm-specific piRNA biogenesis factors2014

    • 著者名/発表者名
      Izumi N, Tomari Y
    • 雑誌名

      Genes & Development

      巻: 28 号: 7 ページ: 665-671

    • DOI

      10.1101/gad.241323.114

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [雑誌論文] Poly (A)-specific ribonuclease mediates 3'-end trimming of Argonaute2-cleaved precursor microRNAs2013

    • 著者名/発表者名
      Yoda M, Cifuentes D, Izumi N, Sakaguchi Y. Suzuki T. Giraldez AJ.
    • 雑誌名

      Cell Report

      巻: 5 号: 3 ページ: 715-726

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2013.09.029

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Hsp90 facilitates accurate loading of precursor piRNAs into PIWI proteins2013

    • 著者名/発表者名
      Izumi N, Kawaoka S, Yasuhara S, Suzuki Y. Sugano S. Katsuma S. Tomari Y
    • 雑誌名

      RNA

      巻: 19 号: 7 ページ: 896-901

    • DOI

      10.1261/rna.037200.112

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Heat shock protein 90 regulates phosphatidylinositol 3-kinase-related protein kinase family proteins together with the RUVBL1/2 and Tel2-containing co-factor complex2012

    • 著者名/発表者名
      Izumi N, Yamashita A, Hirano H, Ohno S
    • 雑誌名

      Cancer Sci

      巻: 103 号: 1 ページ: 50-57

    • DOI

      10.1111/j.1349-7006.2011.02112.x

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] N- and C-terminal Upf1 phosphorylations create binding platforms for SMG-6 and SMG-5:SMG-7 during NMD2012

    • 著者名/発表者名
      Okada-Katsuhata Y, Yamashita A, Kutsuzawa K, Izumi N, Hirahara F, Ohno S
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res

      巻: 40 号: 3 ページ: 1251-1266

    • DOI

      10.1093/nar/gkr791

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Integrated regulation of PIKK-mediated stress responses by AAA+proteins RUVBL1 and RUVBL22012

    • 著者名/発表者名
      Izumi N, Yamashita A, Ohno S
    • 雑誌名

      Nucleus

      巻: 1 ページ: 29-43

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 3' end formation of PIWI-interacting RNAs in vitro2011

    • 著者名/発表者名
      Kawaoka S, Izumi N, Katsuma S, Tomari Y
    • 雑誌名

      Mol Cell

      巻: 16 号: 6 ページ: 1015-1022

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2011.07.029

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Recognition of the pre-miRNA structure by Drosophila Dicer-12011

    • 著者名/発表者名
      包明久、川俣朋子、泉奈津子、Herve Seitz, 泊幸秀
    • 雑誌名

      Nature Structural and Molecular Biology

      巻: 18;18(10) 号: 10 ページ: 1153-58

    • DOI

      10.1038/nsmb.2125

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Hsp90 facilitates accurate loading of precursor piRNAs into PIWIproteins2014

    • 著者名/発表者名
      Izumi N, Kawaoka S, Yasuhara S, Suzuki Y. Sugano S. Katsuma S. Tomari Y
    • 学会等名
      新学術領域研究「非コードRNA作用マシナリー」領域会議
    • 発表場所
      エクシブ那須白河福島県西白河郡)
    • 年月日
      2014-01-08
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

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公開日: 2011-12-12   更新日: 2024-03-26  

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