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Pab1pによる翻訳非依存のmRNA安定化機構と新たなNGDの分子機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 11J02837
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 分子生物学
研究機関東北大学

研究代表者

坪井 達久  東北大学, 大学院薬学研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2011 – 2013
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
2013年度: 600千円 (直接経費: 600千円)
2012年度: 600千円 (直接経費: 600千円)
2011年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
キーワードmRNA / Mitochondria / 品質管理機構 / Dom34 / endonuclease / NGD / NSD / Sen複合体 / Hbs1 / Pelota / Ribozyme
研究概要

mRNA品質管理機構の一つであるNGD (No-Go Decay)は人工的な二次構造等により翻訳伸長が阻害されたリボソームを認識し、その配列近傍でmRNA分子内切断を引き起こす。初年度、我々はDom34 : Hbsl複合体が、NGDとNSD (Nonstop decay)の2つの経路において、NGDの5'側切断断片(5'側NGD中間産物)及び、ノンストップmRNAを分解するために必要であることを明らかにした(Tsuboi et al., Mol. Ce ll, 2012)。さらに昨年度、Dom34 : Hbs1複合体が異常な翻訳複合体を解消することで細胞小器官への正常なタンパク質輸送を促進していることを共同研究により明らかにした(Izawa et al., 2012)。
これまでmRNAの二次構造や連続したレアコドン、塩基性アミノ酸の連続配列がNGDを引き起こすことが報告されているが、細胞内におけるNGDの標的mRNAは明らかにされてこなかった。私はCBP1 mRNAがNGDの細胞内標的mRNAであることを見いだし、解析を進めてきた。CBP1は核にコードされ、ミトコンドリアに輸送されるタンパク質である。昨年度、CBP1 mRNAにおける分子内切断には、CBP1のミトコンドリア局在化シグナルが必要であり、また、リボソームが652-726nt領域のステムループ構造を翻訳することでその二次構造の3'側が切断されることを明らかにした。本年度はその分子内切断をSen複合体が行うことを分子内切断の欠失変異株を用いた解析で明らかにした。さらに、in vitro再構成系においてもその分子内切断を再現することができた。一方で、Sen複合体のミトコンドリアへの局在、mRNAのミトコンドリアへの輸送に関与するとして知られているTom20も分子内切断に必要であった。以上の結果から、CBP1 mRNAはミトコンドリアに輸送されることでSen複合体により分子内切断を受けると考えられる。さらに、CBP1 mRNA同様にミトコンドリアに局在するmRNAに特に注目し、NGDの有無をRNA-seqを用いて網羅的に解析した結果、いくつかのmRNAで分子内切断を示唆する結果が得られた。本研究は、mRNA品質管理機構とmRNAの細胞小器官への局在に有意な相互関係があることを示唆する初めての成果である。

今後の研究の推進方策

(抄録なし)

報告書

(3件)
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて 2013 2012 2011

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (17件)

  • [雑誌論文] Roles of dom34 : hbs1 in nonstop protein clearance from translocators for normal organelle protein influx.2012

    • 著者名/発表者名
      Toshiaki Izawa, Tatsuhisa Tsuboi, Kazushige Kuroha, et al.
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 2 号: 3 ページ: 447-453

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2012.08.010

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dom34:Hbs1 Plays a General Role in Quality-Control Systems by Dissociation of a Stalled Ribosome at the 3' End of Aberrant mRNA2012

    • 著者名/発表者名
      Tatsuhisa Tsuboi, et al
    • 雑誌名

      Molecular Cell

      巻: 46 号: 4 ページ: 1-12

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2012.03.013

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] CBP1 I mRNA is cleaved and produces nonstop mRNA in a tRNA splicing endon uclease activity dependent manner2013

    • 著者名/発表者名
      坪井達久、鈴木穣、菅野純夫、稲田利文
    • 学会等名
      RNA 2013 The 18th Annual Meeting of the RNA Society
    • 発表場所
      スイス、ダボス
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] CBP1 mRNA is cleaved and produces nonstop mRNA in a translation and tRNA splicing endonuclease activity dependent manner2013

    • 著者名/発表者名
      坪井達久、鈴木穣、菅野純夫、稲田利文
    • 学会等名
      10th International Conference on Intracellular RNA Localization and Localized Translation
    • 発表場所
      カナダ、ナイアガラ
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] CBP1 mRNA is cleaved in a tRNA splicing endonuclease activity dependent manner2013

    • 著者名/発表者名
      坪井達久、鈴木穣、菅野純夫、稲田利文
    • 学会等名
      第15回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      県民文化会館(愛媛県松山市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] CBP1 mRNA is cleaved in a tRNA splicing endonuclease activity dependent manner on mitochondrial outer membrane2013

    • 著者名/発表者名
      坪井達久、鈴木穣、菅野純夫、稲田利文
    • 学会等名
      4th International Symposium on Dynamics of Mitochondria
    • 発表場所
      沖縄残波岬ロイヤルホテル(沖縄県中頭郡)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ミトコンドリアに局在するタンパク質をコードするmRNAは分子内切断を受ける2012

    • 著者名/発表者名
      坪井達久、鈴木穣、菅野純夫、稲田利文
    • 学会等名
      第85回日本生化学会大会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2012-12-15
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] CBP1 mRNA is an Endogenous Target of NGD2012

    • 著者名/発表者名
      坪井達久、鈴木穣、菅野純夫、稲田利文
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2012-12-13
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] CBP1 mRNA is an Endogenous Target of NGD.2012

    • 著者名/発表者名
      Tatsuhisa Tsuboi, Toshifumi Inada
    • 学会等名
      New Frontiers of Metabolism Research in Biomedical Sciences
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2012-09-27
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] The mitochondrial targeting signal is required for the endonucleolytic cleavage of CBP1 mRNA.'2012

    • 著者名/発表者名
      Tatsuhisa Tsuboi, Toshifumi Inada
    • 学会等名
      EMBO | EMBL Symposium Quality control
    • 発表場所
      ハイデルベルグ、ドイツ
    • 年月日
      2012-09-20
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] CBP1 mRNA はNGDの細胞内標的mRNAである2012

    • 著者名/発表者名
      坪井達久、稲田利文
    • 学会等名
      第11回次世代を担う若手ファーマバイオフォーラム - Pharma Bioforum 2012
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2012-09-15
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] CBP1 mRNA はNGDの細胞内標的mRNAである2012

    • 著者名/発表者名
      坪井達久、稲田利文
    • 学会等名
      第14回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2012-07-18
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Dom34:Hbs1複合体は3'末端まで翻訳される異常mRNAからリボソームを解離し、mRNA分解を促進する2012

    • 著者名/発表者名
      坪井達久、黒羽一誠、工藤和兵、牧野支保、井上絵里、鹿島勲、稲田利文
    • 学会等名
      日本生化学会東北支部第78回例会・シンポジウム
    • 発表場所
      山形
    • 年月日
      2012-05-26
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] An Endogenous Target of NGD : CBP1 mRNA.2012

    • 著者名/発表者名
      Tatsuhisa Tsuboi, Toshifumi Inada
    • 学会等名
      The22nd CDB Meeting
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Dom34:Hbs1複合体により、3'末端で停止したリボソームの解離が促進され、終結コドンを欠失した異常なmRNAの分解が促進される2011

    • 著者名/発表者名
      坪井達久、鹿島勲, 他
    • 学会等名
      PBF2011
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2011-10-09
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Dom34:Hbs1複合体によるNGD中間産物及びノンストップmRNA分解機構2011

    • 著者名/発表者名
      坪井達久、鹿島勲, 他
    • 学会等名
      RNAフロンティアミーティング2011
    • 発表場所
      愛知県大府市
    • 年月日
      2011-08-30
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Dom34:Hbs1複合体によるNGD(No-Go Decay)標的mRNA分解機構の解析2011

    • 著者名/発表者名
      坪井達久、黒羽一誠, 他
    • 学会等名
      日本生化学会東北支部会第77回例会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2011-07-23
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Analysis of new NGD target reveals dual function of Dom34:Hbs1 complex in mRNA clearance coupled with translation arrest in yeast2011

    • 著者名/発表者名
      Tatsuhisa Tsuboi, et al.
    • 学会等名
      RNA Society Meeting
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2011-06-17
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Dom34:Hbs1複合体によるNGD中間産物及びノンストップmRNA分解機構2011

    • 著者名/発表者名
      坪井達久、鹿島勲, 他
    • 学会等名
      日本分子生物学会第34回年会
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書

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公開日: 2011-12-12   更新日: 2024-03-26  

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