| 研究課題/領域番号 |
12024101
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| 研究種目 |
特定領域研究(A)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 研究機関 | 名古屋市立大学 |
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研究代表者 |
杉浦 昌弘 名古屋市立大学, 自然科学研究教育センター, 教授 (80027044)
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| 研究分担者 |
石浦 正寛 名古屋大学, 遺伝子実験施設, 教授 (20132730)
杉田 護 名古屋大学, 人間情報学研究科, 教授 (70154474)
櫻井 宣彦 名古屋市立大学, 自然科学研究教育センター, 助手 (00255233)
續 伯彦 愛知学院大学, 計算機センター, 教授 (60064896)
小保方 潤一 名古屋大学, 遺伝子実験施設, 助教授 (50185667)
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| 研究期間 (年度) |
1998 – 2000
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| 研究課題ステータス |
完了 (2000年度)
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| 配分額 *注記 |
3,200千円 (直接経費: 3,200千円)
2000年度: 3,200千円 (直接経費: 3,200千円)
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| キーワード | ラン藻 / 光合成 / ゲノム / mRNA / in vitro転写系 / タバコ / 植物 / DNA |
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| 研究概要 |
(1)Anacystis nidulans6301ゲノム解析
Anacystis nidulans6301(2.7Mbp)の全ゲノムDNAをλDashIIで作製した全ゲノムをカバーする約500個のλクローンを分離、同定し、ゲノム全領域をほぼカバーするcontigを作製した。全領域をカバーする最小のλクローンは約200個である。
平行して、451個のλクローンの両末端の塩基配列を決定し遺伝子解析を行った。これは全ゲノムに対して、2562kbp/902=2.8kbpで平均2.8kbp毎にsequence tagを作製したことになる。これらのsequence tagより現在のところ581個の遺伝子が同定された。平成12年に入り、(株)島津製作所ジェノミックリサーチ室と共同でショットガン法で、同社の開発したDNAシーケンサー「RISA384」を用いて解析を行った。平成12年12月には冗長度5のデータを得て、現在その結合編集を行っている。
(2)植物光合成関連mRNAの濃縮
収光性クロロフィル結合タンパク質mRNA群をモデル系として解析を行った。タバコin vitro転写系をも併用して、転写様式を同定して、他の光合成関連遺伝子mRNAの濃縮に利用できるデータを得た。
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