| 研究課題/領域番号 |
12201002
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| 研究種目 |
特定領域研究(C)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 審査区分 |
生物系
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| 研究機関 | 名古屋市立大学 |
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研究代表者 |
杉浦 昌弘 名古屋市立大学, 自然科学研究教育センター, 教授 (80027044)
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| 研究分担者 |
小保方 潤一 名古屋大学, 遺伝子実験施設, 助教授 (50185667)
櫻井 宣彦 名古屋市立大学, 自然科学研究教育センター, 助手 (00255233)
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| 研究期間 (年度) |
2000
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| 研究課題ステータス |
完了 (2000年度)
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| キーワード | RNAエディティング / タバコ / 葉緑体 / DNAチップ / in vitro系 / mRNA / シス配列 / トランス因子 |
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| 研究概要 |
葉緑体はその発生プログラムにより原色素体(種子)からエチオプラスト(芽生え)、葉緑体(葉)、クロモプラスト(果実)などへと形態的・機能的に大きく変化する。高等植物の葉緑体ゲノムからの転写産物は、RNAエディティング(C→U)によりDNAの一次情報が一部変換するため、ゲノム情報の正確な解読にはRNAエディティングの網羅的知見が必須である。そこで最も研究の進んでいる、タバコ葉緑体を用いて以下の解析を進めている。
1)RNAエディティング部位の網羅的同定
組織的なRNAエディティング部位の探索のため、タンパク質コード領域以外の転写領域を調べる必要がある。そのためタバコ葉緑体のDNAチップ(全ゲノムをカバーする220DNA断片、平均700bp/断片)を作製して予備的実験を開始した。
2)RNAエディティングのシス配列とトランス因子の同定
タバコ単離葉緑体よりin vitro RNAエディティング系を開発した。この系を使って、タバコ葉緑体psbL mRNAとndhB mRNAのシス配列を同定し、psbL mRNAのトランス因子の同定も行った。
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