脊索動物モデルのホヤ発生の遺伝子システムとその進化の解明

• 研究課題/領域番号: 12202001
• 研究種目: 特定領域研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 佐藤 矩行 京都大学, 大学院理学研究科, 教授 (30025481)
• 研究期間 (年度): 2000 – 2004
• 研究課題ステータス: 完了 (2004年度)
• 配分額: 258,000千円 (直接経費: 258,000千円); 2004年度: 64,000千円 (直接経費: 64,000千円); 2003年度: 60,000千円 (直接経費: 60,000千円); 2002年度: 64,000千円 (直接経費: 64,000千円); 2001年度: 70,000千円 (直接経費: 70,000千円)
• キーワード: カタユレイボヤ / ゲノム解読 / 脊索動物の進化 / 発生遺伝子 / 転写因子遺伝子 / シグナル分子遺伝子 / EST解析 / cDNAプロジェクト / ホヤ / 脊索動物 / 発生 / 進化 / ゲノムプロジェクト / 染色体マッピング / ドラフトゲノム / 遺伝子発現 / 網羅的解析 / EST / ケツムプロジェクト

研究概要

ホヤは尾索類に属し、ナメクジウオの頭索類、サカナやヒトを含む脊椎動物とともに脊索動物門を構成する。これらの動物は脊索・背側神経管・鰓裂など多くの共有形質を有し、今から約5.5億年以上昔に共通の祖先から進化してきたものと考えられている。本研究は、カタユウレイボヤのゲノムプロジェクトおよびめcDNAプロジェクト展開を計り、脊索動物モデルとしての発生遺伝子システムとその進化に関連したゲノム科学の進展を計ることを目的とした。
ゲノムプロジェクトの展開:国立遺伝研およびアメリカとの共同研究によって、カタユウレイボヤ(Ciona intestinalis)のドラフトゲノムを2002年に解読し、公表した。このホヤの約160Mbのゲノムに15,852のタンパク質をコードする遺伝子の存在が明らかになった。これらを脊椎動物ゲノムおよび無脊椎動物ゲノムと比較するこによって、脊索動物および脊索動物の進化に関わったと思われるゲノム変化を論じた。また2色FISH法を駆使して、ドラフトゲノム情報の約65%をn=14本の染色体にマップした。
cDNAプロジェクトの展開と脊索動物モデルとしての発生遺伝子システムの解析:いくつかの発生段階の胚および成体の組織から16のcDNAライブラリーを作製し、それをもとに、総計67万におよぶEST解析を行った。また、発生に重要な役割を担う転写因子およびシグナル分子をコードする遺伝子を含め約6千のcDNAの順完全長塩基配列を決定した。そしてゲノム解読によって得られた情報も加えて、発生に関わる遺伝子を正確にアノテーションした。これらの情報をもとに、脊索動物モデルとしてのホヤ発生遺伝子システムの解析を多方面にわたって展開した。

研究成果

• [雑誌論文] Chromosomal mapping of 170 BAC clones in the ascidian Ciona intestinalis (2006)
  • 著者名/発表者名: Shoguchi, E.
  • 雑誌名: Genome Res. 16 ページ: 297-303
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Systematic analysis of embryonic expression profiles of zinc finger genes in Ciona intestinalis (2006)
  • 著者名/発表者名: Miwata, K.
  • 雑誌名: Dev. Biol. (In press)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Chromosomal mapping of 170 BAC clones in the ascidian Ciona intestinalis (2006)
  • 著者名/発表者名: Shoguchi, E., Kawashima, T., Satou, Y., Hamaguchi, M., Sin-i, T., Kohara, Y., Putnam, N., Rokhsar, D.S., Satoh, N.
  • 雑誌名: Genome Res. 16 ページ: 297-303
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Systematic analysis of embryonic expression profiles of zinc finger genes in Ciona intestinalis (2006)
  • 著者名/発表者名: Miwata, K., Chiba, T., Horii, R., Yamada, L., Kubo, A., Miyamura, D., Satoh, N., Satou, Y.
  • 雑誌名: Dev. Biol. (in press)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A saturation screen for cis-acting regulatory DNA in the Hox genes of Ciona intestinalis (2005)
  • 著者名/発表者名: Keys, D. N.
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102 ページ: 679-683
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Dynamic changes in developmental gene expression in the basal chordate Ciona intestinalis (2005)
  • 著者名/発表者名: Kawashima, T.
  • 雑誌名: Dev. Growth Differ. 47 ページ: 187-199
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Surfing with the tunicates into the post-genome era (2005)
  • 著者名/発表者名: Satoh, N.
  • 雑誌名: Genes Dev. 19 ページ: 2407-2411
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Ci-Tbx6b and Ci-Tbx6c are key mediators of the maternal effect gene Ci-machol in muscle cell differentiation in Ciona intestinalis embryos (2005)
  • 著者名/発表者名: Yagi, K.
  • 雑誌名: Dev. Biol. 282 ページ: 535-549
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Molecular cytogenetic characterization of Ciona intestinalis chromosomes (2005)
  • 著者名/発表者名: Shoguchi, E.
  • 雑誌名: Zool. Sci. 22 ページ: 511-516
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A genome-wide survey of genes for enzymes involved in pigment synthesis in an ascidian, Ciona intestinalis (2005)
  • 著者名/発表者名: Takeuchi, K.
  • 雑誌名: Zool. Sci. 22 ページ: 723-734
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Comprehensive analysis of the ascidian genome reveals novel insights into the molecular evolution of ion channel genes (2005)
  • 著者名/発表者名: Okamura, Y.
  • 雑誌名: Physiol. Genomics 22 ページ: 269-282
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Assembly of polymorphic genomes : Algorithms and application to Ciona savignyi (2005)
  • 著者名/発表者名: Vinson, J. P.
  • 雑誌名: Genome Res. 15 ページ: 1127-1135
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Oligonucleotide-based microarray analysis of retinoic acid target genes in the protochordate, Ciona intestinalis (2005)
  • 著者名/発表者名: Ishibashi, T.
  • 雑誌名: Dev. Dynamics 233 ページ: 1571-1578
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] An integrated database of the ascidian, Ciona intestinalis : Towards functional genomics (2005)
  • 著者名/発表者名: Satou, Y.
  • 雑誌名: Zool. Sci. 22 ページ: 837-843
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Cataloging transcription factor and major signaling molecule genes for functional genomic studies in Ciona intestinalis (2005)
  • 著者名/発表者名: Satou, Y.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 215 ページ: 580-596
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] De novo discovery of a tissue-specific gene regulatory module in a chordate (2005)
  • 著者名/発表者名: Johnson, D. S.
  • 雑誌名: Genome Res. 15 ページ: 1315-1324
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Transposon-mediated insertional mutagenesis revealed the functions of animal cellulose synthase in the ascidian, Ciona intestinalis (2005)
  • 著者名/発表者名: Sasakura, Y.
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102 ページ: 15134-15139
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A saturation screen for cis-acting regulatory DNA in the Hox genes of Ciona intestinalis (2005)
  • 著者名/発表者名: Keys, D.N., Lee, B.-i., DiGregorio, A., et al.
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102 ページ: 679-683
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Dynamic changes in developmental gene expression in the basal chordate Ciona intestinalis (2005)
  • 著者名/発表者名: Kawashima, T., Satou, Y., Murakami, S.D., Satoh, N.
  • 雑誌名: Dev. Growth Differ 47 ページ: 187-199
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Surfing with the tunicates into the post-genome era (2005)
  • 著者名/発表者名: Satoh, N., Levine, M.
  • 雑誌名: Genes Dev. 19 ページ: 2407-2411
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Ci-Tbx6b and Ci-Tbx6c are key mediators of the maternal effect gene Ci-machol in muscle cell differentiation in Ciona intestinalis embryos (2005)
  • 著者名/発表者名: Yagi, K., Takatori, N., Satou, Y., Satoh, N.
  • 雑誌名: Dev. Biol. 282 ページ: 535-549
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Molecular cytogenetic characterization of Ciona intestinalis chromosomes (2005)
  • 著者名/発表者名: Shoguchi, E., Kawashima, T., Nishida-Umehara, C., Matsuda, Y., Satoh, N.
  • 雑誌名: Zool. Sci. 22 ページ: 511-516
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A genome-wide survey of genes for enzymes involved in pigment synthesis in an ascidian, Ciona intestinalis (2005)
  • 著者名/発表者名: Takeuchi, K., Satou, Y., Yamamoto, H., Satoh, N.
  • 雑誌名: Zool. Sci. 22 ページ: 723-734
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Comprehensive analysis of the ascidian genome reveals novel insights into the molecular evolution of ion channel genes (2005)
  • 著者名/発表者名: Okamura, Y., Nishino, A., Murata, Y., et al.
  • 雑誌名: Physiol. Genomics 22 ページ: 269-282
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Assembly of polymorphic genomes : Algorithms and application to Ciona savignyi (2005)
  • 著者名/発表者名: Vinson, J.P., Jaffe, D.B., O'Neill, K., et al.
  • 雑誌名: Genome Res. 15 ページ: 1127-1135
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Oligonucleotide-based microarray analysis of retinoic acid target genes in the protochordate, Ciona intestinalis (2005)
  • 著者名/発表者名: Ishibashi, T., Usami, T., Fujie, M., Azumi, K., Satoh, N., Fujiwara, S.
  • 雑誌名: Dev. Dynamics 233 ページ: 1571-1578
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] An integrated database of the ascidian, Ciona intestinalis : Towards functional genomics (2005)
  • 著者名/発表者名: Satou, Y., Kawashima, T., Shoguchi, E., Nakayama, A., Satoh, N.
  • 雑誌名: Zool. Sci. 22 ページ: 837-843
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Cataloguing transcription factor and major signalling molecule genes for functional genomic studies in Ciona intestinalis (2005)
  • 著者名/発表者名: Satou, Y., Satoh, N.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 215 ページ: 580-596
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] De novo discovery of a tissue-specific gene regulatory module in a chordate (2005)
  • 著者名/発表者名: Johnson, D.S., Zhou, Q., Yagi, K., Satoh, N., Wong, W., Sidow, A.
  • 雑誌名: Genome Res. 15 ページ: 1315-1324
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Transposon-mediated insertional mutagenesis revealed the functions of animal cellulose synthase in the ascidian, Ciona intestinalis (2005)
  • 著者名/発表者名: Sasakura, Y., Nakashima, K., Awazu, S., Matsuoka, T., Nakayama, A., Azuma, J.-i., Satoh, N.
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci.USA 102 ページ: 15134-15139
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Fluorescent in situ hybridization to ascidian chromosomes (2004)
  • 著者名/発表者名: Shoguchi, E.
  • 雑誌名: Zool. Sci. 21 ページ: 153-157
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A zinc finger transcription factor, ZicL, is a direct activator of Brachyury in the notochord specification of Ciona intestinalis (2004)
  • 著者名/発表者名: Yagi, K.
  • 雑誌名: Development 131 ページ: 1279-1288
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] T-box genes in the ascidian Ciona intestinalis : Characterization of cDNAs and spatial expression (2004)
  • 著者名/発表者名: Takatori, N.
  • 雑誌名: Dev. Dynamics 230 ページ: 743-753
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Piecing together evolution of the vertebrate endocrine system (2004)
  • 著者名/発表者名: Campbell, R. K.
  • 雑誌名: Trends Genet. 20 ページ: 359-366
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Gene expression profiles of transcription factors and signaling molecules in the ascidian embryo : towards a comprehensive understanding of gene networks (2004)
  • 著者名/発表者名: Imai, K. S.
  • 雑誌名: Development 131 ページ: 4047-4058
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Fluorescent in situ hybridization to ascidian chromosomes (2004)
  • 著者名/発表者名: Shoguchi, E., Ikuta, T., Yoshizaki, F., Satou, Y., Satoh, N., Asano, K., Saiga, H., Nishikata, T.
  • 雑誌名: Zool. Sci. 21 ページ: 153-157
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A zinc finger transcription factor, ZicL, is a direct activator of Brachyury in the notochord specification of Ciona intestinalis (2004)
  • 著者名/発表者名: Yagi, K., Satou, Y., Satoh, N.
  • 雑誌名: Development 131 ページ: 1279-1288
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] T-box genes in the ascidian Ciona intestinalis Characterization of cDNAs and spatial expression (2004)
  • 著者名/発表者名: Takatori, N., Hotta, K., Mochizuki, Y., Satoh, G., Mitani, Y., Satoh, N., Satou, Y., Takahashi, H.
  • 雑誌名: Dev. Dynamics 230 ページ: 743-753
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Piecing together evolution of the vertebrate endocrine system (2004)
  • 著者名/発表者名: Campbell, R.K., Satoh, N., Degnan, B.M.
  • 雑誌名: Trends Genet. 20 ページ: 359-366
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Gene expression profiles of transcription factors, signalling molecules in the ascidian embryo : towards a comprehensive understanding of gene networks (2004)
  • 著者名/発表者名: Imai, K.S., Hino, K., Yagi, K., Satoh, N., Satou, Y.
  • 雑誌名: Development 131 ページ: 4047-4058
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Piecing together evolution of the vertebrate endocrine system (2004)
  • 著者名/発表者名: Campbell, R.K.
  • 雑誌名: Trends in Genetics 20 ページ: 359-366
• [雑誌論文] The ascidian Mesp gene specifies heart precursor cells (2004)
  • 著者名/発表者名: Satou, Y.
  • 雑誌名: Development 131 ページ: 2533-2541
• [雑誌論文] Gene expression profiles of transcription factors and signaling molecules in the ascidian embryo : towards a comprehensive understanding of gene networks (2004)
  • 著者名/発表者名: Imai, K.S.
  • 雑誌名: Development 131 ページ: 4047-4058
• [雑誌論文] Three distinct lineages of mesenchymal cells in Ciona intestinalis embryos demonstrated by specific gene expression (2004)
  • 著者名/発表者名: Tokuoka, M.
  • 雑誌名: Developmental Biology 274 ページ: 211-224
• [雑誌論文] Identification of downstream genes of the ascidian muscle determinan gene Ci-machol (2004)
  • 著者名/発表者名: Yagi, K.
  • 雑誌名: Developmental Biology 274 ページ: 478-489
• [雑誌論文] Microarray analysis of embryonic retinoic acid target genes in the ascidian Ciona intestinalis (2003)
  • 著者名/発表者名: Ishibashi, T.
  • 雑誌名: Dev. Growth Differ. 45 ページ: 249-259
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] The ascidian tadpole larva : Comparative molecular development and genomics (2003)
  • 著者名/発表者名: Satoh, N.
  • 雑誌名: Nature Rev. Genet. 4 ページ: 285-295
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Ciona intestinalis : an emerging model for whole-genome analyses (2003)
  • 著者名/発表者名: Satoh, N.
  • 雑誌名: Trends Genet. 19 ページ: 376-381
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Genomewide surveys of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis (2003)
  • 著者名/発表者名: Satou, Y.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 213 ページ: 211-212
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis : I. Genes for bHLH transcription factors (2003)
  • 著者名/発表者名: Satou, Y.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 213 ページ: 213-221
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis : II. Genes for homeobox transcription factors (2003)
  • 著者名/発表者名: Wada, S.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 213 ページ: 222-234
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis : III. Genes for Fox, ETS, nuclear receptors and NFκB (2003)
  • 著者名/発表者名: Yagi, K.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 213 ページ: 235-244
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis : IV. Genes for HMG transcriptional regulators, bZip and GATA/Gli/Zic/Snail (2003)
  • 著者名/発表者名: Yamada, L.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 213 ページ: 245-253
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis : V. Genes for receptor tyrosine kinase pathway and Notch signaling pathway (2003)
  • 著者名/発表者名: Satou, Y.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 213 ページ: 254-263
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis : VI. Genes for Wnt, TGFβ, hedgehog and JAK/STAT signaling pathways (2003)
  • 著者名/発表者名: Hino, K.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 213 ページ: 264-272
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis : VII. Molecules involved in the regulation of cell polarity and actin dynamics (2003)
  • 著者名/発表者名: Sasakura, Y.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 213 ページ: 273-283
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis : VIII. Genes for PI3K signaling and cell cycle (2003)
  • 著者名/発表者名: Kawashima, T.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 213 ページ: 284-290
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis : IX. Genes for muscle structural proteins (2003)
  • 著者名/発表者名: Chiba, S.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 213 ページ: 291-302
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis : X. Genes for cell junctions and extracellular matrix (2003)
  • 著者名/発表者名: Sasakura, Y.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 213 ページ: 303-313
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Large scale EST analyses in Ciona intestinalis : Its application as Northern blot analyses (2003)
  • 著者名/発表者名: Satou, Y.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 213 ページ: 314-318
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] The invertebrate ancestry of endocannabinoid signalling : an orthologue of vertebrate cannabinoid receptors in the urochordate Ciona intestinalis (2003)
  • 著者名/発表者名: Elphick, M. R.
  • 雑誌名: Gene 302 ページ: 95-101
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Identification of candidate genes encoding the core components of the cell death machinery in the Ciona intestinalis genome (2003)
  • 著者名/発表者名: Terajima, D.
  • 雑誌名: Cell Death Differ. 10 ページ: 749-753
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Large-scale characterization of genes specific to the larval nervous system in the ascidian Ciona intestinalis (2003)
  • 著者名/発表者名: Mochizuki, Y.
  • 雑誌名: genesis 36 ページ: 62-71
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Genomic analysis of immunity in a urochordate and the emergence of the vertebrate immune system : "waiting for Godot" (2003)
  • 著者名/発表者名: Azumi, K.
  • 雑誌名: Immunogenetics 55 ページ: 570-581
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Microarray analysis of embryonic retinoic acid target genes in the ascidian Ciona intestinalis (2003)
  • 著者名/発表者名: Ishibashi, T., Nakazawa, M., Ono, H., Satoh, N., Gojobori, T.Fujiwara, S.
  • 雑誌名: Dev. Growth Differ. 45 ページ: 249-259
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Ciona intestinalis : an emerging model for whole-genome analyses (2003)
  • 著者名/発表者名: Satoh, N., Satou, Y., Davidson, B., Levine, M.
  • 雑誌名: Trends Genet. 19 ページ: 376-381
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Genomewide surveys of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis (2003)
  • 著者名/発表者名: Satou, Y., Satoh, N.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 213 ページ: 211-212
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis : I. Genes for bHLH transcription factors (2003)
  • 著者名/発表者名: Satou, Y., Imai, K.S., Levine, M., Kohara, Y., Rokhsar, D.Satoh, N.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 213 ページ: 211-212
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis II. Genes for homeobox transcription factors (2003)
  • 著者名/発表者名: Wada, S., Tokuoka, M., Shoguchi, E., et al.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 213 ページ: 222-234
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis III. Genes for Fox, ETS, nuclear receptors and NFκB (2003)
  • 著者名/発表者名: Yagi, K., Satou, Y., Mazet, F., et al.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 213 ページ: 235-244
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis IV. Genes for HMG transcriptional regulators, bZip and GATA/Gli/Zic/Snail (2003)
  • 著者名/発表者名: Yamada, L., Kobayashi, K., Degnan, B., Satoh, N., Satou, Y.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 213 ページ: 245-253
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis V. Genes for receptor tyrosine kinase pathway and Notch signalling pathway (2003)
  • 著者名/発表者名: Satou, Y., Sasakura, Y., Yamada, L., Imai, K.S., Satoh, N., Degnan, B.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 213 ページ: 254-263
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis VI. Genes for Wnt, TGFβ, hedgehog and JAK/STAT signalling pathways (2003)
  • 著者名/発表者名: Hino, K., Satou, Y., Yagi, K., Satoh, N.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 213 ページ: 264-272
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis VII. Molecules involved in the regulation of cell polarity and actin dynamics (2003)
  • 著者名/発表者名: Sasakura, Y., Yamada, L., Takatori, N., Satou, Y., Satoh, N.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 213 ページ: 273-283
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis VIII. Genes for PI3K signalling and cell cycle (2003)
  • 著者名/発表者名: Kawashima, T., Tokuoka, M., Awazu, S., Satoh, N., Satou, Y.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 213 ページ: 284-290
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis IX. Genes for muscle structural proteins (2003)
  • 著者名/発表者名: Chiba, S., Awazu, S., Itoh, M., et al.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 213 ページ: 291-302
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis X. Genes for cell junctions and extracellular matrix (2003)
  • 著者名/発表者名: Sasakura, Y., Shoguchi, E., Takatori, N., Wada, S., Meinertzhagen, I.A., Satou, Y., Satoh, N.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 213 ページ: 303-313
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Large scale EST analyses in Ciona intestinalis : Its application as Northern blot analyses (2003)
  • 著者名/発表者名: Satou, Y., Kawashima, T., Kohara, Y., Satoh, N.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 213 ページ: 314-318
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The invertebrate ancestry of endocannabinoid signalling : an orthologue of vertebrate cannabinoid receptors in the urochordate Ciona intestinalis (2003)
  • 著者名/発表者名: Elphick, M.R., Satou, Y., Satoh, N.
  • 雑誌名: Gene 302 ページ: 95-101
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Identification of candidate genes encoding the core components of the cell death machinery in the Ciona intestinalis genome (2003)
  • 著者名/発表者名: Terajima, D., Shida, K., Takada, N., et al.
  • 雑誌名: Cell Death Differ. 10 ページ: 749-753
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Large-scale characterization of genes specific to the larval nervous system in the ascidian Ciona in testinalis (2003)
  • 著者名/発表者名: Mochizuki, Y., Satou, Y., Satoh, N.
  • 雑誌名: genesis 36 ページ: 62-71
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Genomic analysis of immunity in a urochordate and the emergence of the vertebrate immune system : "waiting for Godot" (2003)
  • 著者名/発表者名: Azumi, K., De Santis, R., De Tomaso, A., et al.
  • 雑誌名: Immunogenetics 55 ページ: 570-581
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Gene expression profiles in tadpole larvae of Ciona intestinalis (2002)
  • 著者名/発表者名: Kusakabe, T.
  • 雑誌名: Dev. Biol. 242 ページ: 188-203
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Gene expression profiles in Ciona intestinalis cleavage-stage embryos (2002)
  • 著者名/発表者名: Fujiwara, S.
  • 雑誌名: Mech. Dev. 112 ページ: 115-127
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Gene expression profiles in young adult Ciona intestinalis (2002)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara, M.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 212 ページ: 173-185
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Ciona intestinalis cDNA projects : expressed sequence tag analyses and gene expression profiles during embryogenesis (2002)
  • 著者名/発表者名: Satou, Y.
  • 雑誌名: Gene 287 ページ: 83-96
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Construction of BAC libraries derived from the ascidian Ciona intestinalis (2002)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, M.
  • 雑誌名: Genes Genet. Syst. 77 ページ: 283-285
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A cDNA resource from the basal chordate Ciona intestinalis (2002)
  • 著者名/発表者名: Satou, Y.
  • 雑誌名: genesis 33 ページ: 153-154
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Fgf genes in the basal chordate Ciona intestinalis (2002)
  • 著者名/発表者名: Satou, Y.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 212 ページ: 432-438
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] The draft genome of Ciona intestinalis : insights into chordate and vertebrate origins (2002)
  • 著者名/発表者名: Dehal, P.
  • 雑誌名: Science 298 ページ: 2157-2167
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Gene expression profiles in tadpole larvae of Ciona intestinalis (2002)
  • 著者名/発表者名: Kusakabe, T., Yoshida, R., Kawakami, I., et al.
  • 雑誌名: Dev. Biol. 242 ページ: 188-203
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Gene expression profiles in Ciona intestinalis cleavage-stage embryos (2002)
  • 著者名/発表者名: Fujiwara, S., Maeda, Y., Shin-i, T., Kohara, Y., Takatori, N., Satou Y., Satoh, N.
  • 雑誌名: Mech. Dev. 112 ページ: 115-127
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Gene expression profiles in young adult Ciona intestinalis (2002)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara, M., Sasaki, A., Metoki, H., Shin-i, T., Kohara, Y., Satoh, N., Satou, Y.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 212 ページ: 173-185
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Ciona intestinalis cDNA projects expressed sequence tag analyses and gene expression profiles during embryogenesis (2002)
  • 著者名/発表者名: Satou, Y., Takatori, N., Fujiwara, S., Nishikata, T.,.Saiga, H., Kusakabe, T., Shin-i, T., Kohara, Y., Satoh, N.
  • 雑誌名: Gene 287 ページ: 83-96
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Construction of BAC libraries derived from the ascidian Ciona intestinalis (2002)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, M., Matsuda, M., Asakawa, S., Shimizu, N., Nagahama, Y., Satou, Y., Satoh, N.
  • 雑誌名: Genes Genet. Syst. 77 ページ: 283-285
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A cDNA resource from the basal chordate Ciona intestinalis (2002)
  • 著者名/発表者名: Satou, Y., Yamada, L., Mochizuki, Y., Takatori, N., Kawashima, T., Sasaki, A., Hamaguchi, M., Awazu, S., Yagi, K., Sasakura, Y., Nakayama, A., Ishikawa, H., Inaba, K., Satoh, N.
  • 雑誌名: genesis 33 ページ: 153-154
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Fgf genes in the basal chordate Ciona intestinalis (2002)
  • 著者名/発表者名: Satou, Y., Imai, K.S., Satoh, N.
  • 雑誌名: Dev. Genes Evol. 212 ページ: 432-438
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The draft genome of Ciona intestinalis insights into chordate and vertebrate origins (2002)
  • 著者名/発表者名: Dehal, P., Satou, Y., Campbell, R.K., et al.
  • 雑誌名: Science 298 ページ: 2157-2167
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Gene expression profiles in Ciona intestinalis tailbud embryos (2001)
  • 著者名/発表者名: Satou, Y.
  • 雑誌名: Development 128 ページ: 2893-2904
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Profiles of maternally expressed genes in fertilized eggs of Ciona intestinalis (2001)
  • 著者名/発表者名: Nishikata, T.
  • 雑誌名: Dev. Biol. 238 ページ: 315-331
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Action of morpholinos in Ciona embryos (2001)
  • 著者名/発表者名: Satou, Y.
  • 雑誌名: Genesis 30 ページ: 103-106
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Ascidian embryos as a model system to analyze expression and function of developmental genes (2001)
  • 著者名/発表者名: Satoh, N.
  • 雑誌名: Differentiation 68 ページ: 1-12
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] EST analysis of genes that are expressed in the neural complex of Ciona intestinalis adults (2001)
  • 著者名/発表者名: Takamura, K.
  • 雑誌名: Zool. Sci. 18 ページ: 1231-1236
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Gene expression profile in Ciona intestinalis tailbud embryos (2001)
  • 著者名/発表者名: Satou, Y., Takatori, N., Yamada, L., et al.
  • 雑誌名: Development 128 ページ: 2893-2904
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Profiles of maternally expressed genes infertilized eggs of Ciona intestinalis. (2001)
  • 著者名/発表者名: Nishikata, T., Yamada, L., Mochizuki, Y., Satou, Y., Shin-i, T., Kohara, Y., Satoh, N.
  • 雑誌名: Dev. Biol. 238 ページ: 315-331
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Action of morpholinos in Ciona embryos (2001)
  • 著者名/発表者名: Satou, Y., Imai, K.S., Satoh, N.
  • 雑誌名: Genesis 30 ページ: 103-106
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] EST analysis of genes that are expressed in the neural complex of Ciona intestinalis adults (2001)
  • 著者名/発表者名: Takamura, K., Oka, N., Akagi, A., et al.
  • 雑誌名: Zool. Sci. 18 ページ: 1231-1236
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [文献書誌] Satoh, N.: "The ascidian tadpole larva : Comparative molecular development and genomics"Nature Reviews Genetics. 4. 285-295 (2003)
• [文献書誌] Satoh, N.: "Ciona intestinalis : an emerging model for whole-genome analyses"Trends in Genetics. 19. 376-381 (2003)
• [文献書誌] Satoh, N.: "Genomewide surveys of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis"Development Genes and Evolution. 213. 211-212 (2003)
• [文献書誌] Satoh, N.: "A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis : I. Genes for bHLH transcription factors"Development Genes and Evolution. 213. 213-221 (2003)
• [文献書誌] Wada, S.: "A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis : II. Genes for homeobox transcription factors"Development Genes and Evolution. 213. 222-234 (2003)
• [文献書誌] Yagi, K.: "A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis : III. Genes for Fox, ETS, nuclear receptors and NFκB"Development Genes and Evolution. 213. 235-244 (2003)
• [文献書誌] Yamada, L.: "A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis : IV. Genes for HMG transcriptional regulators, bZip and GATA/Gli/Zic/Snail"Development Genes and Evolution. 213. 245-253 (2003)
• [文献書誌] Satou, Y.: "A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis : V. Genes for receptor tyrosine kinase pathway and Notch signaling pathway"Development Genes and Evolution. 213. 254-263 (2003)
• [文献書誌] Hino, K.: "A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis : VI. Genes for Wnt, TGFfβ, hedgehog and JAK/STAT signaling pathways"Development Genes and Evolution. 213. 264-272 (2003)
• [文献書誌] Sasakura, Y.: "A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis : VII. Molecules involved in the regulation of cell polarity and actin dynamics"Development Genes and Evolution. 213. 273-283 (2003)
• [文献書誌] Kawashima, T.: "A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis : VIII. Genes for P13K signaling and cell cycle"Development Genes and Evolution. 213. 284-290 (2003)
• [文献書誌] Chiba, S.: "A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis : IX. Genes for muscle structural proteins"Development Genes and Evolution. 213. 291-302 (2003)
• [文献書誌] Sasakura, Y.: "A genomewide survey of developmentally relevant genes in Ciona intestinalis : X. Genes for cell junctions and extracellular matrix"Development Genes and Evolution. 213. 303-313 (2003)
• [文献書誌] Satou, Y.: "Large scale EST analyses in Ciona intestinalis : Its application as Northern blot analyses"Development Genes and Evolution. 213. 314-318 (2003)
• [文献書誌] Terajima, D.: "Identification of candidate genes encoding the core components of the cell death machinery in the Ciona intestinalis genome"Cell Death and Differentiation. 10. 749-753 (2003)
• [文献書誌] Mochizuki, Y.: "Large-scale characterization of genes specific to the larval nervous system in the ascidian Ciona intestinalis"genesis. 36. 62-71 (2003)
• [文献書誌] Elphick, M.R.: "The invertebrate ancestry of endocannabinoid signalling : an orthologue of vertebrate cannabinoid receptors in the urochordate Ciona intestinalis"Gene. 302. 95-101 (2003)
• [文献書誌] Azumi, K.: "Genomic analysis of immunity in a urochordate and the emergence of the vertebrate immune system : "Waiting for Godot""Immunogenetics. 55. 570-581 (2003)
• [文献書誌] Dehal, P.: "The draft genome of Ciona intestinalis : insights into chordate and vertebrate origins"Science. 298. 2157-2167 (2002)
• [文献書誌] Kusakabe, T.: "Gene expression profiles in tadpole larvae of Ciona intestinalis"Developmental Biology. 242. 188-203 (2002)
• [文献書誌] Fujiwara, S.: "Gene expression profiles in Ciona intestinalis cleavage-stage embryos"Mechanisms of Development. 112. 115-127 (2002)
• [文献書誌] Satou, Y.: "Ciona intestinalis cDNA projects : expressed sequence tag analyses and gene expression profiles during embryogenesis"Gene. 287. 83-96 (2002)
• [文献書誌] Ogasawara, M.: "Gene expression profiles in young adult Ciona intestinalis"Development Genes and Evolution. 212. 173-185 (2002)
• [文献書誌] Satou, Y.: "A cDNA resource from the basal chordate Ciona intestinalis"genesis. 33. 153-154 (2002)
• [文献書誌] Yutaka Satou: "Gene expression profiles in Ciona intestinalis tailbud embryos"Development. 128. 2893-2904 (2001)
• [文献書誌] Takahito Nishikata: "Profiles of maternally expressed genes in fertilized eggs in Ciona intestinalis"Develop. Biol.. 238. 315-331 (2001)
• [文献書誌] Katsumi Takamura: "EST analysis of genes that are expressed in the neural complex of Ciona intestinalis adults"Zool. Sci.. 18. 1231-1236 (2001)
• [文献書誌] Yutaka Satou: "Gene expression profiles in Ciona intestinalis tailbud embryos"Development. (発表予定).