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ヒト疾患における遺伝要因のゲノム的解析と分子病態の解明

研究課題

研究課題/領域番号 12203002
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関東京大学

研究代表者

菅野 純夫  東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (60162848)

研究分担者 羽田 明  千葉大学, 大学院医科学研究院, 教授 (00244541)
三木 哲郎  愛媛大学, 医学部, 教授 (00174003)
徳永 勝士  東京大学, 大学院医学系研究科, 教授 (40163977)
新川 詔夫  長崎大学, 大学院医歯薬学総合研究科, 教授 (00111170)
前田 忠計  北里大学, 理学部, 教授 (90265728)
成富 研二  琉球大学, 大学院・医学研究科, 教授 (20101446)
三輪 史朗  (財)冲中記念成人病研究所, 理事長(研究職) (40034954)
福嶋 義光  信州大学, 医学部, 教授 (70273084)
林 健志  九州大学, 生体防御医学研究所, 教授 (00019671)
濱口 秀夫  筑波大学, 基礎医学系, 教授 (00091918)
五條堀 孝  国立遺伝学研究所, 遺伝情報解析, 教授 (50162136)
笹月 健彦  国立国際医療センター研究所, 所長(研究職) (50014121)
矢崎 義雄  国立国際医療センター病院, 総長(研究職) (20101090)
研究期間 (年度) 2000 – 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
2,982,100千円 (直接経費: 2,982,100千円)
2005年度: 3,000千円 (直接経費: 3,000千円)
2004年度: 856,200千円 (直接経費: 856,200千円)
2003年度: 860,900千円 (直接経費: 860,900千円)
2002年度: 855,900千円 (直接経費: 855,900千円)
2001年度: 406,100千円 (直接経費: 406,100千円)
キーワードアレルギー喘息 / ゲノム / 循環器・高血圧 / 糖尿病 / 高血圧 / アレルギー / 喘息 / 多因子疾患 / リュウマチ / DNAチップ
研究概要

日本学術振興会未来開拓研究事業(平成16年度終了)、文部科学省特定領域研究「応用ゲノム」(平成16度-平成21年度)と合同で、国際シンポジウム「ゲノム科学による疾患の解明-ゲノム科学の明日の医学へのインパクト」及び市民講座「ゲノム科学と社会」を平成18年1月17日-1月21日に行なった。国際シンポジウムの発表者は未来開拓5人、本特定領域6人、応用ゲノム3人、海外招待講演者9人であった。市民講座は、科学者側6名に対し、国際基督教大学の村上陽一郎氏に一般講演をお願いし、最後にパネルディスカッションを行なった。参加者は延べ550人であった。
また、文部科学省特定領域「ゲノム」4領域(統合、医科学、生物学、情報科学、平成16年度終了)合同の一般向け研究成果公開シンポジウム「ゲノムは何をどのように決めているのか?-生命システムの理解へ向けて-」を平成18年1月28,29日に行なった。本シンポジウムの構成は、セッション1:ゲノムから細胞システム(司会:高木利久)講演4題、セッション2:ゲノムから高次機能(司会:菅野純夫)講演6題、セッション3:ゲノムから人間、ヒトへの道(司会:小笠原直毅)講演7題を行い、さらに、小原雄治統合ゲノム代表の司会の下、門脇孝、小笠原直毅、漆原秀子、藤山秋佐夫、高木利久、加藤和人の各班員、各代表をパネリストとしてパネルディスカッションを行なった。参加者は延べ700人であった。また、本領域の最終的な報告書を作製した。

報告書

(7件)
  • 2005 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2004 実績報告書
  • 2003 実績報告書
  • 2002 実績報告書
  • 2001 実績報告書
  • 2000 実績報告書

研究成果

(75件)

すべて 2005 2004 2003 2002 2001 2000 その他

すべて 雑誌論文 図書 文献書誌

  • [雑誌論文] 15'SAGE : 5'-end Serial Analysis of Gene Expression database.2005

    • 著者名/発表者名
      Kasai Y, et al.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 33

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] The genome of the social amoeba Dictyostelium discoideum.2005

    • 著者名/発表者名
      Eichinger L, et al.
    • 雑誌名

      Nature 435

      ページ: 43-57

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Substitution Rate and Structural Divergence of 5'UTR Evolution : Comparative Analysis Between Human and Cynomolgus Monkey cDNAs.2005

    • 著者名/発表者名
      Osada N, et al.
    • 雑誌名

      Mol Biol Evol. 22

      ページ: 1976-1982

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書 2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] dbQSNF : a database of SNPs in human promoter regions with allele frequency information determined by single-strand conformation polymorphism-based methods.2005

    • 著者名/発表者名
      Tahira T, et al.
    • 雑誌名

      Hum Mutat. 226

      ページ: 69-77

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Cell surface labeling and mass spectrometry reveal diversity of cell-surface markers and signaling molecules expressed in undifferentiated mouse embryonic stem cells.2005

    • 著者名/発表者名
      Nunomura K, et al.
    • 雑誌名

      Mol Cell Proteomics. 4

      ページ: 1968-1976

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書 2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 5'SAGE : 5'-end Serial Analysis of Gene Expression database.2005

    • 著者名/発表者名
      Kasai Y, et al.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 33

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書 2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] The genome of the social amoeba Dictyostelium discoideum2005

    • 著者名/発表者名
      Eichinger L, et al.
    • 雑誌名

      Nature. 435

      ページ: 43-57

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Genome-wide analysis reveals strong correlation between CpG islands with nearby transcription start sites of genes and their tissue specificity.2005

    • 著者名/発表者名
      Yamashita R, et al.
    • 雑誌名

      Gene. 350

      ページ: 129-136

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] dbQSNP : a database of SNPs in human promoter regions with allele frequency information determined by single-strand conformation polymorphism-based methods.2005

    • 著者名/発表者名
      Tahira T., et al.
    • 雑誌名

      Hum Mutat. 226

      ページ: 69-77

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] The genome of the social amoeba Dictyostelium discoideum.2005

    • 著者名/発表者名
      Eichinger L., et al.
    • 雑誌名

      Nature 435

      ページ: 43-57

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] dbQSNP : a database of SNPs in human promoter regions with allele frequency information determined by single-strand conformation polymorphism-based methods.2005

    • 著者名/発表者名
      Tahira T, et al.
    • 雑誌名

      Hum Mutat. 226

      ページ: 69-77

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs.2004

    • 著者名/発表者名
      Ota T, et al.
    • 雑誌名

      Nat Genet. 36

      ページ: 40-45

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Full-malaria 2004 : an enlarged database for comparative studies of full-length cDNAs of malaria parasites, Plasmodium species.2004

    • 著者名/発表者名
      Watanabe, J., et al.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 32

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] DBTSS, DataBase of Transcriptional Start Sites : progress report 2004.2004

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, Y., et al.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 32

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 5'-end SAGE for the analysis of transcriptional start sites.2004

    • 著者名/発表者名
      Hashimoto SI., et al.
    • 雑誌名

      Nat Biotechnol. 22

      ページ: 1146-1149

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Analysis of small human proteins reveals the translation of upstream open reading frames of mRNAs.2004

    • 著者名/発表者名
      Oyama M, et al.
    • 雑誌名

      Genome Res. 10B

      ページ: 2048-2052

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Sequence comparison of human and mouse genes reveals a homologous block structure in the promoter regions.2004

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Y, et al.
    • 雑誌名

      Genome Res. 14

      ページ: 1711-1718

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Promoter prediction analysis on the whole human genome.2004

    • 著者名/発表者名
      Bajic VB, et al.
    • 雑誌名

      Nat Biotechnol. 22

      ページ: 1467-1473

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 5'-end SAGE for the analysis of transcriptional start sites.2004

    • 著者名/発表者名
      Hashimoto SI, et al.
    • 雑誌名

      Nat Biotechnol. 22

      ページ: 1146-1149

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs2004

    • 著者名/発表者名
      Ota T., et al.
    • 雑誌名

      Nat Genet 36

      ページ: 40-45

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Genome sequence of the ultrasmall unicellular red alga Cyanidioschyzon merolae 10D2004

    • 著者名/発表者名
      Matsuzaki M., et al.
    • 雑誌名

      Nature 428

      ページ: 653-657

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] 5'-end SAGE for the analysis of transcriptional start sites2004

    • 著者名/発表者名
      Hashimoto SI, et al.
    • 雑誌名

      Nat Biotechnol 22

      ページ: 1146-1149

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Analysis of small human proteins reveals the translation of upstream open reading frames of mRNAs2004

    • 著者名/発表者名
      Oyama M., et al.
    • 雑誌名

      Genome Res 10B

      ページ: 2048-2052

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Sequence comparison of human and mouse genes reveals a homologous block structure in the promoter regions2004

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Y., et al.
    • 雑誌名

      Genome Res 14

      ページ: 1711-1718

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Promoter prediction analysis on the whole human genome2004

    • 著者名/発表者名
      Bajic VB, et al.
    • 雑誌名

      Nat Biotechnol 22

      ページ: 1467-1473

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Construction of a full-length enriched and a 5'-end enriched cDNA library using the oligo-capping method.2003

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Y, et al.
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol. 221

      ページ: 73-91

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Analysis of 5'-end sequences of chimpanzee cDNAs.2003

    • 著者名/発表者名
      Sakate R, et al.
    • 雑誌名

      Genome Res. 13

      ページ: 1022-1026

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Large-scale identification and characterization of human genes that activate NF-kappaB and MAPK signaling pathways.2003

    • 著者名/発表者名
      Matsuda A, et al.
    • 雑誌名

      Oncogene. 22

      ページ: 3307-3318

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] The 5' terminal oligopyrimidine tract of human elongation factor 1A-1 gene functions as a transcriptional initiator and produces a variable number of Us at the transcriptional level.2003

    • 著者名/発表者名
      Shibui-Nihei A et al.
    • 雑誌名

      Gene. 311

      ページ: 137-145

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Collection, mapping, and annotation of over 28,000 cDNA clones from japonica rice.2003

    • 著者名/発表者名
      Kikuchi S. et al.
    • 雑誌名

      Science. 301

      ページ: 376-379

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Expression profiling and characterization of 4200 genes cloned from primary neuroblastomas : identification of 305 genes differentially expressed between favorable and unfavorable subsets.2003

    • 著者名/発表者名
      Ohira M, et al.
    • 雑誌名

      Oncogene 22

      ページ: 5525-5536

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Small open reading frames in 5' untranslated regions of mRnas.2003

    • 著者名/発表者名
      Yamashita R, et al.
    • 雑誌名

      C R Biol. 326

      ページ: 987-991

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] The 5' terminal oligopyrimidine tract of human elongation factor 1A-1 gene functions as a transcriptional initiator and produces a variable number of Us at the transcriptional level.2003

    • 著者名/発表者名
      Shibui-Nihei A, et al.
    • 雑誌名

      Gene. 311

      ページ: 137-45

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Expression profiling and characterization of 4200 genes cloned from primary neuroblastomas : identification of305 genes differentially expressed between favorable and unfavorable subsets.2003

    • 著者名/発表者名
      Ohira M, et al.
    • 雑誌名

      Oncogene. 22

      ページ: 5525-5536

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Analysis of transcriptomes of human malaria parasite Plasmodium falciparum using full-length enriched library : identification of novel genes and diverse transcription start sites of messenger RNAs.2002

    • 著者名/発表者名
      Watanabe J, et al.
    • 雑誌名

      Gene. 291

      ページ: 105-113

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] OASIS is a transcriptional activator of CREB/ATF family with a transmembrane domain.2002

    • 著者名/発表者名
      Omori Y, et al.
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun. 293

      ページ: 470-477

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Search for genes positively selected during primate evolution by 5'-end-sequence screening of cynomolgus monkey cDNAs.2002

    • 著者名/発表者名
      Osada N, et al.
    • 雑誌名

      Genomics. 79

      ページ: 657-662

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] DBTSS : DataBase of human Transcriptional Start Sites and full-length cDNAs.2002

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Y, et al.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 30

      ページ: 328-331

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] A Transcription Factor Response Element for Gene Expression During Circadian Night.2002

    • 著者名/発表者名
      Ueda R.H, et al.
    • 雑誌名

      Nature 418

      ページ: 534-539

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Molecular cloning, mRNA expression and chromosomal localization of mouse angiotensin-converting enzyme-related carboxypeptidase (mACE2).2002

    • 著者名/発表者名
      Komatsu T, et al.
    • 雑誌名

      DNA Seq. 13

      ページ: 217-220

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] A Transcription Factor Response Element for Gene Expression During Circadian Night.2002

    • 著者名/発表者名
      Ueda R.et al.
    • 雑誌名

      Nature. 418

      ページ: 534-539

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] HUNT : launch of a full-length cDNA database from the helix research institute.2001

    • 著者名/発表者名
      Yudate, H.T., et al.
    • 雑誌名

      Nucl. Acid Res. 29

      ページ: 185-188

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Identification and characterization of the potential promoter regions of 1031 kinds of human genes.2001

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Y, et al.
    • 雑誌名

      Genome Res. 11

      ページ: 677-684

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Diverse transcriptional initiation revealed by fine, large-scale mapping of mRNA start sites.2001

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Y, et al.
    • 雑誌名

      EMBO Rep. 2

      ページ: 388-393

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Construction of full-length-enriched cDNA libraries. The oligo-capping method.2001

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Y, et al.
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol. 175

      ページ: 143-153

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Diverse transcriptional initiation revealed by fine, large-scale mapping of mRNA start sites2001

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Y, et al.
    • 雑誌名

      EMBO Rep. 2

      ページ: 388-393

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Statistical analysis of 5' untranslated region of human mRNA using "Oligo-capping" cDNA libraries.2000

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, Y., et al.
    • 雑誌名

      Genomis 64

      ページ: 286-297

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Comparative PCR : A Simple and Sensitive Method to Quantify Low-Abundant mRNA Species.2000

    • 著者名/発表者名
      Ohmori, Y., et al.
    • 雑誌名

      Genomics 67

      ページ: 140-145

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Statistical analysis of 5' untranslated region of human mRNA using "Oligo-capping" cDNA libraries.2000

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, Y, et al.
    • 雑誌名

      Genomis 64

      ページ: 286-297

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Comparative PCR : A Simple and Sensitive Method to Quantify Low-Abundant mRNA Species.2000

    • 著者名/発表者名
      Ohmori, Y, et al.
    • 雑誌名

      Genomics 67

      ページ: 140-145

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [図書] Methods Mol Biol. (221)2003

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Y
    • 出版者
      Construction of a full-length enriched and a 5'-end enriched cDNA library using the oligo-cappping method
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [文献書誌]

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌]

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌]

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌]

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      2003 実績報告書
  • [文献書誌]

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      2003 実績報告書
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      2003 実績報告書
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      2002 実績報告書
  • [文献書誌]

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      2002 実績報告書
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      2002 実績報告書
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      2002 実績報告書
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      2002 実績報告書
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      2001 実績報告書
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      2001 実績報告書
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      2001 実績報告書
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      2001 実績報告書
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      2000 実績報告書
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      2000 実績報告書
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      2000 実績報告書
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      2000 実績報告書

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公開日: 2001-04-01   更新日: 2018-03-28  

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