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染色体構造異常を利用した疾患関連遺伝子群の解析法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 12204005
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関富山大学

研究代表者

磯部 正治  富山大学, 工学部, 教授 (70211050)

研究期間 (年度) 2000 – 2004
研究課題ステータス 完了 (2004年度)
配分額 *注記
43,800千円 (直接経費: 43,800千円)
2004年度: 8,000千円 (直接経費: 8,000千円)
2003年度: 10,400千円 (直接経費: 10,400千円)
2002年度: 10,400千円 (直接経費: 10,400千円)
2001年度: 15,000千円 (直接経費: 15,000千円)
キーワード染色体異常 / 成人T細胞白血病 / HTLV-1 / 染色体転座 / PCR / BAC / SNP / 14番染色体 / ATL1
研究概要

1)転座切断点近傍の構造解析を迅速化し、かつ貴重な試料を節約するためAdaptor-ligated PCR法を応用した転座切断点の単離法を開発した。この方法により100ngのゲノムDNAを用いて、約4日間の操作で切断点の構造情報が得られるようになった。
2)西南日本に多発する成人T細胞白血病(ATL)のほとんどの症例ではHTLV-1ウイルスの宿主ゲノム内への挿入が検出される。そこで、上述の手法を応用し、5種類のATL患者由来の細胞株と33症例のATL患者由来試料から合計58箇所の新規ウイルス挿入部位を単離し、現在までに報告されていたウイルス挿入部位を加え,合計106箇所のHTLV-1挿入部位について、近傍の遺伝子との関連を解析した。その結果、ウイルスは遺伝子発現を行っているクロマチン領域に挿入されやすいことが明らかとなった。また本研究によって、遺伝子領域内へHTLLV-1の挿入が起こると約20%のATL症例において、挿入された遺伝子の過剰発現が誘導されることが明らかとなった。これらの過剰発現が誘導された遺伝子には、GPHNやANK1遺伝子が存在した。
3)ATLの発症にはHTLV-1の感染だけでは不十分で、細胞内遺伝子の発現変化が必須である。成人T細胞白血病(ATL)では、ヒト14番染色体、2番染色体、ならびに17番染色体の各長腕に染色体異常の集積領域が存在する。われわれは、14番染色体の染色体異常好発領域近傍からATLの発症に深く関わる遺伝子を同定しATL1と命名した。この遺伝子をHela細胞で強制発現させると腫瘍抑制効果が認められた。したがって、この遺伝子の発現減少がATLの発症と深く結びついている可能性が強く示唆された。

報告書

(6件)
  • 2004 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2003 実績報告書
  • 2002 実績報告書
  • 2001 実績報告書
  • 2000 実績報告書
  • 研究成果

    (38件)

すべて 2006 2005 2004 2002 2001 2000 その他

すべて 雑誌論文 (29件) 文献書誌 (9件)

  • [雑誌論文] TCR variable gene involvement in chromosome inversion between 14q11 and 14q24 in adult T-cell leukemia.2006

    • 著者名/発表者名
      Haider, S.
    • 雑誌名

      J Hum Genet (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Molecular characterization of a novel translocation t(5;14)(q21;q32) in a patient with congenital abnormalities.2006

    • 著者名/発表者名
      Haider, S.
    • 雑誌名

      J Hum Genet (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] TCR variable gene involvement in chromosome inversion between 14q11 and 14q24 in adult T-cell leukemia.2006

    • 著者名/発表者名
      Haider, S., Hayakawa, K.Itoyama, T.Sadamori, N.Kurosawa, N., Isobe.M.
    • 雑誌名

      J Hum Genet (in press)

    • NAID

      10017479812

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Molecular characterization of a novel translocation t(5;14)(q21;q32) in a patient with congenital abnormalities.2006

    • 著者名/発表者名
      Haider, S., Matsumoto, R., Kurosawa, N., Wakui, K., Fukushima, Y., Isobe, M.
    • 雑誌名

      J Hum Genet (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Frag1, a homolog of alternative replication factor C subunits, links replication stress surveillance with apoptosis.2005

    • 著者名/発表者名
      Ishii, H.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci U S A 102

      ページ: 9655-9660

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Genetic analysis of learning and memory deficits in senescence-accelerated mouse (SAM).2005

    • 著者名/発表者名
      Tomobe, K.
    • 雑誌名

      Physiol Behav 84

      ページ: 505-510

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Frag1, a homolog of alternative replication factor C subunits, links replication stress surveillance with apoptosis.2005

    • 著者名/発表者名
      Ishii, H., Inageta, T., Mimori, K., Saito, T., Sasaki, H., Isobe, M., Mori, M., Croce, C.M., Huebner, K., Ozawa, K., Furukawa, Y.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci USA 102(27)

      ページ: 9655-9660

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Genetic analysis of learning and memory deficits in senescence-accelerated mouse (SAM).2005

    • 著者名/発表者名
      Tomobe, K., Isobe, M., Okuma, Y., Kitamura, K., Oketani, Y., Nomura, Y.
    • 雑誌名

      Physiol Behav 84(4)

      ページ: 505-510

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Analysis of genetically determined learning and memory deficits in SAMP8 cross-mated with JF1 mice.2005

    • 著者名/発表者名
      K.Tomobe
    • 雑誌名

      Physiology and Behavior (in press)

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Rapid isolation of viral integration site reveals frequent integration of HTLV-1 into expressed loci.2004

    • 著者名/発表者名
      Ozawa, T.
    • 雑誌名

      J Hum Genet 49

      ページ: 154-165

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 3' rapid amplification of cDNA ends (RACE) walking for rapid structural analysis of large transcripts.2004

    • 著者名/発表者名
      Ozawa, T.
    • 雑誌名

      J Hum Genet 49

      ページ: 102-105

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Rapid isolation of viral integration site reveals frequent integration of HTLV-1 into expressed loci.2004

    • 著者名/発表者名
      Ozawa, T., Itoyama, T., Sadamori, N., Yamada, Y., Hata, T., Tomonaga, M., Isobe, M.
    • 雑誌名

      J Hum Genet 49(3)

      ページ: 154-165

    • NAID

      10012891202

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 3' rapid amplification of cDNA ends (RACE) walking for rapid structural analysis of large transcripts.2004

    • 著者名/発表者名
      Ozawa, T., Kondo, M., Isobe, M.
    • 雑誌名

      J Hum Genet 49(2)

      ページ: 102-105

    • NAID

      10012114900

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 3' rapid amplification of cDNA ends (RACE) walking for rapid structural analysis of large transcripts.2004

    • 著者名/発表者名
      T.Ozawa
    • 雑誌名

      J.Hum.Genet. 49

      ページ: 102-105

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Rapid isolation of viral integration site reveals frequent integration of HTLV-1 into expressed loci.2004

    • 著者名/発表者名
      T.Ozawa
    • 雑誌名

      J.Hum.Genet. 49

      ページ: 154-165

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Quantitative trait loci for age-related memory dysfunction in SAMP8 and JF1 mice.2004

    • 著者名/発表者名
      M.Isobe
    • 雑誌名

      International Congress Series 1260

      ページ: 29-34

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Genetic analysis of learning and memory deficits in MAMP8 mice.2004

    • 著者名/発表者名
      K.Tomobe
    • 雑誌名

      International Congress Series 1260

      ページ: 353-356

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Allelic imbalance of 14q32 in esophageal carcinoma.2002

    • 著者名/発表者名
      Ihara, Y.
    • 雑誌名

      Cancer Genet Cytogenet 135

      ページ: 177-181

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Allelic imbalance of 14q32 in esophageal carcinoma.2002

    • 著者名/発表者名
      Ihara, Y., Kato, Y., Bando, T., Yamagishi, F., Minamimura, T., Sakamoto, T., Tsukada, K., Isobe, M.
    • 雑誌名

      Cancer Genet Cytogenet 135(2)

      ページ: 177-181

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Identification of an aberrant type of rearrangement in the T-cell receptor alpha/delta locus in adult T-cell leukemia.2001

    • 著者名/発表者名
      Saitou, M.
    • 雑誌名

      J Hum Genet 46

      ページ: 706-711

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Identification of an aberrant type of rearrangement in the T-cell receptor alpha/delta locus in adult T-cell leukemia.2001

    • 著者名/発表者名
      Saitou, M., Sadamori, N., Isobe.M.
    • 雑誌名

      J Hum Genet 46(12)

      ページ: 706-711

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Molecular analysis of the rearranged genome and chimeric mRNAs caused by the t(6;11)(q27;q23) chromosome translocation involving MLL in an infant acute monocytic leukemia.2000

    • 著者名/発表者名
      Akao, Y.
    • 雑誌名

      Genes Chromosomes Cancer 27

      ページ: 412-417

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Genetic heterogeneity of ribosomal RNA gene and matK gene in Panax notoginseng.2000

    • 著者名/発表者名
      Fushimi, H.
    • 雑誌名

      Planta Med 66

      ページ: 659-661

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Identification of the TCL6 genes within the breakpoint cluster region on chromosome 14q32 in T-cell leukemia.2000

    • 著者名/発表者名
      Saitou, M.
    • 雑誌名

      Oncogene 19

      ページ: 2796-2802

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Cryopreservation of competent intact yeast cells for efficient electroporation.2000

    • 著者名/発表者名
      Suga, M.
    • 雑誌名

      Yeast 16

      ページ: 889-896

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Molecular analysis of the rearranged genome and chimeric mRNAs caused by the t(6;11)(q27;q23) chromosome translocation involving MLL in an infant acute monocytic leukemia.2000

    • 著者名/発表者名
      Akao, Y., Isobe, M.
    • 雑誌名

      Genes Chromosomes Cancer 27(4)

      ページ: 412-417

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Genetic heterogeneity of ribosomal RNA gene and matK gene in Panax notoginseng.2000

    • 著者名/発表者名
      Fushimi, H., Komatsu, K., Namba, T., Isobe, M.
    • 雑誌名

      Planta Med 66(7)

      ページ: 659-661

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Identification of the TCL6 genes within the breakpoint cluster region on chromosome 14q32 in T-cell leukemia.2000

    • 著者名/発表者名
      Saitou, M., Sugimoto, J., Hatakeyama, T., Russo, G., Isobe, M.
    • 雑誌名

      Oncogene 19(23)

      ページ: 2796-2802

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Cryopreservation of competent intact yeast cells for efficient electroporation.2000

    • 著者名/発表者名
      Suga, M., Isobe, M., Hatakeyama, T.
    • 雑誌名

      Yeast 16(10)

      ページ: 889-896

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Ozawa: "3' rapid amplification of cDNA ends (RACE) walking for rapid structural analysis of large transcripts."J.Hum.Genet.. 49. 102-105 (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] T.Ozawa: "Rapid isolation of viral integration site reveals frequent integration of HTLV- 1 into expressed loci"J.Hum.Genet.. (In press). (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] M.Isobe: "Quantitative trait loci for age-related memory dysfunction in SAMP8 and JF1 mice."International Congress Series. 1260. 353-356 (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Y.Ihara: "Allelic imbalance of 14q32 in esophageal carcinoma"Cancer Genet Cytogenet. 135. 177-181 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Saitou M.: "Identification of an aberrant type of rearrangement in T-cell receptor α/δ locus in adult T-cell leukemia"J.Hum.Genet.. 46(12). 706-711 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Akao,Y.: "Molecular analysis of the rearranged genome and chimeric mRNAs caused by the t (6;11)(q27;q23) chromosome translocation involving MLL in an infant acute monocytic leukemia."Genes Chromosomes Cancer. 27. 412-417 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Saitou,M.: "Identification of the TCL6 genes within the breakpoint cluster region on chromosome 14q32 in T-cell leukemia."Oncogene. 19. 2796-2802 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Fushimi,H.: "Genetic heterogeneity of ribosomal RNA gene and matK gene in Panax notoginseng."Planta Medica. 66. 659-661 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Suga,M.: "Cryopreservation of competent intact yeast cells for efficient electroporation."Yeast. 16. 889-896 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書

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公開日: 2001-04-01   更新日: 2018-03-28  

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