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遺伝子発現を基盤とする病態機序の解明法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 12204006
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関国立遺伝学研究所 (2003-2004)
九州大学 (2002)
大阪大学 (2000-2001)

研究代表者

大久保 公策  国立遺伝学研究所, 生命情報・DDBJ研究センター, 教授 (40233069)

研究分担者 日紫喜 光良  信州大学, 医学部・附属病院, 助手 (30324271)
研究期間 (年度) 2000 – 2004
研究課題ステータス 完了 (2004年度)
配分額 *注記
82,700千円 (直接経費: 82,700千円)
2004年度: 17,900千円 (直接経費: 17,900千円)
2003年度: 22,400千円 (直接経費: 22,400千円)
2002年度: 22,400千円 (直接経費: 22,400千円)
2001年度: 20,000千円 (直接経費: 20,000千円)
キーワード自然言語処理 / 情報検索 / 遺伝子発現 / EST / 比較ゲノム / 自動索引 / ゲノム / 情報工学 / マイクロアレイ / 遺伝子 / 生体生命情報学 / 疾患遺伝子 / iAFLP法 / 発現プロファイル / 遺伝子発現プロフィール / 病理組織 / 乾癬 / アレルギー性皮膚炎 / 乳がん / 知識発見 / オントロジー / 塩基配列決定
研究概要

解釈の仕組みBOB構築
BOBはあらゆる分野の専門的な文書を内容に基づいて高次元に構造化する方法であり、また文書内容を直感的に理解可能に表現するための方法である。論文アブストラクトはいうまでもなく、遺伝子、蛋白質、薬品、疾患など基礎医学を構成する概念の機能や特徴は様々な形でサマリーや関連文献集としてまとめられている。したがってこれらを利用することで遺伝子機能、薬品効能、疾患症状すべてがBOBでの構造化や表現の対象となる。ひとたび内容に形が与えられればマイクロアレイデータの解釈から文献検索結果の複数の文献のアドホックなクラスター化、ゲノム座標と特定の疾患の関係の表現などその様々な応用が期待できる。
ESTを自動的に組織別に分類する仕組み
ESTは700万を超える件数の多さや絶対量に関する情報を与えるなどの利点から発現データとして再度注目されている。このESTを発現情報として利用するためには個別エントリーをライブラリ単位にかため各ライブラリのRNA情報を読み解いて臓器や細胞単位に分類する作業が必要である。NCBIに用意されているUniLiB情報に頼らずにこれが行える仕組みを作成して常に最新のdbESTを遺伝子x臓器のBodyMapフォーマットに整理公開できるようにした。具体的には、1.エントリーの様式をもとに同じ登録者の同時登録を判別しライブラリ単位にまとめる。2.臓器オントロジーとも呼べる臓器細胞名称および形容詞の辞書を作成し、エントリ中の特定フィールドの記述中にある用語を40の基本臓器名称にマップする。3.この40の基本臓器の特徴表を作成し自由にライブラリが離散会合できる。の3つの要素機能を作成した。

報告書

(6件)
  • 2004 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2003 実績報告書
  • 2002 実績報告書
  • 2001 実績報告書
  • 2000 実績報告書
  • 研究成果

    (97件)

すべて 2005 2004 2003 2002 2001 2000 その他

すべて 雑誌論文 (63件) 図書 (10件) 産業財産権 (1件) 文献書誌 (23件)

  • [雑誌論文] DDBJ in collaboration with mass-sequencing teams on annotation.2005

    • 著者名/発表者名
      Tateno, Y.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 33

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] The Human Anatomic Gene Expression Liberary (H-ANGEL), theH-Invitegrativedisplay of human gene expression across disparate technologies and platforms.2005

    • 著者名/発表者名
      Tanino, M.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 33

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Identification and characterization of a novel component of the cornified envelope, cornifelin.2004

    • 著者名/発表者名
      Michibata, H.
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun. 318

      ページ: 803-813

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書 2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Integrative annotation of 21, 037 human genes validated by full-Length cDNA clones.2004

    • 著者名/発表者名
      Imanishi, T.
    • 雑誌名

      PLoS Biol. 2

      ページ: 856-875

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Indexing anatomical concepts to OMIM Clinical Synopsis using the UMLS Metathesaurus.2004

    • 著者名/発表者名
      Hishiki, T.
    • 雑誌名

      In Silico Biol. 4

      ページ: 31-54

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書 2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Cloning of a Gene for a Novel Epithelium-specific Cytosolic Phospholipase A2, cPLA2{delta}, Induced in Psoriatic Skin.2004

    • 著者名/発表者名
      Chiba H.
    • 雑誌名

      J Biol Chem. 279

      ページ: 12890-12897

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Identification and characterization of a novel component of the cornified envelope, cornifelin.2004

    • 著者名/発表者名
      Michibata, H., Chiba, H., Wakimoto, K., Seishima, M., Kawasaki, S., Okubo, K., Mitsui, H., Torii, H., Imai, Y.
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun. 318

      ページ: 803-13

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Integrative annotation of 21,037 human genes validated by full-Length cDNA clones.2004

    • 著者名/発表者名
      Imanishi, T., Itoh, T., Suzuki, Y., O'Donovan, C., Fukuchi, S., Koyanagi, KO., Barrero, RA., Tamura, T., Yamaguchi-Kabata, Y., Tanino, M., Yura, K., Miyazaki, S., Ikeo, K., Homma, K., Kasprzyk, A., Nishikawa, T., Hirakawa, M., Thierry-Mieg, J., Thierry-Mieg, D., Ashurst, J., Jia, L., Nakao, M., Thomas, MA., Mulder, N., Karavidopoulou, Y., Jin, L., Kim, S., Yasuda, T., Lenhard, B., Eveno, E., Suzuki, Y., Yamasaki, C., Takeda, JI., Gough, C., Hilton, P., Fujii, Y., Sakai, H., Tanaka, S., Amid, C., Bellgard, M., Bonaldo, Mde F., Bono, H., Bromberg, SK., Brookes, AJ., Bruford, E., Carninci, P., Chelala, C., Couillault, C., Souza, SJ., Debily, MA., Devignes, MD., Dubchak, I., Endo, T., Estreicher, A., Eyras, E., Fukami-Kobayashi, K., R Gopinath, G., Graudens, E., Hahn, Y., Han, M., Han, ZG., Hanada, K, Hanaoka, H., Harada, E., Hashimoto, K., Hinz, U., Hirai, M., Hishiki, T., Hopkinson, I., Imbeaud, S., Inoko, H., Kanapiri, A., Kaneko, Y., Kasukawa, T., Kelso, J., Kersey, P., Kikuno, R., Kimura, K., Korn, B., Kuryshev, V., Makalowska, I., Makino, T., Mano, S., Mariage-Samson, R., Mashima, J., Matsuda, H., Mewes, HW., Minoshima, S., Nagai, K., Nagasaki, H., Nagata, N., Nigam, R., Ogasawara, O., Ohara, O., Ohtsubo, M., Okada, N., Okido, T., Oota, S., Ota, M., Ota, T., Otsuki, T., Piatier-Tonneau, D., Poustka, A., Ren, SX., Saitou, N., Sakai, K, Sakamoto, S., Sakate, R., Schupp, I., Servant, F., Sherry, S., Shiba, R., Shimizu, N., Shimoyama, M., Simpson, AJ., Soares, B., Steward, C., Suwa, M., Suzuki, M., Takahashi, A., Tamiya, G., Tanaka, H., Taylor, T., Terwilliger, JD., Unneberg, P., Veeramachaneni, V., Watanabe, S., Wilming, L., Yasuda, N., Yoo, HS., Stodolsky, M., Makalowski, W., Go, M., Nakai, K, Takagi, T., Kanehisa, M., Sakaki, Y., Quackenbush, J., Okazaki, Y., Hayashizaki, Y., Hide, W., Chakraborty, R., Nishikawa, K., Sugawara, H., Tateno, Y., Chen, Z., Oishi, M., Tonellato, P., Apweiler, R., Okubo, K., Wagner, L., Wiemann, S., Strausberg, RL., Isogai, T., Auffray, C., Nomura, N., Gojobori, T., Sugano, S.
    • 雑誌名

      PLoS Biol. 2

      ページ: 856-75

    • NAID

      120004667172

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Indexing anatomical concepts to OMIM Clinical Synopsis using the UMLS Metathesaurus.2004

    • 著者名/発表者名
      Hishiki, T., Ogasawara, O., Tsuruoka, Y., Okubo, K.
    • 雑誌名

      In Silico Biol. 4

      ページ: 31-54

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Cloning of a gene for a novel epithelium-specific Cytosolic Phospholipase A2,cPLA2delta, induced in Psoriatic Skin.2004

    • 著者名/発表者名
      Chiba, H., Michibata, H., Wakimoto, K, Seishima, M., Kawasaki, S., Okubo, K, Mitsui, H., Torii, H., Imai, Y.
    • 雑誌名

      J Biol Chem. 279

      ページ: 12890-7

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Quantification of Gene Expression in Mouse, Human Renal Proximal Tubules., 「Laser Capture Microdissection Methods and Protocols」 (Grame I. Murray and Stephanie Curran ed.) Methods in Molecular Biology2004

    • 著者名/発表者名
      Kaimori, J., Takenaka, M., Okubo, K.
    • 雑誌名

      Humana Press 293

      ページ: 209-220

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Integrative annotation of 21,037 human genes validated by full-Length cDNA clones.2004

    • 著者名/発表者名
      Imanishi, T.
    • 雑誌名

      PloS Biol. 2

      ページ: 856-875

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Cloning of a gene for a novel epithelium-specific Cytosolic Phospholipase A2, cPLA2delta, induced in Psoriatic Skin.2004

    • 著者名/発表者名
      Chiba, H.
    • 雑誌名

      J Biol Chem. 279

      ページ: 12890-12897

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Zipf's law and human transcriptomes : an explanation with an evolutionary model.2003

    • 著者名/発表者名
      Ogasawara O.
    • 雑誌名

      C R Biol. 326

      ページ: 1097-1101

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] A novel diacylglycerol acyltransferase(DGAT2) is decreased in human psoriatic skin and increased in diabetic mice.2003

    • 著者名/発表者名
      Wakimoto K.
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communication. 310

      ページ: 296-302

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Up-regulated gene expression in the conjunctival epithelium of patients with Sjogren's syndorome.2003

    • 著者名/発表者名
      Kawasaki S.
    • 雑誌名

      Exp Eye Res. 77

      ページ: 17-26

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Induction of glia maturation factor-beta in proximal tubular cells leads to vulnerability to oxidative injury through the p38 pathway and changes in antioxidant enzyme activities.2003

    • 著者名/発表者名
      Kaimori JY.
    • 雑誌名

      J. biol. chem. 278

      ページ: 33519-33527

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Zipfs law and human transcriptomes : an explanation with an evolutionary model.2003

    • 著者名/発表者名
      Ogasawara, O., Kawamoto, S., Okubo, K.
    • 雑誌名

      C R Biol. 326

      ページ: 1097-1101

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] A novel diacylglycerol acyltransferase(DGAT2)is decreased in human psoriatic skin and increased in diabetic mice.2003

    • 著者名/発表者名
      Wakimoto K, Chiba H, Michibata H, Seishima M, Kawasaki S, Okubo K, Mitsui H, Torii H, Imai Y.
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun. 310

      ページ: 296-302

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Up-regulated gene expression in the conjunctival epithelium of patients with Sjogren's syndorome.2003

    • 著者名/発表者名
      Kawasaki S, Kawamoto S, Yokoi N, Connon C, Minesaki Y, Kinoshita S, Okubo K.
    • 雑誌名

      Exp Eye Res. 77

      ページ: 17-26

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Induction of glia maturation factor-beta in proximal tubular cells leads to vulnerability to oxidative injury through the p38 pathway and changes in antioxidant enzyme activities.2003

    • 著者名/発表者名
      Kaimori JY, Takenaka M, Nakajima H, Hamano T, Horio M, Sugaya T, Ito T, Hori M, Okubo K, Imai E.
    • 雑誌名

      J. Biol Chem. 278

      ページ: 33519-33527

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Knowledge Discovery from the Human Transcriptome. Introduction to Bioinformatics 「A Theoretical And Practical Approach2003

    • 著者名/発表者名
      Okubo K., Hishiki T.
    • 雑誌名

      Humana Press

      ページ: 693-717

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Expression map of human genes : between genome and proteome2002

    • 著者名/発表者名
      Tamura T
    • 雑誌名

      Tanpakushitsu Kakusan Koso. 47

      ページ: 906-913

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Construction of human corneal endothelial cDNA library and identification of novel active genes.2002

    • 著者名/発表者名
      Sakai R.
    • 雑誌名

      Invest Ophthalmol Vis Sci. 43

      ページ: 1749-1756

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Gene expression profile of renal proximal tubules regulated by proteinuria.2002

    • 著者名/発表者名
      Nakajima H
    • 雑誌名

      Kidney Int. 61

      ページ: 1577-1587

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Non-overlapping expression of Olig3 and Olig2 in the embryonic neural tube.2002

    • 著者名/発表者名
      Takebayashi H
    • 雑誌名

      Mech Dev. 113

      ページ: 169-174

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Expression profile of active genes in the human pituitary gland.2002

    • 著者名/発表者名
      Tanaka S
    • 雑誌名

      J Mol Endocrinol. 28

      ページ: 33-44

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Gene expression profiling of mucosal addressin cell adhesion molecule-1+ high endothelial venule cells(HEV) and identification of a leucine-rich HEV glycoprotein as a HEV marker.2002

    • 著者名/発表者名
      Saito K
    • 雑誌名

      J Immunol. 168

      ページ: 1050-1059

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Expression map of human genes : between genome and proteome2002

    • 著者名/発表者名
      Tamura T, Okubo K.
    • 雑誌名

      Tanpakushitsu Kakusan Koso. 47

      ページ: 906-13

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Construction of human corneal endothelial cDNA library and identification of novel active genes.2002

    • 著者名/発表者名
      Sakai R, Kinouchi T, Kawamoto S, Dana MR, Hamamoto T, Tsuru T, Okubo K, Yamagami S.
    • 雑誌名

      Invest Ophthalmol Vis Sci. 43

      ページ: 1749-56

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Gene expression profile of renal proximal tubules regulated by proteinuria.2002

    • 著者名/発表者名
      Nakajima H, Takenaka M, Kaimori JY, Nagasawa Y, Kosugi A, Kawamoto S, Imai E, Hori M, Okubo K.
    • 雑誌名

      Kidney Int. 61

      ページ: 1577-87

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Non-overlapping expression of Olig3 and Olig2 in the embryonic neural tube.2002

    • 著者名/発表者名
      Takebayashi H, Ohtsuki T, Uchida T, Kawamoto S, Okubo K, Ikenaka K, Takeichi M, Chisaka O, Nabeshima Y.
    • 雑誌名

      Mech Dev. 113

      ページ: 169-74

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Expression profile of active genes in the human pituitary gland.2002

    • 著者名/発表者名
      Tanaka S, Tatsumi K, Okubo K, Itoh K, Kawamoto S, Matsubara K, Amino N.
    • 雑誌名

      J Mol Endocrinol. 28

      ページ: 33-44

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Gene expression profiling of mucosal addressin cell adhesion molecule-1+ high endothelial venule cells(HEV) and identification of a leucine-rich HEV glycoprotein as a HEV marker.2002

    • 著者名/発表者名
      Saito K, Tanaka T, Kanda H, Ebisuno Y, Izawa D, Kawamoto S, Okubo K, Miyasaka M.
    • 雑誌名

      J Immunol. 168

      ページ: 1050-9

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] iAFLP-introduced amplified length polymorphism [Analysing Gene Expression」2002

    • 著者名/発表者名
      Okubo K.
    • 雑誌名

      Wiley (Lorkowski and Cullen ed.)

      ページ: 98-103

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Bodymap an anatomical gene expression database of human and mouse 「Analysing GeneExpression」2002

    • 著者名/発表者名
      Kawamoto S., Okubo K.
    • 雑誌名

      Wiley (Lorkowski and Cullen ed.)

      ページ: 57-58

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Knowledge Discovery from the Human Transcriptome 「Introduction to Bioinformatics A Theoretical And Practical Approach」2002

    • 著者名/発表者名
      Okubo K., Hishiki T.
    • 雑誌名

      (Krawetz, SA., Womble, DD. ed.) Human Press

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Gene expression analysis on several human tissues.2001

    • 著者名/発表者名
      Kawasaki S
    • 雑誌名

      Tanpakushitsu Kakusan Koso. 46

      ページ: 2351-2356

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Cloning and characterization of a novel subunit of protein serine/threonine phosphatase 4 from mesangial cells.2001

    • 著者名/発表者名
      Wada T
    • 雑誌名

      J Am Soc Nephrol. 12

      ページ: 2601-2608

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Characteristics of the human ocular surface epithelium.2001

    • 著者名/発表者名
      Kinoshita S
    • 雑誌名

      Prog Retin Eye Res. 20

      ページ: 639-673

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Isolation of novel heart-specific genes using the BodyMap database.2001

    • 著者名/発表者名
      Soejima H
    • 雑誌名

      Genomics. 74

      ページ: 115-120

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Identification and characterization of the potential promoter regions of 1031 kinds of human genes.2001

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Y
    • 雑誌名

      Genome Res. 11

      ページ: 677-684

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] An expression profile of active genes in human conjunctival epithelium.2001

    • 著者名/発表者名
      Dota A
    • 雑誌名

      Exp Eye Res. 72

      ページ: 235-241

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] BodyMap incorporated PCR-based expression profiling data and a gene ranking system.2001

    • 著者名/発表者名
      Sese J
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 29

      ページ: 156-158

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Gene expression analysis on several human tissues.2001

    • 著者名/発表者名
      Kawasaki S, Okubo K.
    • 雑誌名

      Tanpakushitsu Kakusan Koso. 46

      ページ: 2351-6

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Cloning and characterization of a novel subunit of protein serine/threonine phosphatase 4 from mesangial cells.2001

    • 著者名/発表者名
      Wada T, Miyata T, Inagi R, Nangaku M, Wagatsuma M, Suzuki D, Wadzinski BE, Okubo K, Kurokawa K.
    • 雑誌名

      J Am Soc Nephrol. 12

      ページ: 2601-8

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Characteristics of the human ocular surface epithelium.2001

    • 著者名/発表者名
      Kinoshita S, Adachi W, Sotozono C, Nishida K, Yokoi N, Quantock AJ, Okubo K.
    • 雑誌名

      Prog Retin Eye Res. 20

      ページ: 639-73

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Isolation of novel heart-specific genes using the BodyMap database.2001

    • 著者名/発表者名
      Soejima H, Kawamoto S, Akai J, Miyoshi O, Arai Y, Morohka T, Matsuo S, Niikawa N, Kimura A, Okubo K, Mukai T.
    • 雑誌名

      Genomics. 74

      ページ: 115-20

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Identification and characterization of the potential promoter regions of 1031 kinds of human genes.2001

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Y, Tsunoda T, Sese J, Taira H, Mizushima-Sugano J, Hata H, Ota T, Isogai T, Tanaka T, Nakamura Y, Suyama A, Sakaki Y, Morishita S, Okubo K, Sugano S.
    • 雑誌名

      Genome Res. 11

      ページ: 677-84

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] An expression profile of active genes in human conjunctival epithelium.2001

    • 著者名/発表者名
      Dota A, Nishida K, Adachi W, Nakamura T, Koizumi N, Kawamoto S, Okubo K, Kinoshita S.
    • 雑誌名

      Exp Eye Res. 72

      ページ: 235-41

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] BodyMap incorporated PCR-based expression profiling data and a gene ranking system.2001

    • 著者名/発表者名
      Sese J, Nikaidou H, Kawamoto S, Minesaki Y, Morishita S, Okubo K.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 29

      ページ: 156-8

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Knowledge Dicovery from transcriptome In Introduction to Bioinformatics.2001

    • 著者名/発表者名
      Okubo K.Hishiki T.
    • 雑誌名

      (S.A.Krawetzed.)Humana Press (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Characteristics of the human ocular surface epithelium.2001

    • 著者名/発表者名
      Kinoshita S, Adachi W, Sotozono C, Nishida K, Yokoi N, Quantock A, Okubo K.
    • 雑誌名

      Prog Retin Eye Res. 20

      ページ: 639-673

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Gene expression profiles of the collecting duct in the mouse renal inner medulla.2000

    • 著者名/発表者名
      Takenaka M
    • 雑誌名

      Kidney Int. 57

      ページ: 19-24

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Isolation and characterization of a Ca(2+)-activated chloride channel from human corneal epithelium.2000

    • 著者名/発表者名
      Itoh R
    • 雑誌名

      Curr Eye Res. 21

      ページ: 918-925

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Clinical significance of micrometastases in axillary lymph nodes assessed by reverse transcription-polymerase chain reaction in breast cancer patients.2000

    • 著者名/発表者名
      Masuda N
    • 雑誌名

      Clin Cancer Res. 6

      ページ: 4176-4185

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Human uroplakin Ib in ocular surface epithelium.2000

    • 著者名/発表者名
      Adachi W
    • 雑誌名

      Invest Ophthalmol Vis Sci. 41

      ページ: 2900-2905

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] BodyMap : a human and mouse gene expression database.2000

    • 著者名/発表者名
      Hishiki T
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 28

      ページ: 136-138

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Gene expression profiles of the collecting duct in the mouse renal inner medulla.2000

    • 著者名/発表者名
      Takenaka M, Imai E, Nagasawa Y, Matsuoka Y, Moriyama T, Kaneko T, Hori M, Kawamoto S, Okubo K.
    • 雑誌名

      Kidney Int. 57

      ページ: 19-24

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Isolation and characterization of a Ca(2+)-activated chloride channel from human corneal epithelium.2000

    • 著者名/発表者名
      Itoh R, Kawamoto S, Miyamoto Y, Kinoshita S, Okubo K.
    • 雑誌名

      Curr Eye Res. 21

      ページ: 918-25

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Clinical significance of micrometastases in axillary lymph nodes assessed by reverse transcription-polymerase chain reaction in breast cancer patients.2000

    • 著者名/発表者名
      Masuda N, Tamaki Y, Sakita I, Ooka M, Ohnishi T, Kadota M, Aritake N, Okubo K, Monden M.
    • 雑誌名

      Clin Cancer Res. 6

      ページ: 4176-85

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Human uroplakin Ib in ocular surface epithelium.2000

    • 著者名/発表者名
      Adachi W, Okubo K, Kinoshita S.
    • 雑誌名

      Invest Ophthalmol Vis Sci. 41

      ページ: 2900-5

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] BodyMap a human and mouse gene expression database.2000

    • 著者名/発表者名
      Hishiki T, Kawamoto S, Morishita S, Okubo K.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 28

      ページ: 136-8

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [図書] Analysing Gene Expression2004

    • 著者名/発表者名
      Kaimori, J.
    • 総ページ数
      11
    • 出版者
      John Wiley&Sons, Inc.
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [図書] ゲノム語とオントロジーという名の形而上学-進化と医学(科学)2004

    • 著者名/発表者名
      大久保公策
    • 総ページ数
      3
    • 出版者
      岩波書店
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [図書] Quantification of Gene Expression in Mouse and Human Renal Proximal Tubules., 「Laser Capture Microdissection Methods and Protocols」2004

    • 著者名/発表者名
      Kaimori, J.
    • 出版者
      Humana Press
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [図書] Introduction to Bioinformatics A Theoretical And Practical Approach2003

    • 著者名/発表者名
      Okubo K.
    • 総ページ数
      24
    • 出版者
      Humana Press
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [図書] Analysing Gene Expression2002

    • 著者名/発表者名
      Okubo K.
    • 総ページ数
      5
    • 出版者
      John Wiley&Sons,Inc.
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [図書] Analysing Gene Expression2002

    • 著者名/発表者名
      Kawamoto S.
    • 総ページ数
      1
    • 出版者
      John Wiley&Sons, Inc.
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [図書] 遺伝子の発現地図-ゲノムとプロテオームの間(蛋白質核酸酵素)2002

    • 著者名/発表者名
      田村卓郎
    • 総ページ数
      7
    • 出版者
      共立出版株式会社
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [図書] Characteristics of the human ocular surface epithelium.2001

    • 著者名/発表者名
      Kinoshita S
    • 総ページ数
      34
    • 出版者
      Prog Retin Eye Res.
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [図書] リアルタイム絶対および相対定量PCR,ゲノム機能研究プロトコール(実験医学別冊)2000

    • 著者名/発表者名
      伊藤玲子
    • 総ページ数
      4
    • 出版者
      羊土社
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [図書] CRに基づくゲノムワイドな遺伝子発現解析(実験医学別冊)2000

    • 著者名/発表者名
      川崎 諭
    • 総ページ数
      16
    • 出版者
      羊土社
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [産業財産権] 注目する情報を知識集積物との関係で可視的に処理するた2002

    • 発明者名
      大久保公策
    • 権利者名
      大久保公策
    • 産業財産権番号
      2004-073614
    • 出願年月日
      2002
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Chiba H.: "Cloning of a Gene for a Novel Epithelium-specific Cytosolic Phospholipase A2, cPLA2{delta}, Induced in Psoriatic Skin."J Biol Chem.. 279. 12890-12897 (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Ogasawara O.: "Zipf's law and human transcriptomes : an explanation with an evolutionary model."C R Biol.. 326. 1097-1101 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Wakimoto K.: "A novel diacylglycerol acyltransferase(DGAT2) is decreased in human psoriatic skin and increased in diabetic mice."Biochemical and Biophysical Research Communication.. 310. 296-302 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Kawasaki S.: "Up-regulated gene expression in the conjunctival epithelium of patients with Sjogren's syndorome."Exp Eye Res.. 77. 17-26 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Kaimori J.: "Induction of glia maturation factor-beta in proximal tubular cells leads to vulnerability to oxidative injury through the p38 pathway and changes in antioxidant enzyme activities."J.biol.chem.. 278. 33519-33527 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Sakai R.: "Construction of human corneal endothelial cDNA library and identification of novel active genes."Invest Ophthalmol Vis Sci.. 43. 1749-1756 (2002)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Okubo K.: "iAFLP-introduced amplified length polymorphism, 「Analysing Gene Expression」(Lorkowski and Cullen ed.)"Wiley. 5 (2002)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Sakai R et al.: "Construction of human corneal endothelial cDNA library and identification of novel active genes"Invest Ophthalmol Vis Sci. 43(6). 1749-1756 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Nakajima H et al.: "Gene expression profile of renal proximal tubules regulated by proteinuria"Kidney Int. 61(5). 1577-1587 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Tanaka S et al.: "Expression profile of active genes in the human pituitary gland"J Mol Endocrinol. 28(1). 33-34 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Saito K et al.: "Gene expression profiling of mucosal addressin cell adhesion molecule-1+ high endothelial venule cells (HEV) and identification of a leucine-rich HEV glycoprotein as a HEV marker"J Immunol. 168(3). 1050-1059 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Doa A.: "An expression profile of active genes in human conjunctival epithelium"Exp.Eye Res.. 72. 235-241 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Sese J.: "BodyMap Incorporated PCR-based expression profiling data and a gene ranking system"Nucleic Acids Research. 29(1). 156-158 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Suzuki Y.: "Identification and characterization of the potential promoter regions of 1031 kinds of human genes"Genome Res.. 11. 677-684 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Okubo K.: "Knowledge discovery from transcriptome. In introduction to Bioinformatics"Humana Press. (in press).

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Okubo K.: "Gene expression analysis by iAFLP. In Analysis of Gene Expression"Wiley-VCH. (in press).

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Okubo K.: "Gene Expression Database ; BodyMap. In Analysis of Gene Expression"Wiley-VCH. (in press).

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Kawamoto S.: "Body Map : a collection of 3'ESTs for analysis of human gene expression information."Genome Research. 10(11). 1817-1827 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Hishiki M.: "Body Map : a human and mouse gene expression database."Nucleic Acids Research. 28(1). 136-138 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Masuda S.: "Clinical significance of micrometastases in axillary lymph nodes assessed by reverse transcription-polymerase chain reaction in breast cancer patients."Clin Cancer Research. 6(11). 4176-4185 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Takenaka M.: "Gene expression profiles of the collecting duct in the mouse renal inner medulla."Kidney Int.. 57(1). 19-24 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Sese J.: "Body Map incorporated PCR-based expression profiling data and a gene ranking system."Nucleic Acids Research. 29(1). 156-158 (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Dota A.: "An Expression Profile of Active Genes in Human Conjunctival Epithelium."Exp.Eye Research. 72(3). 235-241 (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書

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公開日: 2001-04-01   更新日: 2018-03-28  

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