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DNAチップを用いた病態解析法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 12204012
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関国立がんセンター(研究所及び東病院臨床開発センター)

研究代表者

市川 仁  国立がんセンター(研究所), 腫瘍発現解析プロジェクト, プロジェクトリーダー (30201924)

研究分担者 水島 洋  国立がんセンター, 研究所・がん情報研究部, 室長 (50219630)
研究期間 (年度) 2000 – 2004
研究課題ステータス 完了 (2004年度)
配分額 *注記
35,100千円 (直接経費: 35,100千円)
2004年度: 7,500千円 (直接経費: 7,500千円)
2003年度: 8,800千円 (直接経費: 8,800千円)
2002年度: 8,800千円 (直接経費: 8,800千円)
2001年度: 10,000千円 (直接経費: 10,000千円)
キーワードマイクロアレイ / 遺伝子発現解析 / 転写制御ネットワーク / 好中球分化 / パスウェイ / 急性骨髄性白血病 / 遺伝子 / ゲノム / 発現制御 / 発生・分化 / 遺伝子発現制御 / DNAチップ / 白血病 / G-CSFシグナル伝達 / 遺伝子発現プロファイリング / t(8;21)転座 / AML1-MTG8
研究概要

本研究は、外来性に特定の遺伝子を発現させる等の操作を行った培養細胞の遺伝子発現データを用いて、疾患の遺伝子発現を理解する基盤を構築し、病態の把握や病因の解明に役立てる手法を開発することを目的としている。この目的のため、主に急性骨髄性白血病(AML)を対象とし、DNAチップ(マイクロアレイ)を用いて以下の解析を行った。
1.白血病キメラ転写因子が引き起こす遺伝子発現異常の解析:白血病キメラ転写因子AML1-MTG8がマウス骨髄系細胞株L-Gに引き起こす遺伝子発現変化を解析し、前骨髄球以降の分化を阻害することを示した。
2.好中球分化に伴う遺伝子発現変化の解析:マウス骨髄系細胞株L-GMを用いて、G-CSFにより分化を誘導する系と、転写因子C/EBPα、C/EBPε、PU.1の発現により分化を誘導する系を構築し、分化に伴う遺伝子発現変化を解析することで、分化制御パスウェイの一端を明らかにした。
3.小児AMLの遺伝子発現解析:61症例の小児AML臨床検体の遺伝子発現を解析し、AMLの遺伝子発現パターンがt(8;21)、inv(16)、11q23再構成、+21等の染色体異常により強く規定されていること、少ないながら予後と相関する遺伝子発現シグナチャが存在することを明らかにした。
4.白血病の病態解析法の開発:3.において明らかになった分化パスウェイ特異的遺伝子の発現を比較することで、各分化パスウェイの活性化状態を把握するシステムを開発し、白血病発症に働いている分化阻害機構を予測できる可能性を示した。
5.細胞の形質転換に関わる遺伝子の解析:白血病以外の悪性腫瘍の解析を行う基盤として、Srcプロテインキナーゼが正常細胞を形質転換する時に発現変動する遺伝子の解析を行い、基質非依存性増殖に関わる遺伝子と、運動能に関わる遺伝子を同定した。

報告書

(6件)
  • 2004 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2003 実績報告書
  • 2002 実績報告書
  • 2001 実績報告書
  • 2000 実績報告書
  • 研究成果

    (20件)

すべて 2006 2005 2004 2003 2002 2001 その他

すべて 雑誌論文 (14件) 文献書誌 (6件)

  • [雑誌論文] Src utilizes Cas to suppress Fhl1 in order to promote nonanchoredgrowth and migration of tumor cells.2006

    • 著者名/発表者名
      Y.Shen et al.
    • 雑誌名

      Cancer Res. 66

      ページ: 1543-1552

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Cas to suppress Fh11 in order to promote nonanchoredgrowth and migration of tumor cells.2006

    • 著者名/発表者名
      Y.Shen et al.
    • 雑誌名

      Cancer Res. 66

      ページ: 1543-11552

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] The oncogenic TLS-ERG fusion protein exerts different effects in hematopoietic cells and fibroblasts.2005

    • 著者名/発表者名
      J.Zou et al.
    • 雑誌名

      Mol. Cell. Biol. 25

      ページ: 6235-6246

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] The oncogenic TLS-ERG fusion protein exerts different effects in hematopoietic cells and fibroblasts.2005

    • 著者名/発表者名
      J.Zou et al.
    • 雑誌名

      Mol Cell. Biol 25

      ページ: 6235-6246

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Normal cells control the growth of neighboring transformed cells independent of gap junctional communication and Src activity2004

    • 著者名/発表者名
      D.B.Alexander et al.
    • 雑誌名

      Cancer Res. 64

      ページ: 1347-1358

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Normal cells control the growth of neighboring transformed cells independent of gap junctional communication and Src activity.2004

    • 著者名/発表者名
      D.B.Alexander et al.
    • 雑誌名

      Cancer Res. 64

      ページ: 1347-1358

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Impaired IgG production in mice deficient for heat shock transcription factor 1.2004

    • 著者名/発表者名
      S.Inoue, et al.
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 279

      ページ: 38701-38709

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Normal cells control the growth of neighboring transformed cells independent of gap junctional communication and Src activity.2004

    • 著者名/発表者名
      D.B.Alexander, et al.
    • 雑誌名

      Cancer Res. 64

      ページ: 1347-1358

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Nemo-like kinase suppresses a wide range of transcription factors, including nuclear factor-κB.2004

    • 著者名/発表者名
      J.Yasuda, et al.
    • 雑誌名

      Cancer Sci. 95

      ページ: 52-57

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Identification of a gene expression signature associated with pediatric AML prognosis2003

    • 著者名/発表者名
      T.Yagi et al.
    • 雑誌名

      Blood 102

      ページ: 1849-1856

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Identification of a gene expression signature associated with pediatric AML prognosis.2003

    • 著者名/発表者名
      T.Yagi et al.
    • 雑誌名

      Blood 102

      ページ: 1849-1856

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Potential involvement of the AML1-MTG8 fusion protein in the granulocytic maturation characteristic of the t(8;21) acute myelogenous leukemia revealed by microarray analysis2002

    • 著者名/発表者名
      H.Shimada et al.
    • 雑誌名

      Leukemia 16

      ページ: 874-885

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Potential involvement of the AML1-MTG8 fusion protein in the granulocytic maturation characteristic of the t(8;21) acute myelogenous leukemia revealed by microarray analysis.2002

    • 著者名/発表者名
      H.Shimada et al.
    • 雑誌名

      Leukemia 16

      ページ: 874-885

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Global effects of anchorage on gene expression during mammary carcinoma cell growth reveal role of tumor necrosis factor-related apoptosis-inducing ligand in anoikis.2001

    • 著者名/発表者名
      G.S.Goldberg et al.
    • 雑誌名

      Cancer Res. 61

      ページ: 1334-1337

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Yagi, et al.: "Identification of a gene expression signature associated with pediatric AML prognosis."Blood. 102. 1849-1856 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] H.Shimada, et al.: "Potential involvement of the AML1-MTG8 fusion protein in the granulocytic maturation characteristic of the t(8;21) acute myelogenous leukemia revealed by microarray analysis"Leukemia. 16. 874-885 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] H.Shimada: "Potential involvement of the AML1-MTG8 fusion protein in the granulocytic maturation characteristic of the t(8 ; 21) acute myelogenous leukemia revealed by microarray analysis"Leukemia. (in press).

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] G.S.Goldberg: "Global effects of anchorage on gene expression during mamnary carcinoma cell growth reveal role of tumor necrosis factor-related apoptosis-inducing ligand in anoikis"Cancer Research. 61. 1334-1337 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] H.Shimada: "Analysis of genes under the downstream regulation of the t(8;21) fusion protein AML1-MTG8 : overexpression of the TIS11b (ERF-1, cMG1) gene induces myeloid cell proliferation in response to G-CSF."Blood. 96. 655-663 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] S.Kobayashi: "Mouse Peg9/Dlk1 and human PEG9/DLK1 are paterrally expressed imprinted genes closely located to the maternally expressed imprinted genes : mouse Meg3/Gt12 and human MEG3."Genes Cells. 5. 1029-1037 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書

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公開日: 2001-04-01   更新日: 2018-03-28  

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