細胞性粘菌のゲノム解析による細胞分化を制御する遺伝子システムの解明

• 研究課題/領域番号: 12206001
• 研究種目: 特定領域研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 筑波大学
• 研究代表者: 漆原 秀子 (2003-2004) 筑波大学, 大学院生命環境科学研究科, 教授 (00150087); 田仲 可昌 (2000-2002) 筑波大学, 生物科学系, 教授 (80091908)
• 研究分担者: 田仲 可昌 筑波大学, 大学院生命環境科学研究科, 教授 (80091908) ; 森尾 貴広 筑波大学, 大学院生命環境科学研究科, 助手 (10292509) ; 前田 ミネ子 大阪大学, 大学院理学研究科, 助教授 (70029700) ; 落合 廣 北海道大学, 大学院理学研究科, 教授 (10002122) ; 漆原 秀子 筑波大学, 生物科学系, 助教授 (00150087)
• 研究期間 (年度): 2000 – 2004
• 研究課題ステータス: 完了 (2004年度)
• 配分額: 136,800千円 (直接経費: 136,800千円); 2004年度: 30,000千円 (直接経費: 30,000千円); 2003年度: 30,000千円 (直接経費: 30,000千円); 2002年度: 33,800千円 (直接経費: 33,800千円); 2001年度: 43,000千円 (直接経費: 43,000千円)
• キーワード: 細胞性粘菌 / EST解析 / 発生分化 / 遺伝子発現制御 / マイクロアレイ解析 / 転写因子 / 上流配列 / シス因子 / 遺伝子発現 / 遺伝子ネットワーク / 脱分化 / 転写制御 / 配列アセンブル / DNAマイクロアレイ / cDNA解析 / ゲノム / 細胞分化 / マイクロアレイ / in situハイブリダイゼーション / 転写制御因子 / 完全長cDNA / ポリAトラップ法

研究概要

栄養条件下では単細胞アメーバとして分裂増殖するが、飢餓状態では集合して細胞分化を伴う多細胞体を形成するという独特な生活環をもつ細胞性粘菌を材料として、発生分化を制御する遺伝情報を理解するための研究を行った。まず、大規模cDNA解析により、遺伝子リソースを整備した。5種類の発生段階から14種類のcDNAライブラリーを構築し、完全長72,703クローンを含む95,884のcDNAクローンに由来する157,284配列のアセンブルによって、6,790の独立遺伝子を得ることができた。これはゲノム解読結果から予想される12,500遺伝子の約54%である。次に、このリソースを利用して逆遺伝学的・生物情報学的解析を行い、以下のような結果を得た。
1.DNAマイクロアレイ解析によって正常発生における遺伝子発現の基本パターンを取得し、細胞の集合が遺伝子発現プロフィールの大規模な変化を誘導すること、脱分化過程を制御する遺伝子群のあることなどを明らかにすることができた。また、イン・シチュハイブリダイゼーションによって予定柄細胞領域内に精巧なパターン形成が行われていることを示した。
2.予想転写因子遺伝子約260種を抽出し、そのうちの40種についてリアルタイムPCRによる精密な発現パターンを得るとともに、13種類の遺伝子破壊株を作製・解析した。
3.転写因子遺伝子破壊株での遺伝子発現パターンの実データを元にして、S-システムによる計算で遺伝子ネットワークの予測を行った。
4.完全長cDNA配列をゲノムにマッピングすることによって転写調節に関わるプロモーター配列を取得し、データベース化するとともに、発生過程における時期特異的遺伝子発現に関わると予想される配列を取得した。

研究成果

• [雑誌論文] Dictyostelium transcriptional host cell response upon infection with Legionella. (2006)
  • 著者名/発表者名: Farbrother, P.
  • 雑誌名: Cell. Microbiol. (印刷中)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A small GTPase RacF2 affects sexual cell fusion and asexual development in Dictyostelium discoideum through the regulation of cell adhesion (2006)
  • 著者名/発表者名: Muramoto, T.
  • 雑誌名: Dev. Growth Differ. (印刷中)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Evidence that the Dictyostelium STAT protein Dd-STATa plays a role in the differentiation of inner basal disc cells and identification of a promoter element essential for expression in these cells. (2005)
  • 著者名/発表者名: Shimada, N.
  • 雑誌名: Differentiation 73 ページ: 50-60
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] On the development of an analysis system for upstream sequences in Dictyostelium discoideum genome. (2005)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, N.
  • 雑誌名: コンピュータソフトウェア 22 ページ: 167-172
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Reverse genetic analyses of gamete-enriched genes revealed a novel regulator of the cAMP signaling pathway in Dictyostelium discoideum. (2005)
  • 著者名/発表者名: Muramoto, T.
  • 雑誌名: Mech. Dev. 122 ページ: 733-743
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] The genome of the social amoeba Dictyostelium discoideum. (2005)
  • 著者名/発表者名: Eichinger, L.
  • 雑誌名: Nature 435 ページ: 43-57
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A comparative sequence analysis reveals a common GBD/FH3-FH1-FH2-DAD architecture in formins from Dictyostelium, fungi and metazoa. (2005)
  • 著者名/発表者名: Rivero, F.M.T.
  • 雑誌名: BMC Genom. 6 ページ: 28-28
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Evidence that the Dictyostelium STAT protein Dd-STATa plays a role in the differentiation of inner basal disc cells and identification of a promoter element essential for expression in these cells. (2005)
  • 著者名/発表者名: Shimada, N., Kawata, T., Maruo, T., Maeda, M., Urushihara, H.
  • 雑誌名: Differentiation 73 ページ: 50-60
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] On the development of an analysis system for upstream sequences in Dictyostelium discoideum genome. (2005)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, N., Marin, M., Tanaka, Y., Urushihara, H.
  • 雑誌名: Computor Softwear 22(3) ページ: 167-172
  • NAID: 130005006570
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Reverse genetic analyses of gamete-enriched genes revealed a novel regulator of the cAMP signalling pathway in Dictyostelium discoideum. (2005)
  • 著者名/発表者名: Muramoto, T., Takeda, S., Furuya, Y., Urushihara, H.
  • 雑誌名: Mech.Dev. 122 ページ: 733-743
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The genome of the social amoeba Dictyostelium discoideum. (2005)
  • 著者名/発表者名: Eichinger, L., Pachebat, J.A., Glockner, G, Rajandream, M.-A., Sucgang, R., Berriman, M., Song, J., Olsen, R., Szafranski, K., Xu, Q.et al.
  • 雑誌名: Nature 435 ページ: 43-57
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A comparative sequence analysis reveals a common GBD/FH3-FH1-FH2-DAD architecture in formins from Dictyostelium, fungi and metazoa. (2005)
  • 著者名/発表者名: Rivero, F.M.T., Meyer, A.K., Urushihara, H., Uyeda, T.Q., Kitayama, C
  • 雑誌名: BMC Genom. 6(1) ページ: 28-28
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Evidence that the Dictyostelium STAT protein Dd-STATa plays a role in the differentiation of inner basal disc cells and identification of a promoter element essential for expression in these cells (2005)
  • 著者名/発表者名: Shimada, N. et al.
  • 雑誌名: Differentiation (In press)
• [雑誌論文] An orderly retreat : dedifferentiation is a regulated process. (2004)
  • 著者名/発表者名: Katoh, M.
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101 ページ: 7005-7010
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Analyses of cDNAs from growth and slug stages of Dictyostelium discoideum. (2004)
  • 著者名/発表者名: Urushihara, H.
  • 雑誌名: Nuc. Acids Res. 32 ページ: 1647-1653
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Extracellular matrix family proteins that are potential targets of Dd-STATa in Dictyostelium discoideum. (2004)
  • 著者名/発表者名: Shimada, N.
  • 雑誌名: J. Plant Res. 117 ページ: 345-353
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Identification of new modes of Dd-STATa regulation of gene expression in Dictyostelium by in situ hybridization. (2004)
  • 著者名/発表者名: Shimada, N.
  • 雑誌名: Int. J. Dev. Biol. 48 ページ: 679-682
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Defect in peroxisomal multifunctional enzyme MFE1 affects cAMP relay in Dictyostelium. (2004)
  • 著者名/発表者名: Matsuoka, S.
  • 雑誌名: Dev. Growth Differ. 45 ページ: 195-199
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Control of cell-type proportioning in Dictyostelium discoideum by differentiation-inducing factor as determined by in situ hybridization. (2004)
  • 著者名/発表者名: Maruo, T.
  • 雑誌名: Eukaryot. Cell 3 ページ: 1241-1248
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] An orderly retreat : dedifferentiation is a regulated process. (2004)
  • 著者名/発表者名: Katoh, M., Shaw, C., Van Driessche, N., Xu, Q., Morio, T., Kuwayama, H., Obara, S., Urushihara, H., Tanaka, Y., Shaulsky, G.
  • 雑誌名: Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101 ページ: 7005-7010
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Analyses of cDNAs from growth and slug stages of Dictyostelium discoideum. (2004)
  • 著者名/発表者名: Urushihara, H., Morio, T., Saito, T., Kohara, Y., Kouriki, E., Ochiai, H., Maeda, M., Williams, J.G, Takeuchi, I., Tanaka, Y.
  • 雑誌名: Nuc.Acids Res. 32 ページ: 1647-1653
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Extracellular matrix family proteins that are potential targets of Dd-STATa in Dictyostelium discoideum. (2004)
  • 著者名/発表者名: Shimada, N., Nishino, K., Maeda, M., Urushihara, H., Kawata, T.
  • 雑誌名: J.Plant Res. 117 ページ: 345-353
  • NAID: 10013737062
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Identification of new modes of Dd-STATa regulation of gene expression in Dictyostelium by in situ hybridization. (2004)
  • 著者名/発表者名: Shimada, N., Maeda, M., Urushihara, H., Kawata, T.
  • 雑誌名: Int.J.Dev.Biol. 48 ページ: 679-682
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Defect in peroxisomal multifunctional enzyme MFE1 affects cAMP relay in Dictyostelium (2004)
  • 著者名/発表者名: Matsuoka, S., Kuwayama, H., Ikeno, D., Oyama, M., Maeda, M.
  • 雑誌名: Dev.Growth Differ. 45 ページ: 195-199
  • NAID: 10012907986
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Control of cell-type proportioning in Dictyostelium discoideum by differentiation-inducing factor as determined by in situ hybridization. (2004)
  • 著者名/発表者名: Maruo, T., Sakamoto, S., Iranfar, N., Fuller, D., Morio, T., Urushihara, H., Tanaka, Y., Maeda, M., F.Loomis, W.F.
  • 雑誌名: Eukaryot.Cell 3 ページ: 1241-1248
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] An orderly retreat : Dedifferentiation is a regulated process. (2004)
  • 著者名/発表者名: Katoh, M. et al.
  • 雑誌名: Proc.Nat.Acad.Sci.USA 101(18) ページ: 7005-7010
• [雑誌論文] Identification of new modes of Dd-STATa regulation of gene expression in Dictyostelium by in situ hybridisation. (2004)
  • 著者名/発表者名: Shimada, N. et al.
  • 雑誌名: Int.J.Dev.Biol. 48 ページ: 679-682
• [雑誌論文] Extracellular matrix family proteins that are poteintial targets of Dd-STATa in Dictyostelium discoideum. (2004)
  • 著者名/発表者名: Shimada, N. et al.
  • 雑誌名: J. Plant Res. 117 ページ: 345-353
• [雑誌論文] Analyses of cDNAs from growth and slug stages of Dictyostelium discoideum (2004)
  • 著者名/発表者名: Urushihara, H. et al.
  • 雑誌名: Nuc. Acids Res. 32(5) ページ: 1647-1655
• [雑誌論文] Reverse genetic analyses of gamete-enriched genes revealed a novel regulator of the cAMP signaling pathway in Dictyostelium discoideum (2004)
  • 著者名/発表者名: Muramoto, T. et al.
  • 雑誌名: Mech.Dev. (In press)
• [雑誌論文] Changing patterns of gene expression in prestalk cell subtypes of Dictyostelium recognized by in situ hybridization with genes from microarray analyses. (2003)
  • 著者名/発表者名: Maeda, M.
  • 雑誌名: Eukaryot. Cell 2 ページ: 627-637
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] MFE1, a member of the peroxisomal hydroxyacyl coenzyme A dehydrogenase family, affects fatty acid metabolism necessary for morphogenesis in Dictyostelium spp. (2003)
  • 著者名/発表者名: Matsuoka, S.
  • 雑誌名: Eukaryot. Cell 2 ページ: 638-645
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Construction of a gamete-enriched gene pool and RNAi- mediated functional analysis in Dictyostelium discoideum. (2003)
  • 著者名/発表者名: Muramoto, T.
  • 雑誌名: Mech. Dev. 120 ページ: 965-975
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Identification and characterization of novel calcium-binding proteins of Dictyostelium and their spatial expression patterns during development. (2003)
  • 著者名/発表者名: Sakamoto, S.
  • 雑誌名: Dev. Growth Differ. 45 ページ: 507-514
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A novel gene trap method using terminator-REMI and 3'rapid amplification of cDNA ends (RACE) in Dictyostelium. (2003)
  • 著者名/発表者名: Takeda, K.
  • 雑誌名: Gene 312 ページ: 321-333
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A STAT regulated, stress-induced signalling pathway in Dictyostelium. (2003)
  • 著者名/発表者名: Araki, T.
  • 雑誌名: J. Cell Sci. 116 ページ: 2907-2915
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Changing patterns of gene expression in prestalk cell subtypes of Dictyostelium recognized by in situ hybridization with genes from microarray analyses. (2003)
  • 著者名/発表者名: Maeda, M., Sakamoto, S., Iranfar, N., Fuller, D., Maruo, T., Ogihara, S., Morio, T., Urushihara, H., Tanaka, Y., Loomis, W.L.
  • 雑誌名: Eukaryot.Cell 2 ページ: 627-637
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] MFE1, a member of the peroxisomal hydroxyacyl coenzyme A dehydrogenase family, affects fatty acid metabolism necessary for morphogenesis in Dictyostelium spp. (2003)
  • 著者名/発表者名: Matsuoka, S., Saito, T., Kuwayama, H., Morita, N., Ochiai, H., Maeda, M.
  • 雑誌名: Eukaryot.Cell 2 ページ: 638-645
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Construction of a gamete-enriched gene pool and RNAi-mediated functional analysis in Dictyostelium discoideum. (2003)
  • 著者名/発表者名: Muramoto, T., Suzuki, K., Shimizu, H., Kohara, Y., Kohriki, E., Obara, S., Tanaka, Y., Urushihara, H.
  • 雑誌名: Mech.Dev. 120 ページ: 965-975
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Identification and characterization of novel calcium-binding proteins of Dictyostelium and their spatial expression patterns during development. (2003)
  • 著者名/発表者名: Sakamoto, S., Nishino, K., Tomisako, M., Kuwayama, H., Tanaka, Y., Suetake, I., Tajima, S., Ogihara, S., Coukell, B., Maeda, M.
  • 雑誌名: Dev.Growth Differ. 45 ページ: 507-514
  • NAID: 10012005774
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A novel gene trap method using terminator-REMI and 3' rapid amplification of cDNA ends (RACE) in Dictyostelium. (2003)
  • 著者名/発表者名: Takeda, K., Saito, T., Tanaka, T., Morio, T., Maeda, M., Tanaka, Y., Ochiai, H.
  • 雑誌名: Gene 312 ページ: 321-333
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A STAT regulated, stress-induced signalling pathway in Dictyostelium. (2003)
  • 著者名/発表者名: Araki, T., Tsujioka, M., Abe, A., Fukuzawa, M., Meima, M., Schaap, P., Morio, T., Urushihara, H., Katoh, M., Maeda, M., Tanaka, Y., Takeuchi, I., Williams, J.G
  • 雑誌名: J.Cell Sci. 116 ページ: 2907-2915
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] PCR-mediated generation of a gene disruption construct without the use of DNA ligase and plasmid vectors. (2002)
  • 著者名/発表者名: Kuwayama, H.
  • 雑誌名: Nuc. Acids Res. 30
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A transcriptional profile of multicellular development in Dictyostelium discoideum. (2002)
  • 著者名/発表者名: Van Driessche, N.
  • 雑誌名: Development 129 ページ: 1543-1552
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A novel PCR-mediated method for one tube generation of a gene disruption construct. (2002)
  • 著者名/発表者名: Kuwayama, H.
  • 雑誌名: Biotech. Lett. 24 ページ: 1307-1312
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Syntaxin 7, syntaxin 8, Vtil and VAMP7 (vesicle-associated membrane protein 7) form an active SNARE complex for early macropinocytic compartment fusion in Dictyostelium discoideum. (2002)
  • 著者名/発表者名: Bogdanovic, A.
  • 雑誌名: Biochem. J. 368 ページ: 29-39
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Functional Genomics of the social amoebae, Dictyostelium discoideum. (2002)
  • 著者名/発表者名: Urushihara, H.
  • 雑誌名: Mol. Cells 13 ページ: 1-4
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] PCR-mediated generation of a gene disruption construct without the use of DNA ligase and plasmid vectors. (2002)
  • 著者名/発表者名: Kuwayama, H., Obara, O., Morio, T., Katoh, M., Urushihara, H., Tanaka, Y.
  • 雑誌名: Nuc.Acids Res. 30
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A transcriptional profile of multicellular development in Dictyostelium discoideum. (2002)
  • 著者名/発表者名: Van Driessche, N., Shaw, C., Katoh, M., Morio, T., Sucgang, R., Ibarra, M., Kuwayama, H., Saito, T., Urushihara, H., Maeda, M., Takeuchi, I., Ochiai, H., Eaton, W., Tollett, J., Halter, J., Kuspa, K., Tanaka, Y., Shaulsky, G.
  • 雑誌名: Development 129 ページ: 1543-1552
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A novel PCR-mediated method for one tube generation of a gene disruption construct. (2002)
  • 著者名/発表者名: Kuwayama, H., Obara, S., Morio, T., Katoh, M., Kuhara, K., Tanaka, Y.
  • 雑誌名: Biotech.Lett. 24 ページ: 1307-1312
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Syntaxin 7, syntaxin 8, Vti1 and VAMP7 (vesicle-associated membrane protein 7) form an active SNARE complex for early macropinocytic compartment fusion in Dictyostelium discoideum. (2002)
  • 著者名/発表者名: Bogdanovic, A., Bennett, N., Kieffer, S., Louwagie, M., Morio, T., Garin, J., Satre, M., Bruckert, F.
  • 雑誌名: Biochem.J. 368 ページ: 29-39
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Functional Genomics of the social amoebae, Dictyostelium discoideum. (2002)
  • 著者名/発表者名: Urushihara, H.
  • 雑誌名: Mol.Cells 13 ページ: 1-4
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Identification and characterization of two penta-EF-hand Ca2+-binding proteins in Dictyostelium discoideum. (2001)
  • 著者名/発表者名: Ohkouchi, S.
  • 雑誌名: J. Biochem. 130 ページ: 207-215
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] ORI-GENE : gene classification based on the evolutionary tree. (2001)
  • 著者名/発表者名: Mizuno, H.
  • 雑誌名: Bioinformatics 17 ページ: 167-173
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Spatial expression patterns of genes involved in cyclic AMP responses in Dictyostelium development. (2001)
  • 著者名/発表者名: Tsujioka, M.
  • 雑誌名: Dev. Growth ＆ Differ. 43 ページ: 275-283
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] FebA : a gene for eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein (4E-BP) in Dictyostelium discoideum. (2001)
  • 著者名/発表者名: Morio, T.
  • 雑誌名: Biochim. Biophys. Acta 1519 ページ: 65-69
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Identification and characterization of two penta-EF-hand Ca2+-binding proteins in Dictyostelium discoideum. (2001)
  • 著者名/発表者名: Ohkouchi, S., Nishio, K., Maeda, M., Hitomi, K., Adachi, H., Maki, M.
  • 雑誌名: J.Biochem. 130 ページ: 207-215
  • NAID: 130003534226
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] ORI-GENE : gene classification based on the evolutionary tree. (2001)
  • 著者名/発表者名: Mizuno, H., Tanaka, Y., Nakai, K., Sarai, A.
  • 雑誌名: Bioinformatics 17(2) ページ: 167-73
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Spatial expression patterns of genes involved in cyclic AMP responses in Dictyostelium development. (2001)
  • 著者名/発表者名: Tsujioka, M., Yokoyama, M., Nishino, K., Kuwayama, H., Morio, T., Katoh, M., Urushihara, H., Saito, T., Ochiai, H., Tanaka, Y., Takeuchi, I., Maeda, M.
  • 雑誌名: Dev.Growth ＆ Differ. 43 ページ: 275-283
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] FebA : a gene for eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein (4E-BP) in Dictyostelium discoideum. (2001)
  • 著者名/発表者名: Morio, T., Yasukawa, H., Urushihara, H., Saito, T., Ochiai, H., Takeuchi, I., Maeda, M., Tanaka, Y.
  • 雑誌名: Biochim.Biophys.Acta 1519 ページ: 65-69
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A second functional delta-5 fatty acid desaturase in the cellular slime mold Dictyostelium discoideum. (2000)
  • 著者名/発表者名: Saito, T.
  • 雑誌名: Eur. J. Biochem. 267 ページ: 1813-1818
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Loss of a member of the aquaporin gene family, aqpA affects spore dormancy in Dictyostelium. (2000)
  • 著者名/発表者名: Mitra, B.N.
  • 雑誌名: Gene 251 ページ: 131-139
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Developmental changes in the spatial expression of genes involved in myosin function in Dictyostelium. (2000)
  • 著者名/発表者名: Maeda, M.
  • 雑誌名: Dev. Biol. 223 ページ: 114-119
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A syntaxin 7 homologue is present in Dictyostelium discoideum endosomes and controls their homotypic fusion. (2000)
  • 著者名/発表者名: Bogdanovic, A.
  • 雑誌名: J Biol. Chem. 275 ページ: 36691-36697
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A second functional delta-5 fatty acid desaturase in the cellular slime mold Dictyostelium discoideum. (2000)
  • 著者名/発表者名: Saito, T., Morio, T., Ochiai, H.
  • 雑誌名: Eur.J.Biochem. 267 ページ: 1813-1818
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Loss of a member of the aquaporin gene family, aqpA affects spore dormancy in Dictyostelium. (2000)
  • 著者名/発表者名: Mitra, B.N., Yoshino, R., Morio, T., Yokoyama, M., Maeda, M., Urushihara, H., Tanaka, Y.
  • 雑誌名: Gene 251 ページ: 131-139
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Developmental changes in the spatial expression of genes involved in myosin function in Dictyostelium. (2000)
  • 著者名/発表者名: Maeda, M., Kuwayama, H., Yokoyama, M., Nishino, K., Morio, T., Urushihara, H., Katoh, M., Tanaka, Y., Saito, T., Ochiai, H., Takemoto, K., Yasukawa, H., Takeuchi, I.
  • 雑誌名: Dev. Biol. 223 ページ: 114-119
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A syntaxin 7 homologue is present in Dictyostelium discoideum endosomes and controls their homotypic fusion. (2000)
  • 著者名/発表者名: Bogdanovic, A., Bruckert, F., Morio, T., Satre, M.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 275(47) ページ: 36691-36697
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Dictyostelium transcriptional host cell response upon infection with Legionella.
  • 著者名/発表者名: Farbrother, P., Wagner, C., Na, J., Budi, N.A., Tunggal, B., Morio, T., Urushihara, H., Tanaka, Y., Schleicher, M., Steinert, M., Eichinger, L.
  • 雑誌名: Cell.Microbiol. (in press)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A small GTPase RacF2 affects sexual cell fusion and asexual development in Dictyostelium discoideum through the regulation of cell adhesion.
  • 著者名/発表者名: Muramoto, T., Urushihara, H.
  • 雑誌名: Dev.Growth Differ. (in press)
  • NAID: 10018123285
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The cDNA Sequencing Project.
  • 著者名/発表者名: Urushihara, H., Morio, T., Tanaka, Y.
  • 雑誌名: Methods in Molecular Biology : Dictyostelium discoideum. (eds. Eichinger, L. andRivero, F.) (Humana Press) (in press)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [図書] The cDNA Sequencing Project. In : Methods in Molecular Biology : Dictyostelium discoideum. (2006)
  • 著者名/発表者名: Urushihara, H.
  • 出版者: Humana Press(印刷中)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [図書] 「細胞性粘菌のゲノム解析」ゲノミクス・プロテオミクスの新展開〜生物情報の解析と応用〜 (2004)
  • 著者名/発表者名: 田仲可昌, 漆原秀子, 森尾貴広
  • 出版者: エヌ・ティー・エス
• [文献書誌] Urushihara, H. et al.: "Analyses of cDNAs from growth and slug stages of Dictyostelium discoideum"Nucleic Acids Research. 32(5). 1647-1655 (2004)
• [文献書誌] Sakamoto, H. et al.: "Identification and characterization of novel calcium-binding proteins of Dictyostelium and their spatial expression patterns during development"Development Growth & Differentiation. 45(5-6). 507-514 (2003)
• [文献書誌] Muramoto, T. et al.: "Construction of a gamete-enriched gene pool and RNAi-mediated functional analysis in Dictyostelium discoideum"Mechanisms of Development. 120. 967-977 (2003)
• [文献書誌] Araki, T. et al.: "A STAT-regulated, stress-induced signalling pathway in Dictyostelium"Journal of Cell Science. 116. 2907-2915 (2003)
• [文献書誌] Maeda, M. et al.: "Changing patterns of gene expression in prestalk cell subtypes of Dictyostelium recognized by in situ hybridization with genes from microarray analyses"Eukaryotic Cell. 2. 638-645 (2003)
• [文献書誌] Takeda, K. et al.: "A novel gene trap method using terminator-REMI and 3' rapid amplification of cDNA ends (RACE) in Dictyostelium"Gene. 312. 321-333 (2003)
• [文献書誌] Mineko MAEDA: "Changing patterns of gene expression in prestalk cell subtypes of Dictyostelium recognized by in situ hybridization with genes from microarray analyses"Eukaryotic Cell. (In press). (2003)
• [文献書誌] Hidekazu KUWAYAMA: "A novel PCR-mediated method for one tube generation of a gene disruption construct"Biotechnology letters. 24. 1307-1312 (2002)
• [文献書誌] Nancy Van DRIESSCHE: "A transcriptional profile of multicellular development in Dictyostelium discoideum"Development. 129. 1543-1552 (2002)
• [文献書誌] Hideko URUSHIHARA: "Functional genomics in Dictyostelium discoideum"Molecules and Cells. 13. 1-4 (2002)
• [文献書誌] 桑山 秀一: "PCR法による遺伝子破壊コンストラクトの作製法"日本農芸化学会誌. 77. 150-153 (2003)
• [文献書誌] Aleksandra BOGDANOVIC: "Syntaxin 7, syntaxin 8, Vtil and VAMP7(vesicle-associated membrane protein 7)form an active SNARE complex for early macropinocytic compartment fusion in Dictyostelium discoideum"Biochemical Journal. 368. 29-39 (2002)
• [文献書誌] Nancy VAN DRIESSCHE: "A transcriptional profile of multicellular development in Dictyostelium disooideum"Development. (in press). (2002)
• [文献書誌] Hidekazu KUWAYAMA: "PCR-mediated generation of a gene disruption construct without the use of DNA ligase and plasmid vectors"Nucleic Acids Research. 30. e2 (2002)
• [文献書誌] Takahiro MORIO: "FebA : a gene for eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein (4E-BP) in Dictyostelium discoideum"Biochimica et Biophysica Acta.. 1519. 65-69 (2001)
• [文献書誌] Hideko URUSHIHARA: "Functional genomics in Dictyostelium discoideum"Molecules and Cells. (in press). (2002)
• [文献書誌] Masatsune TSUJIOKA: "Spatial expression patterns of genes involved in cAMP-responses in Dictyostelium development."Development Growth and Differentiation. (in press). (2001)
• [文献書誌] Hideatei MIZUNO: "ORI-GENE : A tool for gene classification based on the evolutionary tree."Bioinformatics. (in press). (2001)
• [文献書誌] Biswa Nath MITRA: "Loss of a member of the aquaporin gene family, aqpA affects spore dormancy in Dictyostelium."Gene. 251. 131-139 (2000)
• [文献書誌] Mineko MAEDA: "Developmental changes in the spatial expression of genes involved in myosin function in Dictyostelium."Developmental Biology. 223. 114-119 (2000)