枯草菌の増殖と細胞分化を規定する蛋白質ネットワークの解明

• 研究課題/領域番号: 12206007
• 研究種目: 特定領域研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 奈良先端科学技術大学院大学
• 研究代表者: 小笠原 直毅 奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 教授 (10110553)
• 研究分担者: 金谷 重彦 奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 教授 (90224584) ; 河村 富士夫 立教大学, 理学部, 教授 (10126039) ; 吉川 博文 東京農業大学, 応用生物科学部, 教授 (50175676) ; 渡部 一仁 摂南大学, 薬学部, 教授 (20107105) ; 佐藤 勉 東京農工大学, 共生科学技術研究部, 助教授 (70215812) ; 小林 和夫 奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 助手 (70324978) ; 笠原 康裕 奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 助手 (20273849) ; 守家 成紀 (守夜 成紀) 奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 助教授 (40191051)
• 研究期間 (年度): 2000 – 2004
• 研究課題ステータス: 完了 (2004年度)
• 配分額: 135,700千円 (直接経費: 135,700千円); 2004年度: 35,200千円 (直接経費: 35,200千円); 2003年度: 35,000千円 (直接経費: 35,000千円); 2002年度: 30,000千円 (直接経費: 30,000千円); 2001年度: 35,500千円 (直接経費: 35,500千円)
• キーワード: 枯革菌 / ゲノム / 必須遺伝子 / 蛋白質間相互作用 / 胞子 / 枯草菌 / リボゾーム / 蛋白質相互作用 / 蛋白質複合体 / 質量分析法 / 酵母2ハイブリッドシステム / 変異株バンク / 酵母2ハイブリッド系 / GFP / ゲノム解析

研究概要

1)新たに約300の変異株を作製することにより、枯草菌の全機能未知遺伝子を含む変異株バンクが作製された。その結果、富栄養培地・37度での増殖には271遺伝子が必須であることが明らかとなり、細胞増殖の基本システムが明らかとなった。
2)機能未知の必須遺伝子の一つがtRNA中の塩基修飾にかかわること、必須膜タンパク質YneSが、PlsXとの共に、リン脂質合成の第一ステップに関与することを発見した。必須GTP結合タンパク質YlqFについて、50Sリボゾーム粒子の形成の最終段階に関与することを明らかにした。
3)57種のリボソームタンパク質遺伝子の破壊株の構築を試み、既知の破壊可能遺伝子を含め、合計22種のリボソームタンパク質遺伝子が単独破壊可能であることが明らかとなった。
4)枯草菌のパラログ遺伝子の解析により、polAと-ypcPの2重破壊は、岡崎プライマーRNAの除去機能が失われ致死となるという、新しい知見を得た。
5)プロテオーム、トランスクリプトーム、遺伝学的解析により、既知119遺伝子に加えて、新たに175遺伝子がスポア形成期に特異的に発現することを明らかにし、その発現を制御するシグマ因子を同定した。さらに、約90種類の胞子タンパク質についてGFPを用いた局在解析を行い、少なくとも10種類の局在パターンを見出し、胞子中でのタンパク質の配置という、今後の重要な研究テーマを明らかにした。
6)酵母2ハイブリッド法、細胞内複合体の質量分析計による解析による、相互作用解析も試み、ECFシグマ因子の活性を制御するアンチシグマ因子、Comタンパク質の活性を制御するRapタンパク質、胞子形成開始キナーゼの活性制御にかかわるYheIHタンパク質、FtsZと結合し、細胞分裂に関与するYlqFタンパク質、DnaA, Nと相互作用し、複製開始の制御に関わるYabAタンパク質を見出した。

研究成果

• [雑誌論文] Functional dissection of YabA, a negative regulator of DNA replication initiation in Bacillus subtilis (2006)
  • 著者名/発表者名: Noirot-Gros, M. F.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci USA 103 ページ: 2368-2373
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] The GTP-binding protein, YlqF, participates in the late step of 50S ribosomal subunit assembly in Bacillus subtilis (2006)
  • 著者名/発表者名: Matsuo, Y.
  • 雑誌名: J Biol Chem 281 ページ: 8110-8117
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Bacillus subtilis EzrA and FtsL synergistically regulate FtsZ ring dynamics during cell division (2006)
  • 著者名/発表者名: Kawai, Y.
  • 雑誌名: Microbiology 152 ページ: 1129-1141
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] The putative ABC transporter YheH/YheI is involved in the signaling pathway that activates KinA during sporulation initiation (2006)
  • 著者名/発表者名: Fukushima, S.
  • 雑誌名: FEMS Microbiol Lett 256 ページ: 90-97
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Functional dissection of YabA, a negative regulator of DNA replication initiation in Bacillus subtilis. (2006)
  • 著者名/発表者名: Noirot-Gros, M.F.; Velten, M., Yoshimura, M., McGovern, S., Morimoto, T., Ehrlich, S.D., Ogasawara, N., Polard, P., Noirot, P.
  • 雑誌名: Proc Nati Acad Sci U S A. 103 ページ: 2368-2373
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The GTP-binding protein, YlqF, participates in the late step of 50S ribosomal subunit assembly in Bacillus subtilis. (2006)
  • 著者名/発表者名: Matsuo, Y., Morimoto, T., Kuwano, M., Loh, P.C., Oshima, T., Ogasawara, N.
  • 雑誌名: J Biol Chem 281 ページ: 8110-8117
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Bacillus subtilis EzrA and FtsL synergistically regulate FtsZ ring dynamics during cell division. (2006)
  • 著者名/発表者名: Kawai, Y., Ogasawara, N.
  • 雑誌名: Microbiology 152 ページ: 1129-1141
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The putative ABC transporter YheH/YheI is involved in the signaling pathway that activates KinA during sporulation initiation. (2006)
  • 著者名/発表者名: Fukushima, S., Yoshimura, M., Chibazakura, T., Sato, T., Yoshikawa, H.
  • 雑誌名: FEMS Microbiol Lett 256 ページ: 90-97
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Synergistic regulation of competence development in Bacillus subtilis by two Rap-Phr systems (2005)
  • 著者名/発表者名: Bongiorni, C.
  • 雑誌名: J Bacteriol 187 ページ: 4353-4361
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] The ylbO gene product of Bacillus subtilis is involved in the coat development and lysozyme resistance of spore (2005)
  • 著者名/発表者名: Kuwana R.
  • 雑誌名: FEMS Microbiol Lett 242 ページ: 51-57
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Synergistic regulation of competence development in Bacillus subtilis by two Rap-Phr systems. (2005)
  • 著者名/発表者名: Bongiorni, C., Ishikawa, S., Stephenson, S., Ogasawara, N., Perego, M.
  • 雑誌名: J Bacteriol 187 ページ: 4353-4361
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The ylbO gene product of Bacillus subtilis is involved in the coat development and lysozyme resistance of spore. (2005)
  • 著者名/発表者名: Kuwana R., Okumura T., Takamatsu H., Watabe K.
  • 雑誌名: FEMS Microbiol Lett 242 ページ: 51-57
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The, ylbO gene product of Bacillus subtilis is involved in the coat development and lysozyme resistance of spore (2005)
  • 著者名/発表者名: Kuwana, R.
  • 雑誌名: FEMS Microbiol.Lett. 242・1 ページ: 51-57
• [雑誌論文] DBTBS : database of transcriptional regulation in Bacillus subtilis and its contribution to comparative genomics (2004)
  • 著者名/発表者名: Makita, Y.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 32
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Zinc is a key factor in controlling alternation of two types of L31 protein in the Bacillus subtilis ribosome (2004)
  • 著者名/発表者名: Nanamiya, H.
  • 雑誌名: Mol Microbiol 52 ページ: 273-283
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Functional relationship between SpoVIF and GerE in gene regulation during sporulation of Bacillus subtilis (2004)
  • 著者名/発表者名: Kuwana, R.
  • 雑誌名: Microbiology 150 ページ: 163-170
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] spoIVH (ykvV), a requisite cortex formation gene, is expressed in both sporulating compartments of Bacillus subtilis (2004)
  • 著者名/発表者名: Imamura, D.
  • 雑誌名: J Bacteriol 186 ページ: 450-5459
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Systematic analysis of SigD-regulated genes in Bacillus subtilis by DNA microarray and Northern blotting analyses (2004)
  • 著者名/発表者名: Serizawa, M.
  • 雑誌名: Gene 329 ページ: 125-136
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Interaction of Bacillus subtilis extracytoplasmic function (ECF) sigma factors with the N-terminal regions of their potential anti-sigma factors (2004)
  • 著者名/発表者名: Yoshimura, M.
  • 雑誌名: Microbiology 150 ページ: 591-599
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Characterization of a polysaccharide deacetylase gene homologue (pdaB) on sporulation of Bacillus subtilis (2004)
  • 著者名/発表者名: Fukushima, T.
  • 雑誌名: J Biochem 136 ページ: 283-291
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Zinc is a key factor in controlling alternation of two types of L31 protein in the Bacillus subtilis ribosome. (2004)
  • 著者名/発表者名: Nanamiya, H., Akanuma, G., Natori, Y., Murayama, R., Kosono, S., Kudo, T., Kobayashi, K., Ogasawara, N., Park, S.M., Ochi, K., Kawamura, F.
  • 雑誌名: Mol Microbiol 52 ページ: 273-283
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] spoIVH (ykvV), a requisite cortex formation gene, is expressed in both sporulating compartments of Bacillus subtilis. (2004)
  • 著者名/発表者名: Imamura, D., Kobayashi, K., Sekiguchi, J., Ogasawara, N., Takeuchi, M., Sato, T.
  • 雑誌名: J Bacteriol 186 ページ: 5450-5459
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Functional relationship between SpoVIF and GerE in gene regulation during sporulation of Bacillus subtilis. (2004)
  • 著者名/発表者名: Kuwana, R., Ikejiri, H., Yamamura, S., Takamatsu, H., Watabe, K.
  • 雑誌名: Microbiology 150 ページ: 163-170
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Interaction of Bacillus subtilis extracytoplasmic function (ECF) sigma factors with the N-terminal regions of their potential anti-sigma factors. (2004)
  • 著者名/発表者名: Yoshimura, M., Asai, K., Sadaie, Y., Yoshikawa, H.
  • 雑誌名: Microbiology 150 ページ: 591-599
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] DBTBS : database of transcriptional regulation in Bacillus subtilis and its contribution to comparative genomics. (2004)
  • 著者名/発表者名: Makita, Y., Nakao, M., Ogasawara, N., Nakai, K.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 32
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Systematic analysis of SigD-regulated genes in Bacillus subtilis by DNA microarray and Northern blotting analyses. (2004)
  • 著者名/発表者名: Serizawa, M., Yamamoto, H., Yamaguchi, H., Fujita, Y., Kobayashi, K., Ogasawara, N., Sekiguchi, J.
  • 雑誌名: Gene 329 ページ: 125-136
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Characterization of a polysaccharide deacetylase gene homologue (pdaB) on sporulation of Bacillus subtilis. (2004)
  • 著者名/発表者名: Fukushima, T., Tanabe, T., Yamamoto, H., Hosoya, S., Sato, T., Yoshikawa, H., Sekiguchi, J.
  • 雑誌名: J Biochem. 136 ページ: 283-291
  • NAID: 10016201890
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Zinc is a key factor in controlling alteration of two types of L31 protein in the Bacillus subtilis ribosome (2004)
  • 著者名/発表者名: Nanamiya, H.
  • 雑誌名: Mol.Microbiol. 52・1 ページ: 273-283
• [雑誌論文] Interaction of Bacillus subtilis extracytoplasmic function (ECF) sigma factors with the N terminal regions of their potential anti-sigma factors (2004)
  • 著者名/発表者名: Yoshimura, M.
  • 雑誌名: Microbiology 150・3 ページ: 591-599
• [雑誌論文] spoIVH (ykvV), a requisite cortex formation gene, expresses in both sporulating compartments of Bacillus subtilis (2004)
  • 著者名/発表者名: Imamura, D
  • 雑誌名: J.Bacteriol. 186・16 ページ: 5450-5459
• [雑誌論文] Essential Bacillus subtilis genes (2003)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, K.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci USA 100 ページ: 4678-4683
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] An RNA-modifying enzyme that governs both the codon and amino acid specificities of isoleucine tRNA (2003)
  • 著者名/発表者名: Soma, A.
  • 雑誌名: Mol Cell 12 ページ: 689-698
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Identification of a protein, YneA, responsible for cell division suppression during the SOS response in Bacillus subtilis (2003)
  • 著者名/発表者名: Kawai, Y.
  • 雑誌名: Mol Microbiol 47 ページ: 1113-1122
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] The BceRS two-component regulatory system induces expression of the bacitracin transporter, BceAB, in Bacillus subtilis (2003)
  • 著者名/発表者名: Ohki, R.
  • 雑誌名: Mol Microbiol 49 ページ: 1135-1144
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Binding of response regulator DegU to the aprE promoter is inhibited by RapG, which is counteracted by extracellular PhrG in Bacillus subtilis (2003)
  • 著者名/発表者名: Ogura, M
  • 雑誌名: Mol Microbiol 49 ページ: 1685-1697
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] YufLM two-component system regulates the expression of the malate transporters MaeN (YufR) and YflS, and is essential for utilization of malate in minimal medium (2003)
  • 著者名/発表者名: Tanaka, K.
  • 雑誌名: Microbiology 149 ページ: 2317-2329
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Bacillus subtilis diacylglycerol kinase (DgkA) enhances efficient sporulation (2003)
  • 著者名/発表者名: Amiteye, S.
  • 雑誌名: J Bacteriol 185 ページ: 5306-5309
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] ncreasing the ratio of Soj to SpoOJ promotes replication initiation in Bacillus subtilis (2003)
  • 著者名/発表者名: Ogura, Y.
  • 雑誌名: J Bacteriol 185 ページ: 6316-6324
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Bacillus subtilis spoVIF (yjcC) gene, involved in coat assembly and spore resistance (2003)
  • 著者名/発表者名: Kuwana, R.
  • 雑誌名: Microbiology 149 ページ: 3011-3021
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Involvement of ClpX protein in the post-transcriptional regulation of a competence specific transcription factor, ComK protein, of Bacillus subtilis (2003)
  • 著者名/発表者名: Nanamiya, H.
  • 雑誌名: J Biochem (Tokyo) 133 ページ: 295-302
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Transcriptional, functional and cytochemical analyses of the veg gene in Bacillus subtilis (2003)
  • 著者名/発表者名: Fukushima, T.
  • 雑誌名: J Biochem (Tokyo) 133 ページ: 475-483
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Essential Bacillus subtilis genes. (2003)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, K., Ehrlich, S.D., Albertini, A., Amati, G., Andersen, K.K., Arnaud, M., Asai, K., Ashikaga, S., Aymerich, S., Bessieres, P., et al.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci U S A 100 ページ: 4678-4683
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] An RNA-modifying enzyme that governs both the codon and amino acid specificities of isoleucine tRNA. (2003)
  • 著者名/発表者名: Soma, A., Ikeuchi, Y., Kanemasa, S., Kobayashi, K., Ogasawara, N., Ote, T., Kato, J., Watanabe, K., Sekine, Y., Suzuki, T.
  • 雑誌名: Mol Cell 12 ページ: 689-698
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Identification of a protein, YneA, responsible for cell division suppression during the SOS response in Bacillus subtilis. (2003)
  • 著者名/発表者名: Kawai, Y., Moriya, S., Ogasawara, N.
  • 雑誌名: Mol Microbiol 47 ページ: 1113-1122
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The BceRS two-component regulatory system induces expression of the bacitracin transporter, BceAB, in Bacillus subtilis. (2003)
  • 著者名/発表者名: Ohki, R., Giyanto, Tateno, K., Masuyama, W., Moriya, S., Kobayashi, K., Ogasawara, N.
  • 雑誌名: Mol Microbiol 49 ページ: 1135-1144
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Binding of response regulator DegU to the aprE promoter is inhibited by RapG, which is counteracted by extracellular PhrG in Bacillus subtilis. (2003)
  • 著者名/発表者名: Ogura, M., Shimane, K., Asai, K., Ogasawara, N., Tanaka, T.
  • 雑誌名: Mol Microbiol 49 ページ: 1685-1697
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Bacillus subtilis diacylglycerol kinase (DgkA) enhances efficient sporulation. (2003)
  • 著者名/発表者名: Amiteye, S., Kobayashi, K., Imamura, D., Hosoya, S., Ogasawara, N., Sato, T.
  • 雑誌名: J Bacteriol 185 ページ: 5306-5309
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Increasing the ratio of Soj to SpoOJ promotes replication initiation in Bacillus subtilis. (2003)
  • 著者名/発表者名: Ogura, Y., Ogasawara, N., Harry, E.J., Moriya, S.
  • 雑誌名: J Bacteriol 185 ページ: 6316-6324
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The Bacillus subtilis YufLM two-component system regulates the expression of the malate transporters MaeN (YufR) and YflS, and is essential for utilization of malate in minimal medium. (2003)
  • 著者名/発表者名: Tanaka, K., Kobayashi, K., Ogasawara, N.
  • 雑誌名: Microbiology 149 ページ: 2317-2329
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Bacillus subtilis spoVIF (yjcC) gene, involved in coat assembly and spore resistance. (2003)
  • 著者名/発表者名: Kuwana, R., Yamamura, S., Ikejiri, H., Kobayashi, K., Ogasawara, N., Asai, K., Sadaie, Y., Takamatsu, H., Watabe, K.
  • 雑誌名: Microbiology 149 ページ: 3011-3021
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Involvement of ClpX protein in the post-transcriptional regulation of a competence specific transcription factor, ComK protein, of Bacillus subtilis. (2003)
  • 著者名/発表者名: Nanamiya, H., Shiomi, E., Ogura, M., Tanaka, T., Asai, K., Kawamura, F.
  • 雑誌名: J Biochem (Tokyo) 133 ページ: 295-302
  • NAID: 10012053276
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Transcriptional, functional and cytochemical analyses of the veg gene in Bacillus subtilis. (2003)
  • 著者名/発表者名: Fukushima, T., Ishikawa, S., Yamamoto, H., Ogasawara, N., Sekiguchi, J.
  • 雑誌名: J Biochem (Tokyo) 133 ページ: 475-483
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Discovery of two novel families of proteins that are proposed to interact with prokaryotic SMC proteins, and characterization of the Bacillus subtilis family members ScpA and ScpB (2002)
  • 著者名/発表者名: Soppa, J.
  • 雑誌名: Mol Microbiol 45 ページ: 59-71
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Analysis of the Bacillus subtilis spoIIIJ gene and its paralogue gene, yqjG (2002)
  • 著者名/発表者名: Murakami, T.
  • 雑誌名: J Bacteriol 184 ページ: 1998-2004
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Whole-genome analysis of genes regulated by the Bacillus subtilis competence transcription factor ComK (2002)
  • 著者名/発表者名: Ogura, M.
  • 雑誌名: J Bacteriol 184 ページ: 2344-2351
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Mutation in yaaT leads to significant inhibition of phosphorelay during sporulation in Bacillus subtilis (2002)
  • 著者名/発表者名: Hosoya, S.
  • 雑誌名: J Bacteriol 184 ページ: 5545-5553
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Six GTP-binding proteins of the Era/Obg family are essential for cell growth in Bacillus subtilis (2002)
  • 著者名/発表者名: Morimoto, T.
  • 雑誌名: Microbiology 148 ページ: 3539-3352
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Proteomics characterization of novel spore proteins of Bacillus subtilis (2002)
  • 著者名/発表者名: Kuwana, R.
  • 雑誌名: Microbiology 148 ページ: 3971-3982
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Identification and characterization of the Bacillus subtilis D-glucarate/galactarate utilization operon ycbCDEFGHJ (2002)
  • 著者名/発表者名: Hosoya, S.
  • 雑誌名: FEMS Microbiol. Lett 210 ページ: 193-199
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] DnaK chaperone machine and trigger factor are only partially required for normal growth of Bacillus subtilis (2002)
  • 著者名/発表者名: Reyes, D. Y.
  • 雑誌名: Biosci Biotechnol Biochem 66 ページ: 1583-1586
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] (2002). Discovery of two novel families of proteins that are proposed to interact with prokaryotic SMC proteins, and characterization of the Bacillus subtilis family members ScpA and ScpB. (2002)
  • 著者名/発表者名: Soppa, J., Kobayashi, K., Noirot-Gros, M.F., Oesterhelt, D., Ehrlich, S.D., Dervyn, E., Ogasawara, N., Moriya, S.
  • 雑誌名: Mol Microbiol 45 ページ: 59-71
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Analysis of the Bacillus subtilis spoIIIJ gene and its paralogue gene, yqjG. (2002)
  • 著者名/発表者名: Murakami, T., Haga, K., Takeuchi, M., Sato, T.
  • 雑誌名: J Bacteriol 184 ページ: 1998-2004
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Whole-genome analysis of genes regulated by the Bacillus subtilis competence transcription factor ComK. (2002)
  • 著者名/発表者名: Ogura, M., Yamaguchi, H., Kobayashi, K., Ogasawara, N., Fujita, Y., Tanaka, T.
  • 雑誌名: J Bacteriol 184 ページ: 2344-2351
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Mutation in yaaT leads to significant inhibition of phosphorelay during sporulation in Bacillus subtilis. (2002)
  • 著者名/発表者名: Hosoya, S., Asai, K., Ogasawara, N., Takeuchi, M., Sato, T.
  • 雑誌名: J Bacteriol 184 ページ: 5545-5553
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Six GTP-binding proteins of the Era/Obg family are essential for cell growth in Bacillus subtilis. (2002)
  • 著者名/発表者名: Morimoto, T., Loh, P.C., Hirai, T., Asai, K., Kobayashi, K., Moriya, S., Ogasawara, N.
  • 雑誌名: Microbiology 148 ページ: 3539-3352
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Proteomics characterization of novel spore proteins of Bacillus subtilis. (2002)
  • 著者名/発表者名: Kuwana, R., Kasahara, Y., Fujibayashi, M., Takamatsu, H., Ogasawara, N., Watabe, K.
  • 雑誌名: Microbiology 148 ページ: 3971-3982
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Identification and characterization of the Bacillus subtilis D-glucarate/galactarate utilization operon ycbCDEFGHJ. (2002)
  • 著者名/発表者名: Hosoya, S., Yamane, K., Takeuchi, M., Sato, T.
  • 雑誌名: FEMS Microbiol Lett 210 ページ: 193-199
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] DnaK chaperone machine and trigger factor are only partially required for normal growth of Bacillus subtilis. (2002)
  • 著者名/発表者名: Reyes, D.Y., Yoshikawa, H.
  • 雑誌名: Biosci Biotechnol Biochem 66 ページ: 1583-1586
  • NAID: 110002693868
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Combined transcriptome and proteome analysis as a powerful approach to study genes under glucose repression in Bacillus subtilis. (2001)
  • 著者名/発表者名: Yoshida, K
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 29 ページ: 683-692
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] DnaD protein of Bacillus subtilis interacts with DnaA, the initiator protein of replication (2001)
  • 著者名/発表者名: Ishigo-Oka, D.
  • 雑誌名: J Bacteriol 183 ページ: 2148-2150
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Comprehensive DNA microarray analysis of Bacillus subtilis two-component regulatory systems (2001)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, K.
  • 雑誌名: J Bacteriol 183 ページ: 7365-7370
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A putative ATP-binding cassette transporter YbdA involved in sporulation of Bacillus subtilis (2001)
  • 著者名/発表者名: Isezaki, M
  • 雑誌名: FEMS Microbiol Lett 204 ページ: 239-245
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Combined transcriptome and proteome analysis as a powerful approach to study genes under glucose repression in Bacillus subtilis. (2001)
  • 著者名/発表者名: Yoshida, K., Kobayashi, K., Miwa, Y., Kang, C., Matsunaga, M., Yamaguchi, H., Tojo, S., Yamamoto, M., Nishi, R., Ogasawara, N., Nakayama, T., Fujita, Y.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 29 ページ: 683-692
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] DnaD protein of Bacillus subtilis interacts with DnaA, the initiator protein of replication. (2001)
  • 著者名/発表者名: Ishigo-Oka, D., Ogasawara, N., Moriya, S.
  • 雑誌名: J Bacteriol 183 ページ: 2148-2150
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Comprehensive DNA microarray analysis of Bacillus subtilis two-component regulatory systems. (2001)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, K., Ogura, M., Yamaguchi, H., Yoshida, K., Ogasawara, N., Tanaka, T., Fujita, Y.
  • 雑誌名: J Bacteriol 183 ページ: 7365-7370
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A putative ATP-binding cassette transporter YbdA involved in sporulation of Bacillus subtilis. (2001)
  • 著者名/発表者名: Isezaki, M., Hosoya, S., Takeuchi, M., Sato, T.
  • 雑誌名: FEMS Microbiol Lett 204 ページ: 239-245
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [文献書誌] Kawai, Y.: "Identification of a protein, YneA, responsible for cell division suppression during the SOS response in Bacillus subtilis"Mol Microbial. 47. 1113-1122 (2003)
• [文献書誌] Nanamiya, H.: "Involvement of ClpX protein in the post-transcriptional regulation of a competence specific transcription factor, ComK protein, of Bacillus subtilis"J Biochem (Tokyo). 133. 295-302 (2003)
• [文献書誌] Fukushima, T.: "Transcriptional, functional and cytochemical analyses of the veg gene in Bacillus subtilis"J Biochem (Tokyo). 133. 475-483 (2003)
• [文献書誌] Kobayashi, K.: "Essential Bacillus subtilis genes"Proc Natl Acad Sci USA. 100. 4678-4683 (2003)
• [文献書誌] Ohki, R.: "The BeeRS two-component regulatory system induces expression of the bacitracin transporter, BceAB, in Bacillus subtilis"Mol Microbiol. 49. 1135-1144 (2003)
• [文献書誌] Amiteye, S.: "Bacillus subtilis diacylglycerol kinase (DgkA) enhances efficient sporulation"J Bacteriol. 185. 5306-5309 (2003)
• [文献書誌] Ogura, M.: "Binding of response regulator DegU to the aprE promoter is inhibited by RapG, which is counteracted by extracellular PhrG in Bacillus subtilis"Mol Microbiol. 49. 1685-1697 (2003)
• [文献書誌] Tanaka, K.: "The Bacillus subtilis YufLM two-component system regulates the expression of the malate transporters MaeN (YufR) and YflS, and is essential for utilization of malate in minimal medium"Microbiology. 149. 2317-2329 (2003)
• [文献書誌] Kuwana, R.: "Bacillus subtilis spoVIF (yjcC) gene, involved in coat assembly and spore resistance"Microbiology. 149. 3011-3021 (2003)
• [文献書誌] Ohashi, Y.: "Expression profiling of translation-associated genes in sporulating Bacillus subtilis and consequence of sporulation by gene inactivation"Biosci Biotechnol Biochem. 67. 2245-2253 (2003)
• [文献書誌] Kuwana, R.: "Functional relationship between SpoVIF and GerE in gene regulation during sporulation of Bacillus subtilis"Microbiology. 150. 163-170 (2004)
• [文献書誌] Yoshimura, M.: "Interaction of Bacillus subtilis extracytoplasmic function (ECF) sigma factors with the N-terminal regions of their potential anti-sigma factors"Microbiology. 150. 591-599 (2004)
• [文献書誌] Soppa, J.: "Discovery of two novel families of proteins that are proposed to interact with prokaryotic SMC proteins, and characterization of the Bacillus subtilis family members SpA and ScpB"Mol Microbiol. 45・1. 59-71 (2002)
• [文献書誌] Reyes, D. Y.: "DnaK Chaperone Machine and trigger factor are only partially required for normal growth of Bacillus subtilis"Biosci Biotech Biochem. 66・7. 1583-1586 (2002)
• [文献書誌] Morimoto, T.: "Six GTP-binding proteins of the Era/Obg family are essential for cell growth in Bacillus subtilis"Microbiology. 148・11. 3539-3552 (2002)
• [文献書誌] Kawai, Y.: "Identification of a protein, YneA, responsible for cell division suppression during the SOS response in Bacillus subtilis"Mol Microbiol. 47・4. 1113-1122 (2003)
• [文献書誌] Nanamiya, H.: "Involvement of ClpX Protein in the Post-Transcriptional Regulation of Competence Specific Transcription Factor, ComK Protein, of Bacillus subtilis"J Biochemistry. 133・3. 295-302 (2003)
• [文献書誌] Kobayashi, K.: "Essential Bacillus subtilis genes"Proc Natl Acad Sci USA. (印刷中). (2003)
• [文献書誌] Yoshida, K.: "Combined transcriptome and proteome analysis as a powerful approach to study genes under glucose repression in Bacillus subtilis"Nucleic Acids Res.. 29. 683-692 (2001)
• [文献書誌] Ishigo-Oka, D.: "DnaD protein of Bacillus subtilis interacts with DnaA, the initiator protein of replication"J. Bacteriol.. 183. 2148-2150 (2001)
• [文献書誌] Ishigo-oka,D.: "DnaD protein of Bacillus subtilis interacts with DnaA, the initiator protein of replication."J.Bacteriol.. 183・6. 2148-2150 (2001)
• [文献書誌] Fukuchi,K.: "The essential two-component regulatory system encoded by yycF and yycG modulates expression of the ftsAZ operon in Bacillus subtilis."Microbiology. 146・7. 1573-1583 (2000)
• [文献書誌] Imai,Y.: "Subcellular localization of Dna-initiation proteins of Bacillus subtilis : evidence that chromosome replication begins at either edge of nucleoids."Mol.Microbiol.. 36・5. 1037-1048 (2000)
• [文献書誌] Nakano,M.M.: "Mutations conferring amino acid residue substitutions in the carboxyl-terminal domain of RNA polymerase αcan suppress clpX and clpP with respect to developmentally regulated transcription in Bacillus subtilis."Mol.Microbiol.. 37・4. 869-884 (2000)
• [文献書誌] Kobayashi,H.: "Genetic analysis of SecA-SecY interaction required for spore development in Bacillus subtilis."FEMS Microbiol.Lett.. 184・2. 285-289 (2000)
• [文献書誌] Nanamiya,H.: "Suppression of temperature-sensitive sporulation mutation in the Bacillus subtilis sigA gene by rpoB mutation."FEMS Microbiol.Lett.. 192・2. 237-241 (2000)