枯草菌転写制御ネットワークの全体像の解明

• 研究課題/領域番号: 12206010
• 研究種目: 特定領域研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 福山大学
• 研究代表者: 藤田 泰太郎 福山大学, 生命工学部, 教授 (40115506)
• 研究分担者: 三輪 泰彦 福山大学, 生命工学部, 助教授 (00219833) ; 広岡 和丈 福山大学, 生命工学部, 講師 (20389068) ; 関口 順一 信州大学, 繊維学部, 教授 (80111053) ; 田中 暉夫 東海大学, 海洋学部, 教授 (10236606) ; 定家 義人 埼玉大学, 理学部, 教授 (40000252) ; 吉田 健一 福山大学, 助教授 (20230732)
• 研究期間 (年度): 2000 – 2004
• 研究課題ステータス: 完了 (2004年度)
• 配分額: 96,500千円 (直接経費: 96,500千円); 2004年度: 25,600千円 (直接経費: 25,600千円); 2003年度: 25,400千円 (直接経費: 25,400千円); 2002年度: 21,000千円 (直接経費: 21,000千円); 2001年度: 24,500千円 (直接経費: 24,500千円)
• キーワード: 枯草菌 / 転写制御 / ネットワーク / DNAマイクロアレイ / シグマ因子 / 2成分制御系 / HTH制御蛋白質 / レギュロン / HTH蛋白質

研究概要

枯草菌を種々の培養あるいはストレス状況に曝した、遺伝子クラスタリングのDNAマイクロアレイ解析、および転写制御変異株を用いた、標的遺伝子候補を抽出するアレイ解析により、500に及ぶマイクロアレイ解析データを獲得した。この膨大な転写制御知見のうち、枯草菌の窒素代謝に関する遺伝子クラスタリング解析、代謝に関連した転写制御蛋白質のDNAマイクロアレイ解析による標的遺伝子候補の抽出、および分子遺伝学的解析から、合成系を代表する分岐鎖アミノ酸合成の制御を中心に据える炭素代謝制御(CcpAが関与)、窒素代謝制御(CodYとTnrAが関与)と緊縮制御(RelAが関与)のネットワークを想定できた。
DNA結合転写制御因子のDNAマイクロアレイ解析結果に基づく、個々のレギュロンの機能解析では、ECFシグマ因子の網羅的解析を終了させることができた。また、2成分制御系レギュロンの網羅的機能解析をほぼ終了させた。後者の解析の結果、34個の2成分制御系のうち、機能の全く推測できないものは6個程度になった。さらに、数百のHTH転写制御蛋白質の支配するレギュロンのDNAマイクロアレイ解析結果に基づく網羅的機能解析では、MarR、TetRとMerRファミリーの薬剤耐性に関与するHTH転写制御蛋白質の支配するレギュロンの分子遺伝学的研究を進め、これらのファミリーに属する制御蛋白質の殆どで、少なくとも一つの主要な標的遺伝子を見出した。特に、YsiAが脂肪酸分解制御に関与するグローバルな制御因子であることを見出した事は特筆に値する。これらの結果の殆どとこれまで蓄積されてきた文献情報により、転写制御ネットワークの輪郭を把握した6この5年間に渡る研究成果は、39編に登る学術論文(次ページにリスト)と100回を超える学会発表で公表した。

研究成果

• [雑誌論文] Elaborate transcription regulation of the Bacillus subtilis ilv-leu operon involved in the biosynthesis of branched-chain amino acids through global regulators of CcpA, CodY and TnrA (2005)
  • 著者名/発表者名: Shigeo Tojo
  • 雑誌名: Molecular Microbiology 56 (6) ページ: 1560-1573
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Enhancement of glutamine utilization in Bacillus subtilis through the GlnK-GlnL two-component regulatory system (2005)
  • 著者名/発表者名: Takenori Satomura
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 187 (14) ページ: 4813-4821
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A polysaccharide deacetylase homologue, PdaA, in Bacillus subtilis is N-acetylmuramic acid deacetylase in vitro (2005)
  • 著者名/発表者名: Tatsuya Fukushima
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 187 (4) ページ: 1287-1292
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] The Bacillus subtilis YdfHI two-component system regulates the transcription of ydfJ, a member of the RND superfamily (2005)
  • 著者名/発表者名: Masakuni Serizawa
  • 雑誌名: Microbiology 151 (6) ページ: 1769-1778
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Solution structure of the peptidoglycan binding domain of B. subtilis cell wall lytic enzyme, CwlC : characterization of the sporulation-related repeats by NMR (2005)
  • 著者名/発表者名: Masaki Mishima
  • 雑誌名: Biochemistry 44 (30) ページ: 10153-10163
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Functional analysis of the YvrGHb two-component system of Bacillus subtilis : identification of the regulated genes by DNA microarray and Northern blot analyses (2005)
  • 著者名/発表者名: Masakuni Serizawa
  • 雑誌名: Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 69 (11) ページ: 2155-2169
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Genes for SkfA killing factor production protect a Bacillus subtilis lipase against degradation (2005)
  • 著者名/発表者名: Helga Westers
  • 雑誌名: Applied and Environmental Microbiology 71 (4) ページ: 1899-1908
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Inhibition of Bacillus subtilis scoC expression by multicopy senS (2005)
  • 著者名/発表者名: Eiji Kawachi
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 187 (24) ページ: 8526-8530
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Transcriptional analysis of the ylaABCD operon of Bacillus subtilis encoding a sigma factor of extracytoplasmic function family (2005)
  • 著者名/発表者名: Takashi Matsumoto
  • 雑誌名: Genes ＆ Genetic Systems 80 (6) ページ: 385-393
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Restriction and modification of SP10 phage by BsuM of Bacillus subtilis Marburg (2005)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Matsuoka
  • 雑誌名: FEMS Microbiology Letters 244 (2) ページ: 335-339
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Elaborate transcription regulation of the Bacillus subtilis ilv-leu operon involved in the biosynthesis of branched-chain amino acids through global regulators of CcpA, CodY and TnrA (2005)
  • 著者名/発表者名: Tojo, S., Satomura, T., Morisaki, K., Deutscher, J., Hirooka, K., Fujita, Y.
  • 雑誌名: Molecular Microbiology 56-6 ページ: 1560-1573
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Enhancement of glutamine utilization in Bacillus subtilis through the GlnK-GlnL two-component regulatory system (2005)
  • 著者名/発表者名: Satomura, T., Shimura, D., Asai, K., Sadaie, Y., Hirooka, K., Fujita, Y.
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 187-14 ページ: 4813-4821
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A polysaccharide deacetylase homologue, PdaA, in Bacillus subtilis is N-acetylmuramic acid deacetylase in vitro (2005)
  • 著者名/発表者名: Fukushima, T., Kitajima, T., Sekiguchi, J.
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 187-4 ページ: 1287-1292
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The Bacillus subtilis YdfHI two-component system regulates the transcription of ydfJ, a member of the RND superfamily.. (2005)
  • 著者名/発表者名: Serizawa, M., Sekiguchi, J.
  • 雑誌名: Microbiology 151-6 ページ: 1769-1778
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Solution structure of the peptidoglycan binding domain of B. subtilis cell wall lytic enzyme, CwlC : characterization of the sporulation-related repeats by NMR. (2005)
  • 著者名/発表者名: Mishima, M., Shida, T., Yabuki, K., Kato, K., Sekiguchi, J., Kojima, C.
  • 雑誌名: Microbiology 151-6 ページ: 1769-1778
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Solution structure of the peptidoglycan binding domain of B. subtilis cell wall lytic enzyme, CwlC : characterization of the sporulation-related repeats by NMR (2005)
  • 著者名/発表者名: Mishima, M., Shida, T., Yabuki, K., Kato, K., Sekiguchi, J., Kojima, C.
  • 雑誌名: Biochemistry 44-30 ページ: 10153-10163
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Functional analysis of the YvrGHb two-component system of Bacillus subtilis : identification of the regulated genes by DNA microarray and Northern blot analyses (2005)
  • 著者名/発表者名: Serizawa, M., Kodama, K., Yamamoto, H., Kobayashi, K., Ogasawara, N., Sekiguchi, J.
  • 雑誌名: Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 69-11 ページ: 2155-2169
  • NAID: 130000030490
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Genes for SkfA killing factor production protect a Bacillus subtilis lipase against degradation (2005)
  • 著者名/発表者名: Westers, H., Peter, G, Braun, P., Westers, L., Antelmann, H., Hecker, M., Jongbloed, J., D.H., Yoshikawa, H., Tanaka, T., van Dijl, J.M., Quax, W.J.
  • 雑誌名: Applied and Environmental Microbiology 71-4 ページ: 1899-1908
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Inhibition of Bacillus subtilis scoC expression by multicopy senS (2005)
  • 著者名/発表者名: Kawachi, E., Abe, S., Tanaka, T.
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 187-24 ページ: 8526-8530
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Transcriptional analysis of the ylaABCD operon of Bacillus subtilis encoding a sigma factor of extracytoplasmic function family (2005)
  • 著者名/発表者名: Matsumoto, T., Nakanishi, K., Asai, K., Sadaie, Y.
  • 雑誌名: Genes ＆ Genetic Systems 80-6 ページ: 385-393
  • NAID: 10020534735
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Restriction and modification of SP10 phage by BsuM of Bacillus subtilis Marburg. (2005)
  • 著者名/発表者名: Matsuoka, S., Asai K, Sadaie, Y.
  • 雑誌名: FEMS Microbiology Letters 244-2 ページ: 335-339
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Restriction and modification of SP10 phage by BsuM of Bacillus subtilis Marburg (2005)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Matsuoka
  • 雑誌名: FEMS Microbiology Letters 244 ページ: 335-339
• [雑誌論文] A polysaccharide deacetylase homologue, PdaA, in Bacillus subtilis acts as an N-acetylmuramic acid deacetylase in vitro (2005)
  • 著者名/発表者名: Tatsuya Fukushima
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 187 ページ: 1287-1292
• [雑誌論文] Systematic analysis of SigD-regulated genes in Bacillus subtilis by DNA microarray and Northern blotting analyses (2004)
  • 著者名/発表者名: Masakuni Serizawa
  • 雑誌名: Gene 329 ページ: 125-136
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Bacillus subtilis LmrA is a repressor of the lmrAB and yxaGH operons : Identification of its binding site and functional analysis of lmrB and yxaGH (2004)
  • 著者名/発表者名: Ken-ichi Yoshida
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 186 (17) ページ: 5640-5648
  • NAID: 120000946358
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Negative transcriptional regulation of the ilv-leu operon for biosynthesis of branched-chain amino acids through Bacillus subtilis global regulator TnrA (2004)
  • 著者名/発表者名: Shigeo Tojo
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 186 (23) ページ: 7971-7979
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Bacillus subtilis SalA (YbaL) negatively regulates expression of scoC encoding the repressor for the alkaline exoprotease gene, aprE (2004)
  • 著者名/発表者名: Mitsuo Ogura
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 186 (10) ページ: 3056-3064
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] spoIVH (ykvV), a requisite cortex formation gene, is expressed in both sporulating compartments of Bacillus subtili (2004)
  • 著者名/発表者名: Daisuke Imamura
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 186 (16) ページ: 5450-5459
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Characterization of a new Bacillus subtilis peptidoglycan hydrolase gene, yvcE (named cwlO), and the enzymatic properties of its encoded protein (2004)
  • 著者名/発表者名: Hiroyuki Yamaguchi
  • 雑誌名: Journal of Bioscience and Bioengineering 98 (3) ページ: 174-181
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Characterization of a polysaccharide deacetylase gene homologue (pdaB) on sporulation of Bacillus subtilis (2004)
  • 著者名/発表者名: Tatsuya Fukushima
  • 雑誌名: Journal of Biochemistry (Tokyo) 136 (3) ページ: 283-291
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Identification of the nonA and nonB loci of Bacillus subtilis Marburg permitting the growth of SP10 phage (2004)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Matsuoka
  • 雑誌名: Genes ＆ Genetic Systems 79 (6) ページ: 311-317
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Interaction of Bacillus subtilis extracytoplasmic function (ECF) sigma factors with the N-terminal regions of their potential anti-sigma factors (2004)
  • 著者名/発表者名: Mika Yoshimura
  • 雑誌名: Microbiology 150 (3) ページ: 591-599
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Systematic analysis of SigD-regulated genes in Bacillus subtilis by DNA microarray and Northern blotting analyses (2004)
  • 著者名/発表者名: Serizawa, M., Yamamoto, H., Yamaguchi, H., Fujita, Y., Kobayashi, K., Ogasawara, N., Sekiguchi, J.
  • 雑誌名: Gene 329 ページ: 125-136
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Bacillus subtilis LmrA is a repressor of the lmrAB and yxaGH operons : Identification of its binding site and functional analysis of lmrB and yxaGH (2004)
  • 著者名/発表者名: Yoshida, K., Ohki, Y., Murata, M., Kinehara, M., Matsuoka, H., Satomura, T., Ohki, R., Kumano, M., Yamane, K., Fujita, Y.
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 186-17 ページ: 5640-5648
  • NAID: 120000946358
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Negative transcriptional regulation of the ilv-leu operon for biosynthesis of branched-chain amino acids through Bacillus subtilis global regulator TnrA (2004)
  • 著者名/発表者名: Tojo, S., Satomura, T., Morisaki, K., Yoshida, K., Hirooka, K., Fujita, Y.
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 186-23 ページ: 7971-7979
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Bacillus subtilis SalA (YbaL) negatively regulates expression of scoC encoding the repressor for the alkaline exoprotease gene, aprE (2004)
  • 著者名/発表者名: Ogura, M., Matsuzawa, A., Yoshikawa, H., Tanaka, T.
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 186-10 ページ: 3056-3064
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] spoIVH (ykvV), a requisite cortex formation gene, is expressed in both sporulating compartments of Bacillus subtilis. (2004)
  • 著者名/発表者名: Imamura, D., Kobayashi, K., Sekiguchi, J., Ogasawara, N., Takeuchi, M., T.Sato, T.
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 186-16 ページ: 5450-5459
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Characterization of a new Bacillus subtilis peptidoglycan hydrolase gene, yvcE (named cwlO), and the enzymatic properties of its encoded protein (2004)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi, H., K.Furuhata, K., Fukushima, T., Yamamoto, H., Sekiguchi, J.
  • 雑誌名: Journal of Bioscience and Bioengineering 98-3 ページ: 174-181
  • NAID: 110002665355
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Characterization of a polysaccharide deacetylase gene homologue (pdaB) on sporulation of Bacillus subtilis (2004)
  • 著者名/発表者名: Fukushima, T., Tanabe, T., Yamamoto, H., Hosoya, S., Sato, T., Yoshikawa, H., Sekiguchi, J.
  • 雑誌名: Journal of Biochemistry (Tokyo) 136-3 ページ: 283-291
  • NAID: 10016201890
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Identification of the nonA and nonB loci of Bacillus subtilis Marburg permitting the growth of SP10 phage (2004)
  • 著者名/発表者名: Matsuoka, S., Arai, T., Murayama, R., Kawamura, F., Asai, K, Sadaie Y.
  • 雑誌名: Genes ＆ Genetic Systems 79-6 ページ: 311-317
  • NAID: 10015427377
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Interaction of Bacillus subtilis extracytoplasmic function (ECF) sigma factors with the N-terminal regions of their potential anti-sigma factors (2004)
  • 著者名/発表者名: Yoshimura, M., Asai, K., Sadaie, Y., Yoshikawa, H.
  • 雑誌名: Microbiology 150-3 ページ: 591-599
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Negative transcriptional regulation of the ilv-leu operon for biosynthesis of branched-chain amino acids through the Bacillus subtilis global regulator TnrA (2004)
  • 著者名/発表者名: Sigeo Tojo
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 186 ページ: 7971-7979
• [雑誌論文] Identification of the nonA and nonB loci of Bacillus subtilis Marburg permitting the growth of SP10 phage (2004)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Matsuoka
  • 雑誌名: Genes & Genetic Systems 79 ページ: 311-317
• [雑誌論文] Bacillus subtilis LmrA is a repressor of the lmrAB and yxaGH operons : identification of its binding site and functional analysis of lmrB and yxaGH (2004)
  • 著者名/発表者名: Ken-ichi Yoshida
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 186 ページ: 5640-5648
  • NAID: 120000946358
• [雑誌論文] Characterization of a polysaccharide deacetylase gene homologue (pdaB) on sporulation of Bacillus subtilis (2004)
  • 著者名/発表者名: Tatsuya Fukushima
  • 雑誌名: Journal of Biochemistry (Tokyo) 136 ページ: 283-291
• [雑誌論文] IVH (ykvV), a requisite cortex formation gene, is expressed in both sporulating compartments of Bacillus subtilis (2004)
  • 著者名/発表者名: Daisuke Imamuraspo
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 186 ページ: 5640-5648
• [雑誌論文] Bacillus subtilis SalA (YbaL) negatively regulates expression of scoC, which encodes the repressor for the alkaline exoprotease gene, aprE (2004)
  • 著者名/発表者名: Mitsuo Ogura
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 186 ページ: 3056-3064
• [雑誌論文] Systematic analysis of SigD-regulated genes in Bacillus subtilis by DNA microarray and Northern blotting analyses (2004)
  • 著者名/発表者名: Masakuni Serizawa
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 186 ページ: 5640-5648
• [雑誌論文] Interaction of Bacillus subtilis extracytoplasmic function (ECF) sigma factors with the N-terminal regions of their potential anti-sigma factors. (2004)
  • 著者名/発表者名: Mika Yoshimura
  • 雑誌名: Microbiology 150 ページ: 591-599
• [雑誌論文] A bacitracin-resistant Bacillus subtilis gene encodes a homologue of the membrane-spanning subunit of the Bacillus licheniformis ABC transporter (2003)
  • 著者名/発表者名: Reiko Ohki
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 185 (1) ページ: 51-59
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Additional targets of the Bacillus subtilis global regulator CodY identified by chromatin immunoprecipitation and genome-wide transcript analysis (2003)
  • 著者名/発表者名: Virgine Molle
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 185 (6) ページ: 1911-1922
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] DNA microarray analysis of Bacillus subtilis sigma factors of extracytoplasmic function family (2003)
  • 著者名/発表者名: Kei Asai
  • 雑誌名: FEMS Microbiology Letters 220 (1) ページ: 155-160
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Transcriptional, functional and cytochemical analyses of the veg gene in Bacillus subtilis (2003)
  • 著者名/発表者名: Tatsuya Fukushima
  • 雑誌名: Journal of Biochemistry (Tokyo) 133 (4) ページ: 475-483
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Identification of additional TnrA-regulated genes of Bacillus subtilis associated with a TnrA box (2003)
  • 著者名/発表者名: Ken-ichi Yoshida
  • 雑誌名: Molecular Microbiology 49 (1) ページ: 157-165
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Mannitol-1-phosphate dehydrogenase (MtlD) is required for mannitol and glucitol assimilation in Bacillus subtilis : possible cooperation of mtl and gut operons (2003)
  • 著者名/発表者名: Shouji Watanabe
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 185 (16) ページ: 4816-4824
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] The Bacillus subtilis ywkA gene encodes a malic enzyme and its transcription is activated by the YufL/YufM two-component system in response to malate (2003)
  • 著者名/発表者名: Thierry Doan
  • 雑誌名: Microbiology 149 (9) ページ: 2331-2343
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Localization of the vegetative cell wall hydrolases LytC, LytE, and LytF on the Bacillus subtilis cell surface and stability of these enzymes to cell wall-bound or extracellular proteases (2003)
  • 著者名/発表者名: Hiroki Yamamoto
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 185 (22) ページ: 6666-6677
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Organization and expression of the Bacillus subtilis sigY operon (2003)
  • 著者名/発表者名: Shigeo Tojo
  • 雑誌名: Journal l of Biochemistry (Tokyo) 134 (6) ページ: 935-946
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Essential Bacillus subtilis genes (2003)
  • 著者名/発表者名: Kazuo Kobayashi
  • 雑誌名: Proc Natl. Acad. Sci. USA 100 (8) ページ: 4678-4683
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A bacitracin-resistant Bacillus subtilis gene encodes a homologue of the membrane-spanning subunit of the Bacillus licheniformis ABC transporter (2003)
  • 著者名/発表者名: Ohki, R., Takeno, K., Okada, Y., Okajima, H., Asai, K., Sadaie, Y., Murata, M., Aiso, T.
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 185-1 ページ: 51-59
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Additional targets of the Bacillus subtilis global regulator CodY identified by chromatin immunoprecipitation and genome-wide transcript analysis (2003)
  • 著者名/発表者名: Molle, V., Nakaura, Y., Shivers, R.P., Yamaguchi, H., Losick, R., Fujita, Y., Sonenshein, A.L.
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 185-6 ページ: 1911-1922
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] DNA microarray analysis of Bacillus subtilis sigma factors of extracytoplasmic function family (2003)
  • 著者名/発表者名: Asai, K., Yamaguchi, H., Kang, C., Yoshida, K., Fujita, Y., Sadaie, Y.
  • 雑誌名: FEMS Microbiology Letters 220-1 ページ: 155-160
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Transcriptional, functional and cytochemical analyses of the veg gene in Bacillus subtilis (2003)
  • 著者名/発表者名: Fukushima, T., Ishikawa, S., Yamamoto, H., Ogasawara, N., Sekiguchi, J.
  • 雑誌名: Journal of Biochemistry (Tokyo) 133-4 ページ: 475-483
  • NAID: 10012054043
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Identification of additional TnrA-regulated genes of Bacillus subtilis associated with a TnrA box (2003)
  • 著者名/発表者名: Yoshida, K., Yamaguchi, H., Kinehara, M., Ohki, Y., Nakaura, Y., Fujita, Y.
  • 雑誌名: Molecular Microbiology 49-1 ページ: 157-165
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Mannitol-l-phosphate dehydrogenase (MtlD) is required for mannitol and glucitol assimilation in Bacillus subtilis : possible cooperation of mtl and gut operons (2003)
  • 著者名/発表者名: Watanabe, S., Hamano, M., Kakeshita, H., Bunai, K., Tojo, S., Yamaguchi, H., Fujita, Y., Wong, S, Yamane, K.
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 185-16 ページ: 4816-4824
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Binding of response regulator DegU to the aprE promoter is inhibited by RapG, which is counteracted by extracellular PhrG in Bacillus subtilis (2003)
  • 著者名/発表者名: Ogura, M., Shimane, K., Asai, K., Ogasawara, N., Tanaka, T.
  • 雑誌名: Molecular Microbiology 49-6 ページ: 1685-1697
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The Bacillus subtilis ywkA gene encodes a malic enzyme and its transcription is activated by the YufL/YufM two-component system in response to malate (2003)
  • 著者名/発表者名: Doan, T., Servant, P., Tojo, S., Yamaguchi, H., Lerondel, G., Yoshida, K., Fujita, Y., Aymerich, S.
  • 雑誌名: Microbiology 149-9 ページ: 2331-2343
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Localization of the vegetative cell wall hydrolases LytC, LytE, and LytF on the Bacillus subtilis cell surface and stability of these enzymes to cell wall-bound or extracellular proteases (2003)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, H., Kurosawa, S., Sekiguchi, J.
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 185-22 ページ: 6666-6677
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Organization and expression of the Bacillus subtilis sigY operon (2003)
  • 著者名/発表者名: Tojo, S., Matsunaga, M., Matsumoto, T., Kang, C., Yamaguchi, H., Asai, K., Sadaie, Y., Yoshida, K., Fujita, Y.
  • 雑誌名: Journal 1 of Biochemistry (Tokyo) 134-6 ページ: 935-946
  • NAID: 10012060241
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Essential Bacillus subtilis genes (2003)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, K., Ehrlich, S.D.et al.
  • 雑誌名: Proc Natl. Acad. Sci. USA 100-8 ページ: 4678-4683
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Identification of two myo-inositol transporter genes of Bacillus subtilis (2002)
  • 著者名/発表者名: Ken-ichi Yoshida
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 184 (4) ページ: 983-991
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Whole genome analysis of genes regulated by Bacillus subtilis competence transcription factor, ComK (2002)
  • 著者名/発表者名: Mitsuo Ogura
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 184 (9) ページ: 2344-2351
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Recent progress in Bacillus subtilis two-component regulation (2002)
  • 著者名/発表者名: Mitsuo Ogura
  • 雑誌名: Frontiers in Bioscience 7d ページ: 1815-1824
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Med, a cell-surface localized protein regulating a competence transcription factor, comK, in Bacillus subtilis (2002)
  • 著者名/発表者名: Mitsuo Ogura
  • 雑誌名: Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 66 (4) ページ: 892-896
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Identification of two myo-inositol transporter genes of Bacillus subtilis (2002)
  • 著者名/発表者名: Yoshida, K., Yamamoto, Y., Omae, K., Yamamoto, M., Fujita, Y.
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 184-4 ページ: 983-991
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Whole genome analysis of genes regulated by Bacillus subtilis competence transcription factor, ComK (2002)
  • 著者名/発表者名: Ogura, M., Yamaguchi, H., Kobayashi, K., Ogasawara, N., Fujita, Y., Tanaka, T.
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 184-9 ページ: 2344-2351
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Recent progress in Bacillus subtilis two-component regulation. (2002)
  • 著者名/発表者名: Ogura, M., Tanaka, T.
  • 雑誌名: Frontiers in Bioscience 7
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Med, a cell-surface localized protein regulating a competence transcription factor, comK, in Bacillus subtilis (2002)
  • 著者名/発表者名: Ogura, M., Hashimoto, H., Tanaka, T.
  • 雑誌名: Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 66-4 ページ: 892-896
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] DBTBS : a database of Bacillus subtilis promoters and transcription factors (2001)
  • 著者名/発表者名: Takahiro Ishii
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 29 (1) ページ: 278-280
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Combined transcriptome and proteome analysis as a powerful approach to study genes under glucose repression in Bacillus subtilis (2001)
  • 著者名/発表者名: Ken-ichi Yoshida
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 29 (3) ページ: 683-692
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] DNA microarray analysis of Bacillus subtilis DegU, ComA and PhoP regulons : an approach to comprehensive analysis of B. subtilis two-component regulatory systems (2001)
  • 著者名/発表者名: Mitsuo Ogura
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 29 (18) ページ: 3804-3813
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Involvement of two distict cataboite-responsive elements in catabolite repression of the Bacillus subtilis myo-inositol (iol) operon (2001)
  • 著者名/発表者名: Yasuhiko Miwa
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 183 (24) ページ: 5877-5884
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Comprehensive DNA microarray analysis of Bacillus subtilis two-component regulatory systems (2001)
  • 著者名/発表者名: Kazuo Kobayashi
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 183 (24) ページ: 7365-7370
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] DBTBS : a database of Bacillus subtilis promoters and transcription factors (2001)
  • 著者名/発表者名: Ishii, T., Yoshida, K., Terai, G.Fujita, Y., Nakai, K.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 29-1 ページ: 278-280
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Combined transcriptome and proteome analysis as a powerful approach to study genes under glucose repression in Bacillus subtilis. (2001)
  • 著者名/発表者名: Yoshida, K., Kobayashi, K., Miwa, Y., Kang, C., Matsunaga, M., Yamaguchi, H., Tojo, S., Yamamoto, M., Nishi, R., Ogasawara, N., Nakayama, T., Fujita, Y.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 29-3 ページ: 683-692
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] DNA microarray analysis of Bacillus subtilis DegU, ComA and PhoP regulons : an approach to comprehensive analysis of B. subtilis two-component regulatory systems (2001)
  • 著者名/発表者名: Ogura, M., Yamaguchi, H., Yoshida, K., Fujita, Y., Tanaka, T.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 29-18 ページ: 3804-3813
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Involvement of two distict cataboite-responsive elements in catabolite repression of the Bacillus subtilis myo-inositol (iol) operon (2001)
  • 著者名/発表者名: Miwa, Y., Fujita, Y.
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 183-20 ページ: 5877-5884
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Comprehensive DNA microarray analysis of Bacillus subtilis two-component regulatory systems (2001)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, K., Ogura, M., Yamaguchi, H., Yoshida, K., Ogasawara, N., Tanaka, T., Fujita, Y.
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 183-24 ページ: 7365-7370
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Elaborate transcription regulation of the Bacillus subtilis ilv-leu operon involved in the biosynthesis of branched-chain amino acids through global regulators of CcpA, CodY and TnrA
  • 著者名/発表者名: Shigeo Tojo
  • 雑誌名: Mol.ecular Microbiology (印刷中)
• [雑誌論文] The Bacillus subtilis YdfHI two-compoment system regulates the transcription of ydfJ that is a member of the RND superfamily
  • 著者名/発表者名: Masakuni Serizawa
  • 雑誌名: Micobiology (印刷中)
• [文献書誌] Hideaki Nanamiya: "Involvement of ClpX protein in the post-transcriptional regulation of a competence specific transcription factor, ComK protein, of Bacillus subtilis"Journal of Biochemistry (Tokyo). 133(3). 295-302 (2003)
• [文献書誌] Kei Asai: "DNA microarray analysis of Bacillus subtilis sigma factors of extracytoplasmic function family"FEMS Microbiology Letters. 220(1). 155-160 (2003)
• [文献書誌] Kazuo Kobayashi: "Essential Bacillus subtilis genes"Proceedings of National Acadmy of Science of the United States of America. 100(8). 4678-4683 (2003)
• [文献書誌] Tasuya Fukushima: "Transcriptional, functional and cytochemical analyses of the veg gene in Bacillus subtilis"Journal of Biochemistry (Tokyo). 133(4). 475-483 (2003)
• [文献書誌] Ken-ichi Yoshida: "Identification of additional TnrA-regulated genes of Bacillus subtilis associated with a TnrA box"Molecular Microbiology. 49(1). 157-165 (2003)
• [文献書誌] Shouji Watanabe: "Mannitol-1-phosphate dehydrogenase (MtlD) is required for mannitol and glucitol assimilation in Bacillus subtilis : possible cooperation of mtl and gut operons"Journal of Bacteriology. 185(16). 4816-4824 (2003)
• [文献書誌] Mitsuo Ogura: "Binding of response regulator DegU to the aprE promoter is inhibited by RapG, which is counteracted by extracellular PhrG in Bacillus subtilis"Molecular Microbiology. 49(6). 1685-1697 (2003)
• [文献書誌] Thiery Doan: "The Bacillus subtilis ywkA gene encodes a malic enzyme and its transcription is activated by the YufL/YufM two-component system in response to malate"Microbiology. 149(9). 2331-2343 (2003)
• [文献書誌] Ritsuko Kuwana: "Bacillus subtilis spoVIF (yjcC) gene, involved in coat assembly and spore resistance"Microbiology. 149(10). 3011-3021 (2003)
• [文献書誌] Hideki Yamamoto: "Localization of the vegetative cell wall hydrolases LytC, LytE, and LytF on the Bacillus subtilis cell surface and stability of these enzymes to cell wall-bound or extracellular proteases"Journal of Bacteriology. 185(22). 6666-6677 (2003)
• [文献書誌] Atsuhiro Arai: "Inhibition of Bacillus subtilis aprE expression by lincomycin at the posttranscriptional level through inhibition of ppGpp synthesis"Journal of Biochemistry (Tokyo). 134(5). 691-697 (2003)
• [文献書誌] Shigeo Tojo: "Organization and expression of the Bacillus subtilis sigY Operon"Journal of Biochemistry (Tokyo). 134(6). 935-946 (2003)
• [文献書誌] Masanao Oda: "Analysis of HutP-dependent transcription antitermination in the Bacillus subtilis hut operon : identification of HutP binding sites on but antiterminator RNA and the involvement of the N-terminus of HutP in binding of HutP to the antiterminator RNA"Molecular Microbiology. 51(4). 1155-1168 (2004)
• [文献書誌] Fumitaka Kawai: "Cardiolipin domains in Bacillus subtilis Marburg membranes"Journal of Bacteriology. 186(5). 1475-1483 (2004)
• [文献書誌] Masakuni Serizawa: "Systematic analysis of SigD-regulated genes in Bacillus subtilis by DNA microarray and Northern blotting analyses"Gene. (in press).
• [文献書誌] Ken-ichi Yoshida: "The fifth gene of the iol operon of Bacillus subtilis, iolE, encodes 2-keto-myo-inositol hydratase"Microbiolology. (in press).
• [文献書誌] Mitsuo Ogura: "Whole-genome analysis of genes regulated by the Bacillus subtilis competence transcription factor ComK"Journal of Bacteriology. 184(9). 2344-2351 (2002)
• [文献書誌] Mituso Ogura: "Recent progress in Bacillus subtilis two-component regulation"Frontiers in Bioscience. 7. d1815-d1824 (2002)
• [文献書誌] Mitsuo Ogura: "Med, a cell-surface localized regulating a competence transcription factor gene, comK, in Bacillus subtilis"Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry. 66(4). 892-896 (2002)
• [文献書誌] Reiko Ohki: "A bacitracin-resistant Bacillus subtilis gene encodes a homologue of the membrane-spanning subunit of the Bacillus Iicheniformis ABC transporter"Journal of Bacteriology. 185(1). 51-59 (2003)
• [文献書誌] Virginie Molle: "Additional targets of the Bacillus subtilis global regulator CodY identified by chromatin immunoprecipitation and genome-wide transcript analysis"Journal of Bacteriology. 185(6). 1911-1922 (2003)
• [文献書誌] Kei Asai: "DNA microarray analysis of Bacillus subtilis sigma factors of extracytoplasmic function family"FEMS Microbiology Letters. (in press).
• [文献書誌] Yasuhiko Miwa: "Involvement of two distinct catabolite-responsive elements in catabolite repression of the Bacillys subtilis myo-inositol (Tol) operon"Journal of Bacteriology. 183(20). 5877-5884 (2001)
• [文献書誌] Mitsuo Ogura: "DNA microarray analysis of Bacillus subtilis Deg U, Com A and PhoP regulons : on approach to comprehensive analysis of B. subfilis two-component regulatory systems"Nucleic Acids Research. 29(18). 3804-3813 (2001)
• [文献書誌] Kazuo Kobayashi: "Comprehensive DNA microarray analysis of Bacillus subtilis two-component regulatory systems"Journal of Bacteriology. 183(24). 7365-7370 (2001)
• [文献書誌] Ken-ichi Yoshida: "Identification of two myo-inositol transporter genes of Bacillus subtilis"Journal of Bacteriology. 184(4). 983-991 (2002)
• [文献書誌] 山口弘毅: "DNAマイクロアレイ解析で枯草菌の糖代謝とカタボライト抑制に迫る"化学と生物. 40(1). 2-4 (2002)
• [文献書誌] Ken-ichi Yoshida: "Anoperon for a putatire, ATP-binding cassette transport system involved in a cetoin utilization of Bacillus subtilis"Journal of Bacteriology. 182(19). 5454-5461 (2000)
• [文献書誌] Takahiro Ishii: "DBTBS : a database of Bacillns subtilis promoters and transcription factors"Nucleic Acids Research. 29(1). 278-280 (2001)
• [文献書誌] Ken-ichi Yoshida: "Combined transcriptome and proteome analysis as a powerful approach to study genes under glucose repression in Bacillus subtilis"Nuclei-Acids Research. 29(3). 683-692 (2001)
• [文献書誌] Mitsuo Dgura: "Bacillus subtilis comZ (YJ3A) negatively regulates comG expression independently of ComK"Journal of Bacteriology. 182(17). 4992-4994 (2000)
• [文献書誌] 藤田泰太郎: "ポストシークエンスのゲノム科学(2)ゲノム機能第1章発現プロファイル,トランスクリプトーム 第3節枯草菌のトランスクリプトーム解析"中山書店. 14 (2000)