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DNA複製エラーに起因する自然突然変異の発生機構

研究課題

研究課題/領域番号 12213082
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関奈良先端科学技術大学院大学

研究代表者

真木 壽治 (真木 寿治)  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 教授 (20199649)

研究分担者 愿山 郁  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 助手 (10346322)
研究期間 (年度) 2000 – 2004
研究課題ステータス 完了 (2004年度)
配分額 *注記
66,000千円 (直接経費: 66,000千円)
2004年度: 13,300千円 (直接経費: 13,300千円)
2003年度: 13,600千円 (直接経費: 13,600千円)
2002年度: 14,000千円 (直接経費: 14,000千円)
2001年度: 13,100千円 (直接経費: 13,100千円)
2000年度: 12,000千円 (直接経費: 12,000千円)
キーワードミューテーター / DNA複製 / DNA修復 / ノックアウトマウス / DNA損傷 / DNAポリメラーゼ / 校正機能 / フレームシフト / DNA報復 / 修復 / 大腸菌
研究概要

複製エラーおよびそれに起因する突然変異の特徴を詳細に解析した結果、大腸菌およびマウス個体の両方で、複製装置によるDNA合成のエラーは高頻度に生じているものの、ミスマッチ修復によりほぼ完全に修復されていることが明らかになった。このことから、ミスマッチ修復に耐性の前変異損傷として、自然DNA損傷により誘発される複製エラーと鋳型スイッチングエラーが重要な役割を果たしていることを提唱し、その後の研究により、この仮説を強く裏付ける以下の成果を得た。
1)自然突然変異の発生に寄与する酸化DNA損傷
自然DNA損傷の代表格である自然酸化DNA損傷についての研究では、塩基置換の発生には水酸ラジカルが主要な活性酸素種として関与することを明らかにし、一方、スーパーオキシドはグリコールアルデヒドなどの2炭糖を酸化して強力な自然変異原物質を産生することで変異の原因となることを突き止めた。
2)鋳型スイッチングエラーの発生と抑制の分子機構
鋳型スイッチングエラーの発生機構の研究では、岡崎フラグメントのプロセッシングに欠損が生じると鋳型スイッチングエラーの発生が昂進することを見いだし、各種のエキソヌクレアーゼが鋳型スイッチングエラーの特異的修復に関与することを示した。
3)DNA損傷による複製フォークの進行阻害と損傷乗り越えDNA合成による回復
試験管内で再構成した複製装置・複製フォークを用いて複製フォークの進行阻害とその回復過程の生化学的解析についても大きな進展が得られた。リーディング鎖上の脱塩基損傷により進行が阻害された大腸菌の複製装置がDNAポリメラーゼIVの働きにより複製を再開する過程を世界で初めて検出することに成功した。また、自然突然変異の発生における組換え修復と損傷乗り越えDNAポリメラーゼの役割についても詳細な検討を行い、自然DNA損傷により引き起こされる自然突然変異は組換え修復により強く抑制されていること、また、損傷乗り越えDNAポリメラーゼは自然突然変異の発生に通常の環境下ではほとんど寄与しないことを明らかにした。

報告書

(6件)
  • 2004 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2003 実績報告書
  • 2002 実績報告書
  • 2001 実績報告書
  • 2000 実績報告書
  • 研究成果

    (53件)

すべて 2004 2003 2002 2001 2000 その他

すべて 雑誌論文 (31件) 文献書誌 (22件)

  • [雑誌論文] Evidence for interplay among yeast replicative DNA polymerases alpha, delta and epsilon from studies of exonuclease and polymerase active site mutations.2004

    • 著者名/発表者名
      Pavlov, Y.
    • 雑誌名

      BMC Biol 2

      ページ: 11-11

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Distinct roles of DNA polymerases dalta and epsilon at the replication fork in Xenopus egg extracts.2004

    • 著者名/発表者名
      Fukui, T.
    • 雑誌名

      Genes to Cells 9

      ページ: 179-191

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Evidence for interplay among yeast replicative DNA polymerases alpha, delta and epsilon from studies of exonuclease and polymerase active site mutations.2004

    • 著者名/発表者名
      Pavlov, Y., et al.
    • 雑誌名

      BMC Biol 2

      ページ: 11-11

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Distinct roles of DNA polymerases dalta and epsilon at the replication fork in Xenopus egg extracts.2004

    • 著者名/発表者名
      Fukui, T., et al.
    • 雑誌名

      Genes to Cells 9

      ページ: 179-191

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Distinct roles of DNA polymerases dalta and epsilon at the replication fork in Xenopus egg extracts.2004

    • 著者名/発表者名
      T.Fukui
    • 雑誌名

      Genes to Cells 9

      ページ: 179-191

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Evidence for interplay among yeast replicative DNA polymerases alpha, delta and epsilon from studies of exonuclease and polymerase active site mutations.2004

    • 著者名/発表者名
      Y.Pavlov
    • 雑誌名

      BMC Biol 2・1

      ページ: 11-11

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Double-stranded DNA binding properties of Saccharomyces cerevisiae DNA polymerase ε and of the Dpb3p-Dpb4p subassembly.2003

    • 著者名/発表者名
      Tsubota, T.
    • 雑誌名

      Genes to Cells 8

      ページ: 873-888

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Fate of DNA replication fork encountering a single DNA lesion during oriC plasmid DNA replication in vitro.2003

    • 著者名/発表者名
      Higuchi, K.
    • 雑誌名

      Genes to Cells 8

      ページ: 437-449

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Positive and negative roles of homologous recombination in the maintenance of genome stability in Saccbaromyces cerevisiae2003

    • 著者名/発表者名
      Yoshida, J.
    • 雑誌名

      Genetics 164

      ページ: 31-46

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Spontaneous hotspot mutations resistant to mismatch correction in Escherichia coli : Transcription-dependent mutagenesis involving template-switching mechanisms.2003

    • 著者名/発表者名
      Yoshiyama, K.
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol. 327

      ページ: 7-18

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Double-stranded DNA binding properties of Saccharomyces cerevisiae DNA polymerase ε and of the Dpb3p-Dpb4p subassembly.2003

    • 著者名/発表者名
      Tsubota, T., et al.
    • 雑誌名

      Genes to Cells 8

      ページ: 873-888

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Fate of DNA replication fork encountering a single DNA lesion during oriC plasmid DNA replication in vitro.2003

    • 著者名/発表者名
      Higuchi, K., et al.
    • 雑誌名

      Genes to Cells 8

      ページ: 437-449

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Positive and negative roles of homologous recombination in the maintenance of genome stability in Saccharomyces cerevisiae.2003

    • 著者名/発表者名
      Yoshida, J., et al.
    • 雑誌名

      Genetics 164

      ページ: 31-46

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Spontaneous hotspot mutations resistant to mismatch correction in Escherichia coli : Transcription-dependent mutagenesis involving template-switching mechanisms.2003

    • 著者名/発表者名
      Yoshiyama, K., et al.
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol. 327

      ページ: 7-18

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Origins of spontaneous mutations : Specificity of base-substitution, frameshift and sequence-substitution mutageneses.2002

    • 著者名/発表者名
      Maki, H.
    • 雑誌名

      Annu.Rev.Genet. 36

      ページ: 279-303

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Mutational specificity of mice defective in the MTH1 and/or the MSH2 genes.2002

    • 著者名/発表者名
      Egashira, A.
    • 雑誌名

      DNA Repair 1

      ページ: 881-893

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Eleveted incidence of loss of heterozygosity(LOH) in an sgs1 mutant of Saccharomyces cerevisiae.2002

    • 著者名/発表者名
      Ajima, J.
    • 雑誌名

      Mutation Research 504

      ページ: 157-172

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Hyper-processive and slower DNA chain elongation catalyzed by DNA polymerase III holoenzyme purified from tha dnaE173 mutator mutant of Escherichia coli.2002

    • 著者名/発表者名
      Sugaya, Y.
    • 雑誌名

      Genes to Cells 7

      ページ: 385-399

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Involvement of RAD9-dependent damage checkpoint control in arrest of cell cycle, induction of cell death, and chromosome instability caused by defects in origin recognition complex in Saccharomyces cerevisiae2002

    • 著者名/発表者名
      Watanabe, K.
    • 雑誌名

      Eukaryotic Cell 1

      ページ: 200-212

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structural analysis of aberrant chromosomes that occur spontaneously in diploid Saccharomyces cerevisiae : Retrotransposon Tyl plays a crucial role in chromosomal rearrangements.2002

    • 著者名/発表者名
      Umezu, K.
    • 雑誌名

      Genetics 160

      ページ: 97-110

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Mutational specificity of mice defective in the MTH1 and/or the MSH2 genes.2002

    • 著者名/発表者名
      Egashira, A., et al.
    • 雑誌名

      DNA Repair 1

      ページ: 881-893

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Eleveted incidence of loss of heterozygosity(LOH) in an sgsl mutant of Saccharomyces cerevisiae.2002

    • 著者名/発表者名
      Ajima, J., et al.
    • 雑誌名

      Mutation Research 504

      ページ: 157-172

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Hyper-processive and slower DNA chain elongation catalyzed by DNA polymerase III holoenzyme purified from tha dnaE173 mutator mutant of Escherichia coli.2002

    • 著者名/発表者名
      Sugaya, Y., et al.
    • 雑誌名

      Genes to Cells 7

      ページ: 385-399

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Involvement of RAD9-dependent damage checkpoint control in arrest of cell cycle, induction of cell death, and chromosome instability caused by defects in origin recognition complex in Saccharomyces cerevisiae.2002

    • 著者名/発表者名
      Watanabe, K., et al.
    • 雑誌名

      Eukaryotic Cell 1

      ページ: 200-212

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structural analysis of aberrant chromosomes that occur spontaneously in diploid Saccharomyces cerevisiae : Retrotransposon Tyl plays a crucial role in chromosomal rearrangements.2002

    • 著者名/発表者名
      Umezu, K., et al.
    • 雑誌名

      Genetics 160

      ページ: 97-110

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Directionality of DNA replication fork movement strongly affects the generation of spontaneous mutations in Escherichia coli.2001

    • 著者名/発表者名
      Yoshiyama, K.
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol. 307

      ページ: 1195-1206

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Directionality of DNA replication fork movement strongly affects the generation of spontaneous mutations in Escherichia coli.2001

    • 著者名/発表者名
      Yoshiyama, K., et al.
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol. 307

      ページ: 1195-1206

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Spontaneous loss heterozygosity in diploid Saccharomyces cerevisiae.2000

    • 著者名/発表者名
      Hiraoka, M.
    • 雑誌名

      Genetics 156

      ページ: 1531-1548

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Two DNA polymerases of Escherichia coli display distinct misinsertion specificities for 2-Hydroxy-dATP during DNA synthesis.2000

    • 著者名/発表者名
      Kamiya, M.
    • 雑誌名

      Biochemistry 39

      ページ: 9508-9513

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Spontaneous loss heterozygosity in diploid Saccharomyces cerevisiae.2000

    • 著者名/発表者名
      Hiraoka, M., et al.
    • 雑誌名

      Genetics 156

      ページ: 1531-1548

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Two DNA polymerases of Escherichia coli display distinct misinsertion specificities for 2-Hydroxy-dATP during DNA synthesis.2000

    • 著者名/発表者名
      Kamiya, M., et al.
    • 雑誌名

      Biochemistry 39

      ページ: 9508-9513

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yoshiyama, K.: "Spontaneous hotspot mutations resistant to mismatch correction in Escherichia coli Transcription-dependent mutagenesis involving template-switching mechanisms."J.Mol.Biol.. 327. 7-18 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Yoshida, J.: "Positive and negative roles of homologous recombination in the maintenance of genome stability in Saccharomyces cerevisiae"Genetics. 164. 31-46 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Higuchi, K.: "Fate of DNA replication fork encountering a single DNA lesion during oriC plasmid DNA replication in vitro."Genes to Cells. 8. 437-449 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Tsubota, T.: "Double-stranded DNA binding properties of Saccharomyces cerevisiae DNA polymerase ε and of the Dpb3p-Dpb4p subassembly."Genes to Cells. 8. 837-888 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Umezu, K.: "Structural analysis of aberrant chromosomes that occur spontaneously in diploid Saccharomyces cerevisiae : Retrotransposon Ty1 plays a crucial role in chromosomal rearrangements"Genetics. 160. 97-110 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Watanabe, K.: "Involvement of RAD9-dependent damage checkpoint control in arrest of cell cycle, induction of cell death, and chromsome instability caused by defects in origin recognition complex in Saccharomyces cerevisiae"Eukaryotic Cell. 1. 200-212 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Sugaya, Y.: "Hyper-processive and slower DNA chain elongation catalyzed by DNA polymerase III holoenzyme purified from tha dnaE173 mutator mutant of Escherichia coli"Genes to Cells. 7. 385-399 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Ajima, J.: "Eleveted incidence of loss of heterozygosity (LOH) in an sgs1 mutant of Saccharomyces cerevisiae"Mutation Research. 504. 157-172 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Egashira, A.: "Mutational specificity of mice defective in the MTH1 and/or the MSH2 genes"DNA Repair. 1. 884-893 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Maki, H.: "Origins of spontaneous mutations : Specificity of base-substitution, frameshift and sequence-substitution mutageneses"Annu. Rev. Genet.. 36. 279-303 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Yoshiyama, K.: "Spontaneous hotspot mutations resistant to mismatch correction in Escherichia coli ; Transcription-dependent mutagenesis involving template-switching mechanisms"J. Mol. Biol.. 327. 7-18 (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Yoshida, J.: "Positive and negative roles of homologous recombination in the maintenance of genome stability in Saccharomyces cerevisiae"Genetics. (In Press). (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Higuchi, K.: "Fate of DNA replication fork encountering a single DNA lesion during oriC plasmid DNA replication in vitro"Genes to Cells. (In Press). (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Yoshiyama, K.: "Directionality of DNA replication fork movement strongly affects the generation of spontaneous mutations in Escherichia coli"J. Mol. Biol.. 307. 1195-1206 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Umezu, K.: "Structural analysis of aberrant chromosomes that occur spontaneously in diploid Saccharomyces cerevisiae : Retrotransposon Ty1 plays a crucial role in chromosomal rearrangements"Genetics. 160. 97-110 (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Watanabe, K.: "Involvement of RAD9-dependent damage checkpoint control in arrest of cell cycle, induction of cell death, and chromosome instability caused by defects in origin recognition complex in Saccharomyces cerevisiae"Eukaryotic Cell. (In press). (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Sugaya, Y.: "Hyper-processive and slower DNA chain elongation catalyzed by DNA polymerase III holoenzyme purified from tha dnaE173 mutator mutant of Escherichia coli"Genes to Cells. (In press). (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Tsuzuki, T.: "Spontaneous tumorigenesis and mutagenesis in mice defective in the MTH1 gene encoding 8-oxo-dGTPase"Mutation Research. (In Press). (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Ajima, J.: "Eleveted incidence of loss of heterozygosity(LOH) in an sgs1 mutant of Saccharomyces cerevisiae"Mutation Research. (In Press). (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Yoshiyama,K.: "Directionality of DNA replication fork movement strongly affects the generation of spontaneous mutations in Escherichia coli."J.Mol.Biol.. (印刷中). (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Hiraoka,M.: "Spontaneous loss of heterozygosity in diploid Saccharomyces cerevisiae cells."Genetics. 156. 1531-1548 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Kamiya,H.: "Two DNA polymerases of Escherichia coli display distinct misinsertion specificities for 2-Hydroxy-dATP during DNA synthesis."Biochemistry. 39. 9508-9513 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書

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公開日: 2000-04-01   更新日: 2018-03-28  

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