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細胞毒性tRNaseの体系的研究

研究課題

研究課題/領域番号 12306005
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用微生物学・応用生物化学
研究機関東京大学

研究代表者

正木 春彦  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (50134515)

研究分担者 日高 真誠  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教授 (50183918)
研究期間 (年度) 2000 – 2003
研究課題ステータス 完了 (2003年度)
配分額 *注記
46,650千円 (直接経費: 40,500千円、間接経費: 6,150千円)
2003年度: 7,020千円 (直接経費: 5,400千円、間接経費: 1,620千円)
2002年度: 6,890千円 (直接経費: 5,300千円、間接経費: 1,590千円)
2001年度: 12,740千円 (直接経費: 9,800千円、間接経費: 2,940千円)
2000年度: 20,000千円 (直接経費: 20,000千円)
キーワードコリシン / tRNA / リボヌクレアーゼ / tRNase / 制限酵素 / 大腸O157株 / 分子擬態 / アンチコドン / 大腸菌 / 反応機構 / O157 / コドン / インヒビター / 塩基触媒 / RNA制限酵素 / ピオシン / バクテリオファージ / 酸塩基触媒
研究概要

我々は、tRNAを標的とするトキシン作用を2例発見した。コリシンは、大腸菌プラスミドが生産し他の大腸菌の細胞に侵入して細胞を殺す蛋白性毒素である。我々は、コリシンE5がtRNA^<Tyr>,tRNA^<His>,tRNA^<Asn>,tRNA^<Asp>のアンチコドンを切断して蛋白質合成を止め、菌を殺すこと、さらに別のコリシンDが、tRNA^<Arg>の4種のイソアクセプター分子のアンチコドンループ3'末端を切断して蛋白質合成を止めることを見出し、これらを"細胞毒性tRNase"と位置づけた。本研究では、"細胞毒性tRNase"のさらなる探索を行い、コリシンE5とDの分子構造と基質認識や酵素活性を究明するとともに、その応用可能性を探った。
大腸菌0157株コレクションからtRNase型の新規コリシンを見つけることは出来なかったが、0157株の約1/4が何らかのコリシンを生産し、実にその3/4以上をコリシンDが占めていた。コリシンE5の活性ドメインE5-CRDは、コドンを分子擬態してtRNAアンチコドンを認識し、アルカリ開裂に似た新機構でRNAを切ること、またインヒビターImmE5はtRNAアンチコドンを分子擬態してE5-CRDに結合することを示した。E5-CRDは単鎖RNAのGU配列を切る「RNA制限酵素」である。これに対しコリシンDの活性ドメインD-CRDは局所構造のみの認識はしていない。D-CRDは基質との共結晶が得られなかったので基質との相互作用を示せなかったが、研究期間後に継続した各種変異実験により各残基の役割と分子機構が推定できた。また、tRNaseの酵母や動物細胞での発現に成功して、tRNAを切断して細胞増殖をとめること、各インヒビターによってその活性を中和できることを明らかにし、真核細胞機能研究のツールとなる可能性を示した。

報告書

(5件)
  • 2003 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2002 実績報告書
  • 2001 実績報告書
  • 2000 実績報告書
  • 研究成果

    (33件)

すべて 2004 2003 2002 2001 2000 その他

すべて 雑誌論文 (10件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (14件) 図書 (2件) 文献書誌 (7件)

  • [雑誌論文] In vitro selection of RNA aptamers that bind to colicin E3 and structurally resemble the decoding site of 16S ribosomal RNA2004

    • 著者名/発表者名
      HIRAO, Ichiro
    • 雑誌名

      Biochemistry 43

      ページ: 3214-3221

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Relation between tRNase activity and the structure of colicin D according to X-ray crystallography2004

    • 著者名/発表者名
      YAJIMA, Shunsuke
    • 雑誌名

      Biochem.Biophys.Res.Com. 322

      ページ: 966-973

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Relation between tRNase activity and the structure of colicin D according to X-ray crystallography.2004

    • 著者名/発表者名
      Yajima, S., Nakanishi, K., Takahashi, K., Ogawa, T., Hidaka, M., Kezuka, Y., Nonaka, T., Ohsawa, K., Masaki, H.
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Com. 966-973

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] In vitro selection of RNA aptamers that bind to colicin E3 and structurally resemble the decoding site of 16S ribosomal RNA.2004

    • 著者名/発表者名
      Hirao, I., Harada, Y., Nojima, T., Ogawa, Y., Masaki, M., Yokoyama, S.
    • 雑誌名

      Biochemistry 43

      ページ: 3214-3221

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] The mode of action of colicins E5 and D,and related cytotoxic tRNases2002

    • 著者名/発表者名
      MASAKI, Haruhiko
    • 雑誌名

      Biochimie 84

      ページ: 433-438

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The mode of action of colicins E5 and D, and related cytotoxic tRNases2002

    • 著者名/発表者名
      Masaki, H., Ogawa, T.
    • 雑誌名

      Biochimie 84

      ページ: 433-438

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] in Offensive and defensive proteins in biological interactions(eds, Uchiyama, T., et. al.)(Kyoritsu, Tokyo)2001

    • 著者名/発表者名
      Masaki, H.
    • ページ
      305-314
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] A cytotoxic ribonuclease targeting specific tRNAs.2001

    • 著者名/発表者名
      Ogawa, T, Masaki, H.
    • 雑誌名

      in Offensive and defensive proteins in biological interactions(eds, Uchiyama, T., et. al.)(Kyoritsu, Tokyo)

      ページ: 333-340

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] A cytotoxic ribonuclease which specifically cleaves four isoaccepting arginine tRNAs at their anticodon loops2000

    • 著者名/発表者名
      TOMITA, Kozo
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci., USA 97

      ページ: 8278-8283

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A cytotoxic ribonuclease which specifically cleaves four isoaccepting arginine tRNAs at their anticodon loops.2000

    • 著者名/発表者名
      Tomita, K., Ogawa, T., Uozumi, T., Watanabe, K. Masaki, H.
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci., USA 97

      ページ: 8278-8283

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Specific recognition of the substrate tRNAs and inhibitor proteins by colicins E5 and D2003

    • 著者名/発表者名
      Masaki, Haruhiko
    • 学会等名
      RNA 2003 Kyoto"The new frontier of RNA science"
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2003-11-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Specific recognition of the substrate tRNAs and inhibitor proteins by colicins E5 and D.2003

    • 著者名/発表者名
      Masaki, H., Ogawa, T., Nakanishi, K., Inoue, S., Hidaka, M., Yajima, S.
    • 学会等名
      RNA 2003 Kyoto The new frontier of RNA science
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2003-11-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Catalytic mechanism of an RNA restriction enzyme, colicin E52003

    • 著者名/発表者名
      MASAKI, Haruhiko
    • 学会等名
      RNA 2003 Kyoto"The new frontier of RNA science"
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2003-11-24
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Catalytic mechanism of an RNA restriction enzyme, colicin E5.2003

    • 著者名/発表者名
      Inoue, S., Ogawa, T., Yajima, S., Hidaka, M. and Masaki, H.
    • 学会等名
      RNA 2003 Kyoto The new frontier of RNA science
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2003-11-24
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Structures and functions of ribonucleases that cleave specific tRNAs2003

    • 著者名/発表者名
      MASAKI, Haruhiko
    • 学会等名
      76th Annual meeting of JBS
    • 発表場所
      Yokohama
    • 年月日
      2003-10-17
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Structures and functions of ribonucleases that cleave specific tRNAs.2003

    • 著者名/発表者名
      Masaki, H., Ogawa, T., Inoue, S., Ito, K., Nakanishi, K., Hidaka, M., Yajima, S.
    • 学会等名
      76th Annual Meeting of JBS
    • 発表場所
      Yokohama
    • 年月日
      2003-10-17
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Cytotoxic endoribonucleases specific to transfer RNAs2002

    • 著者名/発表者名
      MASAKI, Haruhiko
    • 学会等名
      Chongwon International Symposium on Advanced Science and Technology, Korea
    • 発表場所
      Korea
    • 年月日
      2002-08-30
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [学会発表] A unique group of new ribonucleases targeting specific tRNAs2002

    • 著者名/発表者名
      MASAKI, Haiuhiko
    • 学会等名
      6th Intenational Conference on Ribonucleases
    • 発表場所
      Bath,UK
    • 年月日
      2002-06-22
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Catalytic mechanism of an RNA restriction enzyme,colicin E52002

    • 著者名/発表者名
      INOUE
    • 学会等名
      6th Intemational Conference on Ribonucleases
    • 発表場所
      Bath,UK
    • 年月日
      2002-06-22
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [学会発表] A unique group of new ribonucleases targeting specific tRNAs.2002

    • 著者名/発表者名
      Masaki, H.
    • 学会等名
      6th International Conference on Ribonucleases
    • 発表場所
      Bath, UK
    • 年月日
      2002-06-22
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Studies on tRNA-specific ribonucleases.2002

    • 著者名/発表者名
      Haruhiko Masaki
    • 学会等名
      Novozymes Japan Enzyme Symposium
    • 発表場所
      Kyoto
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [学会発表] An RNA restriction enzyme which specifically recognizes a dinucleotide GU2001

    • 著者名/発表者名
      MASAKI, Haruhiko
    • 学会等名
      2nd International Conference on Proteins that bind RNA
    • 発表場所
      Austin,USA
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [学会発表] An RNA restriction enzyme which specifically recognizes a dinucleotide GU.2001

    • 著者名/発表者名
      Masaki, H
    • 学会等名
      2nd international conterence on proteins that bind RNA
    • 発表場所
      Austin, USA
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Cytotoxic endoribonucleases specific to transfer RNAs.

    • 著者名/発表者名
      Haruhiko Masaki
    • 学会等名
      Chongwon Intenational Symposium on Advanced Science and Technology
    • 発表場所
      Korea
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [図書] 「生物間の攻撃と防御の蛋白質」の中の「バクテリオシンの多様性およびコリシンの構造と進化」2001

    • 著者名/発表者名
      正木 春彦
    • 出版者
      共立出版
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [図書] 生物間の攻撃と防御の蛋白質」の中の「tRNAを標的とする細胞毒性リボネクレアーゼ」2001

    • 著者名/発表者名
      小川 哲弘
    • 出版者
      共立出版
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hirao, I.: "In vitro selection of RNA aptamers that bind to colicin E3 and structurally resemble the decoding site of 16S ribosomal RNA"Biochemistry. (印刷中). (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Haruhiko MASAKI: "The modes of action of colicins E5 and D, and related cytotoxic tRNases"Biochimie. 84,(5/6). 433-438 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Haruhiko MASAKI: "An RNA restriction enzyme which secifically recognizes a dinucleotide GU"Proceedings of the second international conference on proteins that bind RNA. 107 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Tomita,K.: "A cytotoxic ribonuclease which specifically cleaves four isoaccepting arginine tRNAs at their anticodon loops."Proc.Natl.Acad.Sci.,USA.,. 97・15. 8278-8283 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] 正木春彦: "バクテリオシンの多様性およびコリシンの構造と進化"蛋白質・核酸・酵素. 46・4. 305-314 (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] 小川哲弘: "tRNAを標的とする細胞毒性リボヌクレアーゼ"蛋白質・核酸・酵素. 46・4. 334-340 (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] 内山竹彦 他 編著: "生物間の攻撃と防御の蛋白質(蛋白質・核酸・酵素 2001年3月号増刊)"共立出版. 288 (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書

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公開日: 2000-04-01   更新日: 2016-04-21  

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