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疎水性物質排出ポンプを構成するAcrBの機能改変による大腸菌の有機溶媒耐性の向上

研究課題

研究課題/領域番号 12460042
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用微生物学・応用生物化学
研究機関東京工業大学

研究代表者

道久 則之 (2002)  東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助手 (60302957)

青野 力三 (2000-2001)  東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 教授 (30126643)

研究分担者 塚越 範彦  株式会社クボタ, 研究員
道久 則之  東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助手 (60302957)
研究期間 (年度) 2000 – 2002
研究課題ステータス 完了 (2002年度)
配分額 *注記
8,600千円 (直接経費: 8,600千円)
2002年度: 1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
2001年度: 2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
2000年度: 4,700千円 (直接経費: 4,700千円)
キーワード大腸菌 / 有機溶媒 / 有機溶媒耐性 / AcrAB-TolC排出ポンプ / sox-marレギュロン / sox-marレギュロン遺伝子 / marA / rob / soxS
研究概要

大腸菌のAcrAB-TolCポンプは、sox-marレギュロンに属するacrABオペロンとtolC遺伝子とによってコードされる。本ポンプはプロトン駆動力によって駆動され、細胞内に取り込まれた薬剤および有機溶媒分子などの疎水性異物を排出する。その結果、大腸菌の多剤耐性および有機溶媒耐性に寄与している。AcrAB-TolCポンプは、内膜に存在するAcrBタンパク、ペリプラズムに存在するAcrAタンパク、外膜に存在するTolCタンパクによって構成されている。野生型AcrAB-TolCポンプによる有機溶媒排出活性を調べたところ、ヘプタンに対する排出活性が最も高いことが認められた。本ポンプの基質特異性を決定しているのはトランスポーターAcrBタンパク質であると推定され、acrB遺伝子に対して変異処理を施すことによってAcrBタンパクの有機溶媒排出機能を向上させることが可能であることが期待される。
クローニングしたacrAB遺伝子に対して、DNAシャッフリング法(acrB遺伝子のパラログあるいはホモログ遺伝子の断片を鋳型として用いるファミリーシャッフリング法)およびerror prone PCRによりacrB遺伝子にランダム変異を導入した。変異処理を施したacrB遺伝子により大腸菌acrB欠失株を形質転換し、形質転換体の有機溶媒耐性を調べた。その結果、野生型大腸菌と比べて溶媒耐性が様々な程度に低下したクローンが得られた。このことは、有機溶媒排出機能が変化した変異AcrBが構築された可能性を示唆する。また、AcrABのホモログタンパク質を調べることにより、AcrAB-TolCよりも有機溶媒耐性を向上させるポンプを検索した。この結果、AcrAB-TolCポンプは幾つかのホモログタンパク質よりも溶媒耐性度を向上させる効果が大きいことが示された。

報告書

(4件)
  • 2002 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2001 実績報告書
  • 2000 実績報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (22件)

  • [文献書誌] Norihiko Tsukagoshi: "Entry into and release of solvents by escherichia coli in an organic-aqueous two-liquid-phase system and substrate specificity of the acrab-tolc solvent-extruding pump"Journal of Bacteriology. 182. 4803-4810 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Rikizo Aono: "Evaluation of the growth inhibition strength of hydrocarbon solvents against Escherichia coli and Pseudomonas putida grown in a two-liquid phase culture system consisting of a medium and organic solvent"Extremophiles. 5. 11-15 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kei Kobayashi: "Suppression of hypersensitivity of escherichia coli acrb mutant to organic solvents by integrational activation of the acref operon with the is1 or is2 element"Journal of Bacteriology. 183. 2646-2653 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Noriyuki Doukyu: "Cloning, sequence analysis and expression of a gene encoding an organic solvent-and detergent-tolerant cholesterol oxidase of Burkholderia cepacia strain ST-200"Applied Microbiology and Biotechnology. 57. 146-152 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Noriyuki Doukyu: "Isolation of an Acinetobacter sp.ST-550 which produces a high level of indigo in a water-organic solvent two-phase system containing high levels of inodole"Applied Microbiology and Biotechnology. 58. 543-546 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Noriyuki Doukyu: "Indigo production by Escherichia coli carrying phenol hydroxylase gene from Acinetobacter sp.strain ST-550 in a water-organic solvent two phase system"Applied Microbiology and Biotechnology. 60. 720-725 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Norihiko Tsukagoshi and Rikizo Aono: "Entry into and release of solvents by Escherichia coli in an organic aqueous two-liquid phase system and substrate specificity of the AcrAB-TolC solvent-extruding pump"Journal of Bacteriology. 182(17). 4803-4810 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Rikizo Aono, Tsukagoshi Norihiko and Miyamoto Toshihiko: "Evalution of the growth inhibition strength of hydrocarbon solvents against Escherichia coli and Pseudomonas putida grown in a two-liquid phase culture system consisting of a medium and organic solvent"Extremophiles. 5(1). 11-15 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kei Kobayashi, Tshukagoshi Norihiko Rikizo Aono: "Suppression of the hypersensitivity of Escherichia coli acrB mutant to organic solvents by integrational activation of the acrEF operon with the ISI or IS2 element"Journal of Bacteriology. 183(8). 2646-2653 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Noriyuki Doukyu and Rikizo Aono: "Cloning, sequence analysis and expression of a gene encoding an organic solvent-and detergent-tolerant cholesterol oxidase of Burkholderia cepacia strain ST-200"Applied Microbiology and Biotechnology. 57. 146-152 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Noriyuki Doukyu and Rikizo Aono: "Isolation of an Acinetobacter sp. ST-550 which produces a high level of indigo in a water-organic solvent two-phase system containing high levels of indole"Applied Microbiology and Biotechnology. 58. 543-546 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Noriyuki Doukyu and Rikizo Aono: "Indigo production by Escherichia coli carrying phenol hydroxylase gene from Acinetobacter sp. Strain ST-550 in a water-organic solvent two phase system"Applied Microbiology and Biotechnology. 60. 720-725 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Noriyuki Doukyu: "Isolation of an Acinetobacter sp. ST-550 which produces a high level of indigo in a water-organic solvent two-phase system containing high levels of indole"Applied Microbiology and Biotechnology. 58. 543-546 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Noriyuki Doukyu: "Indigo production by Escherichia coli carrying phenol hydroxylase gene from Acinetobacter sp. strain ST-550 in a water-organic solvent two phase system"Applied Microbiology and Biotechnology. 60. 720-725 (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Norihiko Tsukagoshi: "Entry into and release of solvents by Escherichia Coli in an organic aqueous two-liquid phase system and substrate specificity of the AcrAB-TolC solvent-extruding pump"Journal of Bacteriology. 182. 4803-4810 (2000)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Rikizo Aono: "Evaluation of the growth inhibition strength of hydrocarbon solvents against Escherichia coli and Pseudomonas putida grown in a two-liquid phase culture system consisting of a medium and organic solvent"Extremophiles. 5. 11-15 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Kei Kobayashi: "Suppression of the hypersensitivity of Escherichia coli acrB mutant to organic solvents by integrational activation of the acrEF operon with the IS1 or IS2 element"Journal of Bacteriology. 183. 2646-2653 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Noriyuki Doukyu: "Cloning, sequence analysis and expression of a gene encoding an organic solvent- and detergent-tolerant cholesterol oxidase of Burkholderia cepacia strain ST-200"Applied Microbiology and Biotechnology. 57. 146-152 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Noriyuki Doukyu: "Isolation of an Acinetobacter sp. ST-550 which produces a high level of indigo in a water-organic solvent two-phase system containing high levels of indole"Applied Microbiology and Biotechnology. 58(印刷中). (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Norihiko Tsukagoshi: "Entry into and release of solvents by Escherichia coliin an organic aqueous two-liquid phase system and substrate specificity of the AcrAB-TolC solvent-extruding pump"Journal of Bacteriology. 182. 4803-4810 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Rikizo Aono: "Evaluation of the growth inhibition strength of hydrocarbon solvents against Escherichia coli and Pseudomonas putida grown in a two-liquid phase culture system consisting of a medium and organic solvent"Extremophiles. 5(印刷中). (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Kei Kobayashi: "Suppression of the hypersensitivity of Escherichia coli acrB mutant to organic solvents by integrational activation of the acrEF operon with the IS1 or IS2 element"Journal of Bacteriology. 183(印刷中). (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書

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公開日: 2000-04-01   更新日: 2016-04-21  

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