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ニワトリ機能遺伝子の大規模染色体マッピングによる比較染色体地図の作製

研究課題

研究課題/領域番号 12460120
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用動物科学
研究機関北海道大学

研究代表者

松田 洋一  北海道大学, 先端科学技術共同研究センター, 教授 (70165835)

研究分担者 梅原 千鶴子  北海道大学, 先端科学技術共同研究センター, 助手 (80291227)
阿形 清和  理化学研究所, 発生・再生科学総合研究センター, グループディレクター (70167831)
島田 清司  名古屋大学, 大学院・生命農学研究科, 教授 (40065579)
研究期間 (年度) 2000 – 2002
研究課題ステータス 完了 (2002年度)
配分額 *注記
13,900千円 (直接経費: 13,900千円)
2002年度: 4,100千円 (直接経費: 4,100千円)
2001年度: 4,300千円 (直接経費: 4,300千円)
2000年度: 5,500千円 (直接経費: 5,500千円)
キーワードニワトリ / ヒト / ホロホロチョウ / SOX遺伝子 / FISH / 比較染色体地図 / 染色体相同性 / Z染色体 / ニホンウズラ / DNAライブラリー / ESTクローン / 機能遺伝子 / 染色体マッピング / cDNAライブラリー / EST
研究概要

ニワトリ脳のcDNAライブラリーから得られたヒト遺伝子ホモログのESTクローンと共同研究者より分与された既存の遺伝子DNAクローンを用いて、昨年度までに192の機能遺伝子よりなるニワトリの染色体地図を作製した。今年度は新たに25個の機能遺伝子をニワトリ染色体上にマップするとともに、FANCG, FANCC, RPS6,VASAの4遺伝子がニワトリZ染色体上に存在することを確認し、ニワトリ性染色体の起源に関する新たな情報を提供した。また、8つのSOX遺伝子をニワトリ染色体上にマッピングし、染色体上でのSOX遺伝子群の存在様式がヒト-マウス間よりもヒト-ニワトリ間の方が保存性が高いことを明らかにした。
次に、ニワトリとホロホロチョウ間の染色体相同性を明らかにするために、ニワトリ1-9番染色体とZ染色体染色体特異的DNAプローブを用いてホロホロチョウに比較染色体ペインティングを行った。さらに、我々がニワトリ1-8番染色体およびZ染色体にマップした45のコスミドクローンを用いてニワトリ-ホロホロチョウ間で比較染色体地図を作製した。その結果、ニワトリ-ホロホロチョウ間で高い染色体相同性の存在が確認されたが、ニワトリ5番染色体はホロホロチョウの6番と7番染色体間の動原体融合によって生じ、ホロホロチョウの4番染色体はニワトリの4番染色体の長腕とニワトリ9番染色体の動原体融合によって生じたことを明らかにした。さらに、ホロホロチョウの7番染色体で逆位の存在が確認された。
また、ニワトリの染色体特異的プローブを用いて、キジ目3科12種について比較染色体ペインティングを行い、キジ目鳥類の進化過程に生じた染色体再構成のプロセスを明らかにした。得られた結果はミトコンドリアのcytochrome b遺伝子の塩基配列から推定された分子系続関係とよく一致し、キジ目鳥類の祖先型の核型が、走鳥類のエミューに非常によく似ていることが判明した。

報告書

(4件)
  • 2002 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2001 実績報告書
  • 2000 実績報告書
  • 研究成果

    (26件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (26件)

  • [文献書誌] Yamada, K.et al., Matsuda, Y.: "Characterization and chromosomal distribution of novel satellite DNA sequences of the lesser rhea (Pterocnemia pennata) and the greater rhea (Rhea americana)"Chromosome Research. 10. 513-523 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kuroiwa, A.et al., Matsuda, Y.: "Chromosome assignment of eight SOX family genes in chicken"Cytogenetic and Genome Research. 98. 189-193 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shibusawa, M.et al., Matsuda, Y.: "Chromosome rearrangements between chicken and guinea fowl defined by comparative chromosome painting and FISH mapping of DNA clones"Cytogenetic and Genome Research. 98. 225-230 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kuroiwa, A.et al., Matsuda, Y.: "Biallelic expression of Z-linked genes in male chickens"Cytogenetic and Genome Research. (in press).

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yamada, K.et al., Matsuda, Y.: "Molecular cloning and characterization of novel centromeric repetitive DNA sequences in the blue-breasted quail (Coturnix chinensis, Galliformes)"Cytogenetic and Genome Research. (in press).

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tanaka K., Suzuki T., et al., Matsuda Y.: "Characterization and chromosomal distribution of a novel satellite DNA sequence of Japanese quail(Coturnix coturnix japonica)"J. Hered.. 91. 413-415 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shibusawa M., Minai, S., et al., Matsuda Y.: "A comparative cytogenetic study of chromosome homology between chicken and Japanese quali"Cytogenet. Cell Genet.. 95. 103-109 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yamada K., Nishida-Umehara C., Matsuda Y.: "Characterization and chromosomal distribution of novel satellite DNA sequences of the lesser rhea(Pterocnemia pennata)and the greater rhea(Rhea americana)"Chromosome Res.. 10. 513-523 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kuroiwa A., Kamachi Y., et al., Matsuda Y.: "Chromosome assignment of eight SOX family genes in chicken"Cytogenet. Genome Res.. 98. 189-193 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shibusawa M., Nishida-Umehara C., et al., Matsuda T.: "Chromosome rearrangements between chicken and guinea fowl defined by comparative chromosome painting and FISH mapping of DNA clones."Cytogenet. Genome Res.. 98. 225-230 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kuroiwa A., Yokomine T., et al., Matsuda Y.: "Biallelic expression of Z-linked genes in male chickens"Cytogenet, Genome Res.. (in press).

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yamada K , Shibusawa M., et al., Matsuda Y.: "Molecular cloning and characterization of novel centromeric repetitive DNA sequences in the blue breasted quail(Coturnix chinensis, Galliformes)"Cytogenet, Genome Res.. (in press).

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yamada, K., Matsuda, Y.et al.: "Characterization and chromosomal distribution of novel satellite DNA sequences of the lesser rhea (Pterocnemia pennata) and the greater rhea (Rhea americana)"Chromosome Research. 10. 513-523 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Inoue-Murayama, M., Matsuda, Y.et al.: "Molecular sexing of Japanese cormorant used for traditional fishing on the Nagara River in Gifu City"Animal Science Journal. 73. 417-420 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Kuroiwa, A., Matsuda, Y.et al.: "Biallelic expression of Z-linked genes in male chickens"Cytogenetic and Genome Research. (in press).

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Shibusawa, M., Matsuda, Y.et al.: "Chromosome rearrangements between chicken and guinea fowl defined by comparative chromosome painting and FISH mapping of DNA clones"Cytogenetic and Genome Research. (in press).

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Kuroiwa, A., Matsuda, Y.et al.: "Chromosome assignment of eight SOX family genes in chicken"Cytogenetic and Genome Research. (in press).

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Yamada, K., Matsuda, Y.et al.: "Molecular cloning and characterization of novel centromeric repetitive DNA sequences in the blue breasted quail (Coturnix chinensis, Galliformes)"Cytogenetic and Genome Research. (in press).

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Kansaku, N., Matsuda et al.: "Molecular cloning of chicken vasoactive intestinal polypeptide receptor complementary DNA, tissue distribution and chromosomal localization"Biology of Reproduction. 64. 1575-1581 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Inoue-Murayama, Matsuda et al.: "Chicken microsatellite primers are not efficient markers for Japanese quail"Animal Genetics. 32. 7-11 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Ogura, K., Matsuda et al.: "Cloning and chromosomal mapping of human and chicken iroquois(IRX) genes"Cytogenetics and Cell Genetics. 92. 320-325 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Yokomine, T., Matsuda et al.: "Sequence polymorphisms, allelic expression status and chromosomal localization of the chicken IGF2 and MPR1 genes"Cytogenetics and Cell Genetics. 93. 109-113 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Shibusawa, M., Matsuda et al.: "Chromosomal localization of two Z-chromosome-specific DNA fragments(DZGif1 and DZGif2) in Japanese quail"Animal Science Journal. 72. 431-432 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Fukui, A., Matsuda et al.: "Molecular cloning and functional characterization of chicken toll-like receptors: a single chicken toll covers multiple molecular patterns"Journal Biological Chemistry. 276. 47143-47149 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Yoshimura T, Matsuda Y et al.: " Molecular analysis of avian circadian clock genes."Molecular Brain Research.. 78. 207-215 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Tanaka K, Matsuda Y et al.: "Characterization and chromosomal distribution of a novel satellite DNA sequence of Japanese quail (coturnix coturnix Japonica)"Journal of Heredity. 91. 413-415 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書

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公開日: 2000-04-01   更新日: 2016-04-21  

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